蛋白质组学发文章的四重境界（一）

某宝典卷首曰：“欲练神功，必先自宫。”卷尾曰：“即使自宫，未必成功。”这个惨痛案例告诉我们，欲成大事必付出常人难及的巨大代价，然而最终是否成功，仍有很多因素影响，练错一招，走火入魔。临床医生做科研亦如此，白天忙临床已经是一把辛酸泪，还要晚上写文章、申课题，简直是满纸荒唐言。

倘若砸下百万经费就能发CNS，世界和平就不再是梦想，可惜隔行如隔山，纵使柳叶刀旋转跳跃不停歇，一样会落入基因测序的恶性循环；宝贵的临床样本堆积成山，如何修炼科研神功，将之化为文章的金矿？少年郎，陈博见你骨骼惊奇，请收下这部《蛋白质组研究宝典》。

宝典总纲：“天之道，损有余而补不足，是故虚胜实，不足胜有余。”陈博给大家强行翻译成大白话：蛋白质是一切生命活动的直接参与者，蛋白质表达的差异将影响到相关的生理功能变化，蛋白质组学研究是揭示疾病相关分子机制的最直接研究手段，iTRAQ技术是最常用的蛋白质组学研究方案。

译文：样本+iTRAQ+WB。这是最简单粗暴但有效的蛋白质组学研究套路，在临床样本中用iTRAQ找到差异蛋白，经过最基本的数据分析后，进行WB或IHC的验证，发在诸如：Proteomics、Proteome Sci、Plos One等杂志上，屡试不爽。如下例：

Fang P, Ying H, et al. Dissecting characteristics and dynamics of differentially expressed proteins during multistage carcinogenesis of human colorectal cancer. World J Gastroenterol. 2016. (IF=2.8)

这篇文章用一台5600质谱仪做iTRAQ（目前蛋白质组研究中，主流的高分辨率质谱是QE或5600），在样本中找到3000多种差异蛋白，并做了GO分析、聚类分析、数据统计等最基本的数据分析，最后做了IHC验证，影响因子2.8分。

此类研究周期短、花钱少、文章好发、有深挖潜力，实乃抢时间毕业、赶时间结题的神器！作为接下来一系列课题申请的前期研究，这足以打下坚实的基金申请基础。