荧光定量PCR实验中的内参基因

通常它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。内参基因通常是持家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的内参基因包括GAPDH、β-actin(BETA-actin)、18sRNA、B2M、HPRT和TBP等。内参基因的优点是与样品中的靶基因经历完全相同的处理程序,可以监控采样,运输,核酸提取和扩增的全部过程。缺点是不同物种,不同生理状态下,不同组织中的内参基因存在一定的差异。如果样品类型是口腔液,咽拭子等样品,内参基因的量很低可能导致实验不成立。如果检测的是环境样品则内参基因可能完全失效。......阅读全文

荧光定量PCR实验中的内参基因

通常它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来做参照物。内参基因通常是持家基因(house-keeping gene)因为其表达水平受环境因素影响较小,而且在个体各个生长阶段的几乎全部组织中持续表达变化很小。常用的内参基因包括GAPDH、β-actin(BETA-acti

PCR实验中内参基因的作用

1. 判断样品提取是否成功。假如你提取了总RNA然后再做逆转录得到cDNA,然后再去跑PCR发现没有结果,是不是表示样品中没有你的目的基因呢?答案是:不一定。要根据使用同一模板跑出的内参基因的结果才可判断。内参基因的CT在一个合理范围(比如20左右)的前提下,才能说明样品制备没问题,在这个前提下,做

实时荧光定量pcr内参是什么东西

实时荧光定量pcr内参是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

实时荧光定量pcr内参是什么东西

实时荧光定量pcr内参是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

实时荧光定量pcr内参是什么东西

实时荧光定量pcr内参是一种在DNA扩增反应中,以荧光化学物质测每次聚合酶链式反应(PCR)循环后产物总量的方法。通过内参或者外参法对待测样品中的特定DNA序列进行定量分析的方法。

荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的...

荧光定量PCR(qPCR)内参的选择对基因表达差异分析结果的影响与应用实时荧光定量PCR技术是在常规PCR基础上加入荧光标记探针或相应的荧光染料来实现其定量功能的。由于其精准度好、灵敏度高,在分子生物学研究和医学研究等方面得到了广泛的应用,尤其是在基因表达差异分析方面。基因表达差异分析一般是比较不同

荧光定量PCR实验中的扩增对照

通常说的阳性对照和阴性对照指的是扩增试剂盒中附带的不需要提取的阳性对照和阴性对照,更准确的定义应该是扩增阳性对照和扩增阴性对照。扩增阳性对照含有阳性扩增模板,扩增阴性对照应含有阴性扩增模板(基质核酸)。扩增对照只能监控每次扩增过程中的扩增系统是否正常,不能监控采样、提取和每份样品的操作过程。如果是检

荧光定量PCR实验中的内标概念

内标是指在同一反应管中与靶序列共同扩增的一段非靶序列分子。内标有两种形式,一种是使用天然样品中含有的内参基因作为内标,另一种是人工添加的内标。内标的最大特点是与靶序列共同扩增,而其他的对照都是独立扩增。

肌动蛋白基因为什么可以作为荧光定量pcr的内参基因

肌动蛋白基因可以作为荧光定量pcr的内参基因的原因是:内参基因相当于一个标尺,具有校正作用,避免待测样本回收率或者加样误差等因素带来的差异。具有标准化作用,内参基因表达相对稳定,以其为参照,反应基因表达水平的变化。根据查询相关信息显示引入内参基因进行了归一化处理,可以最大限度地减少样本制备,处理时产

荧光定量PCR实验中的核酸提取对照

可以使用内参基因,假病毒混合基质,灭活病毒混合基质来监控提取到扩增的流程。

荧光定量PCR实验中的反转录对照

可以使用提取好的RNA内参基因,RNA假病毒混合基质,灭活RNA病毒混合基质来监控反转录到扩增的流程。无反转录对照(no-RT control)含有除反转录酶以外的所有成分。

荧光定量PCR实验中的空白对照

无模板空白对照NTC是指不含有模板(阳性模板或者阴性模板)的对照。目前的试剂盒的NC一般都是水或阴性缓冲液,所以NC等同于NTC。其实两者有不同的作用。仪器空白对照NTC是含有引物探针和反应液主要监控引物探针,反应体系有没有被污染。这里的仪器空白对照我通常使用的是空反应管来监控仪器有无非特异性的荧光

荧光定量PCR实验步骤

  1、总RNA抽提(枪头和离心管均经过湿热灭菌,无RNA酶)  1)取匀浆器,加入1ml的Trizol Reagent,置冰上预冷。  2)取100mg组织,加入到匀浆器中。  3)充分研磨直至无可见组织块。  4)12000rpm离心10min取上清。  5)加入250 μl三氯甲烷,颠倒离心管

mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参吗

mirna的荧光定量pcr可以用actin做内参miRNA通过与转录本的相互作用,关闭或抑制基因的表达。最近的研究表明它们影响了约三成的基因。miRNA在多个组织中差异表达,这就让表达图谱分析成为研究的重点。同时,miRNA的过表达和抑制也是近年来常用的研究方法。我知道和使用过的U6内参基因只有两个

荧光定量PCR实验指南1

第一部分一、基本步骤:1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;4、反应体系的配制;5、反应条件的设定;6、反应体系和条件的优化;7、荧光曲线和数据分析;8、标准品的制备; 二、技术关键: 1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;

荧光定量PCR实验指南3

3.3 引物、探针的纯度和稳定性定制引物的标准纯度对于大多数PCR应用是足够的。部分应用需要纯化,以除去在合成过程中的任何非全长序列。这些截断序列的产生是因为DNA合成化学的效率不是100%。这是个循环过程,在每个碱基加入时使用重复化学反应,使DNA从3'到5'合成。在任何一个循环都

荧光定量PCR具体实验步骤

荧光定量PCR具体实验步骤,1 样品RNA的抽提①取冻存已裂解的细胞,室温放置5分钟使其完全溶解。②两相分离 每1ml的TRIZOL试剂裂解的样品中加入0.2ml的氯仿,盖紧管盖。手动剧烈振荡管体15秒后,15到30℃孵育2到3分钟。4℃下12000rpm离心15分钟。离心后混合液体将分为下层的红色

荧光定量PCR实验指南5

您可以选择荧光染料SYBGREEN体系,具体请参照说明书。您可灵活使用20-50ul间其他体积,注意保证终浓度相同。A2010A0106试剂盒:反应体系终浓度(自配热启动荧光系统):1-2U的hotstartTaq酶、3-5.5mM的Mg2+ 、0.2mM的dNTPs、1×PCRbuffer(A

荧光定量PCR实验基本步骤

1、目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对;2、引物、探针的设计;3、引物探针的合成;    4、反应体系的配制;    5、反应条件的设定;    6、反应体系和条件的优化;    7、荧光曲线和数据分析;    8、标准品的制备;

荧光定量PCR实验指南4

3.8 防止残余(Carry-over)污染PCR易受污染的影响,因为它是一种敏感的扩增技术。小量的外源DNA污染可以与目的模板一块被扩增。当前一次扩增产物用来进行新的扩增反应时,会发生共同来源的污染。这称之为残余污染。从其他样品中纯化的DNA或克隆的DNA也会是污染源(非残余污染)。可以在PCR过

荧光定量PCR实验设计

 设置对照组:荧光定量PCR检测一般流程如下图,选择检测靶标基因,进行引物筛选及体系构建,后续进行样本处理核酸提取,检测分析结果。对照组是实验的监控系统,监测实验是否有存在异常,也是排除实验异常关键所在;实验对照设置: 通常有阳性对照,阴性对照组等。      具体可根据实验类型进行对照组的设置;对

荧光定量PCR实验指南2

2.3TaqmanMGB探针设计介绍MGB探针的优点:²MGB探针较短(14-20bp),更容易找到所有排序序列的较短片段的保守区。²短片段探针(14-20bp)加上MGB 后,Tm值将提高10℃,更容易达到荧光探针Tm值的要求。²MGB探针的设计原则²探针的5’端避免出现G,即使探针水解为单个碱基

荧光定量PCR实验中的阳性对照和阴性对照

阳性对照和阴性对照是指在相同的处理条件下,比如一份已知的感染样品和一份已知的未感染样品,都进行了提取和扩增最终获得了阳性结果和阴性结果。阴阳性对照强调处理过程与样品一致,并且有明确的预期结果。

荧光定量PCR实验中无Ct值出现的原因

(1)反应的循环数不够:一般要在35个循环以上,但是过多的循环次数可增加背景值。(2)检测荧光信号的步骤有误:SYB-Rgreen法(SG法)采用的是72延伸时采集荧光信号,Taman法则是在退火结束或延伸结束时进行信号采集。(3)引物或探针降解: 可通过PAGE电泳检测其完整性,若是电泳条带呈弥散

荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法

接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法,我们如何选择合适的方法?荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类,特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物;而非特异性检测方法是在在PCR反

荧光定量PCR实验的技术要点

1、 目的基因(DNA和mRNA)的查找和比对    从http://www.ncbi.nlm.nih.gov/网点的genbank中下载所需要的序列。下载的方式有两种:一为打开某个序列后,直接点击“save”,保存格式为“.txt”文件。保存的名称中要包括序列的物种、序列的亚型、序列的注册号。然后

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参

realtime-PCR中内参基因的CT值

这个要看你在做PCR前的加样量是否一致。如果加样量是一致的,而内参做出来差别大(比如3-4个CT值)那说明你的实验体系有严重的问题。理论上加入的DNA量一样多,内参的CT值应该都一样。如果你能肯定加样量是一致的,那说明你的样本要么降解了,要么就是你的实验处理对内参的量产生了影响,必须换一个基因做内参