数字PCR在二代测序辅助建库的应用

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可大大降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。......阅读全文

数字PCR在-二代测序辅助建库的应用

目前靶向测序建库方法包括扩增子方法,在均相溶液中,当扩增引物增加时,由于扩增引物之间的相互作用,从而影响扩增的效率;如果将其分散到大量微液滴中扩增,将可大大降低引物间相互作用,提高扩增效率。同时还可以实现对于少量模板的有效扩增,得到更多的有效测序数据。

Vitae-120-NGSSA建库仪在单细胞测序建库中的应用

为什么要进行单细胞测序?传统的测序是以组织为单位进行的测序,所得的测序结果是多个细胞的平均值,无法精确到单个细胞的遗传信息;而实际上,细胞与细胞之间由于存在异质性,即便在肿瘤组织中,肿瘤组织中心的细胞、周围的细胞、以及出现远端转移的细胞,在基因组和转录组水平上的遗传信息也是有差异的。而单细胞测序是在

微缩化技术在宏基因组测序建库中的应用

2020年伊始,突如其来的新冠疫情牵动着每个人的心。自武汉卫健委首发肺炎疫情情况通报后的短短一个星期,新型冠状病毒就在实验室中被检出,并获得了该病毒的全基因组序列。如此快速地确定病原体抢占研究先机,宏基因组测序技术功不可没。 宏基因组学(Metagenomics),以环境样品中的微生物群体为研究对象

分子诊断:-qPCR、二代测序NGS和数字PCR如何选?

分子诊断是将分子生物学技术应用于疾病诊断的医学分支学科,利用分子生物学技术研究人体内源性或外源性生物分子的存在、结构或表达调控变化,为疾病的预防、预测、诊断、治疗、预后和转归提供信息和决策依据。精准医疗的发展,将持续推动分子诊断的进步。目前常见核酸分子诊断技术涉及三个技术:荧光定量PCR技术(qPC

无需建库,直接测序的测序新技术

  来自英国老牌测序研究机构Sanger研究院,以及英国剑桥巴布拉汉研究所的研究人员发表了题为“Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation”的文章,首

二代测序在肿瘤临床中的应用

二代测序,又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),也叫高通量测序(High-Throughput Sequencing),是相对于传统的桑格儿测序(Sanger Sequencing)而言的。有些文章中可能还会称为大规模平行测序平台(massive

分子诊断3大技术分析:qPCR、二代测序NGS和数字PCR

分子诊断是将分子生物学技术应用于疾病诊断的医学分支学科,利用分子生物学技术研究人体内源性或外源性生物分子的存在、结构或表达调控变化,为疾病的预防、预测、诊断、治疗、预后和转归提供信息和决策依据。精准医疗的发展,将持续推动分子诊断的进步。目前常见核酸分子诊断技术涉及三个技术:荧光定量PCR技术(qPC

核酸分子诊断三大技术:qPCR、二代测序NGS和数字PCR

分子诊断是将分子生物学技术应用于疾病诊断的医学分支学科,利用分子生物学技术研究人体内源性或外源性生物分子的存在、结构或表达调控变化,为疾病的预防、预测、诊断、治疗、预后和转归提供信息和决策依据。精准医疗的发展,将持续推动分子诊断的进步。目前常见核酸分子诊断技术涉及三个技术:荧光定量PCR技术(qPC

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

二代测序及其应用

二代测序为高通量测序,采用微珠或高密度芯片边合成边测序,代表有454,solexa,solid,高通量,可一次获得数G数据,相对与第三代,都仍然需要扩增的方法放大信号,扩增后再检测。二代测序应用如下:1、Illumina 原理:桥式PCR+4色荧光可逆终止+激光扫描成像。2、Roche 454:油包

数字PCR在环境监测的应用

 基因目标的环境监测,需要对复杂样品中低浓度的目标进行准确检测。ddPCR每次运行中能创建数千个PCR反应室,带来了目标的准确测定,即使它们浓度很低,因此可以实现对土壤、污水、淤泥、酒泥等为样本的环境生物学研究和病原微生物监测。

二代测序技术在临床诊疗中的应用(二)

二二代测序在心血管疾病诊断中的应用1. 二代测序在心血管疾病研究中的应用潜力巨大:NGS已被证明可成功鉴定出单基因疾病和心血管系统常见疾病的新型致病突变34。NGS在常见心血管疾病(cardiovascular diseases, CVD)中正变得越来越重要,因为与仅提供已知单核苷酸多态性(si

二代测序技术在临床诊疗中的应用(一)

Sanger测序在过去的二十年间是基因组研究的主流方法,取得了包括人类基因组计划(human genome project, HGP)等一系列重大成就,这使得单基因遗传病的鉴定和靶向治疗成为可能1,2。随着基因组大数据时代的到来,尽管Sanger测序是基因检测的金标准,但是NGS)技术应运而

数字PCR在移植排斥监控中的应用

为了降低器官移植中移植物排斥导致的风险,数字PCR技术通过监测受体中移植器官供体的循环DNA水平来检测早期移植排斥。

数字PCR在肠道菌群分析的应用

数字PCR技术直接计算目的序列的拷贝数,对样品中的微生物实现了绝对定量,可用于微生物检测,以便进一步研究肠道菌群的结构、功能以及数量。

数字PCR在早期精准检验疫情的应用

  2016年,全球首例数字PCR动物疫病检测试剂研发成功,包括禽流感、禽流感H7N9、蓝耳病、高致病性美州株、猪的流行性腹泻等动物疫病检测试剂盒。此项技术的推出,将有助于在食品安全的源头及早发现疫情,尽早处理避免更大面积的传染,更好地控制漏检,减少传染人的几率;也将有助于国家建立规范化、规模化的动

数字PCR在病毒临床检测中的应用

概述2015年刚成历史,2016年已在眼前。就这样,年复一年间沧海成桑田。生命科学领域,新方法层出不穷,老方法不断升级,好不热闹。也如孔子的感叹:逝者如斯夫,不舍昼夜。就拿PCR技术来说,荧光定量PCR作为一种进行基因表达分析的技术,截至目前最大的应用市场是病原微生物的核酸体外诊断。展望未来,作为q

数字PCR在基因表达差异研究的应用

数字PCR由于检测时完全不依赖传统的Ct值即可实现真正意义上的绝对定量,因而可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。

数字PCR在基因型鉴定的应用

PCR也可以用于检测一个生物中是否存在某特定DNA序列,这被称为基因型鉴定。例如,基因型鉴定可通过发现样品中是否存在某种群特异性序列来判断样本的真实性。基因型鉴定还可用于法医分析判断在现场发现的DNA样品是否和嫌疑人的吻合,令凶手无处遁形。

数字PCR在食品安全检测的应用

食品安全日益成为一个重要的公共卫生问题, 受到社会及国家的高度重视。食源性疾病、食品原料造假、转基因食品等逐渐呈现出普遍增长的趋势。食源性疾病是指通过摄食而进入人体的有毒有害物质等致病因子所造成的疾病。比如常见的食物中毒、肠道传染病、人畜共患传染病、寄生虫病等。食源性疾患的发病率居各类疾病总发病率的

二代测序原理及应用

二代测序原理及应用如下:一、原理二代测序原理也就是文库构建,PCR产生的片段或基因组打断的片段两端需要添加接头修饰才能进行测序。1、末端修饰。打断的片段是随机断裂,其末端可能是不平的。因此,建库第一步是补齐不平的末端。2、添加接头。经过末端修饰后的DNA片段3’末端具有突出的A尾,而接头具有突出的T

数字PCR在肿瘤治疗的伴随诊断的应用

 常用体液来源(如血液,胸腹水,唾液及尿液等)的待检标本中的DNA,有正常脱落体细胞和病变脱落细胞两种来源,前者的量远大于后者。通过微液滴处理能在每个微液滴中有效减少正常体细胞DNA的干扰,实现肿瘤标记物的有效检测,如EGFR,ALK,ROS1,KRAS、BRAF等基因的突变检测、乳腺癌/胃癌的HE

数字PCR在肿瘤的液体活检中的应用

 肿瘤学研究是数字PCR的重要应用领域,该技术作为极为重要的工具,能够识别DNA突变(例如EGFR)、肿瘤患者用药监控、基因扩增检测、循环肿瘤细胞(CTC)特性研究、长链非编码RNA检测、液体活检中循环的核酸(cfDNA)和肿瘤细胞(CTC)的绝对定量等研究中。

数字PCR在精准医学领域的十大应用

数字PCR是一种新的核酸检测和定量方法,借助微液滴或微坑,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、绝对定量。数字PCR使得反应更灵敏、结果更可靠、展示更直观,尤其适用于微量或痕量DNA检测与定量。下面我们就目前已经比较明确的数字PCR应用方向做个介绍。基因表达差异研究数

数字PCR应用(三)

Fluidigm公司于2006年底推出了基于集成流体通路(IFC)芯片的Bio-Mark™ 高通量基因剖析系统。 其创新在于集成液体通路技术:应用集成电路制造工艺(光刻)在硅片或石英玻璃上刻上许多微管和微腔体,经过不同的控制阀门控制溶液在其中的活动来完成生物样品的分液、混合、PCR扩增。图8. Bi

数字PCR应用(一)

一. PCR的发展历史 PCR技术自问世以来,在遗传病、病原体、癌基因等分子诊断领域和法医鉴定等方面发挥了巨大作用。第一代 PCR在进行扩增后通过凝胶电泳进行定性分析。 随着生物分子荧光技术的发展,1992年实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR, qPCR) 应运

数字PCR应用(二)

4、能够有效区分浓度差异(变化)微小的样品:更好的准确度、精密度和重复性,可以用于精确测定靶基因的相对表达,基因拷贝数变异分析等。图4. qPCR和dPCR的对比 四.dPCR的多指标检测的实现 如同qPCR一样,dPCR中实现多指标的并行检测能显著降低检测成本,获取更丰富的检测信息。 不同于qPC

数字PCR在糖尿病治疗中的应用

    数字PCR技术目前在糖尿病中的研究热点,通过定量检测非甲基化DNA的水平,对I型糖尿病β细胞死亡进行定量,从而监控病情发展。

数字PCR在-药物基因组检测的应用

  能够通过PCR技术实现药物基因组的检测,提高合理用药水平,具有通量较高,操作简单,仪器设备易普及等优点。    数字PCR冷知识:胎儿性别不是只有B超可以看出来,一只精通数字PCR的科研狗,也可以测出来。

Nacia数字PCR在基因表达分析中的应用

华盛顿大学医学院儿科和加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院儿科的研究人员建立了一个稳定可靠的基于RNA磁珠提取和数字PCR的方法,可从粪便样本中检测与EE(热带肠病)关联的人mRNA,灵敏度可达20拷贝GAPDH mRNA/200mg粪便样本。已有报道表明病人粪便中存在人mRNA,可作为反应病人消化道病