CellRep：DNA序列重复会引发遗传性疾病
近日，来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示，DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定，最终会引发遗传性疾病的发生，比如Freidreich征和亨廷顿病等，相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。 研究者认为，当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复序列，然而最新研究显示这种长的核苷酸序列重复也发生在转录的过程中。研究者Sergei Mirkin教授表示，我们目的是揭示转录和DNA重复扩张之间的关系，当包含DNA重复的DNA片段处于活性转录阶段时其就更易于促进DNA重复发生扩张。 在我们机体的DNA中存在着许多重复的碱基团，比如GAAGAAGAA或CGGCGGCGG，这些碱基团非常稳定，其短时间存在对机体并没有伤害；然而其会发生偶然性地拉伸，从而这种碱基的扩展就会引发基因组稳定性及基因表达的剧烈改变，进而引发许多人类疾病。 这项研究中研究人员利用面包酵母进行研究监测了其细胞中......阅读全文
基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展
近日，在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下，基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究，以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Ev
基因重复的研究进展
基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究，揭示了基因重复对生
分子的重复机制逆转录转座子
复制中的逆元件或逆转录病毒侵入细胞时，病毒蛋白通过将RNA逆转录为DNA来复制其基因组。如果病毒蛋白异常附着于细胞mRNA，可以逆转录它们成为返座基因（Retrogenes）。返座基因通常缺乏内含子序列，并且通常含有整合到基因组中的poly序列。与其亲本基因序列相比，许多返座基因的基因调控的有明显的
2％研究论文都出现图片重复
学术论文中的图片数据反复出现在多张图表或者数据中，这种情况并不少见，匿名评论同行评审网站 PubPeer上就爆出过多起图片重复的事件。4月20日BioRxiv发布的一项研究指出了重复图片的出现率有多高，比如Western blots实验的图片，就有3.8%的论文中出现图片重复。 细胞生物学家D
癌症研究通过可重复性实验
一个旨在检测癌症生物学可重复性的项目近日公布了第二批验证结果，这一次它带来的是好消息：两篇重要癌症论文的绝大多数实验可以被重复。 最新可重复性研究于6月27日发表于开放获取在线生命科学期刊eLife，它们紧随今年1月对5篇论文进行可重复性验证之后。此前就高影响力癌症研究能否被重复的验证产生
关于基因重复的研究进展介绍
基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究，揭示了基因重复
癌症研究通过可重复性实验
图片来源：Adva/Flickr (CC BY-NC 2.0) 一个旨在检测癌症生物学可重复性的项目近日公布了第二批验证结果，这一次它带来的是好消息：两篇重要癌症论文的绝大多数实验可以被重复。 最新可重复性研究于6月27日发表于开放获取在线生命科学期刊eLife，它们紧随今年1月对5篇论文进行可
旋转滴方法研究界面扩张流变性质
摘要：采用旋转滴方法，对2-丙基-4,5-二庚烷基苯磺酸钠（DHPBS）在癸烷-水界面上的扩张流变性质进行了研究，较为详细地介绍了SVT20N视频旋转滴张力仪的装置和实验方法，考察了油滴注入体积、基础转速及振荡振幅等试验条件对扩张模量的影响。研究结果表明，旋转滴方法是一种研究扩张流变性质的新型手段，
Cell－Rep：DNA序列重复会引发遗传性疾病
近日，来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示，DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定，最终会引发遗传性疾病的发生，比如Freidreich征和亨廷顿病等，相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。 研究者认为，当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复
Cell－Rep：DNA序列重复会引发遗传性疾病
近日，来自塔夫斯大学的研究人员通过研究揭示，DNA链中长的核苷酸重复会导致基因组的不稳定，最终会引发遗传性疾病的发生，比如Freidreich征和亨廷顿病等，相关研究刊登于国际杂志Cell Reports上。 研究者认为，当细胞分裂或细胞中DNA修复机制激活时就会在DNA复制过程中形成长的重复
生物物理所揭示基因组重复序列Alu调控转录新机制
7月12日，中国科学院生物物理研究所薛愿超团队在《自然》（Nature）上，在线发表了题为Complementary Alu sequences mediate enhancer-promoter selectivity的研究论文。 转录调控在维持细胞功能和正常发育过程中起着关键作用。其中，增
研究揭示重复性脑创伤典型特征
近日，英国研究人员描述了一种由重复性头部创伤（如运动伤害）引起的神经退行性疾病中的蛋白质组装。慢性创伤性脑部病变（CTE）的特征是tau 蛋白累积聚合，类似阿尔茨海默病一样。这项新研究表明，虽然影响这两种疾病的是同一种tau 蛋白，但CTE 中的tau 组装与阿尔茨海默病中的略有不同。以上发现证
BioTechniques：如何提高iPS研究的重复性
生命科学中的重复性一直都是个敏感话题。至于诱导多能干细胞（iPS），因未来可能涉及到临床应用，其重复性更加引人关注。在这一期的《BioTechniques》上，Jeffrey Perkel就介绍了研究人员通过哪些方式来应对这一问题。 Perkel首先谈到了试剂困境。没有人会怀疑iPS过程本身，
研究人员揭开硝酸甘油扩张血管机理
据奥地利新闻社报道，奥地利格拉茨大学等机构的研究人员日前发表报告说，他们发现了硝酸甘油扩张血管的作用机理，有望在未来大幅提高这类血管扩张药物的疗效。 硝酸甘油等硝酸盐类血管扩张药物目前主要用来治疗心绞痛等症状，但长期使用会因患者产生耐受力而失效。 研究人员发现，硝酸甘油扩张血管的功能
中国科大基因转录调控研究取得进展
近日，中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现，秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55，共调控包括cAMP通路、微小RNA（microRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）等在内的数以千计的靶基因的表达，从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《
研究揭示人胚胎发育转录组
原始态（Naïve state）多能性相关研究是近年来干细胞及重编程领域的研究热点和难点，与传统的primed状态相比，Naïve态捕获了体内植入前胚胎发育的阶段，具有更强的可塑性，在早期胚胎发育研究及未来临床应用中具有更广阔的前景。在近10年的研究中，科学家们取得了一系列重要进展，已建立了较为
空间转录组学研究案例简析
01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1]影响因子：11.878发表时间：2018.06发表期刊：Nat Commun肿瘤内异质性是当今癌症治疗中最大的挑战之一。在这里，研究人员使用空间转录组学（ST）技术研究整个多灶性前列腺癌的全组织基因表达异质性。利用一种新的去卷积方法，分析12个区域的近6
Science：5篇顶级癌症研究文章重复率差！
Science日前报道了癌症生物学领域重现性项目（Reproducibility Project:Cancer Biology）指出该领域中一些高影响力癌症研究文章可重复性非常差。其中，第一阶段的5篇备受瞩目的癌症研究文章，在严格按照原始研究的实验Protocol下进行重复性验证后，发现只有两篇
这项研究遭多次反转，终极办法只有重复实验？
针对一项关于现代人起源的重要研究，中外学者在顶刊上展开了多次争锋。 2021年2月9日，美国《国家科学院院刊》发表了南京大学副教授孙雪峰等研究论文《古DNA和多种测年方式证实现代人晚到达中国南方》。该研究使用古DNA和多种测年方式证实，现代人抵达华南地区不超过六万年。 这一结果推翻了2015
研究解析玉米胚乳灌浆期细胞扩张的分子机理
11月27日，Molecular Plant在线发表了来自中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员巫永睿研究组题为The O2-ZmGRAS11 transcriptional regulatory network orchestrates the coordination of cell ex
新研究揭示前所未知的史前人类大扩张
在史前人类的扩张历程中，许多人都听说过著名的“走出非洲”，但一项最新基因研究显示，在约5万年到4万年前，还存在一次前所未知的大规模扩张，从人口意义上讲比“走出非洲”的规模要大得多。 英国桑格研究所29日发布公告说，该机构研究人员对来自非洲、欧洲、亚洲和美洲各地的男性Y染色体进行了基因分析。
研究发现城市扩张会造成旱地自然生境质量损失
近日，北京师范大学教授何春阳带领的团队研究发现，城市扩张会对全球旱地自然生境造成质量损失。相关研究成果发表于《自然可持续》。 研究指出，近年来，世界各地的城市地区迅速扩张，影响了脆弱的自然栖息地，包括旱地的脆弱自然栖息地，并威胁到联合国可持续发展目标15“陆地生命”的实现。旱地城市扩张可以通过将
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat C
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下，中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 转录复合体将DNA转录
Cell新突破：CRISPR技术助力转录调控研究
CRISPRs 技术成为了最近的新宠儿，这种基因组编辑技术更易于操作，也具有更强的扩展性，近期来自加州大学旧金山分校，伯克利分校等处的研究人员发表了题为 “CRISPR-Mediated Modular RNA-Guided Regulation of Transcription in
前沿：空间转录组学研究案例简析
上一期，我们介绍了空间转录组测序产品，对于它的优势和特点进行了总结。这么一款优秀产品，用起来到底好不好使呢？我们从现有在疾病研究中发表文章略窥一二。 01空间转录组研究解析前列腺癌异质性特征[1] 影响因子：11.878 发表时间：2018.06 发表期刊：Nat
植物转录起始调控机制研究获进展
在国家自然科学基金面上项目和青年项目的资助下，中国科学院华南植物园研究员陈琛团队联合广东省农业科学院研究员刘军、加拿大农业部伦敦研发中心研究员崔玉海在植物转录起始调控机制研究方面取得新进展。相关研究近日发表于《核酸研究》（Nucleic Acids Research）。 转录复合体将DNA转录
单细胞转录组重要研究文献汇总（一）
1.单细胞测序用于生殖领域研究持续火热精子生成过程是一个复杂又具有严格分化过程的生理过程，继18年10月份《Cell Research》上的成年人睾丸转录组图谱研究[1]和19年2月份《Cell Reports》上新生与成年人睾丸细胞单细胞水平鉴定分类[2]的步伐，本月在《Nature
研究揭示细菌固有转录终止的结构基础
1月12日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心合成生物学重点实验室张余研究团队、美国威斯康辛大学麦迪逊分校Robert Landick团队与浙江大学冯钰团队合作，在《自然》（Nature）上，发表题为Structural basis for intrinsic transcription ter
单细胞转录组重要研究文献汇总（二）
4.单细胞转录组测序在植物领域崭露头角相比动物的单细胞研究，由于植物具有细胞壁的特点，使得植物的单细胞研究相比较难，但是继2月份的拟南芥根组织单细胞转录组学研究[8]，本月在《Developmental Cell》上又发表了一篇基于拟南芥根组织的单细胞转录组学研究报道[9]。来自德国图宾根大学植