为什么建库要将dna打断到200bp左右

现有的高通量测序平台(主要是illumina)在直接测序时只能测出200bp长度的序列,因此建库方案是,先将DNA片段化为200bp,然后测序,最后将序列拼接。......阅读全文

Vitae-120-NGSSA建库仪在单细胞测序建库中的应用

为什么要进行单细胞测序?传统的测序是以组织为单位进行的测序,所得的测序结果是多个细胞的平均值,无法精确到单个细胞的遗传信息;而实际上,细胞与细胞之间由于存在异质性,即便在肿瘤组织中,肿瘤组织中心的细胞、周围的细胞、以及出现远端转移的细胞,在基因组和转录组水平上的遗传信息也是有差异的。而单细胞测序是在

WHO欲建埃博拉病毒生物样本库

  随着西非埃博拉疫情的逐渐好转,为了更好地利用公共卫生部门收集的数十万患者样本,一项计划正在酝酿。日前,世界卫生组织(WHO)在塞拉利昂首都弗里敦召开会议,讨论建造生物样本库,储存取自确诊和疑似埃博拉患者的血液、精子、尿液和母乳样本以及取自死亡患者的标本等,共计约10万份样本。   WHO理事会顾

无需建库,直接测序的测序新技术

  来自英国老牌测序研究机构Sanger研究院,以及英国剑桥巴布拉汉研究所的研究人员发表了题为“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章,首

日欲建全球首家治疗用干细胞库

  Shinya Yamanaka打算利用胎儿的血细胞产生细胞系。图片来源:M. Naka/Aflo/Newscom 由于研究瓶颈、伦理和法律障碍以及业界恐慌造成的拖延,干细胞治疗的前进速度一直慢得令人泄气。如今,日本京都大学的干细胞研究先驱Shinya Yamanaka计

欧盟建首个危险化学药品数据库

   据美国物理学家组织网近日报道,欧洲化学品管理局(ECHA)指出,欧盟正在使用的药品中有超过400种化学药品会导致癌症、基因突变或生殖问题。   如有任何公司每年要使用或进口超过1吨,化工企业使用或进口超过1000吨这样的危险化学品,它们都要在11月底之前向欧洲化学品管理局进行

土耳其建世界第三大种子基因库

  土耳其将在首都安卡拉建造世界第三大种子基因库,可保存25万种植物的基因。   土耳其农业和农村事务部部长穆罕默德·迈赫迪·埃克尔说,土耳其的种子基因库将成为世界第三大种子基因库,仅次于美国和中国的种子基因库。它将从国内外收集并保存种子,用于科学实验,帮助土耳其开发农业潜力。   埃克尔说,土

NGS测序中DNA质量对建库结果的影响

NGS测序中的常规类文库主要针对全基因组测序,广泛应用于各类物种的重测序、遗传变异检测、BSA性状定位、遗传图谱构建、群体进化、全基因组关联分析、质粒&线粒体&叶绿体测序、宏基因组测序、小片段测序等领域。NGS测序涉及提取、建库、上机多个环节,每一步都会影响最终的数据质量。很多老师在收到质检报告后,

默沙东在华扩张提速-同时建人才库和造新厂

  全球第二大药企默沙东今天在上海宣布,与复旦大学管理学院合作成立企业人才储备库,培养更多本土制药管理人才,并宣布位于杭州耗资近10亿人民币的最大规模新厂已正式动工。另外,默沙东已有部分药品进入医保目录,个别药品也在华降价以适应中国市场获得更多销量,默沙东在华扩张全面提速。  根据默沙东和复旦大学的

数字PCR在-二代测序辅助建库的应用

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可大大降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。

为什么建库要将dna打断到200bp左右

现有的高通量测序平台(主要是illumina)在直接测序时只能测出200bp长度的序列,因此建库方案是,先将DNA片段化为200bp,然后测序,最后将序列拼接。

华大科技DNA建库起始量低至200ng

  华大基因旗下全资子公司――华大科技服务有限公司(简称“华大科技”),18日在福尔马林固定石蜡包埋组织样本测序技术上再获新突破,成功推出FFPE全基因组外显子测序(WES)技术。   目前,科研人员已成功实现外显子测序DNA建库起始量低至200ng,测序质量与正常样本相近,这将有助于更好地解读F

赣建食品安全专家库-首批229名专家确定

  记者3日从江西省食品安全协调领导小组办公室了解到,江西省食品安全专家库日前组建完毕,首批确定229名食品安全专家。  据介绍,江西省食品安全专家库共分为食用农产品、食品污染物、食品添加剂、食品安全政策法规等9个专业组,涉及食品安全管理、法学、公共卫生、医学、食品检验检测、分析化学、仪器

FastAmp基因扩增仪在Y染色样本建库的应用

自2020年2月6日召开联防联控发布会之后,各个村庄、路口、学校、单位设置了体温检测,体温正常与否是目前比较简单易得的有效判断依据,一旦体温确认超过37.3℃,马上就有会安排到隔离区,并且你有可能会被要求隔离14天。由此看见,温度对当前疫情的重要性,随时牵动了一个小区或者一个片区几万人的神经。温度对

达沃斯:王健林想开连锁医院,IBM要建全球医疗数据库

  今年的1月17日,瑞士达沃斯又一次迎来了全球政界、商界的领袖。17日至20日之间,达沃斯会举办400多场对话活动,这群全世界最有影响力的人将围绕全球治理体系、振兴全球经济等议题展开讨论,而随着医疗行业在全球持续升温,自然也成为了论坛上的一大话题。动脉网在此整理了达沃斯论坛上的一些行业讨论和新消息

我国科学家开发出转录组快速建库新方法

  北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显着提升。  核糖核酸(RNA)是存

西南大学建4个跨学科新型高端智库-开展重大研究

  按照“立足新时代、引领新常态、推动新发展”的思路,日前,西南大学充分调动、整合校内外研究力量,组建“西南大学‘一带一路’研究院”“西南大学意识形态安全与文化发展战略研究院”“西南大学乡村振兴战略研究院”“西南大学民族研究院”4个示范性跨学科新型高端智库,开展跨学科重大研究。研究院对接国家重大战略

基因建库突破性进展,助力我国精准医疗大有可为

  随着十三五规划和国家健康2030纲要的陆续出台,我国政府也在不断加大对精准医疗的支持力度。P4 China国际精准医疗大会在十三五规划国家精准医疗计划开启元年隆重举办,旨在汇聚政、产、学、研、资各方力量,并将政策、监管、资本、技术、应用、商业整合在一个平台,进一步探讨从系统生物学研究、精准诊断的

微缩化技术在宏基因组测序建库中的应用

2020年伊始,突如其来的新冠疫情牵动着每个人的心。自武汉卫健委首发肺炎疫情情况通报后的短短一个星期,新型冠状病毒就在实验室中被检出,并获得了该病毒的全基因组序列。如此快速地确定病原体抢占研究先机,宏基因组测序技术功不可没。 宏基因组学(Metagenomics),以环境样品中的微生物群体为研究对象

北大博士患渐冻症-医学专家呼吁建罕见病细胞库

  25日,安徽一家研究机构已经获得北大“渐冻症”娄滔博士的血液样本,并为其制备细胞株,着手建相关疾病模型中。记者采访获悉,这将需要数月的时间,才能完成相关实验。  近日,29岁北大女博士娄滔的一则遗嘱引来社会关注和热议。娄滔在2015年患上渐冻症,日前在她清醒的时候留下:死后将器官捐献,头部可留给

国家基因库二期将在山中选址建“地下冷库”

科技日报深圳5月8日电 (记者张盖伦)位于深圳大鹏的国家基因库,是继美国、欧盟和日本之后,全球第四个也是最大的综合性基因库,被称作中国的“诺亚方舟”“种子银行”。8日,记者从国家基因库了解到,国家基因库二期正在建设中。 国家基因库包括“三库两平台”。“三库”指的是干库(生物信息数据库),湿

动物所等开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术

基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但会引

英东研究院落户南沙将投1.6亿建基因库

南沙咨询科技园会议中心昨日(6日)举行了香港科大霍英东研究院四个新研究中心落户仪式。四个新研究中心分别是高分子成型过程及系统中心、应用基因组研究中心、生物工程及生物医疗设备中心和绿色产品及加工技术研究中心。香港科大霍英东研究院面积6000平方米,于今年初投入使用。该院新校区的设计图已初步完成,将于明

科研人员开发出低DNA用量、无扩增的PacBio建库技术

  基因组信息在生命科学研究中具有重要价值。基于三代长读长的测序组装越来越广泛地应用于基因组学研究。其中,PacBio高保真测序技术因高精度的测序质量被认为是三代测序的金标准。然而,PacBio标准建库方法需要大量DNA输入,限制了其在小型昆虫或珍稀样本中的应用。DNA扩增虽然可以降低样本输入量,但

三次飞跃!半年攻克千个细胞HiC建库大关!

  降低建库起始量一直都是安诺Hi-C产品的研发重点之一,2019年以来,安诺三维基因组学研发团队披荆斩棘、坚持不懈,用半年的时间攻克了千个细胞Hi-C建库大关,实现了降低Hi-C建库起始量的三次飞跃,成功将Hi-C建库起始量由500万个细胞逐渐降低至1千个细胞,率先实现了微量细胞样本Hi-C建库的

FBI计划斥资10亿美元建世界最大人类生物资料库

美国联邦调查局(FBI)计划斥资10亿美元建设世界最大的人类生物资料库,以协助政府有关部门识别本国犯罪嫌疑人、外国间谍或恐怖分子。 然而,据美国《华盛顿邮报》12月22日报道,不少人反对此项计划,对人眼虹膜形态、脸形、指纹等生物资料的真实性和可靠性提出质疑。 世界最大 FBI即将着手建设的生物资料库

谷歌云服务助力自闭症研究-建最大自闭症基因库

       10 日,美国谷歌(Google)公司和自闭症代言人组织(Autism Speaks)宣布开展合作,由谷歌为后者的自闭症基因研究提供云服务,帮助其应对管理、分析和分享基因组数据方面的挑战。自闭症代言人组织表示,这项合作将推动自闭症基因研究,有助实现突破。  自闭症代言人组织是

四川将投入500万元建食药品统一数据库

  从四川省食品药品监督管理局获悉,四川今年将投入500万元建设覆盖省、市、县、乡四级的食品药品监管统一数据库,初步实现白酒、婴幼儿乳粉等重点食品全程可追溯。  2015年10月,四川省出台了关于食品安全追溯体系建设的指导意见,要求搭建全省食品安全综合追溯平台,制定技术规范、统一技术标准,并开发食品

仅需10万个细胞!“升级版”HiC技术,大大降低建库门槛

  作为遗传物质的载体,染色体在细胞中并不是随机分布的。近年来,越来越多的研究开始关注染色体的空间结构。大量证据表明,染色体构象与基因表达、DNA复制、DNA损伤修复以及基因组的稳定性密切相关。  Hi-C是近年发展起来的三维基因组学研究利器,由高通量测序技术(High-throughput seq

上海交大获全国自动化建库挑战赛一等奖

  近日,由华大智造携上海市遗传学会、解码(上海)生物医药科技有限公司等联合主办的全国自动化建库挑战赛落下帷幕。 本次赛事共有32家单位58位选手的报名,历经为期3个月的培训、实操和考核筛选,横跨中国两大赛区3大赛场。最终,由赵明珠、肖璐、李红梅组成的上海交通大学分析测试中心赛队获得一等奖。大赛

珀金埃尔默助力百迈客打造NGS建库全自动生产线

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497508.shtm3月30日,珀金埃尔默生命科学和诊断业务宣布与百迈客生物深化合作,助力百迈客打造基于NGS(二代测序)建库的全自动生产线。此次推出的百灵2000采用珀金埃尔默platehandler