杨运桂/杨莹开发新技术,首次获得m7GmRNA高分辨率图谱

在RNA分子中鉴定出超过150种RNA修饰。转录组分析是解码这些化学修饰的潜在功能的关键步骤之一。N7-甲基鸟苷(m7G)是tRNA,rRNA和mRNA 5'cap中存在的最丰富的修饰之一,并且在调节RNA加工,代谢和功能中具有关键作用。除了其在mRNA中的帽位置外,还在内部mRNA区域中鉴定了m7G。然而,其在内部mRNA区域内的转录组范围的分布和动态调节仍然未知。 2019年9月13日,中国科学院北京基因组研究所杨运桂及杨莹共同通讯在Cell Research在线发表题为"Dynamic methylome of internal mRNA N7-methylguanosine and its regulatory role in translation"的研究论文,该研究建立了m7G单核苷酸拆分交联和免疫沉淀与测序(m7G miCLIP-seq)方法,以特异性检测内部mRNA m7G修饰。......阅读全文

杨运桂/杨莹开发新技术,首次获得m7G-mRNA高分辨率图谱

  在RNA分子中鉴定出超过150种RNA修饰。转录组分析是解码这些化学修饰的潜在功能的关键步骤之一。N7-甲基鸟苷(m7G)是tRNA,rRNA和mRNA 5'cap中存在的最丰富的修饰之一,并且在调节RNA加工,代谢和功能中具有关键作用。除了其在mRNA中的帽位置外,还在内部mRNA区域

科研人员研发RNA甲基化7甲基鸟嘌呤测序技术

  7-甲基鸟嘌呤(m7G)修饰是转录后调控中最常见的碱基修饰形式之一,广泛分布于tRNA、rRNA以及真核生物mRNA的5’帽子区,对维持RNA的加工代谢、稳定、出核以及蛋白质翻译具有重要作用。近期研究表明高等真核生物mRNA内部也含有m7G修饰,然而对其分布特征和调控作用目前尚不清楚。  中国科

新型RNA修饰m1A与m7G的物种保守性和动态调控条件

表观转录组学”是通过转录后修饰影响RNA的结构和功能,是近几年来生物学科里最热门的研究领域之一,目前已知的RNA修饰类型超过150种,其中包括m6A、m5C、m1A、m7G、2’-氧-甲基化、ac4C RNA乙酰化等。近期小编发现在探究RNA修饰领域中,各位m6A研究领域的鼻祖们又有了新的动作。

高分辨质谱到底“高”在哪里?

  高分辨质谱  用低分辨质谱测定时,分子的质量数都是整数表示,如CO、N2、C2H4和CH2N的质量都是28。如果用高分辨质谱测定就能得到如C2H4=28.031299,CH2N=28.018723,因此,根据高分辨质谱所测得的精密质量就可以对结构加以剖析和区别  小分子化合物确定结构式有多种方法

高分辨率人类基因变异图谱绘成

  由中、美、英等多国共同发起的国际合作项目“千人基因组计划”协作组近日宣布,已成功完成高分辨率人类基因组遗传变异整合图谱。相关研究论文11月1日在《自然》杂志上在线发表。   “千人基因组计划”是由中国华大基因研究院、英国桑格研究所、美国国立人类基因组研究所等多家机构共同启动的一项大规模人类基因

如何从层析图谱上看填料的分辨率

具体看你的溶液情况,可以分步处理,最终达到满意。一般填料前段都是要砂碳滤、精滤,目的是为了保护离子交换树脂,让其发挥最大的效果。至于到底选用什么树脂,看溶液的出水要求,都可以得到一个针对性的处理,操作起来也很简单

迄今为止最大且分辨率最高的胃癌图谱发布

  据物理学家组织网2日报道,新加坡科学家借助单细胞测序等尖端技术,绘制出迄今最大、分辨率最高的胃癌图谱。该图谱在单细胞水平上,提供了胃癌恶化及不同患者之间肿瘤差异的新信息,还确定了促使胃癌恶化并扩散到其他器官的分子途径,为更好地治疗该疾病提供了重要信息。  在最新研究中,科学家们从31名处于胃癌不

家蚕高分辨率甲基化图谱成功构建

  作为表观遗传学的一种重要标记,DNA甲基化在基因组防御、基因调控等方面都发挥着重要作用。相对于动植物,昆虫甲基化水平很低,其功能也一直存在争议。近年来,随着越来越多昆虫甲基化基因和甲基化酶的报道,昆虫甲基化的功能和生物学意义引起了广泛的兴趣。   近期,中国科学院昆明动

信使核糖核酸的提取、分离和纯化介绍

  真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U

信使RNA的提取、分离和纯化

真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)琼

关于真核细胞的mRNA的提取分离原理介绍

  真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U

简述寡聚(dT)纤维素柱层析法提取mRNA的原理

  真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U

高灵敏、高时间分辨率实时在线测量大气OH自由基

  近期,中国科学院合肥物质科学研究院安徽光学精密机械研究所研究员谢品华课题组在大气OH自由基外场高灵敏测量研究方面取得新进展,相关研究工作以《基于激光诱导荧光技术的对流层大气OH自由基外场探测系统》(Development of a field system for measurement of

我国首个高时空分辨率碳同化反演系统发布

  记者从中国科学院地理科学与资源研究所获悉,我国首个高时空分辨率碳同化反演系统——中科院碳追踪同化系统(CarbonTracker-China,CAS)于日前发布。依据该软件系统,可以通过大气二氧化碳浓度的观测数据来估算陆地生态系统碳源碳汇的分布信息。  2007年,美国国家海洋与大气局正式发布了

“化学脱笼”:实现蛋白质高时间分辨的原位激活

  在活细胞等生理环境下开展蛋白质功能的原位研究具有重要的科学意义。北京大学化学与分子工程学院陈鹏课题组长期致力于发展蛋白质的原位激活技术,希望为活细胞内的每一个蛋白质安装“调控开关”。  近日这一研究组与王初课题组合作发表了题为“Time-resolved protein activation b

人脑视觉fMRI图谱——高分辨率功能磁共振弱视神经

  幼年异常的视觉经验(如屈光参差或斜视)会导致弱视,严重损伤视锐度、颜色和立体视觉、眼动和注意等视觉功能,发病率在3%左右。由于技术上的限制,弱视在人类大脑中的神经机制尚不清楚,目前成人弱视缺乏针对性的有效治疗方法。从神经科学的角度,弱视是一个很好的神经发育模型,能够用来研究视觉经验依赖的发育可塑

Polyadenylation-of-mRNA

Gene expression requires the coordination and integration of multiple processes, including transcription, splicing, polyadenylation, nucleocytoplasmic

关于信使RNA的提取分享试剂准备

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南京大学在RNA表观遗传修饰鉴定方面取得进展

  图 (a)高分辨工程化纳米孔检测RNA表观遗传修饰原理示意图;(b)RNA主要表观遗传修饰的结构及其单分子纳米孔指纹信号;(c)—(e)酵母苯丙氨酸tRNA(tRNAphe)修饰图谱检测  在国家自然科学基金项目(批准号:21675083、91753108、31972917)等资助下,南京大学化

mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(1)

1.概 述mRNA差异显示技术(mRNA differetial display)是一种快速有效的克隆差异性表达基因的方法。 方法建立:1992年 Liang P和Pardee首次应用DD技术对比人类乳腺癌细胞与正常细胞所表达的mRNA,以此来克隆癌细胞所特有的基因 目前已应用于个各领域:

mRNA工艺技术平台之mRNA制剂

  mRNA疫苗或药物的生产工艺,主要分为质粒DNA原液制备、mRNA原液制备、mRNA制剂制备三个阶段。本文讨论第三阶段的工艺平台,也是当前挑战最大的环节。  关键的制剂技术突破解决了mRNA的成药性问题,使其从60年的科研之路走向临床商业化应用,并在此次新冠疫苗应用中大放异彩。据公开信息, BN

mRNA差异显示技术(mRNA-differetial-display)(2)

6.技术路线 mRNA 差异显示技术 The fluoroDD System •Builds on the HIEROGLYPH™ system –TMR-labeled anchored primers –Increased primer concentrations –I

天津工业生物所获得λ噬菌体基因表达的高分辨率图谱

  λ-噬菌体作为一种被广泛研究的有机体,已经成为研究基因调控的最简单模式菌株。无论是基因表达的集中研究还是现代矩阵杂交技术的应用,都阐明了λ-噬菌体在生长过程中基因功能的复杂性。最近兴起了一种核糖体图谱新技术,通过捕捉细胞内核糖体的瞬间翻译位点来为大家提供更细致和精准的基因表达图谱。

基于单细胞RNA测序绘制人类大脑高分辨率免疫细胞图谱

  近日,在德国弗赖堡大学医学中心科学家的指导下,一个联合研究团队利用单细胞RNA测序技术绘制了首个人类大脑高分辨率免疫细胞图谱!有史以来第一次证明大脑中的小胶质细胞(即吞噬细胞)具有相同的核心特征,并会根据大脑功能需求进行适应性表达,揭示了小胶质细胞的时间和空间异质性。2月14日,相关研究成果发表

骆清铭小组《科学》论文描绘小鼠全脑高分辨率图谱

  美国当地时间11月5日,第330期《科学》(Science)刊发了题为“显微光学切片层析成像获取小鼠全脑高分辨率图谱”的论文。该论文由华中科技大学武汉光电国家实验室(筹)生物医学光子研究中心教授带领的科研组在校完成。  该论文由武汉光电国家实验室(筹)生物医学光子学研究中心的李安

Science:发布首个全分辨率的人类基因组遗传图谱

  在一项新的研究中,来自冰岛基因解码公司(deCODE genetics)、冰岛大学和雷克雅未克大学的研究人员发布了首个使用全基因组序列数据开发出来的全分辨率人类基因组遗传图谱。  该图谱提供了迄今为止关于人类进化的两个关键驱动因素之间的位置、速率和关联性的最详细观察:重组(recombinati

信使RNA的mRNA提取分离纯化

真核细胞的mRNA分子最显著的结构特征是具有5’端帽子结构(m7G)和3’端的Poly(A)尾巴。绝大多数哺乳类动物细胞mRNA的3’端存在20-30个腺苷酸组成的Poly(A)尾,通常用Poly(A+)表示。这种结构为真核mRNA的提取 ,提供了极为方便的选择性标志,寡聚(dT)纤维素或寡聚(U)

真核premRNA加工的相关介绍

  mRNA的加工在真核生物、细菌和古细菌中差异很大。实质上,非真核mRNA在转录时是成熟的,除极少数情况外不需要加工。然而,真核pre-mRNA需要大量加工。  5’端加帽子:5‘ 帽(也称为RNA帽,RNA 7-甲基鸟苷帽或RNA m7G帽)就是一个经修饰的鸟嘌呤核苷酸,在转录开始不久后就被添加

真核premRNA加工过程

mRNA的加工在真核生物、细菌和古细菌中差异很大。实质上,非真核mRNA在转录时是成熟的,除极少数情况外不需要加工。然而,真核pre-mRNA需要大量加工。5’端加帽子:5‘ 帽(也称为RNA帽,RNA 7-甲基鸟苷帽或RNA m7G帽)就是一个经修饰的鸟嘌呤核苷酸,在转录开始不久后就被添加到新产生

中美科学家首次绘制高覆盖度单精子基因图谱

  中美科学家首次实现高覆盖度的单个精子全基因组测序,构建了迄今为止重组定位精度最高的个人遗传图谱,并得出基因起始区重组率降低的原因是分子机制而非自然选择的结论。这一结果将有助于遗传缺陷规律的探索。相关成果发表在12月21日出版的《科学》杂志上。   同源染色体之间的重组是产生生物多样性的重要机制