基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展
近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Evolutionary Bioinformatics杂志发表。 基因组重复序列(Repetitive Sequence,RS)是复杂且进化活跃的,其对基因和基因组结构的稳定和动态性有着很大影响,并且与生物学功能密切相关。处于不同基因结构区域如外显子、内含子和基因间区的重复序列受到不同程度选择压力的影响。一般来说,这些序列重复的DNA片段通常被分为两类:即卫星序列(Satellite Sequences,SSs)和转座元件(transposable elements,TEs)。目前,许多脊椎动物的基因组测序工作已经完成,这为研究不同......阅读全文
全部脊椎动物基因组测序再上路
为了获得更多的关注和支持,研究人员迫切希望对所有脊椎动物的基因组进行测序。近日,科学家正式启动了脊椎动物基因组计划(VGP),发布了14个物种的15个高质量基因组。但该计划仍远未筹集到所需资金,以记录地球上约6.6万种脊椎动物的基因组。 这个项目已经进行了3年,其前身是2009年启动的基因组1
基因组所重复序列与哺乳动物内含子扩张关系研究获进展
近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员和“百人计划”雷红星研究员的指导下,基因组所王大鹏博士、博士研究生苏尧等科研人员在哺乳动物基因组内含子扩张与基因功能关系研究,以及突变和自然选择在基因组进化中的作用研究中取得新进展。相关学术论文在Ev
“万种脊椎动物基因组计划”宣布启动
拟两年解码101种物种 建立遗传信息数据库 深圳华大基因研究院与“万种脊椎动物基因组计划”联盟(G10KCOS)的科学家联合宣布启动万种脊椎动物基因组一期计划。该计划将依托华大基因先进的新一代测序技术平台、前沿的信息分析和数据处理能力,在未来两年内完成对101种脊椎动物的全基因组测序,解析
基因组所小内含子进化机制研究获得新进展
插入删除数目和比值 近日,在中国科学院北京基因组研究所副所长、中国科学院基因组科学与信息重点实验室主任于军研究员的指导下,该重点实验室博士生王大鹏通过对人类千人基因组计划数据的比较分析,进一步证实了两种DNA组分特殊效应在人类基因组中的存在,使该研究组延续十几年的小内含子基本功能和
基因组研究显示七鳃鳗独立于其他脊椎动物进化
一个国际研究团队在新一期《自然·遗传学》杂志上说,他们成功破译了原始鱼类七鳃鳗的基因组,发现这种动物拥有诸多不同于其他脊椎动物和更原始的无脊椎动物的基因特征,这表明七鳃鳗是独立进化而来的。 七鳃鳗又称八目鳗,属于无腭纲,它们的嘴呈圆筒形,没有上下腭。从进化角度看,七鳃鳗处于接近脊椎动物祖先
新研究实现脊椎动物基因组复制的可视化分析
近日,中山大学海洋科学学院副教授卢建国团队成功构建脊椎动物基因组复制数据库DupScan和一站式分析平台,实现了脊椎动物基因组复制的的可视化分析。相关研究发表于Nucleic Acids Research。卢建国副教授为该论文第一作者和通讯作者,硕士研究生黄沛霖为第二作者,南开大学计算机学院刘健教授
关于内含子归巢的第Ⅱ类内含子介绍
在第Ⅱ类内含子中大部分开放读框都具有一个与反转录转座子相关的区域(除核酸内切酶编码区之外)。这种类型的内含子在低等真核生物和某些细菌中都有发现。反转录酶对于内含子来说是特异的,而且和归巢有关。反转录酶以初始mRNA为模板合成内含子的DNA拷贝,通过采用与反转录病毒相似的机制使内含子插入到靶位点中
PLoS-Genet:科学家深度解析基因组的“黑暗面”:内含子
近日,一项刊登在国际杂志PLoS Genetics上的一篇研究报告中,来自纽卡斯尔大学等机构的科学家们通过研究揭示了内含子突变与人类种群变异之间的直接关联;科学家们在基因组学研究中所面临的最大挑战之一就是揭示人类基因组的“黑暗面”所扮演的关键角色,这些区域即科学家们尚未找到携带特殊功能的基因组区
内含子的定义
内含子(Intron)又称间隔顺序,指一个基因或mRNA分子中无编码作用的片段 。是真核生物细胞DNA中的间插序列。这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因。在前体RNA中的内含子常被称作“间插序列”。在转录后的加工中,它比
内含子的特点
特点内含子(introns)在转录后的加工中, 从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。大多数真核结构基因中的间插序列(intervening sequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子这个
关于内含子归巢的第I组类内含子介绍
第I组内含子具有编码核酸内切酶的开放续框;有时成熟酶的活性和此蛋白有关。第II类内含子具有编码核酸内切酶和反转录酶式的序列,另外成熟酶的活性也与此蛋白有关。在有些情况下还具有与其它酶活性相关联的成熟酶功能的遗传信息,成熟酶主要功能是使内含子的构象稳定,这于剪接来说是很必要的。 现已知道有些
核内含子的概念
中文名称核内含子英文名称nuclear intron定 义存在于核基因中的、隔开外显子的、但转录后须经加工切除的序列。核内含子的5′端和3′端分别具有保守的GT和AG序列,为内含子被剪接除去的识别位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
内含子起源的假说
内含子起源有两种假说。1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了内含子。
简述内含子的相位
内含子可以在转录抄本的任何位置,甚至在以后成为密码子的三核苷酸之间。若内含子位于一密码子的第三位核苷酸和另一密码子的第一位核苷酸(即两密码子之间),则被称为0位内含子。相应地,位于一密码子第一第二位核苷酸之间的内含子被称为1位内含子,位于第二和第三位之间时,则被称为2位内含子。这在外显子复制中很
内含子的类型介绍
根据剪接过程为自发还是要经过剪接体的加工,人们将内含子分为自剪接和剪接体内含子。自剪接内含子:在1981年由汤玛斯·切希发现的自剪接内含子中,又分为:Ⅰ型内含子与Ⅱ型内含子。剪接体内含子:这类内含子的剪除要有剪接体的帮助。一段序列在剪接中是内含子还是外显子,取决于其自身。GT-AG-内含子:最常见的
昆明动物所在食肉目分子系统学方面取得新进展
食肉目犬型超科(Caniformia)各科间的系统发育关系一直是近年来食肉目系统发育关系研究的热点,至今仍处于众说纷纭的状态,尤其是小熊猫科的系统发育位置。小熊猫因其似熊非熊的形态特征,使得它的进化地位存在很大的争议,无法得到解决。 中国科学院昆明动物研究所张亚平院士、云南大
令人吃惊的最古老DNA
来自加州大学伯克利分校,美国能源部基因研究所(U.S. Department of Energy Joint Genome Institute-- DOE JGI),挪威卑尔根大学等处的研究人员发现地球上最古老的动物物种之一:海洋海葵的基因组与脊椎动物的基因组存在令人惊讶的相似性。 而且这一研究也
内含子早现的定义
中文名称内含子早现英文名称introns early定 义认为内含子非常古老,早就出现在进化早期的基因中,现正逐渐从真核基因组中丢失的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)
关于内含子的起源介绍
内含子起源有两种假说。 1.内含子与它所在的基因一样古老,在装配第一个这样的基因时,内含子就已存在。早期的内含子具有自催化、自我复制等能力,因此,它们是原始基因和基因组的组织与复制必不可少的部分。而原核生物和少数低等的真核生物,由于它们需要进行快速的DNA复制从而进行快速的细胞分裂,因而失去了
内含子迟现的概念
中文名称内含子迟现英文名称introns late定 义认为内含子是在近期演化中才出现的,在真核基因组中逐渐积累的假说。应用学科遗传学(一级学科),进化遗传学(二级学科)
细胞化学词汇核内含子
中文名称:核内含子英文名称:nuclear intron定 义:存在于核基因中的、隔开外显子的、但转录后须经加工切除的序列。核内含子的5′端和3′端分别具有保守的GT和AG序列,为内含子被剪接除去的识别位点。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
关于内含子的定义介绍
内含子(Intron)又称间隔顺序,指一个基因或mRNA分子中无编码作用的片段 [1] 。是真核生物细胞DNA中的间插序列。这些序列被转录在前体RNA中,经过剪接被去除,最终不存在于成熟RNA分子中。内含子和外显子的交替排列构成了割裂基因。在前体RNA中的内含子常被称作“间插序列”。在转录后的加
关于内含子的特点介绍
内含子(introns)在转录后的加工中, 从最初的转录产物除去的内部的核苷酸序列。术语内含子也指编码相应RNA内含子的DNA中的区域。 大多数真核结构基因中的间插序列(intervening sequence)或不编码序列。它们可以转录,但在基因转录后,由这些间插序列转录的部分(也可用内含子
基因解码揭示人类无尾之谜
纽约大学格罗斯曼医学院(NYU Grossman School of Medicine)的研究人员进行的一项新研究表明,我们远古祖先的基因变化可以部分解释为什么人类不像猴子那样有尾巴。这项研究成果最近发表在《自然》(Nature)杂志上,研究人员比较了无尾猿和人类与有尾猴的DNA,发现猿类和人类都有
无脊椎动物和有脊椎动物的红细胞的相关介绍
无脊椎动物 在无脊椎动物中具有红细胞,只限于海生动物,如螠虫、光裸星虫、绿纽虫、海豆芽、扫帚虫、魁蛤、海棒槌等。涉及到各门约有100种,但也有的和白血球并没有明显区别,不过和脊椎动物的红细胞则有明显的差异。 有脊椎动物 脊椎动物中哺乳类的红细胞,是中心部凹陷的圆饼状,在造血组织中(的成红血
羊膜脊椎动物的概念
中文名称羊膜脊椎动物英文名称amnion vertebrate定 义胚胎发育过程中胎儿体外包有羊膜的脊椎动物。爬行类、鸟类、哺乳类均属羊膜动物。由外胚层和中胚层发育而成的羊膜,提供了一个水性环境,从而保证胚胎细胞的正常生长和发育。应用学科遗传学(一级学科),发育遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇内含子
断裂基因的非编码序列,在mRNA加工过程中被剪切掉,故成熟mRNA上无内含子编码序列。内含子可能含有“旧码”,就是在进化过程中丧失功能的基因部分。正因为内含子对翻译产物的结构无意义,不受自然选择的压力,所以它比外显子累积有更多的突变。中文名称:内含子英文名称:Intron;Intervening r
什么是内含子的归巢?
内含子的归巢intron homing 在I类II类的某些内含子中含有开放阅读框,可产生具有三种功能的蛋白。这些蛋白可使内含子(或以其原来的DNA形式,或作为RNA的DNA拷贝)移动(mobile),使内含子可插到一个新的靶位点,这个现象叫做归巢(homing)I组和II组内含子分布很广。
内含子归巢的功能简介
在这些内含子的开放续框中编码具有三种功能的蛋白,这些蛋白与DNA或RNA的代谢有关。 (1)核酸内切酶:在DNA的靶位点剪切,使内含子得以插入; (2)反转录酶:涉及将内含子RNA变成DNA拷贝; (3)成熟酶:从前体的RNA中切掉内含子的部分。
中山大学完成3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列测定和分析
日前,中山大学海洋学院教授何建国及其项目组完成了3个脊椎动物虹彩病毒全基因组序列的测定和分析。在此基础上,他们提出了虹彩病毒的一个新属,并找到该病毒里3个与鱼类免疫信号传导系统相互作用的基因。在鳜鱼(俗称桂花鱼)、石斑鱼、大黄鱼等多种养殖鱼类中频繁流行,对鳜鱼的致死率接近100%,对石斑鱼、美国