荧光定量PCR实验中的扩增对照

通常说的阳性对照和阴性对照指的是扩增试剂盒中附带的不需要提取的阳性对照和阴性对照,更准确的定义应该是扩增阳性对照和扩增阴性对照。扩增阳性对照含有阳性扩增模板,扩增阴性对照应含有阴性扩增模板(基质核酸)。扩增对照只能监控每次扩增过程中的扩增系统是否正常,不能监控采样、提取和每份样品的操作过程。如果是检测RNA样品的检测试剂盒,其扩增阳性对照使用质粒,便无法监控反转录过程。......阅读全文

荧光定量PCR实验中的扩增对照

通常说的阳性对照和阴性对照指的是扩增试剂盒中附带的不需要提取的阳性对照和阴性对照,更准确的定义应该是扩增阳性对照和扩增阴性对照。扩增阳性对照含有阳性扩增模板,扩增阴性对照应含有阴性扩增模板(基质核酸)。扩增对照只能监控每次扩增过程中的扩增系统是否正常,不能监控采样、提取和每份样品的操作过程。如果是检

荧光定量PCR实验中的阳性对照和阴性对照

阳性对照和阴性对照是指在相同的处理条件下,比如一份已知的感染样品和一份已知的未感染样品,都进行了提取和扩增最终获得了阳性结果和阴性结果。阴阳性对照强调处理过程与样品一致,并且有明确的预期结果。

荧光定量PCR实验中的核酸提取对照

可以使用内参基因,假病毒混合基质,灭活病毒混合基质来监控提取到扩增的流程。

荧光定量PCR实验中的反转录对照

可以使用提取好的RNA内参基因,RNA假病毒混合基质,灭活RNA病毒混合基质来监控反转录到扩增的流程。无反转录对照(no-RT control)含有除反转录酶以外的所有成分。

荧光定量PCR实验中的空白对照

无模板空白对照NTC是指不含有模板(阳性模板或者阴性模板)的对照。目前的试剂盒的NC一般都是水或阴性缓冲液,所以NC等同于NTC。其实两者有不同的作用。仪器空白对照NTC是含有引物探针和反应液主要监控引物探针,反应体系有没有被污染。这里的仪器空白对照我通常使用的是空反应管来监控仪器有无非特异性的荧光

细数荧光定量PCR中的8种对照

对照的目的是对检测的各个环节进行监控,因此我们按照检测的流程对对照进行梳理。常规荧光定量PCR的流程是:样品采集-运输-样品处理-核酸提取-反转录(RNA病毒)-扩增-结果读取。下面看看各个环节都可以使用哪些对照:1.阳性对照(Positive control,PC)和阴性对照(Negative c

实时荧光定量pcr实验中扩增曲线末尾起跳的原因

末尾起跳原因:(1)阴参曲线末尾起跳,通常表示存在污染;(2)复检样本,排除非特异性扩增的可能性;(3)正常样本也可存在曲线末尾起跳,表示样本浓度低或者加样量不准确。解决方法:排除是否存在污染;复检样本,如果复检后曲线为阴性直线则说明之前的末尾起跳为非特异性扩增,如果复检后曲线仍与之前一致则说明末尾

荧光定量pcr阴性对照的定义

NC的作用在于消除试剂污染的因素~如果NC(无模板)也有扩增曲线那么说明试剂污染较为严重~所谓的阴性就是一定实验后是没有结果的~

荧光定量PCR中扩增曲线能说明什么

在荧光法定量PCR中溶解曲线直接表示了引物的特异性,如果是单一的峰,那么我们要看的是TM值在哪里,通常情况下都是80---90之间,如果太小那可能扩增出来的不是你想要的片段就是引物二聚体,如果两个峰那就说明出现了非特异性扩增

荧光定量pcr的扩增步骤中,退火可以省略吗

一般不单独加退火温度,但其实并不是省略而是合并。一般来说PCR分为变性、退火、延伸三个步骤。变性是高温下DNA双链变成单链,退火是低温下引物跟DNA模板结合,延伸是聚合酶聚合形成新链。退火温度通常随引物Tm值(常为55-60℃)设定,延伸温度则普遍用72度(Taq酶,也就是DNA聚合酶活性最高的温度

荧光定量PCR实验中的内标概念

内标是指在同一反应管中与靶序列共同扩增的一段非靶序列分子。内标有两种形式,一种是使用天然样品中含有的内参基因作为内标,另一种是人工添加的内标。内标的最大特点是与靶序列共同扩增,而其他的对照都是独立扩增。

荧光定量PCR实验中的内参基因

通常它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。内参基因通常是持家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的内参基因包括GAPDH、β-actin(BETA-acti

荧光定量PCR技术中的扩增效率什么意思

PCR原理中,反应一个循环,PCR产物扩增一倍,即为之前的2倍。……反应N个循环,理论上应为原来的2的N次方。此时,理论的扩增效率是100%,即1。但实际上,由于酶,dNTPs,引物,模板等因素,扩增效率达不到100%。因此,我们就要做标准曲线,看实际的扩增效率是多少,也就是标准曲线的斜率。理论上1

荧光定量PCR技术中的扩增效率什么意思

PCR原理中,反应一个循环,PCR产物扩增一倍,即为之前的2倍。……反应N个循环,理论上应为原来的2的N次方。此时,理论的扩增效率是100%,即1。但实际上,由于酶,dNTPs,引物,模板等因素,扩增效率达不到100%。因此,我们就要做标准曲线,看实际的扩增效率是多少,也就是标准曲线的斜率。理论上1

荧光定量PCR异常扩增曲线分析攻略

近几年,从科学研究到临床检测,从“非洲猪瘟”检测到“新冠病毒”检测,荧光定量PCR仪器已成为分子生物学研究的常规设备。检测方法的迅速发展,检测任务的紧急也对检测人员提出了更高的要求,需要他们具备熟练判断数据结果的能力。对于荧光定量PCR的结果的判断,最直观的判断就是看扩增曲线是否正常。很多老师在平时

荧光定量PCR检测负对照有信号的原因

(1)引物设计不够优化:应避免引物二聚体和发夹结构的出现。(2)模板有基因组的污染:RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异扩增。(3)实验器材污染:移液器、水、枪头或者荧光定量PCR孔内有荧光污染。

荧光定量PCR-阴性对照曲线上扬为什么

荧光定量PCR 阴性对照曲线上扬为什么溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线,类似于电泳。那么你扩增几种基因就应该有几种对应的峰(一般SYBR法的目的基因在80~90℃之间),我说的是一般情况,这个跟扩增片段长短有关系。出

荧光定量PCR实验步骤

  1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)  1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。  2)取100mg组织,加入到匀浆器中。  3)充分研磨直至无可见组织块。  4)12000rpm离心10min取上清。  5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管

实时荧光定量PCR仪和基因扩增仪的区别

荧光定量PCR仪比普通的PCR仪多了荧光信号采集系统和计算机分析处理系统,实时荧光定量PCR仪主要是用来定量分析和确定基因转录水平的,而普通的PCR仪是做定性分析和扩增基因片段,定量PCR仪可以做普通PCR仪的工作,而反之就不行了,况且这样代价太大了,一般的实验室都不允许这样做的。总之两者的功能不能

荧光定量PCR扩增曲线形状异常的原因

A.扩增效率过高    出现非特异扩增或引物二聚体:反应体系内模板浓度太高以及模板核酸质量较差,可能导致出现抑制PCR反应的现象。在绝对定量时表现扩增效率大于110%。    解决方案:去除模板浓度最高的反应孔并重新分析标准曲线;对目的基因做标准曲线,一般用质粒做梯度稀释,或用PCR产物做梯度稀释,

荧光定量pcr标准曲线中的扩增效率太高怎么办

1、调整下体系,不要自己配置反应液,最好用商品的MIX,这样各个组分都是最佳的配比。2、三步法改为两步法,退火延伸设置为一步,大部分的温度为60度,这个只是建议,具体看你买的试剂的说明书,会有具体的说明。3、很有可能有非特异性扩增,自己排查下反应体系,根据溶解曲线是否单峰,扩增曲线CT值综合分析。

荧光定量PCR实验指南1

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备; 二、技术关键: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;

荧光定量PCR实验指南3

3.3 引物、探针的纯度和稳定性定制引物的标准纯度对于大多数PCR应用是足够的。部分应用需要纯化,以除去在合成过程中的任何非全长序列。这些截断序列的产生是因为DNA合成化学的效率不是100%。这是个循环过程,在每个碱基加入时使用重复化学反应,使DNA从3'到5'合成。在任何一个循环都

荧光定量PCR具体实验步骤

荧光定量PCR具体实验步骤,1 样品RNA的抽提①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色

荧光定量PCR实验指南2

2.3TaqmanMGB探针设计介绍MGB探针的优点:²MGB探针较短(14-20bp),更容易找到所有排序序列的较短片段的保守区。²短片段探针(14-20bp)加上MGB 后,Tm值将提高10℃,更容易达到荧光探针Tm值的要求。²MGB探针的设计原则²探针的5’端避免出现G,即使探针水解为单个碱基

荧光定量PCR实验基本步骤

1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;    4、反应体系的配制;    5、反应条件的设定;    6、反应体系和条件的优化;    7、荧光曲线和数据分析;    8、标准品的制备;

荧光定量PCR实验指南4

3.8 防止残余(Carry-over)污染PCR易受污染的影响,因为它是一种敏感的扩增技术。小量的外源DNA污染可以与目的模板一块被扩增。当前一次扩增产物用来进行新的扩增反应时,会发生共同来源的污染。这称之为残余污染。从其他样品中纯化的DNA或克隆的DNA也会是污染源(非残余污染)。可以在PCR过

荧光定量PCR实验设计

 设置对照组:荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。对照组是实验的监控系统,监测实验是否有存在异常,也是排除实验异常关键所在;实验对照设置: 通常有阳性对照,阴性对照组等。      具体可根据实验类型进行对照组的设置;对

荧光定量PCR实验指南5

您可以选择荧光染料SYBGREEN体系,具体请参照说明书。您可灵活使用20-50ul间其他体积,注意保证终浓度相同。A2010A0106试剂盒:反应体系终浓度(自配热启动荧光系统):1-2U的hotstartTaq酶、3-5.5mM的Mg2+ 、0.2mM的dNTPs、1×PCRbuffer(A

荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法

接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法,我们如何选择合适的方法?荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类,特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物;而非特异性检测方法是在在PCR反