仅需10万个细胞！“升级版”HiC技术，大大降低建库门槛
作为遗传物质的载体，染色体在细胞中并不是随机分布的。近年来，越来越多的研究开始关注染色体的空间结构。大量证据表明，染色体构象与基因表达、DNA复制、DNA损伤修复以及基因组的稳定性密切相关。 Hi-C是近年发展起来的三维基因组学研究利器，由高通量测序技术（High-throughput sequencing）与染色体构象捕获技术（Chromosome conformation capture）相结合衍生而来，用于染色体构象的分析。 不过，由于需要近千万个级别的细胞才能满足一个Hi-C文库的构建，这种“高不可攀”的建库起始量极大限制了生殖和肿瘤等研究领域微量样本的染色质构象解析以及科研工作者对未知领域的探索。 因此，降低Hi-C建库起始量，一直是三维基因组学研究者想要攻关的难题。 率先降低Hi-C技术建库“门槛” 近期，三维基因组测序技术引领者——安诺基因成功推出了10万个细胞水平的Hi-C建库，率先实现了低起始量H......阅读全文
三次飞跃！半年攻克千个细胞HiC建库大关！
降低建库起始量一直都是安诺Hi-C产品的研发重点之一，2019年以来，安诺三维基因组学研发团队披荆斩棘、坚持不懈，用半年的时间攻克了千个细胞Hi-C建库大关，实现了降低Hi-C建库起始量的三次飞跃，成功将Hi-C建库起始量由500万个细胞逐渐降低至1千个细胞，率先实现了微量细胞样本Hi-C建库的
仅需10万个细胞！“升级版”HiC技术，大大降低建库门槛
作为遗传物质的载体，染色体在细胞中并不是随机分布的。近年来，越来越多的研究开始关注染色体的空间结构。大量证据表明，染色体构象与基因表达、DNA复制、DNA损伤修复以及基因组的稳定性密切相关。 Hi-C是近年发展起来的三维基因组学研究利器，由高通量测序技术（High-throughput seq
日欲建全球首家治疗用干细胞库
Shinya Yamanaka打算利用胎儿的血细胞产生细胞系。图片来源：M. Naka/Aflo/Newscom 由于研究瓶颈、伦理和法律障碍以及业界恐慌造成的拖延，干细胞治疗的前进速度一直慢得令人泄气。如今，日本京都大学的干细胞研究先驱Shinya
WHO欲建埃博拉病毒生物样本库
随着西非埃博拉疫情的逐渐好转，为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本，一项计划正在酝酿。日前，世界卫生组织（WHO）在塞拉利昂首都弗里敦召开会议，讨论建造生物样本库，储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等，共计约10万份样本。 WHO理事会顾
无需建库，直接测序的测序新技术
来自英国老牌测序研究机构Sanger研究院，以及英国剑桥巴布拉汉研究所的研究人员发表了题为“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章，首
北大博士患渐冻症－医学专家呼吁建罕见病细胞库
25日，安徽一家研究机构已经获得北大“渐冻症”娄滔博士的血液样本，并为其制备细胞株，着手建相关疾病模型中。记者采访获悉，这将需要数月的时间，才能完成相关实验。 近日，29岁北大女博士娄滔的一则遗嘱引来社会关注和热议。娄滔在2015年患上渐冻症，日前在她清醒的时候留下：死后将器官捐献，头部可留给
北京基因组所单细胞中识别染色质类染色质拓扑的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近
茄子基因组研究迈入高清时代
10月31日，由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队，于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术，结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法，获得了目前连续性最好的茄科作物基因组，标志着茄子基
茄子基因组研究迈入高清时代
10月31日，由广西农业科学院蔬菜研究所研究员王益奎领衔的研究团队，于生物学论文预印本服务器BioRxiv在线发布了染色体级别的高质量茄子基因组序列。该团队采用PacBio测序技术，结合Dovetail Hi-C建库技术与HiRise组装算法，获得了目前连续性最好的茄科作物基因组，标志着茄子基因
土耳其建世界第三大种子基因库
土耳其将在首都安卡拉建造世界第三大种子基因库,可保存25万种植物的基因。 土耳其农业和农村事务部部长穆罕默德·迈赫迪·埃克尔说，土耳其的种子基因库将成为世界第三大种子基因库,仅次于美国和中国的种子基因库。它将从国内外收集并保存种子,用于科学实验，帮助土耳其开发农业潜力。 埃克尔说,土
欧盟建首个危险化学药品数据库
据美国物理学家组织网近日报道，欧洲化学品管理局(ECHA)指出，欧盟正在使用的药品中有超过400种化学药品会导致癌症、基因突变或生殖问题。 如有任何公司每年要使用或进口超过1吨，化工企业使用或进口超过1000吨这样的危险化学品，它们都要在11月底之前向欧洲化学品管理局进行
NGS测序中DNA质量对建库结果的影响
NGS测序中的常规类文库主要针对全基因组测序，广泛应用于各类物种的重测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、质粒&线粒体&叶绿体测序、宏基因组测序、小片段测序等领域。NGS测序涉及提取、建库、上机多个环节，每一步都会影响最终的数据质量。很多老师在收到质检报告后，
三维基因组（HiC）技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
三维基因组（HiC）技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
三维基因组（HiC）技术解析
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-Seq
默沙东在华扩张提速－同时建人才库和造新厂
全球第二大药企默沙东今天在上海宣布，与复旦大学管理学院合作成立企业人才储备库，培养更多本土制药管理人才，并宣布位于杭州耗资近10亿人民币的最大规模新厂已正式动工。另外，默沙东已有部分药品进入医保目录，个别药品也在华降价以适应中国市场获得更多销量，默沙东在华扩张全面提速。 根据默沙东和复旦大学的
为什么建库要将dna打断到200bp左右
现有的高通量测序平台（主要是illumina）在直接测序时只能测出200bp长度的序列，因此建库方案是，先将DNA片段化为200bp，然后测序，最后将序列拼接。
数字PCR在－二代测序辅助建库的应用
目前靶向测序建库方法包括扩增子方法，在均相溶液中，当扩增引物增加时，由于扩增引物之间的相互作用，从而影响扩增的效率；如果将其分散到大量微液滴中扩增，将可大大降低引物间相互作用，提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增，得到更多的有效测序数据。
“分子标签”技术，让每一个癌细胞都无所遁形
随着精准医学和个性化医疗从概念走向实践，从梦想走进现实，基因组学研究和基因检测技术也在不断走向高精尖，单细胞测序无疑已经成为基因组学前沿研究领域的“新宠”。 在第二十届全国临床肿瘤大会暨2017年CSCO学术年会上，BD作为全球二代测序配套设备和耗材的优质生产商，携其全新的“分子标签”核心技术
日本拟建iPS细胞库
日本京都大学教授山中伸弥5月11日在京都举行的诱导多功能干细胞（iPS细胞）国际研讨会上透露了日本建iPS细胞库的计划。 据日本《每日新闻》5月12日报道，日本规划中的细胞库将储存iPS细胞以及由其分化出来的各种脏器细胞。据山中伸弥介绍，培养iPS细胞相当耗费时日。比如，用于治疗脊髓损伤时，在患者受
达沃斯：王健林想开连锁医院，IBM要建全球医疗数据库
今年的1月17日，瑞士达沃斯又一次迎来了全球政界、商界的领袖。17日至20日之间，达沃斯会举办400多场对话活动，这群全世界最有影响力的人将围绕全球治理体系、振兴全球经济等议题展开讨论，而随着医疗行业在全球持续升温，自然也成为了论坛上的一大话题。动脉网在此整理了达沃斯论坛上的一些行业讨论和新消息
FastAmp基因扩增仪在Y染色样本建库的应用
自2020年2月6日召开联防联控发布会之后，各个村庄、路口、学校、单位设置了体温检测，体温正常与否是目前比较简单易得的有效判断依据，一旦体温确认超过37.3℃，马上就有会安排到隔离区，并且你有可能会被要求隔离14天。由此看见，温度对当前疫情的重要性，随时牵动了一个小区或者一个片区几万人的神经。温度对
赣建食品安全专家库－首批229名专家确定
记者3日从江西省食品安全协调领导小组办公室了解到，江西省食品安全专家库日前组建完毕，首批确定229名食品安全专家。 据介绍，江西省食品安全专家库共分为食用农产品、食品污染物、食品添加剂、食品安全政策法规等9个专业组，涉及食品安全管理、法学、公共卫生、医学、食品检验检测、分析化学、仪器
华大科技DNA建库起始量低至200ng
华大基因旗下全资子公司――华大科技服务有限公司(简称“华大科技”)，18日在福尔马林固定石蜡包埋组织样本测序技术上再获新突破，成功推出FFPE全基因组外显子测序(WES)技术。 目前，科研人员已成功实现外显子测序DNA建库起始量低至200ng，测序质量与正常样本相近，这将有助于更好地解读F
解析肿瘤HiC多组学研究策略
Hi-C (High-through chromosome conformation capture) 是以整个细胞核为研究对象，利用高通量测序技术，结合生物信息分析方法，研究全基因组范围内整个染色质DNA在空间位置上的关系，获得高分辨率的染色质调控元件相互作用图谱。Hi-C可以与RNA-S
国际iPS细胞库正在筹建
克隆羊多利的缔造者、英国科学家伊恩·维尔穆特日前在日本表示，英美日法等国正联合筹建一个国际iPS细胞库，推进iPS细胞在再生医疗领域的应用。 iPS细胞的全称是诱导多能干细胞，是通过对成熟细胞进行“重新编程”培育出的干细胞，拥有与胚胎干细胞相似的分化潜力，有望用于培育人体组织和器官，治疗多
细胞库的管理办法
主细胞库和工作细胞库应分别存放。每一个库应在生产设施内至少2个不同的地点或区域存放。应检测并维护细胞库冻存容器，以保证细胞库贮存在一个高度稳定的环境中。非生产用的细胞和生产用细胞严格分开存放。每种细胞库均应分别建立台账，详细记录放置位置、容器编号、分装及冻存数量，取用记录等。细胞库中的每支细胞均应具
28个世界著名细胞库
28个体外培养保藏机构得到世界培养物保藏联盟（WFCC）的确认，即按知识产权性质在布达佩斯条约中承认的ZL培养物菌种保藏机构（IDA）。在28个保藏机构中，有20个保藏机构主要以真菌、细菌、酵母菌等各种微生物为保存对象；5个保藏机构主要以各种培养物为保存对象；3个保藏机构主要以动植物细胞系为保存对象
我国科学家开发出转录组快速建库新方法
北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文，称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示，这种方法大大简化了建库过程，不仅可用于高质量的单细胞转录组测序，对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。 核糖核酸（RNA）是存
西南大学建4个跨学科新型高端智库－开展重大研究
按照“立足新时代、引领新常态、推动新发展”的思路，日前，西南大学充分调动、整合校内外研究力量，组建“西南大学‘一带一路’研究院”“西南大学意识形态安全与文化发展战略研究院”“西南大学乡村振兴战略研究院”“西南大学民族研究院”4个示范性跨学科新型高端智库，开展跨学科重大研究。研究院对接国家重大战略