教你如何玩转tRNA机制研究(一)

文章导读:“忽如一夜春风来,千树万树梨花开!”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化,环境温度也在不断的变化,那么什么是温度感受器?AET1是tRNA上鸟苷转移酶,它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明,tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对高温环境中发挥着重要作用。发表期刊:MOLECULAR PLANT影响因子:10.12实验方法:tRNA测序、RIP、RIP qPCR、RNA pull down文章内容:AET1突变水稻热敏性AET1突变水稻在高温环境下生长时主要呈矮小株,叶片狭窄卷曲,无法产生种子,相反在相对温和环境下生长时没有展现其他异常性状。AET1基因的ORF区第1144个SNP(C突变为T)会引起第382个氨基酸从脯氨酸改变为丝氨酸。预测AET1基因编码tRNA鸟苷转移酶,多物种比对结果显示AET1基因在包含哺乳动物在内的多种真核生物当中都是高度保守的,而第382个氨......阅读全文

教你如何玩转tRNA机制研究(二)

4.AET1而不是RACK1A以及eIF3h直接和OsARF mRNA结合AET1与RACK1A以及eIF3h的结合是否和mRNA相关?RIP测序(云序生物提供)帮助研究者快速的明确哪些mRNA能够和蛋白AET1结合,分析结果显示高温条件下545个mRNA分子只在野生型水稻株当中和AET1结合,而仅

教你如何玩转tRNA机制研究(一)

文章导读:“忽如一夜春风来,千树万树梨花开!”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化,环境温度也在不断的变化,那么什么是温度感受器?AET1是tRNA上鸟苷转移酶,它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明,tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对高温环境中发

研究揭示人线粒体丙氨酰tRNA合成酶识别tRNA独特机制

  2月15日,国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所王恩多研究组最新研究成果“The G3-U70-independent tRNA recognition by human mitochondrial alanyl-tR

氨酰tRNA

中文名称氨酰tRNA英文名称aminoacyl tRNA定  义转移核糖核酸的3′端通过酯键与氨基酸连接生成,进入核糖体的A位参与蛋白质生物合成。由氨酰tRNA合成酶催化tRNA与活化氨基酸(即氨酰AMP)反应得到。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

甲硫氨酸tRNA

中文名称甲硫氨酸tRNA英文名称methionine tRNA定  义真核生物的一种起始tRNA,携带甲硫氨酸进入核糖体,进入新生肽链的N端。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

tRNA的结构

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

云序客户再发高分文章,教你如何玩转tRNA机制研究

  “忽如一夜春风来,千树万树梨花开!”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化,环境温度也在不断的变化,那么什么是温度感受器?AET1是tRNA上鸟苷转移酶,它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明,tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对高温环境中发挥着重

云序客户再发高分文章,教你如何玩转tRNA机制研究

  文章导读:   “忽如一夜春风来,千树万树梨花开!”自然界的花花草草在悄无声息的感受着大自然的变化。随着全球气候的变化,环境温度也在不断的变化,那么什么是温度感受器?AET1是tRNA上鸟苷转移酶,它是水稻高温条件下正常生长所必需的。本文研究结果表明,tRNAHis鸟苷转移酶AET1在植物应对

王恩多院士两篇JBC文章解析tRNA新分子机制

  tRNA是细胞内主要的RNA之一,是蛋白质合成中的关键生物大分子。在所有胞内的RNA中,tRNA具有最多的修饰,这些修饰对于tRNA在细胞内发挥功能起着重要作用,缺失某些修饰将引起细胞的严重缺陷甚至导致人类疾病。  近期来自中科院上海生科院的王恩多研究组通过质谱、定点突变和酶学动力学等生物化学手

中科院大连化物所揭示真核生物tRNA加工成熟分子机制

   近日,大连化物所分子反应动力学国家重点实验室李国辉研究员团队与上海交通大学精准医学研究院雷鸣教授团队,以长文的形式在国际学术期刊《科学》(Science)在线发表了两个课题组作为共同通讯作者单位合作完成的最新研究成果——“Structural insight into precursor tR

tRNA的功能特点

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA的功能介绍

作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当反密

tRNA测序,约吗?

  高通量RNA测序(RNA-seq)技术的使用让我们认识了细胞中无比精彩的RNA世界。然而,目前的方法无法检测高度修饰或大量折叠的RNA,如tRNA。近日,《Nature Methods》上的两种方法通过在文库制备前去除tRNA的修饰,解决了tRNA测序的技术难题。  尽管tRNA被认为是看家RN

tRNA的结构基础

tRNA的二级结构如图1所示,其在原核生物和真核生物均相对保守。主要结构有D-loop(D环)、T(C)-loop(T环)、Anticodon-loop(反密码子环)、Accepter Arm(受体臂)、3'端CCA保守序列、Discriminator(识别碱基)、Variable-loop

tRNA的结构特征

tRNA的结构特征之一是含有较多的修饰成分,如上面提到的 D、T、 Ψ等;核酸中大部分修饰成分是在tRNA中发现的。修饰成分在tRNA分子中的分布是有规律的,但其功能不清楚。1974年用X射线晶体衍射法测出第一个tRNA——酵母苯丙氨酸tRNA晶体的三维结构,分子全貌象倒写的英文字母L,呈扁平状,长

tRNA的结构介绍

1.tRNA结构保守:70-80个碱基。2.二级结构:三叶草。3.五个主要臂:(1)接受臂:携带氨基酸;(2)TΨC臂;(3)反密码子臂;(4)双氢尿嘧啶臂(DHU);(5)附加臂:大小反映了整个tRNA分子的大小,根据其大小,tRNA分为两类:第Ⅰ类tRNA,3/4 tRNA只有3-5个碱基的附加

tRNA转录加工过程

主要加工方式是切断和碱基修饰。真核生物tRNA前体一般无生物学特性,需要进行加工修饰。加工过程包括:(1)剪切和拼接tRNA前体在tRNA剪切酶作用下,切成一定大小的分子。大肠杆菌RnaseP特异切割tRNA前体5′旁侧序列,3′-核酸内切酶如RnaseF可将tRNA前体3′端一段序列切下来。Rna

揭示线粒体tRNA选择性降解导致HUPRA综合征的分子机制

  中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员周小龙团队与上海儿童医学中心研究员王剑团队合作以Selective degradation of tRNASer(AGY) is the primary driver for mitochondrial seryl-tRNA

关联tRNA的结构特点

中文名称关联tRNA英文名称cognate tRNA定  义由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

细胞化学词汇阻抑tRNA

中文名称:阻抑tRNA英文名称:suppressor tRNA定  义:能够消除信使核糖核酸(mRNA)突变有害结果的突变转移RNA(tRNA)。生物体内蛋白质基因或mRNA的突变往往产生有害的结果,但它可被同一基因的第二次突变或其他基因(包括tRNA基因)的突变所消除。应用学科:生物化学与分子生物

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

苯酚法制备酵母tRNA

            试剂、试剂盒 DEAE 纤维素   二乙醇胺 (TEA) 溶液 0.lmol LTEA 缓冲液  0.lmol L 氯化钠含 0.lmoi. LTEA 缓冲液

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

阻抑tRNA的结构特点

中文名称阻抑tRNA英文名称suppressor tRNA定  义能够消除信使核糖核酸(mRNA)突变有害结果的突变转移RNA(tRNA)。生物体内蛋白质基因或mRNA的突变往往产生有害的结果,但它可被同一基因的第二次突变或其他基因(包括tRNA基因)的突变所消除。应用学科生物化学与分子生物学(一级

苯酚法制备酵母tRNA

通过 DEAE 纤维素柱纯化,除去少量 DNA、大分子 RNA、蛋白质、多糖等杂质,最后得到各种氨基酸专一性 tRNA 的混合物.试剂、试剂盒DEAE 纤维素二乙醇胺 (TEA) 溶液0.lmol LTEA 缓冲液0.lmol L 氯化钠含 0.lmoi. LTEA 缓冲液12mol L 氯化钠含

细胞化学词汇关联tRNA

中文名称:关联tRNA英文名称:cognate tRNA定  义:由同一特异氨酰tRNA合成酶识别的所有tRNA。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

苯酚法制备酵母tRNA

试剂、试剂盒 DEAE 纤维素 二乙醇胺 (TEA) 溶液 0.lmol LTEA 缓冲液 0.lmol L 氯化钠含 0.lmoi. LTEA 缓冲液 12mol L 氯化钠含 0.lmol LTEA 缓冲液 lmol L 氯化钠含 0.lmol LTEA 缓冲液 乙醚 水饱和酚 乙醇仪器

tRNA相关研究背景介绍

  A. 概述   转运RNA(Transfer Ribonucleic Acid,tRNA)是生物体内含量最为丰富的短链非编码RNA分子。它携带并转运氨基酸,参与蛋白翻译,是连接mRNA与蛋白质的重要桥梁。尽管tRNA广泛存在于生物体内,但不同机体基因组对于特定密码子的偏好性不同,从而导致tRN

同工tRNA的结构特点

同工tRNA(cognate tRNA):指几个代表相同氨基酸、能够被一个特殊的氨酰-tRNA合成酶识别的tRNA。

关于tRNA的功能简介

  作为“搬运工具”的tRNA有很多种,体内20种氨基酸都有其自已特有的tRNA,所以,tRNA的种类不少于20种。tRNA在ATP供应能量和酶的作用下,可分别与特定的氨基酸结合。每个tRNA都有一个由三个核苷酸编成的“反密码”。这个反密码可以根据碱基配对的原则与mRNA上对应的密码配对,而且只有当