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生物通报道：美国国家能源部Lawrence Berkeley实验室和加州大学伯克利分校的研究人员采用科罗拉多蓄水层的沉积物和地下水样本，通过宏基因组测序重建了二千五百多个微生物的基因组。这项研究发表在十月二十四日的Nature Communications杂志上，为人们揭示了地下世界惊人的生物学多样性，给生命之树增添了几十个新的分支。 微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。过去的微生物组研究主要是进行16S rDNA基因测序。随着测序成本的直线下降，针对整个菌群的宏基因组测序越来越受到青睐，因为这一技术能够提供更全面的基因组和功能信息。 这项研究获得的基因组覆盖了已知细菌类群的80%，对于一个特定地点来说这样的生物多样性相当惊人。研究人员还发现了47种新细菌并为它们一一命名。加上去年报告的35种细菌，研究人员使已知细菌......阅读全文
16SrRNA基因测序和宏基因组测序是现在微生物检验中的两大新型武器，它们在微生物研究中共同发挥着极大的作用，都是研究微生物的重要方法。但是二者又有什么不同呢?接下来将做一个简单说明。 定义 16SrRNA基因测序：就是指从微生物样本中提取16SrRNA的基因片段，通过克隆、测序或酶
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
直到不久之前，宏基因组学研究还因为高费用、低流通量以及在应用Sanger-方法克隆步骤中出现的结果不准确而受到限制。而今借助于新一代序列测定方法即可获得宏基因组样品全面的图像。宏基因组学研究（metagenomics）是指研究一种复杂微生物群体在其生命空间的全部基因信息。研究的主要目的在于刻画
土壤微生物是元素生物地球化学循环过程及其他土壤生态过程的关键驱动因子。由于土壤结构和组成的复杂性，土壤微生物生态过程在研究中一直以来都被作为“黑箱”看待，要清楚阐明土壤生态功能是土壤生态学研究当前面临的一个重大挑战。 近日，浙江大学环境与资源学院徐建明教授团队在微生物学顶级期刊《国际微生物生态
对环境样品（如海水、医院表面和人类肠道）直接进行微生物测序，已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而，一个微生物物种可能存在遗传多样性，而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中，科学家们开发了一种新的工具，来检测细菌物种内的遗传差异，并
在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群，别看人体肠道所占体积不大，但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌，它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险，还能控制人体对癌症治疗药物的反应。 人体肠道的正常微生物，如双歧杆菌，乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文，引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法，不通过培养，直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物，甚至可以
人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多，被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中，96-99%的微生物聚集在胃肠道，肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。 本文，我们整理了肠道微生物行业的产业现状，包括肠道微生物的应用场景、产业化
微生物宏基因组是当今世界最热门的科研领域之一。越来越多的研究表明，人体微生物发挥着重要的健康作用，但大部分多样性仍未得到充分探索，尤其是在除肠道以外的身体部位及非西方人群。 在今日发表在Cell期刊的一项研究中，由意大利特伦托大学Nicola Segata领导的研究团队利用来自不同地理位置、生
文章导读 感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。目前，全球感染性疾病的发病率有所上升，病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势。近年来快速发展的NGS技术因其不依赖于已知核酸序列，无需特殊探针设计，可直接对未知病原微生物进行检测，打破了传统微生物检验的局限性，在临床微生物领域展现了广阔的前景。
意大利特伦托大学等机构的研究人员通过测序人类微生物组样本中的9,000多个宏基因组，发现了超过15万个微生物基因组，其中大多数是此前未知的。这项重要成果于上周发表在《Cell》杂志上。 意大利特伦托大学等机构的研究人员通过测序人类微生物组样本中的9,000多个宏基因组，发现了超过15万个微生物
时光总是匆匆易逝，转眼间，2019年就要结束了，在即将过去的一年里，科学家们在肠道微生物组研究领域取得了哪些重要的研究成果呢？本文中，小编对相关重要的研究成果进行整理，分享给大家！ 图片来源：6xc.com.au 【1】Nat Biotechnol：突破！科学家在人类肠道微生物组中鉴别出10
微生物几乎是无所不在的，它们对生态环境和人体健康起到了不容忽视的作用。然而人们对微生物的了解还相当匮乏，因为许多微生物是无法在实验室中培养的。宏基因组学是了解这些微生物的重要途径，但宏基因组测序并不是一件容易的事儿，就像是把许多拼图拆散混在一起，然后在毫无参考的情况下拼接。 最近Nature
饲用抗生素的过度使用带来细菌耐药性和超级细菌问题，严重威胁公众健康。伴随着越来越多的国家和地区加入“限抗”和“禁抗”的队伍，寻找和开发“安全、有效、可控、成本低”的天然替抗产品是目前全球研究的热点。 近日，中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所研究员樊伟团队联合湖南农业大学教授曾建国团队、中国
1月23日，国际学术期刊《自然-通讯》（Nature Communications）在线发表了中国科学院北京生命科学研究院计算基因组学实验室赵方庆团队题为MetaSort untangles metagenome assembly by reducing microbial community
美国国家能源部Lawrence Berkeley实验室和加州大学伯克利分校的研究人员采用科罗拉多蓄水层的沉积物和地下水样本，通过宏基因组测序重建了二千五百多个微生物的基因组。这项研究发表在十月二十四日的Nature Communications杂志上，为人们揭示了地下世界惊人的生物学多样性，给生
从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征，这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日，国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期
2016年，美国克利夫兰医学中心预言《2017十大医疗创新科技》，其中利用微生物组预防、诊断和治疗疾病领域高居榜首，这表明全球已掀起微生物研究的新热潮且取得瞩目成绩，同时在市场潜力与应用前景方面，微生物组学将焕发无限生机。 我们知道，所有机体包括人在内都与微生物是共生体，人体身上有超过1
2019年10月26日，“百万微生态”国际合作计划（MMHP）在深圳第14届国际基因组学大会（ICG-14）上正式启动，来自中国、瑞典、丹麦、法国、拉托维亚等多国科学家将合作开展微生物宏基因组研究，致力于在未来三至五年内对100万份来自肠道、口腔、皮肤、生殖道等器官的微生物组样品进行测序分析，绘
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
近日，《核酸研究》（Nucleic AcidsResearch）在线发表了国家微生物科学数据中心（中国科学院微生物研究所微生物资源与大数据中心、世界微生物数据中心）关于全球模式微生物基因组数据库gcType的论文。gcType是由我国牵头的全球模式微生物基因组测序计划的重要成果。 模式菌株（t
分析测试百科网讯 2018年11月24日，Illumina公司举办的“迈入新纪元——NGS临床基因测序论坛暨MiSeq™Dx基因测序仪上市巡讲会”在北京召开。本次会议约有近200人与会，Illumina大中华区市场高级总监倪涛致欢迎辞，国家卫生健康委员会临床检验中心副主任李金明教授、北京大学肿瘤
沃斯的“三域说”是目前生物分类界的主流学说。 “科学坏小子”文特尔（左）参与了这次的研究项目。 在过去的近300年中，生物分类法从两界、三界一直被扩充到六界三域，分类系统不断被改写。然而，演化树的改写可能还会继续下去。美国加州大学基因中心和文特尔研究所对海洋水样本中的DNA序列分
近年来基因组测序技术出现了迅猛的发展，测序通量在不断地提高，而测序成本在持续下降。然而，海量测序数据的产生也给数据分析带来了不小的挑战。 对于那些毫无编程背景的生物学研究者来说，衔接多个生物信息学工具是一件相当头疼的事情。加州大学、Broad研究所和斯坦福大学的研究团队日前在Nature Me
在一项新的研究中，来自俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究人员开发出一种方法极大地改善人们对实验室中不能培养的有机体---如生活在人胃肠道中的微生物，或者生活在海洋深处的细菌---的DNA进行测序的能力。相关研究结果于2016年2月1日在线发表在Nature Methods期刊上，论文标题为“TruSP
由美国、英国、中国等12国科学家参加的大洋钻探旨在打穿地球壳幔边界。1月16日，美国微生物学家在“决心”号大洋钻探船上分析微生物样品。5月22日，在西南印度洋执行大洋科考任务的“向阳红10”科考船上，科考队员顺利回收我国首个深海沉积物微生物原位培养系统。欧洲航天局和俄罗斯联邦航天署于3月1
英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。 近日，英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的方案针对细菌性下
随着人类活动范围的不断扩大、对野生动物的捕猎和烹食，一些在自然界长期存在的病原体突破物种屏障传播给人和家畜造成新发传染病的概率大大增加。 尽管现在对于新型冠状病毒的溯源工作仍在进行，但是野生动物的非法猎杀和售卖为危险病原微生物进入人类社会大开方便之门已是证据确凿。事实上，人类对于病毒和细菌等病
金砖兄弟(BMP)计划 巴西微生物组计划（BMP）旨在协调国家微生物组研究，使之能够与国际计划适当整合，更好地破译巴西的微生物多样性及其动态和环境间的相互关系。 巴 西 特 色 相信看过电影《里约大冒险》的人，都会被巴西这片广袤大地上各种色彩缤纷（令人眩晕）、数不胜数（令人