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近日，中国科学技术大学生命科学学院教授单革实验室研究发现，秀丽线虫中两个高度保守的转录因子UNC-30和UNC-55，共调控包括cAMP通路、微小RNA（microRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）等在内的数以千计的靶基因的表达，从而调控D型运动神经元的发育和可塑性。研究论文近日发表在《发育细胞》（Developmental Cell）上。 为了获知这两个转录因子在D型运动神经元中的所有靶基因，该实验室首先利用CRISPR-Cas9技术将GFP分别插入到unc-30和unc-55基因的末端，得到表达UNC-30::GFP和UNC-55::GFP融合蛋白的秀丽线虫，再对利用所获秀丽线虫进行ChIP（染色质免疫共沉淀）实验。通过对原有ChIP实验方法进行改进和优化，克服了两个转录因子秀丽线虫中表达量小、表达时间窗口短、表达的D型神经元细胞占秀丽线虫细胞比例少（约占2%）等瓶颈，完成了ChIP实验，拿到了可供高通量测序（......阅读全文
1. 真核生物表达的优越性和必要性① 真核生物具有转录后加工系统，可识别并删除基因中的内含子，剪切加工为成熟mRNA.②具备完善的翻译后加工系统，可进行糖基化、乙酰化等修饰，使蛋白形成正确的天然构型，因而真核生物表达系统产生的蛋白更接近天然状态，有利于其功能、生物活性的研究。③某些真核细胞可将基因表
（3）原核生物的基因组基本上是单倍体，而真核基因组是二倍体。（4）如前所述，细菌多数基因按功能相关成串排列，组成操纵元的基因表达调控的单元，共同开启或关闭，转录出多顺反子(polycistron)的mRNA；真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA，即mRNA是单顺反子(monocistron)
2002年日本学者Okazaki在对小鼠cDNA文库进行测序时，第一次发现并鉴定了一类较长的转录产物，并将其命名为长链非编码RNA，也就是我们所知的LncRNA。然而在这种非编码RNA被发现后的很长时间里，由于它不参与蛋白质的编码，当时认为不具有生物学功能，科学家们都普遍认为lncRNA仅仅是基
多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病，最新研究结果表明，胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制，运用基因组DN
多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病，最新研究结果表明，胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制，运用基
多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病，最新研究结果表明，胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制，运用基因组
近日，国际学术期刊《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果，提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型，将基因调控网络的建模研究从编码基因推进
近日，国际学术期刊《美国科学院院刊》（PNAS）在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学、清华大学等单位的科研人员合作的基因调控网络建模的研究成果，提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画顺式调控元件和反式调控元件相互作用的数学模型，将基因调控网络的建模研究从编码基因推进
目的基因的表达调控生命活动丰富多彩、千变万化。但是万变不离其宗，不管如何变化都围绕着中心法则展开。核酸作为遗传物质指导蛋白质的表达，表达产生的一些特殊蛋白（如转录因子、调控蛋白）反过来又对DNA指导合成蛋白质的过程进行调控。对基因表达调控的研究一直是生物学研究热点，涉及到生命活动的各个过程，也是各类
Robustness指一个复杂系统适应和应对内部和外界扰断而行使正常功能的能力。遗传系统健壮性（genetic robustness）指一个生命体能缓冲基因组中有害突变的能力。突变是生命进化的原动力，而有害突变是致死。一个稳定的遗传系统既能缓冲突变同时进行世代更迭，这样本体能维持正常功能，突变在
目前以CRISPR-Cas9为基础的基因编辑及基因调控技术已取得众多成果，除最基本的靶位点DNA切割/修复外，通过将Cas9与不同的因子组合，还可实现靶位点的碱基编辑、表观基因组编辑以及基因表达的激活/抑制。其中表观基因组编辑和基因表达的激活/抑制是通过将失活型Cas9（dCas9）与转录调控因
近期，中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员巫永睿课题组在Plant Cell上，在线发表了题为The B3 Domain-Containing Transcription Factor ZmABI19 Coordinates Expression of Key Factors Require
近些年来，研究人员发现，一些受体酪氨酸激酶 (receptor tyrosine kinase, RTK) 能够出现在细胞核内，可能参与某些基因表达调控，但是具体的分子机制，还未研究清楚【1】。作为一种受体酪氨酸激酶，胰岛素受体 (Insulin receptor, IR) 同样被发现存在于细胞
一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，进行PCR扩增，确认目标基因
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
一、基因敲降的前期准备工作相同 1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。 1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎（通常为48 hpf前的胚胎），提取总RNA，然后进行体外转录（RT）。 1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物，以1.2获得的cDNA为模板，
高世勇*，吕凤，许东旭 （哈尔滨商业大学药物工程技术研究中心，黑龙江 哈尔滨 150076） * 通讯作者：高世勇，研究员 [摘要] 乳腺癌作为一种激素依赖性肿瘤，其发生、发展与雌激素受体的表达密切相关。雌激素可调节多种生理过程，例如细胞生长、增殖、发育和分化。而雌激素受体与雌激素结合可
2月29日，Nature Plants 杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心何跃辉课题组（植物环境表观遗传学实验室）题为Coupling of histone methylation and RNA processing by the nuclear mRNA Cap
芳香化合物广泛存在于自然界，其代谢循环是地球化学元素循环的重要组成部分;同时，作为现代工业的重要原材料，芳香化合物在使用过程中大量排放到环境中，给生态系统带来了巨大压力。微生物经过适应和进化，形成了多种丰富的芳香化合物代谢途径，这些代谢途径的调控机制，是环境微生物学关注的研究热点。 谷氨酸
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶对某
ATAC-seq最近几年是比较火的一种测序技术。那ATAC-seq技术到底什么呢？ATAC-seq的全称是Assay for Transposase Accessible Chromatin using sequencing, 运用测序手段研究转座酶可接近的染色质的一种技术。该技术通过转座酶
最近，中国农业大学国家玉米改良中心田丰教授团队与杨小红教授团队合作研究，以368份玉米自交系未成熟籽粒为实验材料，定位玉米种全基因组水平QTL(数量性状位点），全面解析了其可变剪接的调控机制，并为研究表型变异提供了重要线索。相关论文近日发表在《植物细胞》杂志上。 可变剪接，这个早在上世纪就
可变剪接，这个早在上世纪就被提出的概念，在近几年的研究中，又“火”了起来。科学家们发现，可变剪接不仅丰富蛋白质组多样性，还在生物体内起着重要的调控作用。 可变剪接是什么？这项研究有了什么新发现？是怎样得出来的？实验中的难点是什么？对之后的研究有怎样的借鉴意义？科技日报就此采访了该研究团队。
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制，但是它们可能与人类疾病相关。现在，马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universitätsmedizin Berlin的科学家已经证明，DNA重复序列是否与人类疾病相关，取决于它们在基因组中的位置，序
（3）增强子的位置可在基因5′上游、基因内或其3′下游的序列中，而其作用与所在基因旁侧部位的方向似无关系，因为无论正向还是反向，它都具有增强效应；（4）增强子所含核苷酸序列大多为重复序列，其内部含有的核心序列，对于它进入到另一宿主之后重新产生增强子效应至关重要；（5）增强子一般都具有组织和细胞特异性
来自中科院广州生物医药与健康研究院、吉林大学等机构的研究人员证实，凝集蛋白复合体负向调控了基因组调控蛋白CTCF介导的核糖体RNA基因转录。这项工作发表在7月24日的《生物化学杂志》(JBC)上。 中科院广州生物医药与健康研究院的姚红杰(Hongjie Yao)是这篇论文的通讯作者。其主要
以拟南芥为模式进行的研究表明，basic helix-loop-helix (bHLH) 类型的转录因子MYC2是茉莉酸信号转导途径的核心调控元件。在茉莉酸信号转导过程中，MYC2既作为转录激活因子正向调控早期受伤反应相关基因的表达，又作为转录抑制因子负向调控晚期抗病反应相关基因的表达，但对于M
增强子是真核生物中关键的顺式作用基因调控元件，能有效地促进基因表达。它们可以通过作为转录因子和辅助因子的结合平台来维持转录的精确控制。超级增强子是由一簇典型增强子串联组成的具有更强转录调控能力的顺式元件。而全基因组分析发现增强子和超级增强子可以普遍进行转录，产生eRNA和SE-lncRNA。它们都具
近期，中国科学院生物物理研究所生物大分子国家重点实验室研究员朱冰课题组在eLife上，在线发表题为Sustained TNF-α stimulation leads to transcriptional memory that greatly enhances signal sensitivit
RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”，但越来越多的证据清楚的表明，RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰（RNA interference）的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识，更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具，