单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进行分类。因此，在该框架下，可以得到以下几个图： 图1. A．t-SNE细胞分群图及B细胞标记；B. B 细胞4个Marker基因标记分布图上述结果有两个特点：1.通过在Marker基因中寻找存在的细胞marker对细胞进行标记，但无法给出可靠性评价；2.只能用一个基因的表达模式来反应细胞特征，无法同时对几个基因进行整合展示。因此，能不能将上述多个基因同时对细胞分群结果进行分类和量化，从基因集的角度来反应细胞的类群？通过对最近发表分析算法的调研和调试，我们实现了这样一个需求。我们以上述标记基因: MS4A1，CD79A，C......阅读全文
基因测定方法系谱分析法
非整倍体测交法可以用来测定基因属于哪一个常染色体。用常染色体隐性突变型纯合体（a/a)和野生型二倍体（+/+）杂交，再用子一代杂合体(a/+)和隐性亲本回交,在它们的子代中表型是野生型的和表型是突变型的各占50%（见孟德尔定律）。杂交 a/a × +/+↓回交 a/+ × a/a↓回交子代 a/
基因测定方法系谱分析法
在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗
基因定位方法介绍系谱分析法
系谱分析法基因定位在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种
基因测定的方法系谱分析法介绍
在早期的人类遗传学研究中，基因所属染色体的测定一般都通过系谱分析进行。由于女子有两个X染色体，男子有一个X染色体和一个Y染色体，Y染色体上不存在和X染色体相应的等位基因（也就是说对于 X连锁基因来讲，男子是半合体）。因此男性患者的X连锁致病基因必然来自母亲，以后又必定传给女儿。这种遗传方式称为交叉遗
基因测定方法四分体分析法
由于子囊菌减数分裂所形成的四分体包被在一个子囊里，所以判断两个基因是否连锁，只需计算出各种类型的四分体数（即子囊数）。如果其中一个基因所属的连锁群已经知道，便很容易测定另一基因是否属于同一连锁群。表一四分体有三种，即亲代二型(PD)、非亲代二型(NPD)和四型(T)。如果有关的两个基因是连锁的，即P
朝鲜开发出诊断禽流感的基因分析法
朝鲜农业科学院兽医学研究所的研究人员最近开发出能快速诊断禽流感的基因分析法，并研制出新型诊断试剂。 据朝鲜中央通讯社7月21日报道，这家研究所的研究人员4年前揭示了世界流行的一些禽流感病毒的生物特性，并建立了相应的基因数据库。在此基础上，研究人员成功开发出在不需要标准血清和标准抗原的情况下，能迅
基因聚类分析法快速确定洄游鱼类种群分布
8月28日，记者从中国水产科学研究院获悉，该院珠江水产研究所李新辉等发明的“一种快速确定洄游鱼类种群分布及洄游路线的方法”获得国家发明ZL授权。 据介绍，过去研究洄游鱼类洄游路线，通常选用标志重捕法，但标记会造成鱼类损伤，回捕率也较低。 经过多次研究与实验，珠江水产研究院的科研人员发
使用－TAQMAN－分析法的高通量基因分型实验
实验材料 基因组DNA试剂、试剂盒 PCR 混合液仪器、耗材 96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤 1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng）基因组DNA，保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照，余下8孔每孔加2
基因定位方法介绍四分体分析法
由于子囊菌减数分裂所形成的四分体包被在一个子囊里，所以判断两个基因是否连锁，只需计算出各种类型的四分体数（即子囊数）。如果其中一个基因所属的连锁群已经知道，便很容易测定另一基因是否属于同一连锁群。四分体有三种，即亲代二型(PD)、非亲代二型(NPD)和四型(T)。如果有关的两个基因是连锁的，即PD是
使用－TAQMAN－分析法的高通量基因分型实验
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒PCR 混合液仪器、耗材96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng）基因组DNA，保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照，余下8孔每孔加24基因组
基因测定的方法四分体分析法
四分体分析法由于子囊菌减数分裂所形成的四分体包被在一个子囊里，所以判断两个基因是否连锁，只需计算出各种类型的四分体数（即子囊数）。如果其中一个基因所属的连锁群已经知道，便很容易测定另一基因是否属于同一连锁群。四分体有三种，即亲代二型(PD)、非亲代二型(NPD)和四型(T)。如果有关的两个基因是连锁
从微阵列数据发现癌症相关基因的新分析法
日前，美国德克萨斯大学和达特茅斯学院的研究人员开发出一种识别癌症基因的新型基因表达分析方法。相关研究结果以“How to get the most from microarray data： advice from reverse genomics”为题发表在2014年3月21日的《BMC Ge
华大参与：复杂宏基因组数据的新分析法
当前分析宏基因组数据的大多数方法，都依赖于与参考基因组的对比，但是许多环境中的微生物多样性远远超过了参考数据库所覆盖的范围。将复杂的宏基因组数据从头划分为特定的生物学实体（如特定的菌株或病毒），在很大程度上仍然是一个未解决的问题。 在2014年7月6日的《Nature Biotechnolog
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集
单细胞数据细胞分类与功能挖掘的基因分析法介绍
接触过单细胞转录组数据的小伙伴们都知道，数据的核心结果在于根据每个细胞的基因表达数据，来对细胞进行分群分类。现有通用的分析思路如下：首先根据转录组稀疏矩阵，通过计算和分析，找到不同的细胞Cluster，并找到每一类集群的Marker基因。根据已有对细胞特定Marker基因的认识，来对细胞可能的集群进
滴定分析法（容量分析法）概述（五）
（四）刻度吸管的使用方法 1.刻度吸管是由上而下（或由下而上）刻有容量数字，下端拉尖的圆形玻璃管。用于量取体积不需要十分准确的溶液。 2.刻度吸管有“吹”、“快”两种形式。使用标有“吹”字的刻度吸管时，溶液停止流出后，应将管内剩余的溶液吹出；使用标有“快”字的刻度吸管时，待溶液停止流出后
滴定分析法（容量分析法）概述（四）
2.滴定管的种类 （1）酸式滴定管（玻塞滴定管） 酸式滴定管的玻璃活塞是固定配合该滴定管的，所以不能任意更换。要注意玻塞是否旋转自如，通常是取出活塞，拭干，在活塞两端沿圆周抹一薄层凡士林作润滑剂（或真空活塞油脂），然后将活塞插入，顶紧，旋转几下使凡士林分布均匀（几乎透明）即可，再在活塞尾
滴定分析法（容量分析法）概述（二）
（九）配制滴定液时的计算 举例： 例1 配制高锰酸钾滴定液（0.02mol/L）2000ml，应取KMnO4多少克？ 解：m = C KMnO4V KMnO4M KMnO4 = 0.02×2000/1000×158.03 = 6.321g 例2：称取纯K2Cr2O7 0.1
滴定分析法（容量分析法）概述（一）
一、滴定分析法的原理与种类 1.原理 滴定分析法是将一种已知准确浓度的试剂溶液，滴加到被测物质的溶液中，直到所加的试剂与被测物质按化学计量定量反应为止，根据试剂溶液的浓度和消耗的体积，计算被测物质的含量。 这种已知准确浓度的试剂溶液称为滴定液。 将滴定液从滴定管中加到被测物质
滴定分析法（容量分析法）概述（三）
四、校正因子（F）1. 含义 校正因子 是表示滴定液的实测浓度是规定浓度的多少倍。 由于药典中滴定度是以滴定液的规定浓度来计算的，而在实际工作中所用滴定液的实测浓度不一定与规定浓度恰恰符合。所以在计算含量时，必须用校正因子（F）将滴定液的规定浓度时的滴定度校正为实测浓度时的滴定度。
极谱分析法极谱分析法原理及于伏安分析法的比较
极谱分析法(polarography)与伏安分析法( voltammetry)是通过测量电解过程中所得到的电流-电压(或电位-时间)曲线来确定电解液中含被测组分的浓度,从而实现分析测定的电化学分析法,它他们与电解、库仑分析法的区别在于电解池中的两个电极的性质,其中一个电极的电位完全随外加电压的变化而
库伦分析法
库仑分析法 Coulometric analysis 以测量电解过程中被测物质在电极上发生电化学反应所消耗的电量来进行定量分析的一种电化学分析 法。根据电解方式分为控制电位库仑分析法和恒电流库仑滴定法。①控制电位库仑分析法。在电解过程中，将工作电极电位调节到一个所需要的数值并保持恒定，直 到
仪器分析法
物质相互作用时产生各种实验现象。仪器分析就是利用能直接或间接地表征物质的各种特性（如物理的、化学的、生理性质等）的实验现象，通过探头或传感器、放大器、分析转化器等转变成人可直接感受的已认识的关于物质成分、含量、分布或结构等信息的分析方法。也就是说，仪器分析是利用各种学科的基本原理，采用电学、光学、精
恒电位库仑分析法恒电位库仑分析法
一、方法与装置 恒电位库仑分析法是在电解过程中控制工作电极电位相对于参比电极保持不变，并只有被测物质在电极上发生反应，当电解电流趋于零时，表示该物质已被完全电解，测量电解过程中消耗的电量，再按法拉第电解定律计算被测物质的含量。 恒电位库仑分析的仪器装置基本上和控制阴极电位电解法相
彗星分析法[单细胞凝胶电泳分析法]
治愈癌症(cancer)是一个难题，长期以来研究人员们一直在苦苦探索。我们目前知道，致癌的过程与许多因素有关，但如果我们能阻止其中的任何一个步骤，癌细胞便无法形成。因此，探测致癌物质的技术与癌细胞的及时发现就显得尤其重要！然而截至目前为止，研究人员们仍无法研究出一种简易基因测试法或综合的方法来检测出
彗星分析法(单细胞凝胶电泳分析法)
如果我们能阻止其中的任何一个步骤，癌细胞便无法形成。因此,探测致癌物质的技术与癌细胞的及时发现就显得尤其重要！然而截至目前为止，科学家们仍无法研究出一种简易基因测试法或综合的方法来检测出可能的致癌物。因此，致癌物对ＤＮＡ的作用仍是癌症研究的一个重要课题。遗传毒物学为一专门研究化学及各类物质对人体遗传
基因活性的同位素分析实验——原位裂解细胞的CAT分析法
实验材料转染细胞试剂、试剂盒Triton裂解液仪器、耗材培养皿培养箱实验步骤1. 60 mm 培养皿中转染了CAT表达质粒的细胞，用2 ml PBS洗1次。每培养皿加入2 ml 低渗缓冲液，在室温下温育2~5 min。2. 吸去低渗缓冲液，加入400 μl Triton裂解液。用橡胶刮子将细胞刮
质谱分析法
质谱仪种类非常多，工作原理和应用范围也有很大的不同。从应用角度，质谱仪可以分为下面几类：有机质谱仪：由于应用特点不同又分为：① 气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)在这类仪器中，由于质谱仪工作原理不同，又有气相色谱-四极质谱仪，气相色谱 质谱书籍-飞行时间质谱仪，气相色谱-离子阱质谱仪等。② 液相色谱
质谱分析法
先将中性分子离子化，再顺次分离和记录各种离子的质荷比和丰度先将中性分子离子化，再顺次分离和记录各种离子的质荷比和丰度( 强度)，从而实现分析目的的一种分析方法。