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Nature:如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型?

近日,来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展,他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型,这对于深入了解器官的细胞组成,探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义。 理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清晰的认识。传统发现和分离细胞亚群的方法是基于几个已知的标记基因表达出来的信使RNA或蛋白质实现的。但是对于一些罕见的细胞类型来说,鉴定出它们特定的标记基因目前仍存在很大挑战。而发现一些罕见的细胞类型,如干细胞,短暂存在的前体细胞,癌症干细胞或循环肿瘤细胞,对于深入理解正常和疾病状态下的组织生物学具有非常重要的意义。 为解决这一问题,研究人员首先从培养的小肠类器官中随机挑选了几百种不同的细胞类型进行转录组测序,这种培养的小肠类器官包含了哺乳动物小肠所有的细胞谱系。由于目前可用的计算方法只能对一些丰度较高的细胞类型进行确定,因此研究人员......阅读全文

Nature子刊:癌症研究的突破性技术

  最近,美国研究人员开发出一种微流控芯片,可以捕捉罕见的循环肿瘤细胞(CTC)群,这会对“癌症如何扩散”产生新的重要认识。这项工作是由美国国家生物医学成像和生物工程研究所(NIBIB,国立卫生研究院的一部分)资助。延伸阅读:微芯片揭示肿瘤细胞如何变侵袭细胞。  循环肿瘤细胞(CTCs),是从实体瘤

血片及骨髓片的观察(一)

骨髓粒细胞系各期细胞形态观察     1.原粒细胞:细胞呈圆形或椭圆形,直径11~18微米。胞核较大,占细胞的2/3以上,圆形或椭圆形,居中或略偏位。核染色质呈淡紫红色细粒 状,排列均匀平坦如薄纱。核仁2~5个,清楚易见,呈淡蓝色或无色。胞质量少,呈透明天蓝色,绕于核周,不含颗

多篇研究共同解读近期单细胞测序重磅级研究成果

  本文中,小编整理了近年来单细胞测序领域的重磅级研究成果,与大家一起学习!  【1】Cell:开发出空间单细胞测序技术,有助揭示早期乳腺癌产生浸润性之谜  doi:10.1016/j.cell.2017.12.007  在一项新的研究中,来自美国德州大学MD安德森癌症中心的研究人员报道一种新的遗传

重磅!两篇Nature共同揭示:新型肺细胞

肺部离子细胞(橙色)通过邻近的上皮细胞(细胞核,青色)延伸至呼吸上皮层。这一新发现的细胞类型会高度表达CFTR,一种突变时与囊性纤维化有关的基因。(图片来源:ANNA HUPALOWSKA, DANIEL MONTORO)  这两份围绕“呼吸上皮细胞”的最新研究揭示了数千个肺细胞的基因表达模式,从中

Science:构建出真涡虫细胞类型转录组图谱

  真涡虫是一类相对简单的动物,具有不同寻常的生物学特征:成年真涡虫维持着其他有机体仅在胚胎中短暂存在的发育信息和祖细胞(progenitor cell)。真涡虫获得人们的大量研究,部分原因在于它们具有再生丢失的或受损的身体部位的独特能力。图片来自Christopher Fincher/Whiteh

华人女学者连发干细胞研究成果

  2015年二月份,Cell子刊《Stem Cell Reports》刊登了美国威尔康奈尔医学院Shuibing Chen博士带领的一项研究成果。在这项研究中,研究人员利用一种包含人类胚胎干细胞(hESC)衍生祖细胞和内皮细胞的共培养系统,探讨了内皮细胞在人类发育过程中的确切功能。延伸阅读:优化干

单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向

  单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一,来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此,我们对该review中的部分内容进行解读和分享。   

单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向(二)

三.残留病变和复发:利用单核分析(冰冻材料)在许多癌症类型中,初始治疗后通常伴随着具有增强的侵袭性和抗药性的复发,突出了残留病变及其进展和生长对于建立复发性肿瘤的重要性。已有的研究比较了原发性和复发性肿瘤,并揭示耐药性的各种遗传原因。未来的研究将扩展这种方法,通过scRNA-seq进行比较,并提供更

单细胞检测技术在肿瘤研究中的新挑战和新方向

  单细胞转录组研究是近期生命科学领域运用最火的组学检测技术之一,来自麻省总医院和哈佛医学院的研究人员在《Molecular Cell》(Suva and Tirosh 2019)上讨论了单细胞转录组测序技术在肿瘤研究中的经验与未来挑战。在此,我们对该review中的部分内容进行解读和分享。   

中国首家基因与细胞治疗医院将落户深圳

  8月17日,2018罕见病基因和细胞治疗国际会议将在深圳召开。记者获悉,此次会议上,中国基因集团(香港)将与罗湖医院集团签署合作协议,共同筹建中国首家基因与细胞治疗医院。这意味着,今后脑瘫、GM2神经节苷脂病等多个罕见病以及老年痴呆、白血病等治疗难度较高的疾病有望在该院通过基因与细胞技术进行治疗

单细胞RNA-seq发现调节干细胞发育的新基因

  最近,Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量,揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因,以及新 的细胞亚群,可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源

【盘点】单细胞测序研究进展一览

  细胞是生物学的基本单位,近年来研究人员正努力地尝试将它们进行单个分离、研究和比较。而应用而生的就是单细胞测序技术,该技术是指DNA研究中涉及测序单细胞微生物相对简单的基因组,更大更复杂的人类细胞基因组。而随着测序成本的大幅度下降,破译来自单细胞的30亿碱基的基因组并对逐个细胞进行序列比较已经开始

创新性方法或能帮助研究干细胞微环境

  近日,一项刊登在国际杂志Nature Cell Biology上的研究报告中,来自欧洲分子生物学实验室等机构的科学家们通过研究开发出了一种新方法,其能够在单细胞水平下揭示骨髓的三维组织架构,由于骨髓中含有负责机体终生血液产生的造血干细胞,相关研究结果或有望帮助研究人员深入研究多种血液癌症发生的分

7月5日《自然》杂志内容精选

  运动控制中的神经元活动   人们长期认为,运动皮层和运动前区皮层中的单个神经元是根据方向等运动参数来调整的。但尽管进行了几十年的研究工作,它们所代表的参数的具体性质仍不清楚,这样的“代表”得以能够支持日常生活中所做复杂动作的机制也不清楚。在这项研究中,Churchland等人提

2016年肿瘤干细胞重磅研究进展

  肿瘤干细胞是一群具有自我更新、多向分化潜能、具有启动和重建肿瘤组织表型能力的肿瘤细胞。前期研究均表明,肿瘤干细胞参与肿瘤的转移、复发和对化疗和放疗耐受。因此,靶向肿瘤干细胞的治疗策略将有望为癌症的治疗带来希望。科学家们也在肿瘤干细胞的研究中投入了不少精力,试图通过肿瘤干细胞的研究解决肿瘤起源及治

Nature:治疗实体瘤有了明确靶标,肿瘤干细胞确实存在

  Nature上11月2日在线刊登的一篇从单细胞水平分析脑瘤基因组的研究文章显示癌症干细胞促进少突胶质细胞瘤的生长。这是一种生长缓慢但无法治愈的脑瘤。麻省总院和MIT的Broad研究所以及哈佛的研究人员合作,首次在人脑肿瘤样本中鉴定出肿瘤干细胞和其分化的子代。  通讯作者,麻省总院病理科的Mari

《Cell Metabolism》新技术为β胰岛素细胞的再生铺路

  “如果我们能找到一种药物使β细胞生长,就能改善糖尿病患者的血糖,”UCSD医学院细胞与分子医学系教授Maike Sander医学博士说。“通常患者体内仍有残余的β细胞,但是依靠这些细胞不足以维持正常的血糖水平。”  当人还在子宫内时,β细胞就开始产生,出生后继续保持再生。但是随着年龄的增长,细胞

Nature子刊发布突破性单细胞标记技术

  加拿大蒙特利尔大学和麦吉尔大学的研究团队在Nature Communications杂志上发布了一种强大的单细胞标记技术。这种光漂白细胞标记法(CLaP)将成为研究者们的宝贵工具,广泛用于各个领域的科学研究,特别是基因组学研究。  “我们把激光当作画笔,一个一个地标记细胞,”蒙特利尔大学副教授S

近期治疗糖尿病的研究进展一览

  糖尿病是现代社会的高发代谢疾病,发病的原因包括遗传因素以及环境的影响等等。这一期为大家带来的是最近在糖尿病的研究与药物研发领域的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Nature:重磅!中国科学家解析出一种B类G蛋白偶联受体全长结构,有助开发出新的2型糖尿病药物doi:10.1038/na

加州大学张鹍教授团队合作绘制首份成人肾脏单细胞草图

  自2006年在全世界第一个实现单细胞全基因组测序,华人科学家张鹍教授在单细胞测序领域的研究一直处于全球领先地位。2018年11月,张鹍教授团队因在单细胞研究领域的杰出贡献,荣获美国国立卫生研究院(NIH)两项共计1400万美元的研究基金,用于构建单细胞水平的人体器官3D图谱,推动精准医学进入单细

Nat Cell Biol:重磅!科学家发现乳腺癌的新型细胞起源

  乳腺癌是女性常见的癌症类型之一,长期以来科学家们知道并不是所有的乳腺癌都是相似的,腔体肿瘤主要包含一些和乳腺管内层细胞非常相似的细胞类型,而其它肿瘤所包含的细胞则同乳腺上皮组织外层的细胞相似,研究者认为,这种多样性起源于不同干细胞或祖细胞的突变,而目前研究人员也并没有完全理解这些特有的祖细胞群体

Cancer Cell:癌症中新发现的抑癌免疫细胞

  来自加州大学旧金山分校的研究人员发现,肿瘤中一种新发现的免疫细胞能减少癌症患者的严重预后病症,这也许未来能用于癌症治疗。  这一研究成果公布在10月16日Cancer Cell杂志在线版上,该研究收集了12种癌症的3600个人类肿瘤样品,以及小鼠样品。通过与这些细胞有关的分子,研究人员希望能研发

FDA授予罗氏抗癌药Zelboraf突破性药物资格和优先审查资格

  瑞士制药巨头罗氏(Roche)旗下基因泰克(Genentech)近日宣布,美国食品和药物管理局(FDA)已受理靶向抗癌药Zelboraf(vemurafenib,维罗非尼)治疗BRAF V600突变阳性Erdheim-Chester病(ECD)的补充新药申请(sNDA)并授予了优先审查资格(PR

PNAS:声波助力,“温柔”检测循环肿瘤细胞SO EASY!

  癌细胞通常会摆脱最初的位置,并通过血液循环,在身体的其它地方形成新的肿瘤。检测这些癌细胞为医生提供了一种判断患者肿瘤是否转移以及监测癌细胞对治疗如何响应的新方法。但是想要检测到这些罕见的细胞非常具有挑战性。在1毫升的患者血液样本中可能只有1-10个这样的细胞。  事实上,这种罕见的细胞叫循环肿瘤

JEM:科学家发现同时表达αβ和γδ TCR的T细胞

  都柏林圣三一学院的科学家们在免疫系统中发现了一种罕见的新细胞,它具有"双重人格"。这些细胞在感染免疫中起着关键的保护作用,但如果不加以调节,它们也会介导自身免疫性疾病中的组织损伤。  这些发现将有助于我们设计更有效的疫苗来预防MRSA等感染,也可能有助于我们开发治疗自身免疫性

糖尿病治疗重大突破:发现刺激胰腺β细胞分化新通路

  胰腺β细胞通过产生能量(葡萄糖)的主调节因子激素胰岛素来帮助维持正常的血糖水平。损伤和β细胞的损失中断胰岛素生产,导致1型和2型糖尿病。使用单细胞RNA测序,加利福尼亚大学圣地亚哥分校医学院的研究人员首次绘制了调节β细胞生长的途径,可以利用它们来诱导其再生。  研究结果发表在5月2日刊“细胞代谢

鉴定出调节β细胞生长的分子通路 有助开发新糖尿病疗法

  胰腺β细胞通过产生胰岛素而有助维持正常的血糖水平。β细胞受损和丢失会干扰胰岛素产生,从而导致1型糖尿病和2型糖尿病产生。在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员首次利用单细胞RNA测序绘制出调节β细胞生长的分子通路,从而可能利用这些分子通路诱导它们再生。相关研究结果发表在2017

骨髓增生异常综合征的细胞形态学特点与诊断

1)  概念       骨髓增生异常综合征(myelodysplastic symdrome,MDS)是一种造血干细胞克隆性疾病,骨髓出现病态造血,外周血血细胞减少。2)分类    &nb

人体染色体畸变分析(一)

  一、染色体的数目畸变  正常人的体细胞具有46条染色体(2n),配子细胞(精子和卵)具有23条染色(n),前者称为二倍体,后者称为单位体。染色偏离正常数目称为染色体数目异常或数目畸变。  1.多倍体和多倍性 体细胞染色体倍数超过2倍,即是3n=69,4n=92等时,这些细胞称为多倍

利用单细胞测序技术勾勒一个描述肺部疾病的新细胞框架

  利用新型单细胞测序技术,科学家研究了数千个体细胞的基因表达,全面分析了小鼠气管,并在人体组织中验证了这项结果。  MIT Broad研究所和麻省总医院的研究人员根据基因表达模式发现了新细胞亚型,映射了细胞类型的物理位置,并创建了组织细胞“地图(atlas)”。他们还开发了一种被称为脉冲测序(pu