蛋白质组学相关问题与解答

1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到? 人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用到相应的抗体,所以只要选对抗体,感兴趣的蛋白基本都会被检测到;因此, ELISA/WB检测到的蛋白在组学中没有被检测到也是正常的。 2.itraq的结果,用elisa验证了两个差异蛋白,发现都是阴性结果,是什么情况,出现阴性的概率有多大?一般我们会提到这个概率吗? iTRAQ结果中,选择的蛋白是否得分够高,变化倍数大不大,选择的抗体特异性是否好,都可能会影响WB和iTRAQ的结果,如果以上三方面没有什么问题的话,基本上80%还是方向一致的。 3.iTRAQ、TMT、Labe lfree实验用的是什么质谱仪,......阅读全文

蛋白质组学相关问题与解答

  1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到?    人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用

蛋白质组学入门问题FAQ

常见问题——— HPLC 篇 1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法 样品量不足:解决办法为增加样品量 样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子 样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器 检测器衰减太多:调整衰减即可。 检测器时间常数太大:解决办法为降低时间

蛋白质组学入门问题集锦

  1 . HPLC 灵敏度不够的主要原因及解决办法   样品量不足:解决办法为增加样品量   样品未从柱子中流出:可根据样品的化学性质改变流动相或柱子   样品与检测器不匹配:根据样品化学性质调整波长或改换检测器   检测器衰减太多:调整衰减即可。   检测器时间常数太大:解决

蛋白质组与蛋白质组学简介2

3 甲基化干扰实验用来检测蛋白质的结合位点。甲基化修饰的DNA探针可以干扰蛋白质的结合。结合位点上未被修饰的DNA片段才能与蛋白结合,然后将DNA从被修饰的碱基处切割,电泳分离,结合蛋白的DNA在结合位点上不能被修饰,不能切断,可确定结合位点的位置。 4 Dnase I 足纹分析 蛋白

蛋白质组与蛋白质组学简介1

一、蛋白质组概念:一个细胞、一个组织或一个机体全部基因所表达的全部蛋白质。 二、蛋白质组学研究范畴 1.蛋白质和蛋白质间 2.蛋白质和核酸之间 3.蛋白质及其组成质点的分离、分析、鉴定 4.蛋白质结构分析 5.生理、病理或不同发育状态下蛋白质组表

蛋白组学实验中的常见问题及解答

1,关于使用三氯醋酸沉淀法后蛋白质难于重悬的问题Q:1,Hi !I have been trying to clean and concentrate proteins form eucariotic cell culture medium in order to analyse them in 2

ELISA相关问题在线解答

日前,有客户在网上留言咨询一些问题,我司何经理都一一解答,现在小编就带大家来看看何经理与客户的在线是问答吧。  客户:在稀释抗体中加入的蛋白稳定剂是什么? 何经理:一般就先用一些无关蛋白,如果不行可以添加少量甘油,再不行的话则需购买专门的稳定剂了。客户:在试剂盒的研发中抗体是*重要的吗?何经理:原料

电极相关问题解答

电极是雷磁电化学分析仪器的重要配件,用户在购买电极后可能会出现一些不懂的问题。本站技术文员总结了几个常见问题的相关回答,以供参考! 1、232参比电极用什么液体保存? 答:3.3-3.8mol/L饱和氯化钾溶液 2、电导率电极绝缘差? 答:电导电极的两个极片是隔离开的 3、0.0

EMSA实验问题与解答

以下问题是以Promega公司试剂盒为例。凝胶迁移实验1)什么是凝胶迁移或电泳迁移率实验?凝胶迁移或电泳迁移率实验(EMSA)是一种研究DNA结合蛋白和其相关的DNA结合序列相互作用的技术,可用于定性和定量分析。这一技术最初用于研究DNA结合蛋白,目前已用于研究RNA结合蛋白和特定的RNA序列的相互

RNA制备的问题与解答

1、塑料制品、玻璃和金属物品的处理(a)塑料制品:尽可能使用无菌,一次性塑料制品。已标明RNase-Free 的塑料制品,如没有开封使用过,通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使用。处理方法如下:(1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意:

引物延伸实验问题与解答

1)什么是引物延伸实验?引物延伸实验用于定量mRNA的量,测定低丰度的mRNA的种类。另外引物延伸实验可标定转录产物的5`-端, 确定转录的精确起始。特异的末端标记的引物退火到RNA链的互补区域, 随后用RNA作为模板,用反转录酶延伸引物得到cDNA,用变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析cDNA。cDNA的

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

  AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSp

旋转蒸发仪相关问题解答

Q1:IKA旋转蒸发仪 (配置镀防爆膜玻璃组件) 可以达到的最低真空度是多少?A1:最低可达 1 mBar,在真空系统足够强劲且所有的真空连接都非常密实的情况下。 Q2:竖直型冷凝器和倾斜型冷凝器,哪种比较好?A2:对于应用要求来说两者的冷凝效果相当。这两种冷凝器的冷凝面积和冷却效率是一样的。 Q3

细胞培养相关问题及解答(一)

  小牛血清和胎牛血清有何区别?应用注意事项?   来源不同:胎牛血清(Fetal Bovine Serum ,FBS) 是在屠宰怀孕母牛的时候,通过心脏穿刺采血获取的胎牛的血清,新生牛(小牛)血清(Calf serum, CS)采自出生10至14 天的小牛。   组份与比例不同:两者所含的促细

Cell解答免疫学的基本问题

  只有正确区分敌我,免疫系统才能够在不损伤自身细胞的情况下对抗感染。免疫系统对于自身细胞是很忠诚的,只不过人们还没有完全理解这其中的奥秘。近日Basel大学的科学家们发现,免疫系统通过一个分子计时器,在T细胞的成熟过程中靶标不耐受的T细胞。这一重要成果发表在十月二日的Cell杂志上。  正常功能的

SWATH技术常见问题与解答

   SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)采集模式是苏黎世联邦理工学院及AB SCIEX(全球领先的生命科学分析技术公司)的科学家联合推出的一项基于质谱应用的新技术。利用此项技术,科学家有史以来首次可

浓缩仪常见问题与解答

1、样品浓缩仪与氮吹仪的区别?答:样品浓缩和氮吹仪都是用氮气来进行吹扫,只是各厂家的命名不一样。2、如何能让实验速度更快、效率更高?答:样品浓缩仪的原理是通过提高样品的温度,使样品的溶剂在无氧状态下进行挥发,从而快捷高效的达到浓缩的目的。影响实验速度的原因有两个:1)加热的温度。2)气体的流量及气体

移液器常见问题与解答大全

移液器是实验室里面最长使用的实验仪器之一,基本上每一个实验室人员都曾经或现在使用过移液器,因而也会遇到移液器使用时的一些问题。笔者总结归纳了移液器使用时常见的问题与解答大全,希望对于大家有所帮助:移液器使用时常见的问题与解答大全:问题可能原因提议移液器渗漏多道移液器吸嘴里不均衡的液体水平·吸嘴与移液

SWATH技术常见问题与解答

SWATH(Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra)采集模式是苏黎世联邦理工学院及AB SCIEX(全球领先的生命科学分析技术公司)的科学家联合推出的一项基于质谱应用的新技术。利用此项技术,科学家有史以来首次

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

蛋白质组,蛋白质组学及研究技术路线

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然,不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质,一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类

综述:基于质谱技术的糖蛋白质组学与糖组学研究进展

   糖是组成生命体的四大类重要分子之一,糖蛋白质是由糖链与肽链中的特定氨基酸残基以糖苷键共价连接而成的蛋白质。糖蛋白质普遍存在于生物体内,在很多生命过程中起着重要作用,如蛋白质的折叠、细胞之间的相互识别、炎症反应等。同时,糖基化修饰在疾病中,特别是肿瘤的发生、发展和转移过程中也起到重要作用,许多疾

什么是蛋白质组学

(Marc Wilkins(1994))A study of proteome using the technologies of large-scale protein separation, identification and quantitation.The study of protein

什么是蛋白质组学

这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的

蛋白质组学研究技术

可以说,蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/ 4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很多困难。此外,

蛋白质组学+AI技术

人们在吞咽的时候,颈部有个器官会随着吞咽动作上下活动,它就是甲状腺。西湖欧米有望实现临床转化的第一个项目,就是基于蛋白质标志物的甲状腺结节的良恶性诊断。甲状腺很小,但它影响到五脏六腑。数据显示,每5个成年人中就可能有1人患有甲状腺结节。其中,约60%的甲状腺结节都是良性的。但有10%的结节是恶性的,

什么是蛋白质组学

这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的

什么是蛋白质组学

这个概念最早是在1995年提出的,它在本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。目前,在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的基因编码的蛋白质的

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类

蛋白质组学研究发现,白色脂肪组织蛋白与糖尿病、运动训练相关

一支丹麦研究团队通过对皮下白色脂肪组织进行蛋白质组学分析,发现了与个体体重、2型糖尿病(T2D)状况、运动训练以及相关的临床或代谢特征相一致的蛋白质变化。正如他们在周三的《Science Advances》杂志上报告的那样,哥本哈根大学、奥登斯大学医院和南丹麦大学的研究人员依赖于高通量、高灵敏度的蛋