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IsolationofmicroRNA(miRNA)

实验概要 This protocol utilizes the powerful guanidine isothiocyanate–phenol:chloroform extraction method which allows the rapid isolation of total RNA including small RNAs. The conditions for extraction enable the partitioning of proteins and DNA into the organic layer of the biphasic solution interface, while retaining RNA in the upper aqueous layer. The aqueous phase is removed t......阅读全文

miRNA海绵—长效抑制miRNA

miRNA海绵随着研究的深入,已知miRNA的数量与日俱增,目前Sanger miRBase数据库中收录的人miRNA已达721条。不过,大部分miRNA的功能仍是未知数。在基因功能研究中,最有效的方法是阻止特定基因的功能,然后了解其后果。miRNA同样如此。然而,相比之下,miRNA的功能研究要困

帕博利珠单抗用于MSI-H/dMMR各类瘤种疗效

  创伤性股骨头坏死(TIONFH)是髋部创伤后引起的严重并发症,股骨颈骨折是最常见的原因,因此股骨颈骨折后早期筛查和诊断TONFH尤为重要。有研究发现,骨细胞、血管内皮祖细胞和血液流变学等异常改变与TIONFH相关,TIONFH患者体内微小核糖核酸(miRNA)表达谱也呈现出显著特异性改变。表明m

科研中的“新星”技术——MicroRNA荧光定量PCR

Micro RNA简介微小RNA(microRNA,简称miRNA)是生物体内源长度约为20-23个核苷酸的非编码单链小分子RNA,通过与靶mRNA的互补配对而在转录后水平上对基因的表达进行负调控,导致mRNA的降解或翻译抑制。是由具有发夹结构的约70-90个碱基大小的单链RNA前体经过Dicer酶

miRNA检测的三种方法

MicroRNA  (miRNA)是一种机体内源性表达的单链小分子RNA,位于基因组非编码区,本身不具有开放阅读框(open reading frame,ORF),具有高度保守性,时序性和组织特异性。miRNA广泛存在于各种真核细胞中,不编码任何蛋白质,长度仅为20~24nt。成熟

miRNA的qPCR检测

测序技术的引入促使miRNA研究领域进入快速发展阶段,然而qPCR仍是验证测序数据的重要标准。本文将为您介绍使用qPCR进行miRNA分析的基本要点,希望能帮助新人快速入门。什么是miRNA?miRNA是一类小的非编码RNA,能够与RNA诱导沉默复合物(RISC)结合,通过作用于mRNA,进而介导转

小分子RNA

RNA一度被认为仅仅是DNA和蛋白质之间的“过渡”,但越来越多的证据清楚的表明,RNA在生命的进程中扮演的角色远比我们早前设想的更为重要。RNA 干扰(RNA interference)的发现使得人们对RNA调控基因表达的功能有了全新的认识,更因为可以简化/替代基因敲除而成为研究基因功能的有力工具,

研究揭示microRNA抑制mRNA表达新机制

  为了让基因中包含的指令最终在体内发挥某些功能,构成基因DNA序列的核苷酸或者说碱基必须被读取并用于产生信使RNA(mRNA)。所产生的mRNA随后必须翻译成功能性的蛋白。细胞内的许多不同途径会影响这一重要的生物学过程,决定着基因是否、何时以及在多大的程度上表达。一类主要的调节因子是microRN

血清中 miRNA 抽提和实验设计经验谈

人体内的血液循环系统犹如印度的圣河 – 恒河,河水中携带的养分滋养着古老的大地;洗涤带走地上的ㄧ切污秽,人们的一生都在河水中完成。如此的恒河可以想象,河水中充斥着各种物质,有废物有养分,只要你想都可以从河水中捞取。同样的我们的循环系统如同恒河;流动的血液如同恒河水,身体所需的ㄧ切由血液运送,身体

miRNA与癌症:了解它们之间的关联

  在肿瘤发生的经典模型中,癌症通过慢慢积累突变、放任细胞增长而发生。许多这样的突变影响关键的调控蛋白,如原癌基因和抑癌基因。不过,非编码RNA基因的突变也同样有害,尤其是microRNA。  microRNA(miRNA)是一类22个核苷酸的调控转录本。它们与mRNA靶点相结合,或抑制其翻译,或诱

RIP技术研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合到核糖核

汪阳明组“miRNA与sgRNA联姻”打造基因编辑体系控制新平台

  miRNA是一类长度约22个碱基的核糖核酸分子,广泛表达于植物,动物以及病毒中。miRNA通过与Argonaute (AGO)等蛋白形成RNA诱导沉默复合物(RNA Induced Silencing Complex,RISC),在转录后水平抑制基因表达【1,2】。其表达谱呈现细胞特异性【3】,

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(五)

TaqMan miRNA的检测能力不同,是依据采用let-7a, let-7b, let-7c, let-7d 和let-7e 5个合成miRNA来检测低至一个核苷酸(图7)。每个miRNA的检测对应每个miRNA。相对探测效率是通过计完全匹配和不匹配的目标CT之间的差异,假设完美匹配的效率为1

miRNA和siRNA的基本介绍及区别

1998年,Andrew Fire和Craig Mello提出了一项新技术:通过dsRNA诱导特异基因的沉默,即所谓RNAi。2000年,Amy Pasquinelli等将lin-4和let-7作小时序RNAs(stRNAs,mall temporal RNAs)。RNA干涉(RNAi)在实验室中是

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(一)

摘要:已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分相关的甚至低至一个核苷酸的miRNAs。此外,他们不会受到基因组DNA

外泌体miRNA或将更适合结肠癌早期诊断

  结肠直肠癌(CRC)是全球诊断率排名第三的消化道恶性肿瘤。2018年,约有881,000人死于CRC。据统计,超过70%的CRC位于结肠,也就是结肠癌(CC)。CC在北美、欧洲和澳大利亚等地区的发病率和死亡率非常高。近年来,亚洲国家CC的发病率也逐年递增,CC的诊断和治疗已成为全球关注的热点问题

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(二)

miRNA的作用方式最早被发现的两个miRNAs——lin-4 and let-7被认为是通过不完全互补结合到目标靶mRNA 3’非编码区端,以一种未知方式诱发蛋白质翻译抑制,进而抑制蛋白质合成,阻断mRNA的翻译。多个果蝇miRNAs也被发现和他们的目标靶mRNAs的3’非编码区有部分同源

miRNA的特征、功能及识别方法等详解(三)

2) miRNA的靶基因预测方法 miRNA的研究意义之重大是毋庸置疑的。然而,与新的miRNA的频频发现相比,miRNA的功能研究相对缓慢。到目前为止,在发现的4449多个miRNA中,确定功能的miRNA仅有几十个。导致miRNA功能研究进展缓慢的非常重要的原因是miRNA的作用靶标难

miRNA影响椎间盘退变的机制研究进展

  在当今社会,腰痛(LBP)患者数量庞大,LBP患者也因此饱受病痛折磨,椎间盘退变(IDD)作为LBP的最主要病因,其发病机制十分复杂,目前已知的就有基因、年龄和包括职业因素、吸烟、酗酒在内的一些不良生活习惯等因素。据统计,作为腰痛的主要病因的IDD疾病一年会给全球的经济造成超过700亿欧元的损失

miRNA功能分析的五点建议

  随着microRNA(miRNA)研究的深入,很多人开始从miRNA的发现转入功能分析。miRNA抑制是一种确定miRNA功能的强大技术。如何开展,需要注意些什么?Exiqon公司的专家给出了五点建议。   1. 选择合适的抑制剂   若希望miRNA功能分析成功,首先要选择一个最适合您实验

Nature:脂肪细胞释放到血液中的miRNA调节其他的组织

  脂肪细胞不仅仅是存在于体内的脂滴,它们也释放激素和其他的信号蛋白,从而影响着多种组织。如今,在一项新的研究中,来自美国、瑞士和巴西的研究人员鉴定出脂肪细胞运送一类被称作微RNA(microRNA, miRNA)的小分子RNA的途径,而且所运送的miRNA有助调节其他的器官。相关研究结果于2017

Agilent miRNA芯片在各类样本中的应用(二)

3. 细胞样本细胞作为常用的实验材料,在生物及临床研究中被广泛应用,尤其是对于癌症的研究具有重要意义。细胞培养技术可以把来自机体的组织经分散成为单个细胞,放在类似于体内的体外环境中生长、繁殖或传代,从而用于观察细胞的各种生命现象。细胞可以用于细胞工程与细胞癌变等重要问题的研究。癌细胞体外培养是研究癌

RIP 技术——研究肿瘤发生和转移中microRNA失调的有力工具 一

microRNAs(miRNA)是一种内源性非编码小分子RNA,一般具有18到25个核苷酸,其序列在进化上高度保守,通过靶向特定mRNA来调节基因的表达。miRNA是越来越受关注的转录后调控网络(post-transcriptional control)中重要的调控因子。首先,miRNA结合

上海生科院利用STTM技术发现水稻miRNA的新功能

   5月1日,《美国科学院院刊》(PNAS)杂志在线发表了中国科学院上海生命科学研究院植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating importan

著名学者朱健康最新PNAS文章:利用STTM技术解析miRNA功能

  来自中科院植物逆境生物学研究中心的研究人员发表了题为Short tandem target mimic rice lines uncover functions of miRNAs in regulating important agronomic traits”的文章,利用STTM技术大规模沉

miRNA引物设计流程介绍

MiRNA的命名原则可以大致归纳如下:一个系统命名包含三部分内容,即物种,microRNA类别,序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示,如hsa,mmu和rno分别代表人,小鼠和大鼠。MicroRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre

PNAS:新研究扩大了人类microRNA的数量

  在公共数据库中,人类基因组产生microRNA的位置大约有1900处,而Thomas Jefferson大学的最新研究表明,这个数字将会是更加庞大的。  结果还表明,这些新的位点中,很多都是具有人类和组织特异性的,这将对疾病中miRNA的作用研究产生巨大的影响。  自从二十年前第一次发现miRN

microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术(四)

 图5。对热处理细胞,细胞裂解液和10 miRNA实时定量总RNA进行比较。用阈值循环(CT)来衡量miRNA的表达水平。每PCR扩增约400 HepG2细胞进行了分析。  图6。的TaqMan miRNAmiR-16的分析比较来解决以印迹杂交为基础的分析。总RNA来自

Nat Rev Genetics | 环状RNA的合成与功能

  环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种新兴的内源性非编码RNA(noncoding RNA,ncRNA),是继microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非编码RNA家族中极具研究潜力的新成员。越来越多的研究表明,环状RNA具

自动化的微流控芯片系统在单细胞中检测MicroRNA的异质性3

结论·  我们在C1TM单细胞自动制备系统开发了一种简洁的实验方案,能以最少的手工操作,在不到24小时内,平行处理高达96个单细胞,对其miRNA表达谱进行分析。·  C1 miRNA STA实验方案使用了Life Technologies为miRNA优化过的试剂。特别的,Meg

河北工业大学李建伟等开发强大miRNA-疾病关联预测工具

  MicroRNA(miRNA)是22nt左右的RNA,主要通过靶向mRNA的3'UTR区来调节基因表达。这些小的非编码RNA广泛参与重要的生物学过程,例如细胞分裂,分化,凋亡,细胞周期调节,炎症和应激反应。因此,miRNA的失调,包括表达失调,功能获得或丧失的突变以及表观遗传沉默,通常在