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直到不久之前，宏基因组学研究还因为高费用、低流通量以及在应用Sanger-方法克隆步骤中出现的结果不准确而受到限制。而今借助于新一代序列测定方法即可获得宏基因组样品全面的图像。宏基因组学研究（metagenomics）是指研究一种复杂微生物群体在其生命空间的全部基因信息。研究的主要目的在于刻画存在于样品中的生物体的特征，并确定在其生命空间所起的作用。宏基因组学研究的样品几乎无处不在，例如在人体的各个部位、在土壤中、在极地生命空间例如南极、热的喷泉或者海洋水层之中。迄今为止，还没有合适的方法能够提供具有重现性的图像来反映有关微生物方面和病毒学方面的生命共性、它们的新陈代谢方式以及它们的适应能力。凭借测序技术的进步，包括引入基因组测序仪FLX-系统，宏基因组学研究项目也呈现井喷式发展。由于流通量的改善以及放弃了歪曲结果的克隆步骤，应用范围业已超越常规的16S-rRNA-基因分析法而得到更为广泛的发展。基于基因测序仪-FLX-数......阅读全文
宏基因组学技术(Metagenomic approaches)正快速拓宽我们对微生物代谢能力(microbial metabolic potential)的认识。 长期以来，对微生物(microorganism)功能开展的研究主要依赖的都是以在实验室里培养的单一物种(individua
2012年9月27日至28日，为期两天的首届国际基因组学大会美洲分会(The International Conference on Genomics in the Americas，ICG Americas 2012)在美国费城儿童医院(CHOP)成功召开。本次会议由华大基因与费城儿童
背景 《美国医学会杂志》(JAMA)近期刊发了一篇题为《利用不需培养的宏基因组学测序技术研究产志贺毒素大肠杆菌O104∶H4暴发株》的研究论文，引起了学界和社会的广泛关注。这篇论文中应用了一种称为“宏基因组学”的技术方法，不通过培养，直接从病人样品中检测分析其携带的病原微生物，甚至可以
在人体中最大的微生态库是生活在人体消化道微生物复合群落组成的肠道菌群，别看人体肠道所占体积不大，但是人体肠道内寄生着10万亿个细菌，它们能影响体重和消化能力、抵御感染和自体免疫疾病的患病风险，还能控制人体对癌症治疗药物的反应。 人体肠道的正常微生物，如双歧杆菌，乳酸杆菌等能合成多种人体生长发育
“作为生物技术领域最基础的学科，农业基因组学研究不仅需要国内外科学家同行的协同创新，更需要与生物技术产业发展需求无缝衔接，才能发挥出农业基因组学的最大潜能。基于这种认识，在国家农业科技创新联盟的框架下，建立农业基因组学的协同创新联盟就显得十分迫切。”中国农科院科技局局长梅旭荣表示。 7月24
深圳华大生命科学研究院宏基因组研究所转化应用实验团队首次公开了使用BGISEQ-500对健康人群肠道样本进行深度宏基因组测序的数据，并通过一系列的性能评估，展示了BGISEQ-500宏基因组测序应用性能的优异性、准确性、稳定性及跨平台一致性，相应成果发表于GigaScience。 BGIS
为了庆祝成立40周年，《细胞》期刊(Cell)邀请了全球40位40岁以下的生物领域科学家，共同探讨科学见解、个人哲学、研究乐趣、面临的挑战和他们实验室外的生活。华大基因院长王俊也受邀分享他对科学的见解。 Q1：哪些问题在激励着你的团队? 王俊：最关键的一点是，基因组技术如何造福社会。
2020年伊始，突如其来的新冠疫情牵动着每个人的心。自武汉卫健委首发肺炎疫情情况通报后的短短一个星期，新型冠状病毒就在实验室中被检出，并获得了该病毒的全基因组序列。如此快速地确定病原体抢占研究先机，宏基因组测序技术功不可没。 宏基因组学(Metagenomics)，以环境样品中的微生物群体
优势 · 同时检测克隆和定量荧光标记---使用表现型筛选克隆 · 从加样、涂布到挑取完全自动化工作流程 ·
第五届国际基因组学大会11月16日在深圳大梅沙拉开帷幕。这次大会由深圳华大基因研究院、美国特拉华大学、美国加利福尼亚大学圣地亚哥分校、美国康乃尔大学及中国科学院海洋研究所共同举办。来自各国的400多位基因组学专家和学者出席会议。 当日（11月16日）上午9时，中国科学院院士杨焕明教授
来自华威大学的研究者使用宏基因组学技术发现215年之久的木乃伊的肺结核基因组。 由Mark Pallen带领的研究团队试图用技术来发现组织学标本中的肺结核的DNA。 宏基因组学是一种从样本中检测DNA序列的技术，并且样本不需要培养或扩增。这种方法避免了与细菌培养或DNA扩增
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
单细胞基因组学和宏基因组学是开创性的技术，可帮助研究人员评估环境微生物群落的结构和功能。现在应用这些技术的项目越来越多，但是，仍缺乏一种高通量过程来检查所组装的基因组序列，从而阻碍了这些技术的广泛应用。目前，去除已上传到公共数据库的微生物基因组中的污染序列，还是一个手动和耗时的过程，为了去除污染
英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。 近日，英国东安格利亚大学的Justin O'Grady博士和Earlham研究所的科学家成功开发了一种宏基因组学检测的研究方法。该优化后的方案针对细菌性下
人体是由自身细胞及共生的大量微生物细胞所共同组成的复杂共生生命体。人体肠道微生物数量庞大、种类繁多，被称为“第二基因组”。在人体微生物组学中，96-99%的微生物聚集在胃肠道，肠道微生物与机体健康有着极为密切的联系。 本文，我们整理了肠道微生物行业的产业现状，包括肠道微生物的应用场景、产业化
对环境样品（如海水、医院表面和人类肠道）直接进行微生物测序，已经阐明了我们世界中存在的大量微生物。然而，一个微生物物种可能存在遗传多样性，而在宏基因组分析中往往捕获不到这种多样性。最近在《Genome Research》发表的一项研究中，科学家们开发了一种新的工具，来检测细菌物种内的遗传差异，并
文章导读 感染性疾病是当今世界严重威胁人类健康的重大疾病。目前，全球感染性疾病的发病率有所上升，病原体呈现多样化和复杂化的发展趋势。近年来快速发展的NGS技术因其不依赖于已知核酸序列，无需特殊探针设计，可直接对未知病原微生物进行检测，打破了传统微生物检验的局限性，在临床微生物领域展现了广阔的前景。
近期，GRAND VIEW RESEARCH网站发布了全球NGS市场预测报告，分析了2014年至2025年之间全球NGS市场的发展趋势。报告指出，2015年全球NGS的市场值为46.2亿美元，且预计会在预测期内出现显著增长。本报告从推动市场发展的因素、技术应用市场、企业竞争等角度分析了NGS市场
科学通报，中国科学C辑:生命科学，这两份期刊均是由中国科学院和国家自然科学基金委员会共同主办的，我国学术期刊中的知名品牌，被国内外各主要检索系统收录，如国内的《中国科学论文与引文数据库》(CSTPCD)、《中国科学引文数据库》(CSCD)等；美国的SCI、CA、EI，英国的SA，日本的《科技文献
不久前，中国科学院遗传与发育生物学研究所发表于国际著名期刊《自然》的论文称，该所研究团队已完成小麦A基因组测序和染色体精细图谱绘制。这是继2013年，该团队成功绘制出小麦A基因组祖先种乌拉尔图小麦基因组草图并发表于《自然》之后，在此领域的又一项重大成果。图片来源于网络 中国科学院遗传与发育生
斯坦福大学的研究人员首次将一种新测序技术用于人类肠道微生物组，揭示了惊人的细菌多样性。这项研究发表在十二月十四日的Nature Biotechnology杂志上。 “这些细菌在遗传学上比我们想象的更加多样化，”文章资深作者Michael Snyder教授说。人类个体之间只有千分之一的基因组序列
英国华威大学的研究人员利用宏基因组学技术，从一个215年历史的木乃伊中发现了肺结核(TB)基因组。这项成果于2013年7月18日发表在《新英格兰医学杂志》上。1994年，匈牙利发现了一个包含242具尸体的地下墓室。许多尸体被自然木乃伊化，包括Terézia Hausmann的遗体，她死于17
芝加哥 – 据4月10日发表在《美国医学会杂志》上的一则研究披露；在一项用宏基因组学（对从复杂的微生物样品中提取的DNA进行直接测序）对2011年德国产志贺毒素型大肠杆菌爆发所做的分析中，研究人员成功地对一个疾病爆发菌株的基因组序列进行了重建；这些结果表明用这种方法具有比基于细菌培养的方法更快识
生物医学大数据广泛涉及人类健康相关的各个领域：临床医疗、公共卫生、医药研发、医疗市场与费用、个体行为与情绪、人类遗传学与组学、社会人口学、环境、健康网络与媒体数据。 大数据(big data)是指由于容量太大和过于复杂，无法在一定时间内用常规软件对其内容进行抓取、管理、存储、检索、共享、传输和
从环境宏基因组中挖掘功能基因通常有两条技术路线，一条是建立克隆文库后直接用筛选压力筛选阳性克隆，一条是通过设计引物，从宏基因组中克隆目标基因，然后进行功能研究。近日，李小方研究员团队发展了第三条技术路线，实现了规模化、回避筛选压力的功能宏基因组路线，并用于了金属硫蛋白基因的高通量挖掘。该研究以“
自然界中存在大量的微生物，因无法在实验室中培养，而几乎不为人所知，也因此被称为“生命的暗物质”。尽管基因组学技术能够从单细胞中扩增DNA，提供关于遗传变异的有趣信息，但通常无法捕获罕见细菌的整个基因组。 如今，J. Craig Venter研究所(JCVI)的研究人员利用一种新颖的微型宏基
肠道的微生态是一个复杂的生态系统，而人类结肠则可以被看做是一个厌氧的生物反应器。肠道存在着万亿数量级的微生物，这大大增加了宿主基因组资源。同时这些庞大的微生物生态系统为人体能量捕获、食物消化、生物活性物质的合成等等提供了补充性代谢途径，否则人体将无法实现饮食中营养物质的同化。 人类肠道菌群主要
由中国农业科学院深圳农业基因组研究所主持的一项研究日前在学术期刊《自然·通讯》在线发表。该研究从多个角度揭示了薇甘菊的环境适应性进化和快速生长的分子机制，为防治这一重要外来入侵植物提供了理论依据。 薇甘菊原产于中南美洲，随后入侵到东南亚等地，已被列入世界最有害的外来入侵物种之一，也是中国首批外
饲用抗生素的过度使用带来细菌耐药性和超级细菌问题，严重威胁公众健康。伴随着越来越多的国家和地区加入“限抗”和“禁抗”的队伍，寻找和开发“安全、有效、可控、成本低”的天然替抗产品是目前全球研究的热点。 近日，中国农业科学院（深圳）农业基因组研究所研究员樊伟团队联合湖南农业大学教授曾建国团队、中国
2015年9月28日，中国深圳—深圳华大基因研究院、哥本哈根大学等研究机构共同构建了全球首个小鼠肠道微生物参考基因集，为以小鼠为基础的人类疾病模型研究提供有益参考。最新研究成果今日在线发表于《自然生物技术》。 人类的肠道中居住着种类繁多，数量惊人的微生物，而在这些微生物中，细菌的比例高达90%