研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构
近日，纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构。图片来源于网络 染色体外环状DNA(extrachromosomal circular DNAs，eccDNAs)产生于染色体上的序列，在起源上有较高的异质性，可以影响细胞生命活动，促进肿瘤细胞演进和适应性进化，是肿瘤的重要基因组特征。然而，对于染色体外环状DNA的结构、组成和全基因组频率仍然缺乏较为广泛而深入的研究。科研人员结合基因组学和转录组学的方法分析了神经母细胞瘤（一种起源于儿童期的由交感神经系统原始细胞产生的肿瘤）中的染色体外环状DNA的图谱，鉴定并表征了广泛来源于体细胞的和未被报道的体外染色体环状D......阅读全文
染色体外环状DNA（eccDNA）
1. eccDNA成环的整体统eccDNA测序结果充分体现了基因组水平成环的多样性。eccDNA来源十分丰富，同一个基因有可能会产生非常多的环状，同样一个环状也不仅仅只会包含一个外显子。TTN基因就是一个非常典型的例子。该基因长度达到了0.3Mb，而这样一个基因竟然能衍生得到130个eccDNA，是
癌基因的关键——染色体外环状DNA（eccDNA）
实验方法：环状DNA-seq, RNA-seq（云序生物提供以上服务）1. ecDNA是环状结构为了了解ecDNA的结构，作者通过环状DNA-seq（云序生物提供以上服务）方法研究了三种人类癌细胞系和来自于TCGA的临床肿瘤样品。通过这种方法检测到了GBM39细胞中的圆形扩增子游离于染色体之外，并且
研究者首次发现孕妇染色体外环状DNA
人血浆中细胞游离的DNA（cfDNA）的片段化模式是引起人们广泛研究的领域。在怀孕期间，观察到胎儿血浆DNA（主要是胎盘来源）是线性DNA片段，比母体来源（主要是造血来源）DNA短。有研究报道了人和鼠血浆中存在染色体外环状DNA（eccDNA）。但是，尚无有关孕妇血浆中eccDNA的公开数据。
科学家首次解析肿瘤染色体外DNA的环状结构与功能
早期研究认为肿瘤中大量扩增的原癌基因存在于染色体上。2017年，来自美国加州大学圣迭戈分校的Paul Mischel教授团队在Nature杂志上指出，它们是以染色体外DNA（extrachromosomal DNA，ecDNA）的形式存在的，但ecDNA的结构和功能一直缺乏直接的证据。 201
细胞化学词汇环状DNA
中文名称：环状DNA分 类：环状单链DNA和环状双链环状DNA也有两种，环状单链DNA和环状双链，一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中， 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定，储存的遗传信息更多（重复序列）。原核生物的拟核是大型环状DNA。定 义：超螺旋，D
环状DNA的结构特点
超螺旋，DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋，超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA（eccDNA）
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
研究发现染色体外环状DNA驱动神经母细胞瘤癌基因重构
近日，纪念斯隆?凯特林癌症中心等科研机构的研究人员在Nature Genetics上发表了题为“Extrachromosomal circular DNA drives oncogenic genome remodeling in neuroblastoma”的文章，发现染色体外环状DNA驱动神
开启2020年科研新热点的染色体外环状DNA（eccDNA）
近期，Nature与Cell相继发表文章讨论染色体外环状DNA（eccDNA），这位超级明星在各家媒体、宣传号上纷纷闪亮登场。一时间eccDNA走在了生物医学研究舞台的最中央，云序生物已经带您领略过eccDNA在这两篇重量级文章中的迷人风采（点击链接：颠覆性发现：癌基因竟不在染色体上---环状D
环状染色体的概念和特点
若断裂发生于染色体的二个末端，那么断裂下来的两个断片彼此可以粘合成无着丝粒碎片，而带着丝粒的部分可通过两断端的粘合形成环状染色体。不带着丝粒的碎片往往消失，而带着丝粒的部分能继续进行有丝分裂。如慢性粒细胞白血病患者向急性方向转化时，常可见到环状染色体。（1）真核类生物中的一种异常染色体，为没有末端的
环状DNA的类型和分布
环状DNA也有两种，环状单链DNA和环状双链，一般存在于病毒、细菌和真核生物的线粒体和叶绿体中， 环状DNA一般比线性DNA结合更紧密更稳定，储存的遗传信息更多（重复序列）。原核生物的拟核是大型环状DNA。
当外泌体遇上环状RNA（一）
文章导读外泌体是细胞分泌的大小为30-200nm的盘状囊泡，它在人体体液中分布广 泛。2013年，科学家通过研究外泌体细胞囊泡调控机制获得诺贝尔奖，这使外泌体开始被广 泛关注，随着研究的深入，人们发现外泌体可作为细胞间信息交流的桥梁，在细胞间往来穿梭进行信息传递。另外，外泌体与疾病的发生尤其
当外泌体遇上环状RNA（四）
（3）GC来源的外泌体circSHKBP1在体外能促进GC细胞的增殖、迁移和侵袭为了探索circSHKBP1是否影响GC细胞的生物学过程，分析了circSHKBP1在4种人GC细胞系（BGC823、HGC27、AGS和MGC803）和正常胃上皮细胞系GES1中的表达水平。结果表明，circSHKBP
当外泌体遇上环状RNA（六）
3. 外泌体circPACRGL通过miR-142-3p/miR-506-3p- TGF- cm1过程驱动大肠ai的恶化发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.7.27文章链接：Exosomal circPACRGL promotes progressio
当外泌体遇上环状RNA（七）
（3）circPACRGL作为海绵分子结合miR-142-3p和miR-506-3p作者使用生物信息学数据库预测发现circPACRGL同时具有miR-142-3p和miR-506-3p的结合位点，双荧光素酶报告实验检测也证实miR-142-3p和miR-506-3p可与circPACRGL直接结合
当外泌体遇上环状RNA（二）
（4）circUHRF1通过miR-449c-5p相关途径来抑 制NK细胞功能作者利用生物信息学预测了14个miRNA，在NK-92细胞中进行circUHRF1-RIP以及qPCR，结果表明miR-449c-5p是NK-92细胞中一个与circUHRF1相互作用的miRNA。在NK-92细胞中进行抗
当外泌体遇上环状RNA（五）
（6）circSHKBP1直接HSP90相互作用并抑 制其降解在HGC27细胞中用circSHKBP1探针的RNA pull-down和蛋白质谱结果显示两个差异表达蛋白HSP90β和HSP90α（HSP90的异构体）在过表达circSHKBP1的GC细胞中富集。RIP实验显示，circSHKBP1能
当外泌体遇上环状RNA（三）
2. 外泌体circSHKBP1通过调控miR-582-3p/HUR/VEGF过程以及抑 制HSP90降解来促进胃ai发展发表期刊：Molecular Cancer影响因子：15.302发表时间：2020.6.29文章链接：Exosomal circSHKBP1 promotes gastric
分子遗传学词汇环状DNA
中文名称：环状DNA分 类：环状单链DNA和环状双链定义：超螺旋，DNA双螺旋本身进一步盘绕称超螺旋，超螺旋有正超螺旋和负超螺旋两种。当盘旋方向与DNA双螺旋方向相同时，其超螺旋结构为正超螺旋，反之则为负超螺旋，负超螺旋的存在对于转录和复制都是必要的。
带切口环状DNA的结构特点
中文名称带切口环状DNA英文名称nicked circular DNA定 义双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
细胞化学词汇带切口环状DNA
中文名称：带切口环状DNA英文名称：nicked circular DNA定 义：双链环状DNA分子中一条单链上带有一个或多个裂口。应用学科：生物化学与分子生物学（一级学科），核酸与基因（二级学科）
Nature－Nanotechnology：DNA环状分子的自主复制
生物系统中存在很多的自主复制的例子。然而，人工制造这样的生物系统的自主复制系统却是相当困难，这是因为生物系统很复杂。在其他领域，人类可以创造某些自我复制系统，比如磁场系统以及模块化机器人等等。我们很少将这些人造的自我复制系统和生物系统中的自我复制系统进行比较。因而，如果能从理论上将人工的自主复制
外源DNA的定义
外源DNA，是通过基因工程技术或病毒感染等途径引入靶细胞中的DNA序列。
程序外DNA合成试验
基本方法是测定S期以外3H-胸苷掺入胞核的量，这一掺入量可反映DNA损伤后修复合成的量。由于此种合成发生在DNA正常复制合成主要时期以外，故称为程序外DNA合成(unschedule DNA synthesis UDS)试验或DNA修复合成试验。一般使用人淋巴细胞或啮齿动物肝细胞等不处于正在增殖
概述环状混合痔的外剥内扎改良术
1、分段齿形结扎术1982年丁泽民采用分段齿形结扎术治疗环状混合痔，此法采用放射状切口，使痔核下端分离及结扎顶点的连线均呈曲线，不在同一水平面上，以保证内痔脱落后的创面呈齿形，由于保留了肛管皮桥、黏膜桥，进行了齿形分离结扎，这对避免肛门狭窄、肛门松弛、黏膜外翻等后遗症有重要作用，但不能很好地解决
关于环状混合痔的外剥内扎术介绍
外剥内扎术最早由miles在1919年提出，1937年英国圣·马克医院的milligan和morgan对该手术方式进行了改良，一般称为milligan?morgan手术，是临床上常用的手术方式之一。该手术要点是在痔下端皮肤与黏膜交界处作尖端向外的v 形切口，沿内括约肌表面向上剥离到内痔顶端，在痔
关于共价闭合环状DNA（cccDNA）的简介
在乙肝病毒的复制过程中，病毒DNA进入宿主细胞核，在DNA聚合酶的作用下，两条链的缺口均被补齐，形成超螺旋的共价、闭合、环状DNA分子（covalently closed circularDNA，cccDNA）。细胞外乙型肝炎病毒DNA是一种松弛环状的双链DNA（relaxed circular
细胞化学词汇共价闭和环状DNA
中文名称：共价闭和环状DNA英文名称：covalently closed circular DNA;cccDNA定 义：两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力，所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA，质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这
共价闭和环状DNA的结构特点
中文名称共价闭和环状DNA英文名称covalently closed circular DNA;cccDNA定 义两条多核苷酸链是完全连续的环状双链DNA分子。由于链上没有裂隙可以释放内部张力，所以可以形成超螺旋结构。天然状态下某些病毒、细菌的染色体DNA，质粒、线粒体和叶绿体的DNA具有这种结构
外源DNA的基本特点
基因有两个特点，一是能忠实地复制自己，以保持生物的基本特征；二是基因能够“突变”，突变绝大多数会导致疾病，另外的一小部分是非致病突变。非致病突变给自然选择带来了原始材料，使生物可以在自然选择中被选择出最适合自然的个体。含特定遗传信息的核苷酸序列，是遗传物质的最小功能单位。除某些病毒的基因由核糖核酸（