DNA酶I足迹分析法

实验方法原理 实验材料 含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脱氧核糖核酸酶I (DNA酶I; EC3.L4.5)分析缓冲液A或B干冰DNA酶I终止缓冲液DNA酶I储存缓冲液甲酰胺加样缓冲液仪器、耗材 10 mL 一次性塑料管硅烷化1.5 mL微量离心管可调节水浴锅(±0. 1℃)12 in×7.5 in大小的玻璃或不锈钢碟有盖子的塑料微量离心管6 mm宽间隔12 mm的DNA测序胶梳平头Hamilton注射器(29-G 用于0.4 mm胶)实验步骤 1)用限制性内切核酸酶消化约5 pmol质粒,使得在距第1个蛋白质结合位点25〜100 bp处产生一个3'凹端2......阅读全文

DNA酶I足迹分析法实验——NA酶I足迹分析法

本分析方法用来检测DNA上特异的蛋白质结合位点。位点上结合的蛋白质可保护 D N A 的 磷 酸 二 酯 键 骨 架 免 于 受 D N A 酶 I 催 化 的 水 解 。 水 解 后 D N A 片 段 在 变 性DNA测序胶上分离,通过放射自显影可使结合位点显示出来。足迹法已进一步发展成为确定D

DNA酶I足迹分析法

实验方法原理 实验材料 含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒 适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol

DNA酶I足迹分析法实验

DNA酶I足迹分析法 用光密度及数值分析法决定蛋白质结合的平衡常数 粗制品的DNA酶足迹分析法             实验方法原理

DNA酶I足迹分析法实验——粗制品的DNA酶足迹分析法

实验方法原理DNA酶足迹分析常用来寻找粗制品中的蛋白质,因而提供了一种在纯化过程中采用的分析方法。通过改变条件,如在反应体系中加入大量的竞争性DNA,或增加反应中盐的浓度,可抑制非特异性的DNA结合蛋白结合到标记的DNA上。实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶10

DNA酶I足迹分析法实验2

实验材料含有DNA结合位点的质粒DNA试剂、试剂盒适当的限制性内切核酸酶100%乙醇及冰冷的70%乙醇TE缓冲液[α-32P] dNTP (3000〜6000 Ci mmol)水溶液1O× Klenow片段缓冲液E. coli DNA聚合酶1的Klenow片段5 mmol L 4dNTP 混合液脱氧

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚/

DNA-酶-I-足迹分析实验

试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针酚 氯仿乙醇聚乙烯醇竞争 DNA 缓冲液 Z'(或缓冲液 Ze)DNA 酶 IMgCl2(10 mmol L) CaCl2(5 mmol L)DNA 酶 I 终止液蛋白酶 K甲酰胺加样缓冲液实验步骤 材料32P-标记 DNA 酶 I 足迹探

DNA-酶-I-足迹分析实验

DNA 酶 I 足迹分析实验             试剂、试剂盒 32P-标记 DNA 酶 I 足迹探针 酚 氯仿

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

DNA 酶 I 足迹探针的制备实验             试剂、试剂盒 TE 牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒 TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液 T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵 乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材 SpeedVac 旋转浓缩器

DNA-酶-I-足迹探针的制备实验

试剂、试剂盒TE牛肠碱性磷酸酶缓冲液T4 多核苷酸激酶缓冲液TBE 加样缓冲液TBE质粒 DNA合适的限制酶粉 氯仿氯仿 异戊醇(3-甲基-1-丁醇)乙醇牛肠碱性磷酸酶[γ-32P]ATPT4 多核苷酸激酶乙酸铵乙酸钠丙烯酰胺双丙烯酰胺过硫酸铵TEMED仪器、耗材SpeedVac 旋转浓缩器实验步骤

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

DNA 酶 I 足迹法对 DNA 上的蛋白质结合位点作图实验             实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

实验材料 新鲜组织、培养的细胞、来自细胞或组织的蛋白成分试剂、试剂盒 细胞匀浆缓冲液细胞重悬缓冲液细胞淋洗缓冲液乙醇Ficoll 400甲酰胺染色液MgCl2 CaCl2 溶液NaClNonidetP-40酚:氯仿磷酸盐缓冲液聚乙烯醇终止液组织匀浆液组织重悬缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I

DNA-酶-I-足迹法对-DNA-上的蛋白质结合位点作图实验

本方案介绍在放射性标记的 DNA 片段上确定蛋白质结合位点的作图方法。本方案使用 DNA 酶 I 切割 DNA, 而在替代方案中是用羟自由基断裂 DNA。如果希望得到优化足迹法反应的建议,请参见本方案最后部分的疑难解析以及优化 DNA 酶 I 足迹法反应的栏目。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)

DNA酶足迹法的功能介绍

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。

DNA酶足迹法的原理介绍

DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

DNA酶足迹法的原理和应用

DNA酶足迹法是一种用来测定DNA-蛋白质专一性结合的方法。用于检测与特定蛋白质结合 的DNA序列的部位,可展示蛋白质因子同特定DNA片段之间的结合区域。其原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移

DNA酶足迹法的基本原理

原理为:DNA和蛋白质结合以后便不会被DNAase分解,在测序时便出现空白区(即蛋白质结合区),从而了解与蛋白质结合部位的核苷酸对数目。在用酶移出与蛋白质结合的DNA后,又可测出被结合处DNA的序列。

DNA聚合酶I的简介

  DNA聚合酶I的二级结构以螺旋为主,可划分为A至R共18个螺旋肽段。螺旋肽段之间由非螺旋结构连接。其中H区与I区之间的无规则结构较长,有50个氨基酸残基,I螺旋与O螺旋之间由较大的空隙,可以容纳DNA链,而50个氨基酸的无规结构,就像一个盖子那样与I、O螺旋区共同把DNA链包围起来,使其向一个方

什么是DNA聚合酶I?

  DNA聚合酶I的二级结构以螺旋为主,可划分为A至R共18个螺旋肽段。螺旋肽段之间由非螺旋结构连接。其中H区与I区之间的无规则结构较长,有50个氨基酸残基,I螺旋与O螺旋之间由较大的空隙,可以容纳DNA链,而50个氨基酸的无规结构,就像一个盖子那样与I、O螺旋区共同把DNA链包围起来,使其向一个方

DNA足迹法介绍

DNA足迹法,中文名称:DNA足迹法英文名称:DNA footprinting定义:检测DNA序列中DNA结合蛋白识别部位的一种方法。

DNA-酶-I-超敏感位点作图

实验材料 真核细胞试剂、试剂盒 缓冲液 AEDTA乙醇裂解缓冲液磷酸盐缓冲液台盼蓝染料DNA 酶 I 稀释缓冲液DNA 酶 I 溶液蛋白酶 K 溶液RNA 酶溶液酚:氯仿SDS 缓冲液TE仪器、耗材 Sorvall H1000B 转头或等价物带螺帽的试管振荡水浴锅实验步骤 材料缓冲液和溶液贮存液、缓

DNA-酶-I-超敏感位点作图

            实验材料 真核细胞 试剂、试剂盒 缓冲液 A EDTA 乙醇 裂解缓冲液

DNA-酶-I-超敏感位点作图

DNA 酶 I 超敏感位点作图法经常用于定位真核基因的调控区。由于还未被理解的原因,基因带有对 DNA 酶 I 切割敏感的分开的序列,而且这些所谓超敏感位点图谱是随基因的激活状态而变化的(Weintrauband Gmudine1976)。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)下册,作者:〔美〕J.

关于DNA聚合酶I的基本介绍

  DNA聚合酶I(DNA-pol I),分子量109kD,为单肽链组成,400分子数/细胞,是原核生物的DNA聚合酶,由于发现最早命名为DNA聚合酶I,其他原核生物的DNA聚合酶,按发现的先后顺序分别命名为DNA聚合酶Ⅱ、DNA聚合酶Ⅲ、DNA聚合酶Ⅳ和DNA聚合酶Ⅴ。

关于DNA聚合酶I的功能简介

  1)通过核苷酸聚合反应,使DNA链沿5’→3’方向延长(DNA聚合酶活性)  2)催化由3’端水解DNA链(3’→ 5’核酸外切酶活性,用于切除错配的碱基)  3)催化由5’端水解DNA链(5’→ 3’核酸外切酶活性,用于切除引物)  4)催化由3’端使DNA链发生焦磷酸解  5)催化无机焦磷酸

DNA足迹法的原理介绍

DNA被蛋白质结合后,由于蛋白质的构象保护,DNaseI不能降解这一结合位点,如果对该DNA进行一端的末端标记,并控制好DNaseI的酶量和作用时间,可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解,这段区域到标记末端的片断是缺失的,对其电泳,可找出蛋白质结合位点的精确位置。

DNA足迹法的基本原理

原理:DNA被蛋白质结合后,由于蛋白质的构象保护,DNaseI不能降解这一结合位点,如果对该DNA进行一端的末端标记,并控制好DNaseI的酶量和作用时间,可将该DNA切割成大小不等的DNA片断而蛋白质保护区域不被酶解,这段区域到标记末端的片断是缺失的,对其电泳,可找出蛋白质结合位点的精确位置。

用大肠杆菌-DNA-聚合酶-I-Klenow-片段及单链-DNA-模板进行...

用大肠杆菌 DNA 聚合酶 I Klenow 片段及单链 DNA 模板进行双脱氧测序实验试剂、试剂盒 dATP去离子蒸馏水EDTA延伸 终止混合液和示踪混合液甲酰胺上样缓冲液Tris-Cl酶和缓冲液大肠杆菌 DNA 聚合酶ⅠKienow 片段核酸和寡聚核苷酸寡核苷酸引物单链 DNA 模板放射性化合物

数据分析介绍(I)-主成份分析法

数据分析介绍(I) 主成份分析法