NatureGenetics:多种技术解析草莓基因组
近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。 一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少? 世界各地广泛种植的凤梨草莓(Fragaria×ananassa)是一种有着八倍体基因组的复杂植物,由两种野生的八倍体草莓杂交而成:弗吉尼亚草莓(Fragaria virginiana)和智利草莓(Fragaria chiloensis)。这两种植物都来自四个二倍体祖先物种。 近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。这项成果发表在《Nature Genetics》杂志上。 在这项研究中,研究人员利用了Illumina短读长、PacBio长读长以及10x Genomi......阅读全文
Nature-Genetics:多种技术解析草莓基因组
近日,美国密歇根州立大学和加州大学戴维斯分校的研究人员组装出近乎完整的栽培草莓基因组,并揭示了这种复杂的异源多倍体的起源和进化过程。 一转眼又到了草莓上市的季节。这种小巧可爱的果实有着酸甜可口的味道,可搭配出各种各样的美妙滋味。不过,对于草莓的基因组,你又了解多少? 世界各地广泛种植的凤梨草
研究解析栽培草莓“祖先”的基因组图谱
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/8/507227.shtm草莓具有重要的经济和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹专题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化
新研究解析栽培草莓“祖先”基因组图谱
草莓具有重要的经济价值和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种——弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹课题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关成果在线发表于《自然-植物》。 朱安丹表示,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体
研究解析栽培草莓“祖先”的基因组图谱
草莓具有重要的经济和营养价值,现代八倍体栽培草莓起源于两个八倍体野生种弗州草莓和智利草莓的种间杂交。近日,中国科学院昆明植物研究所研究员朱安丹专题组深入解析了八倍体草莓的起源和遗传分化特征。相关研究成果在线发表于《自然-植物》。朱安丹表示,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先、同源染色体交换和不完全
首个草莓完整基因组发布
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494423.shtm草莓是蔷薇科植物,在世界范围内被广泛栽植。其约有25个种,倍性十分丰富,从二倍体到十倍体均有。森林草莓作为草莓二倍体模式种,有很大的研究价值。2018年GigaScience发表了利用
日破译人工栽培草莓基因组
日本研究人员27日报告说,他们破译了人工栽培草莓的基因组,这一成果将有助于开发更好看好吃并能抵抗虫害的新品种草莓。 位于千叶县木更津市的上总DNA研究所在英国《DNA研究》杂志网络版上介绍说,研究人员将人工栽培草莓品种“丽红”的染色体DNA序列分成片段,分析碱基对的排列,并与4种野生草莓进
草莓甜度可控啦-基因组编辑能精细调控草莓糖分含量
无性繁殖植物在农业生产中具有重要地位,但是长期无性繁殖导致性状多样性的严重匮乏极大阻碍了无性繁殖作物的育种发展。在育种设计中,对数量性状的精细调控可以避免产生剧烈的性状变化,并且可以极大丰富性状多样性,对推进精准育种有重要意义。基因组编辑技术通过对调控元件的遗传操作可以实现对数量性状的改良。对于
草莓和可可树基因组图谱出炉
据美国物理学家组织网12月26日报道,在26日出版的《自然—遗传学》杂志上,两组科学家表示,他们分别解开了野生草莓和克里奥洛可可树的基因密码,新发现有助于育种专家培育出品质更高的草莓和可可树品种。 英国生物工艺学和生物学研究委员会(BBSRC)和其他4个国家的70名研究人员绘制出了野生草莓
科学家搭建草莓基因组数据库
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓为蔷薇科草莓属,因芳香多汁、营养丰富受到喜爱,在全国各地均可种植。栽培草莓为异源多倍体,基因组复杂,杂合度高。 2019年,《自然—遗传学》发表了利用三代测序数据组装的高
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
三维基因组(HiC)技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系,获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
八倍体红颜草莓端粒到端粒完整基因组图谱发布
近日,中国农业科学院郑州果树研究所草莓种质改良团队联合中国农科院深圳农业基因组研究所联合发布八倍体栽培品种红颜草莓的端粒到端粒完整基因组,系统解析了八倍体草莓亚基因组结构和遗传分化,并解析了亚基因组的表观遗传进化机制。相关成果发表于《园艺研究》(Horticulture Research)。
几近完整的高质量草莓参照基因组公布
据英国《自然·遗传学》杂志25日在线发表的一项研究,美国科学家报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该高质量基因组不但为了解草莓起源和演化历史提供了新见解,还对未来改善其品种及提高抗病性大有助力。 八倍体栽培种草莓卡姆罗莎有8组染色体,也被称为花园草莓,因其味美清香而深受喜爱。 此次,美国密歇
草莓基因组研究取得成果-|《自然遗传学》
《自然-遗传学》本周在线发表的一篇论文Origin and evolution of the octoploid strawberry genome报告了一个几近完整的草莓参照基因组。该基因组为了解这一广受欢迎的水果的起源和演化历史提供了新见解。八倍体草莓的演化史。Edger et al. 八
八倍体草莓单倍型定相与着丝粒演化动态研究获进展
多倍化是植物演化的关键驱动力之一。同时,多倍化是植物进化和育种应用的重要机制,对物种遗传组成和习性具有重要影响。现今,广泛栽培的凤梨草莓为异源八倍体,其基因组具有高杂合性和高倍性的特点。随着测序技术与分型算法发展,高质量的单倍型基因组解析成为可能,但未有研究评估分型策略对多倍体基因组解析的影响。植物
Nature:深入解析绦虫基因组
第一次研究人员绘制出了绦虫(tapeworm)的基因组图谱,揭示出了一些现有药物可能发挥作用的潜在药物靶点。这一基因组为我们提供了一个新的资源,为开发出针对这些致人衰弱的疾病急需的有效治疗提供了更快捷的途径。这一研究发表在《自然》(Nature)杂志上。 在世界卫生组织标注的17种遭受忽视
解析现代月季基因组序列
科学家研究现代月季基因。图片来源:monticelloshop.org 近日,法国农业科学研究院、里昂大学、法国国家科学研究中心的研究人员解密了现代月季的基因组序列。现代月季拥有独特的颜色与香味,广受称赞,这项研究帮助人们从分子角度了解这背后的基因和代谢流程。4月30日,相关论文在线刊登于《自然
昆明植物所等揭示八倍体草莓的起源和遗传分化特征
草莓(Fragaria)具有重要的经济和营养价值。现代八倍体栽培草莓(F. × ananassa)起源于两个八倍体野生种弗州草莓(F. virginiana)和智利草莓(F. chiloensis)的种间杂交。然而,由于草莓属系统发育解析涉及未知的祖先,同源染色体交换和不完全谱系分选等问题,学术
草莓季来袭!莲都23个草莓种植基地草莓检测结果在此!
现在正值草莓季,莲都区的草莓已经全面上市,为保障广大消费者舌尖上的安全,保障莲都草莓质量安全,莲都区农业局近期对辖区内23个草莓种植基地,开展质量安全监督抽检。 都检查了哪些项目?检测结果如何?赶紧随小编一起来看看吧~ 检测项目 区农业局随机抽取草莓样品23批次进行监督抽检。检测内容包括:
解析真骨鱼类基因组解析鱼类恒温起源之谜
在脊椎动物的进化过程中,温度对生命体的生理活动具有重要的调节作用。陆地上的鸟类和哺乳类能够适应各种生境,其恒温能力功不可没。相比陆生环境,水生环境的生物获得恒温能力更为艰难,它们必须面对水体高比热,热量易丢失的挑战。然而,根据观测,至少有40种鱼类克服了这些困难,具备类似于哺乳动物和鸟类的恒温能
Science解析热点基因组编辑工具
近来,Cas9酶作为一种有力的新基因组编辑工具,引起了人们极大的研究热情。现在加州大学伯克利分校的研究人员,首次成像了这种酶的精细三维结构,这一成果无疑会进一步提高Cas9的应用价值。文章于二月六日发表在Science杂志上。 加州大学的生化学家Jennifer Doudna和生物物理学家
解析古老的单细胞基因组
单细胞的古细菌用肉眼根本看不到,甚至在使用显微镜时,也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组,却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞,并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。 “直
Nature解析基因组的水平转移
在自然界中,两种不同的植物偶尔会发生杂交。这可能会引发一些问题,因为父本和母本的遗传信息并不相配。不过这个问题很容易解决。 只要亲本植物将完整的遗传信息传递给下一代(而不是一半),这样染色体就能够在减数分裂中正确配对,减数分裂是生殖细胞的形成途径。在这种情况下,杂交形成的植物仍有繁殖能力,并形成
首个毒蛙基因组被成功解析
近日,中国科学院昆明动物研究所联合美国北卡莱罗纳大学、加利福尼亚大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员成功“破译”草莓箭毒蛙(Oophaga pumilio)基因组,揭示了其基因组演化特征。该成果发表在国际期刊Molecular Biology AND Evolution上。美国加利福尼亚大学教授Ra
首个毒蛙基因组被成功解析
近日,中国科学院昆明动物研究所联合美国北卡莱罗纳大学、加利福尼亚大学和丹麦哥本哈根大学的研究人员成功“破译”草莓箭毒蛙(Oophaga pumilio)基因组,揭示了其基因组演化特征。该成果发表在国际期刊Molecular Biology AND Evolution上。美国加利福尼亚大学教授Ra
Nature:99个癌症基因组全面解析
近日来自美国、澳大利亚、加拿大的研究人员组成的一个国际研究小组报告了一项大规模胰腺癌基因组分析研究的结果,揭示了导致这一癌症潜在突变的复杂性,发现了与之相关的两条新信号途径。这些信息将推动开发出胰腺癌的新早期诊断测试。相关论文在线发表在10月24日的《自然》(Nature)杂志上。 贝勒医
Nature新文章解析三大基因组
发表在最新一期(12月19日)《自然》(Nature)杂志上的一篇新文章,揭示了三个重要生物――水蛭(leech)、海蠕虫(Capitella teleta)和青贝(limpet)基因组。通过这一研究,来自莱斯大学、加州大学伯克利分校和美国能源部联合基因组研究所(JGI)的科学家们将冠轮动物
西南大学等解析斜纹夜蛾基因组
9月25日,由西南大学家蚕基因组生物学国家重点实验发起并主持,联合法国、日本、印度、比利时和美国等多家研究机构参与的鳞翅目害虫斜纹夜蛾基因组相关研究成果于Nature子刊《自然—生态学与进化》上在线发表。该研究成果揭示了斜纹夜蛾的高质量基因组精细图谱,以及群体变异图谱和基因表达图谱。 斜纹夜
Nature:系统解析斑马鱼参考基因组
斑马鱼(Zebrafish)是研究发育生物学的新兴模式动物。斑马鱼由于具有饲育容易、胚胎透明、体外受精、突变种多、遗传学工具成熟等诸多优点,近年来已成为研究脊椎动物发育与人类遗传疾病的新兴模式动物。 近日,英国桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)