蛋白质组学实验技术大全

每一个领域的发展都是基于技术的进步和革新,蛋白质组学亦然。蛋白质的可变性和多样性等特殊性质导致了蛋白质研究技术远远比核酸技术要复杂和困难得多,但正是这些特性参与和影响着整个生命过程。在开始实验之前,先看看这篇技术简介吧。一 蛋白质与DNA相互作用在许多的细胞生命活动中,例如DNA复制、mRNA转录与修饰以及病毒的感染等都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用的问题。随着重组DNA技术的发展,人们已分离到了许多重要的基因。现在的关键问题是需要揭示环境因子及发育信号究竟是如何控制基因的转录活性的。为此需要:1. 鉴定分析参与基因表达调控的DNA元件;2. 分离并鉴定这些顺式元件特异性结合的蛋白质因子。这些问题的研究都涉及到DNA与蛋白质之间的相互作用。研究DNA-蛋白质相互作用主要包括以下实验方法:1 凝胶迁移实验(EMSA)EMSA主要基于蛋白-探针复合物在在凝胶电泳过程中迁移较慢的原理。根据实验设计特异性和非特异性探针,当......阅读全文

PNNL发表开源蛋白质组学软件InformedProteomics

  分析测试百科网讯 一则消息可能对蛋白组学研究者们最头痛的事有一定的缓解。美国一机构介绍了一款用于分析鉴定完整蛋白质的新型开源软件。  ProMex中的LS-MS特征查找,该功能是Informed-Proteomics软件套件的第一个组件的特征检测算法。 它被开发用于检测完整蛋白质离子的同位素包膜

细菌表达蛋白质和样本制备

一般直接用SDS凝胶加样缓冲液裂解,具体方法如下:[试剂与设备](1)表达待检测蛋白质的细菌。(2)50mmoL/LTris-HCl(pH7.4)。(3)2xSDS凝胶加样缓冲液:100mmol/L Tris—HCl(pH6.8)200mmol/L 二硫苏糖醇(DTT)4% SDS(电泳级)0.2%

MRM-Proteomics同Biodesix合作开发蛋白质组肺癌精准诊断法

蛋白质组学领头公司MRM Proteomics和分子诊断公司Biodesix于近期签署了一项合作协议。根据协议条款,MRM Proteomics将授予Biodesix使用其专有iMALDI技术的权利,以进一步推进其基于血液的肺癌诊断。在此之前,Biodesix的测试菜单包括GeneStrat®基因组

蛋白质组样品制备程序2

2)在4℃条件下以20000g的离心力冷冻离心60分钟 (离心力务必达到或大于20000g)。3)移取上清溶液。若上清样品不立即使用,则须储存于-80℃(最佳条件)或-20℃的无霜冰箱中以防止蛋白质的降解。2、用初始缓冲液(Start buffer)交换处理细胞裂解液1)在上述细胞裂解液中,加入初始

蛋白质组样品制备程序1

一、样品制备试剂的准备二、细菌细胞样品的裂解处理步骤三、人培养细胞样品的裂解处理步骤四、膜蛋白裂解方法步骤一、样品制备试剂的准备1、裂解缓冲液储备液的准备下述本样品制备方法已经过优化, 并被证明配合使用PF-2D 试剂盒可获得最佳的结果。您若选择其他的样品处理和细胞裂解方法,请务必避免使用离子型的表

蛋白质组学的样品制备

想要研究蛋白质,首先要得到高度纯化且具有生物活性的目的物质,因此,蛋白样品的制备是重要前提。蛋白提取的质量和效果对后续的研究分析有重要影响。不同种类的样本在制备过程中,存在一些差异,要根据样本特征调整实验方案和操作细节。基本原则样品处理尽量简单,减少蛋白损失;尽量避免蛋白的降解;尽可能提高样品蛋白的

蛋白质印迹法所需样本的制备方法

1、单层贴壁细胞总蛋白的提取:(1)倒掉培养液,并将瓶倒扣在吸水纸上使吸水纸吸干培养液(或将瓶直立放置一会儿使残余培养液流到瓶底然后再用移液器将其吸走)。(2)每瓶细胞加3ml 4℃预冷的PBS(0.01M pH7.2~7.3)。平放轻轻摇动1min洗涤细胞,然后弃去洗液。重复以上操作两次,共洗细胞

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。实验材料 蛋白酶 K培养的细胞鼠尾或小鼠组织试剂、试剂盒 乙醇异丙醇酚氯仿异戊醇磷酸盐缓冲溶液SNETTE仪器、耗材 Sorvall 离心机及 H1000B、SH

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。实验方法原理这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取

从鼠尾或其他小样本中制备基因组DNA

            实验方法原理 这一简单的实验方案在成百上千的实验室被广泛应用于转基因或基因剔除小鼠的基因型鉴定以及从小量培养的细胞或组织块中提取 DNA。 实验材料 蛋白

不同塑料样本的制备

增塑剂分析时前的样本制备 在聚合物中添加增塑剂的目的是更加方便地生产塑料制品。由于增塑剂具有潜在风险,因此,事先对增塑剂的效果进行正确分析很有必要,然而正确的试样制备是得出正确分析结果的前提。   图1.经SM 300磨碎机和Cryomill球磨机粗磨和细磨后的橡胶鸭颗粒。

Protocol-for-Protein-Extraction-for-proteomics

Protocol for Protein Extraction10 % w/v TCA/ acetone/ 0.07 % v/v -MercaptoethanolPlant cells are rich in compounds that interfere with the 2DE separat

PROTEOMICS:OGalNAc糖基化修饰蛋白质的系统发现

  近日,上海交通大学系统生物医学研究院张延课题组在国际知名蛋白质组学研究期刊PROTEOMICS上发表题为《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos

简化样本制备的微波系统

用于样本制备的多通道微波新技术 样本制备过程中使用微波技术会得到意想不到的效果。它快速、坚固在食品生产过程中的监控中的作用就如塑料在工业领域中的作用一样,结合了两种技术的新系统拥有了更大的灵活性。 在过去几年里,微波消解技术被广泛地应用在元素分析时的样本制备过程。如今,在现代化实

FDA的样本制备方法举例

   (1)样本的整理在测定生鲜农产品药物残留时,如果没有特别指明,按照规定,应以整个农产品作为试样。除了分析特定食品中特定药物残留外,一般不得洗涤、除尘、削皮。    水果:去掉水果的把、凹处和核。    香蕉:切掉两头。    芒果:去掉皮和核。    甜瓜:去掉皮、茎、籽,只分析食用部分。  

石蜡包埋组织样本的制备

实验材料 组织胰蛋白酶试剂、试剂盒 二甲苯乙醇生理盐水仪器、耗材 尼龙网实验步骤 1. 把石蜡包埋组织切成 40~50 μm 厚的组织片 3~5 片,或用乳钵研成 0.5 mm 直径大小颗粒状,放入 10 ml 的试管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 时,在室温下脱蜡 1~2 d,视石蜡脱净与否,

FFPE样本核酸(DNA/RNA)制备

福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)组织切片的存档代表了珍贵且来源广泛的生物医学研究材料。随着越来越多的研究人员转向 FFPE 样品的分子分析,开发特定的操作步骤,考虑这些样品的独特性质就变得越来越重要。QIAGEN 在 FFPE 样本纯化及下游检测整个流程中都提供完善的解决方案。QIAamp

石蜡包埋组织样本的制备

实验材料组织胰蛋白酶试剂、试剂盒二甲苯乙醇生理盐水仪器、耗材尼龙网实验步骤1. 把石蜡包埋组织切成 40~50 μm 厚的组织片 3~5 片,或用乳钵研成 0.5 mm 直径大小颗粒状,放入 10 ml 的试管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 时,在室温下脱蜡 1~2 d,视石蜡脱净与否,更换 1

基于液质联用的单细胞蛋白质组学研究进展

摘要    蛋白质是细胞功能的主要执行者,由于其无法在体外进行扩增,单细胞蛋白质组学技术相较单细胞基因组学和转录组学技术而言发展相对滞后。传统的蛋白质组学技术可获得大量细胞蛋白表达的平均值,但忽略了细胞亚型及细胞异质性等信息。单细胞水平的蛋白质分析有助于阐明细胞不同表型与异质性的分子基础。随着质谱仪

如果提升样本制备效率和质量

样品制备的目的有:1、为某研究需要提供少量原料,可以过制取样品提供。2、新产品研发,通过制取样品,对样品进行分析判断是否为需要的产品。3、通过样品制备过程,获取制备的各种工艺参数,设备情况,从而设计生产线进行产品生产。为了保证样品制备的厚度、角度,选择电镜样品制备需要它具有分辨率高和景深长等特点,且

如果提升样本制备效率和质量

样品制备的目的有:1、为某研究需要提供少量原料,可以过制取样品提供。2、新产品研发,通过制取样品,对样品进行分析判断是否为需要的产品。3、通过样品制备过程,获取制备的各种工艺参数,设备情况,从而设计生产线进行产品生产。为了保证样品制备的厚度、角度,选择电镜样品制备需要它具有分辨率高和景深长等特点,且

质谱样本制备技术资料

试剂耗材: Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips(eppendorf)、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Try

食品检测样本制备方法举例

  (1)样本的整理 测定生鲜农产品药物残留时,如果没有特别指明,按照规定,应以整个农产品作为试样。除了分析特定食品中特定药物残留外,一般不得洗涤、除尘、削皮。水果:去掉水果的把、凹处和核。   香蕉:切掉两头。   芒果:去掉皮和核。   甜瓜:去掉皮、茎、籽,只分析食用部分。   坚果类:去掉壳

食品检测样本制备方法举例

(1)样本的整理 测定生鲜农产品药物残留时,如果没有特别指明,按照规定,应以整个农产品作为试样。除了分析特定食品中特定药物残留外,一般不得洗涤、除尘、削皮。水果:去掉水果的把、凹处和核。  香蕉:切掉两头。  芒果:去掉皮和核。  甜瓜:去掉皮、茎、籽,只分析食用部分。  坚果类:去掉壳。  菠萝:

血液样本采集和血涂片制备

 一、血液生理概要  要点1:  离体后的血液自然凝固,分离出来的淡黄色透明液体称为血清。血液加抗凝剂后分离出来的淡黄色液体称为血浆。血清与血浆差别是:血清缺少某些凝血因子,如凝血因子Ⅰ(纤维蛋白原)、Ⅱ(凝血酶原)、Ⅴ、Ⅷ等。  要点2:  全血适用于临床血液学检查,如血细胞计数、分类和形态学检查

如果提升样本制备效率和质量

样品制备的目的有:1、为某研究需要提供少量原料,可以过制取样品提供。2、新产品研发,通过制取样品,对样品进行分析判断是否为需要的产品。3、通过样品制备过程,获取制备的各种工艺参数,设备情况,从而设计生产线进行产品生产。为了保证样品制备的厚度、角度,选择电镜样品制备需要它具有分辨率高和景深长等特点,且

饲料样本的采集、制备及保存

(一)样本的采集采样是饲料检测的第一步。样本包括原始样本和化验样本。原始样本来自饲料总体、化验样本来自原始样本。四分法:将原始样本置于一块塑料布,提起塑料布的一角,使饲料反复多动混合均匀,然后将饲料展平、用分样板或药铲、从中划“十”字或以对角线连接,将样本分成四等分,除去对角的两分,将剩余的两分,如

生物样本蛋白质的提取

由于大部分蛋白质都能溶于水、稀盐、稀酸或稀碱溶液,所以蛋白质的提取一般是以水溶液为主,其中盐溶液和缓冲溶液对蛋白质的稳定性好、溶解度大,是提取蛋白质最常用的溶剂。当细胞粉碎后,用盐溶液或缓冲溶液提取蛋白质时,应注意以下一些条件。(1)盐浓度常用等渗盐溶液,尤其以0.02~0.05mol/L磷酸缓冲溶

蛋白质组和蛋白质组学分析

 随着人类基因 组计划研究成果的公布,人们对基因的认识逐渐清晰,但基因数量的有限性和基因结构的相对稳定性,与生命现象的复杂性和多样性之间存在巨大反差。如何了解众多的基因与危害人类身心健康的疾病之间的关系,对生命科学研究者来说仍是一项长期而艰巨的任务。因此,作为生命活动的直接承担者――蛋白质,成为后基

空间转录组测序样本准备指南

  一、外泌体研究热度持续攀升   外泌体(exosome)是活细胞分泌的30-200nm的囊泡,在电镜下具有非常明显单层膜结构,通常为茶托型或一侧凹陷的半球形。其主要来源于细胞内溶酶体微粒内陷形成的多囊泡体,经多囊泡体外膜与细胞膜融合后释放到胞外基质中。多种细胞在正常及病理状态下均可分泌外泌体,