新型“化骨绵掌”——纳米级细胞蛋白质水平调控平台

莱斯大学的化学和生物分子工程师Laura Segatori师从双功能识别系统“NanoDeg”创始人Lara Pferdehirt博士(本科)和Wenting Zhao博士(研究生)。该系统允许操作者靶向细胞特定蛋白质,通过加速蛋白水解,控制靶蛋白翻译后的水平,严格调节它们的降解。 这种“即插即用”系统允许合成生物学家观察蛋白质表达水平对细胞生命特征影响,在细胞内环境中研究特定蛋白质功能。 开发 当研究人员在骆驼(以及后来的鲨鱼)体内发现这种单链抗体的一个功能臂可以定制靶向特定蛋白质后,考虑到它们还有体积小(小于大多数生物的自然抗体)、溶解性高、甚至可识别隐藏或中间体状态等特性,研究人员认为它们非常适合被细菌和其他细胞制造和修饰。 决定某一蛋白发生降解或部分降解的序列要素(degrons),即负责调节蛋白质降解速率的短序列也可被人工合成定制,从而调节靶蛋白至所需水平。 把这种抗体与degrons等要素合并后,一种强......阅读全文

蛋白质代谢的降解蛋白

  1、内源蛋白降解速度不同,一般代谢中关键酶半衰期短,如多胺合成的限速酶-鸟氨酸脱羧酶半衰期只有11分钟,而血浆蛋白约为10天,胶原为1000天。体重70千克的成人每天约有400克蛋白更新,进入游离氨基酸库。  2、内源蛋白主要在溶酶体降解,少量随消化液进入消化道降解,某些细胞器也有蛋白酶活性。内

蛋白质测序——Edman降解法

蛋白质测序可用于: (1)鉴定蛋白质; (2)表征蛋白质翻译后修饰。 (3)分析蛋白质一级结构与功能的关系。实验方法原理主要有质谱法,利用蛋白质测序仪进行测序以及利用蛋白质对应DNA或mRNA进行间接测序。传统的蛋白质测序实验一般包括以下步骤:1.肽链的拆开和分离;2.测定蛋白质分子中多肽链的数目;

蛋白质降解作用的发现

  食物中的蛋白质要经过蛋白质降解酶的作用降解为多肽和氨基酸被人体吸收的过程叫做蛋白质降解。  2004年10月6日瑞典皇家科学院宣布,将2004年诺贝尔化学奖授予以色列和美国的三名科学家,以表彰他们发现了泛素调节的蛋白质降解的作用。  蛋白质是自然界中最复杂、最令人迷惑的物质之一,它与生命有着特别

蛋白质的降解的相关介绍

   对于细胞来说,蛋白质降解有多种用途,包括去除分泌蛋白的N末端信号肽,对前体蛋白进行剪切以产生“成熟”蛋白等。细胞不需要的或受到损伤的非跨膜蛋白质一般由蛋白酶体来进行降解,而真核生物的跨膜蛋白则通过内体运送到溶酶体(动物细胞)或液泡(酵母)中进行降解。降解所生成的氨基酸分子可以被用于合成新的蛋白

泛素化的蛋白质降解介绍

  泛素-蛋白酶体途径是先发现的,也是较普遍的一种内源蛋白降解方式。需要降解的蛋白先被泛素化修饰,然后被蛋白酶体降解。  不过后来又发现,并非所有泛素化修饰都会导致降解。有些泛素化会改变蛋白的活性,导致其他的生物效应,如DNA损伤修复,机体免疫应答等。

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】   1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;  2、熟悉蛋白质基本性质分析;  3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;  4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】   1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(ad

核酸和蛋白质序列分析1

在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等,识别调控区的顺式作用元件,可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本

蛋白质序列分析和结构预测

【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;2、熟悉蛋白质基本性质分析;3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)

核酸和蛋白质序列分析2

(2)输出:除了以文本形式外,还可以通过JalView显示和编辑结果。此外,还可以另外使用GeneDoc(常见于文献)及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列,需要进行ORF分析,每个生

关于蛋白质降解的发展意义介绍

  近年来,国际科技界研究发现,蛋白质经消化道酶促水解后,主要以 小肽的形式吸收,且比完全游离 氨基酸更易更快地被机体吸收和利用。这一发现的依据是,科 学家在对动物和 人体解剖中发现,他们的小肠刷状物上有大量的小肽停留。这一发现推翻了过去认为人体吸收蛋白质主要是以小肽的形式的这一理论,明确了人体吸

蛋白质的酶促降解过程介绍

蛋白质是重要的营养素,人和动物摄食蛋白质用以维持细胞、组织的生长、更新和修补;产生酶、激素、抗体和神经递质等多种重要的生理活性物质,这是糖和脂类不可替代的。每克蛋白质在体内氧气分解产生4千卡能量。

《Cell》揭示蛋白质降解调控机制

  蛋白质不能像钻石一样永久地存在。当它们耗尽之时,需要在细胞内将它们降解成氨基酸,然后再循环利用生成新的蛋白。来自洛克菲勒大学和霍华德休斯医学研究所的研究人员,揭示了细胞的蛋白质回收站——蛋白酶体(proteasome)处理不必要的和潜在毒性蛋白的一条新途径。这一研究发现对于肌萎缩、神经退行性疾病

蛋白质代谢的降解蛋白的介绍

  1、内源蛋白降解速度不同,一般代谢中关键酶半衰期短,如多胺合成的限速酶-鸟氨酸脱羧酶半衰期只有11分钟,而血浆蛋白约为10天,胶原为1000天。体重70千克的成人每天约有400克蛋白更新,进入游离氨基酸库。  2、内源蛋白主要在溶酶体降解,少量随消化液进入消化道降解,某些细胞器也有蛋白酶活性。内

体外蛋白质降解的重要意义

  一是替代了体内细胞外的蛋白质降解。通常人们食用蛋白质食物,需经人体消化系统进行消化,即蛋白质降解,降解成氨基酸和小肽后,通过人体小肠吸收而被组 织利用。我们进行体外蛋白质降解,获得与人体降解的效果一样的营养物质,减少了人体肠胃降解蛋白质功能的负担,这对人体消化器官的养护以及防止衰老退化有 着重要

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;

蛋白质序列分析和结构预测实验

实验步骤1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;(

蛋白质序列分析和结构预测实验

蛋白质序列分析和结构预测实验             实验步骤 1.  人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其

N-端封闭蛋白质内部序列测定实验

实验材料 蛋白质样品(约 200 mol) 试剂、试剂盒 1%乙酸溶液(含丽春红 S 染料)1% 乙酸0.2 mol/L NaOH0.1 mol/L 乙酸溶液(含PVP-40)消化缓冲液1 mg/ml 胰蛋白酶层析溶液 A层析溶液 B 仪器、耗材 0.22 μm

N-端封闭蛋白质内部序列测定实验

基本方案             实验方法原理 实验材料 蛋白质样品(约 200 mol)  

N-端封闭蛋白质内部序列测定实验

实验方法原理 实验材料 蛋白质样品(约 200 mol)试剂、试剂盒 1%乙酸溶液(含丽春红 S 染料)1% 乙酸0.2 mol/L NaOH0.1 mol/L 乙酸溶液(含PVP-40) 消化缓冲液 1 mg/ml 胰蛋白酶层析溶液 A 层析溶液 B仪器、耗材 0.22 μm 硝酸纤维素膜酸洗过的

人造蛋白质能降解塑料瓶微粒

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/10/511294.shtm 科技日报讯 (记者张梦然)西班牙巴塞罗那超级计算中心、催化和石油化学研究所与康普顿斯大学的研究团队联合开发了一种人造蛋白质,其能降解聚对苯二甲酸乙二醇酯(PET)微塑料和纳米塑

预测蛋白质3D结构,单条蛋白质序列就能实现

7月22日,华深智药对外宣布,公司在蛋白质结构预测方面开发出一项新技术OmegaFold,突破了已有计算机预测三维结构的模式,是人工智能(AI)和生命科学领域结合实现的一个突破。华深智药是由清华大学人工智能产业研究院孵化,是一家致力于使用AI重构药物开发流程来提高新药研发速度和效率的企业。日前,华深

新型“化骨绵掌”——纳米级细胞蛋白质水平调控平台

  莱斯大学的化学和生物分子工程师Laura Segatori师从双功能识别系统“NanoDeg”创始人Lara Pferdehirt博士(本科)和Wenting Zhao博士(研究生)。该系统允许操作者靶向细胞特定蛋白质,通过加速蛋白水解,控制靶蛋白翻译后的水平,严格调节它们的降解。  这种“即插

中加合作研究揭示蛋白质部分降解新机制

  中科院上海生物化学与细胞生物学研究所赵允研究组、张雷研究组在与加拿大多伦多大学教授Chi-chung Hui进行合作研究的过程中,揭示了一种新的蛋白质部分降解机制。相关研究成果日前在线发表于学术期刊《发育细胞》。   据介绍,蛋白质的泛素化降解作为一个重要的调控机制参与了细胞内的

细胞内蛋白质降解的主要途径有哪些

真核细胞内蛋白质的降解途径主要有三种,溶酶体途径、泛素化途径和胱天蛋白酶(caspase)途径。1、溶酶体途径:蛋白质在同酶体的酸性环境中被相应的酶降解,然后通过溶酶体膜的载体蛋白运送至细胞液,补充胞液代谢库。胞内蛋白:胞液中有些蛋白质的N端含有KFERQ信号,可以被HSC70识别结合,HSC70帮

蛋白质序列分析及结构预测策略包括哪些步骤

  序列分析通常就是指同源性分析、保守位点分析,motif分析和功能预测等,结构预测通常又包括二级结构三级结构甚至四级结构,二级结构目前预测还是比较准确的,三级结构最简单的可以直接将蛋白序列提交swissmodel在线进行预测,也可以采用一些其他软件,如modeller和一些商业软件,主要原理是同源

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验实验材料样品溶液试剂、试剂盒甲醇(HPLC级)三氟乙酸(TFA)仪器、耗材双向测序柱(Agilent)氮气供应设备聚丙烯试管样品加样器上样漏斗实验步骤一、浸润层析柱1.将准备好的两相柱的亲水段(凸向接头)移开,放在一边。2.将柱的疏水段(凹向接头)和上样漏斗装配在一

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验

方案1 两相柱测序仪的样品上样实验 方案2 将蛋白质从凝胶电转移至 PVDF 膜实验 方案3 检测 PVDF 膜上的蛋白质实验 方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验 方案5 磷酸化多肽的固相微量测序实验 方案6 羧基端序列分

电泳分离的蛋白质肽谱和序列分析实验

方案1 蛋白质的过甲酸氧化实验 方案2 蛋白质还原和S-羧甲基化:大规模方法 方案3 蛋白质还原和S-羧甲基化:微量方法 方案4 用Ellman 试剂测定自由巯基和二硫键实验 方案5 蛋白质的胰酶消化实验 方案6 用溴化氰切割 M

蛋白质氨基端及羧基端序列分析实验4

方案4 浓缩聚丙烯酰胺凝胶上的蛋白质点实验实验材料包含目的蛋白的二维电泳凝胶点试剂、试剂盒丙烯酰胺混合物(30%)琼脂糖 50g L考马斯亮蓝染色液脱色液平衡缓冲液10 X 聚丙烯酰胺电泳缓冲液浓缩胶仪器、耗材巴氏滴管聚丙烯管Protean II xi 2-D 电泳槽(Bio-Rad)注射器试管管式