发布时间:2015-03-04 10:26 原文链接: 质谱技术有新用——临床样本的数字化进程

  近日,来自瑞士的科学家在国际著名生物学期刊nature medicine发表了他们的一项最新研究成果,他们结合压力循环技术(PCT)和SWATH-MS技术提出一种将临床组织样本转换为单个数字文件的方法,应用这种方法对样本的蛋白组学信息进行记录,方便研究人员对样本信息进行反复分析和对比。这一方法的提出对增加临床样本的利用效率具有重要意义。

  活体组织检查(biopsy)简称"活检",是指应诊断、治疗的需要,从患者体内切取、钳取或穿刺等取出病变组织,进行病理学检查的技术。这是诊断病理学中最重要的部分,对绝大多数送检病例都能做出明确的组织病理学诊断,被作为临床的最后诊断。活检取出的组织样本一般量比较少,对于病人疾病的检测和诊断非常重要。但每一个临床样本都具有其唯一性,样本的量非常有限并且不可再生。类似于组织活检这样的小样本经常会在一系列检验分析之后被消耗殆尽。

  研究人员提出一种结合压力循环技术(PCT)和SWATH-MS技术的方法,能够将小量的组织样本转变成单个,永久性的数字文件,该类文件基于质谱技术,记录着样本的蛋白组学信息,并具有快速和可重复性特点。该方法导出的蛋白质组学图谱文件能够用于不同样本之间特定蛋白质的分析,重分析,对比以进行检测和量化。

  研究人员应用这种方法将9名肾细胞癌病人的18个活检样本进行了处理并转换成SWATH-MS片段离子图谱。研究人员从所有样本的蛋白质组学图谱中检测并量化了超过2000种蛋白,具有高度重复性。这些检测出来的蛋白质清晰得将肾脏肿瘤组织与正常的健康组织区分开来,同时也对各种组织形态不同的肾脏肿瘤亚型进行了区分。

  综上所述,该项研究提出了将临床样本进行质谱处理分析转换成数字文件的方法,增强了对临床样本的利用效率,具有非常重要的意义。

相关文章

帕金森病相关蛋白结构确定

澳大利亚沃尔特和伊丽莎霍尔医学研究所团队在对抗帕金森病的斗争中取得重大突破:他们成功解开了一个长达数十年的谜团,确定了人类PINK1蛋白与线粒体结合的具体结构,为开发治疗帕金森病的新药开辟了新道路。这......

术后认知功能障碍研究获新突破

暨南大学生命科学技术学院教授邹奕团队在广东省重点研发项目、广东省自然科学基金等项目的资助下,研究发现转甲状腺激素蛋白或成术后认知功能障碍诊断新标志物,有望助力早期干预。近日,相关成果发表于《分子精神病......

单细胞鉴定6000+蛋白,多场景实测数据震撼来袭!

过去几年里,单细胞蛋白质组学技术取得了长足发展,单细胞蛋白质组学逐渐走向成熟,后续有望广泛应用于肿瘤异质性分析、免疫学研究、发育生物学、神经科学以及精准医学等领域。然而,从技术发展成熟到实际场景应用分......

科学家首次实现跨膜荧光激活蛋白从头设计

记者20日从西湖大学获悉,该校未来产业研究中心、生命科学学院、西湖实验室卢培龙课题组首次实现跨膜荧光激活蛋白的从头设计,这也是首个通过人工设计得到的、能够精确结合特定小分子的跨膜蛋白。相关研究成果当天......

研究发现NLR蛋白免疫信号新通路

水稻是重要的主食来源。真菌Magnaportheoryzae引起的稻瘟病是水稻的严重病害。有研究发现,抗病受体NLR类蛋白在植物免疫调控中发挥重要作用,并在分子抗病育种中得到广泛使用。而NLRs介导的......

科尔帕默闪耀慕尼黑生化展,高通量产品树立研磨效率新标杆

成立于1955年的Cole-Parmer公司,经营的产品超过五十万种,为全球数十万家实验室提供了各种丰富的实验室产品,持续更新的Cole-Parmer产品目录一直享有“实验室宝典“的美誉。2021年后......

借助科技考古,黄公略烈士终于“回家”了

93年前,时任红一方面军第一军团第三军军长的黄公略在江西省吉安市青原区东固畲族乡六渡坳指挥部队转移时,遭敌机袭击壮烈牺牲。近年,疑似黄公略烈士遗骸在江西省吉安市青原区东固畲族乡出土。复旦大学科技考古研......

新加坡国立大学报道一融合自由基SAM和αKGHExxH结构域蛋白

新加坡国立大学Morinaka,BrandonI.团队报道了具有独特的结构褶皱,并催化环烷形成和β-羟基化的融合自由基SAM和αKG-HExxH结构域蛋白。相关研究成果发表在2024年9月18日出版的......

斯坦福大学团队发现对靶向蛋白重定位的方法

美国斯坦福大学StevenM.Banik研究团队发现通过蛋白运输耦合的靶向蛋白重定位。相关论文于2024年9月18日在线发表在《自然》杂志上。研究人员识别了一组具有强效配体的转运蛋白,这些配体适合于纳......

浙江大学新研究为受伤或衰老组织再生提供新治疗见解

浙江大学医学院王迪团队近期取得重要工作进展,他们研究提出,GasderminD介导的代谢相互作用促进组织修复。相关研究成果2024年9月11日在线发表于《自然》杂志上。据介绍,建立早期促再生生态位对组......