使用TAQMAN分析法的高通量基因分型实验

实验材料基因组DNA试剂、试剂盒PCR 混合液仪器、耗材96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加24基因组DNA作为阳性对照,两种纯合子各加4孔。2.每孔加23ul PCR混合液,盖上透明盖,在水平离心机上短暂离心,用ABI PRISM 7700测序仪得到一个PCR反应前荧光读数。使用「PlateRead」形式,确保选中Use Spectral Compensation forEndpoint 项(在Advanced Optionsinthe Instrument and Diagnostics菜单下)。3.用下面的条件在热循环仪上开始PCR。1个循环:2 min 50°C1个循环:10min 95°C(变性)40个循环:15s 94°C......阅读全文

TaqMan-Primer-and-Probe-Design

Adapted from TaqMan® One-Step RT-PCR Master Mix Reagents Kit InstructionDesign of Probes Keep the G-C content in the 20 to 80% range.Avoid runs of an

TaqMan探针法的操作

在之前发表的文章《实时荧光定量PCR检测方法,你选对了吗?》中提到,实时荧光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探针法、分子信标、荧光共振能量传递(FRET)和LUX Primers等。那么应用最为广泛的则是SYBR Green染料法和TaqMan探针法,两者各

使用-TAQMAN-分析法的高通量基因分型实验

实验材料 基因组DNA试剂、试剂盒 PCR 混合液仪器、耗材 96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤 1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加2

使用-TAQMAN-分析法的高通量基因分型实验

实验材料基因组DNA试剂、试剂盒PCR 混合液仪器、耗材96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加24基因组

TaqMan探针基因表达分析全面升级

TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了,然而你知道吗,对于部分降解的RNA,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品中的RNA,TaqMan引物探针的设计有更多的讲究,你知道这是为什么吗?FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化,RNA片段的大小在50-300 nt,大部分片段在100 n

定量PCR-Taqman探针设计要领1

自90年代Taqman探针诞生以来,虽然荧光探针(引物)不断有新的技术出现,但是作为一种经典的定量PCR技术,Taqman探针技术仍然是许多实验研究人员进行定量检测的首选,这主要是因为相对于SYBR荧光染料,Taqman探针具有序列特异性,只结合到互补区,而且荧光信号与扩增的拷贝数具有一一对应的关系

定量PCR-Taqman探针设计要领2

第三步:寻找一家信赖的公司合成引物和探针,一般引物合成大家比较熟悉,而且价格也比较便宜(特别是这两年便宜了许多),而探针则相对来说贵了许多,一般 Taqman探针合成在1000到5000元不等(不同的合成要求价钱不同)——而这只是标记价钱,序列合成基本上和引物合成价钱相似。 第四、五、六步:一般

TaqMan探针设计的基本原则

  1、TaqMan探针位置尽可能靠近扩增引物,但不能与引物重叠。  2、长度一般为18~40碱基。  3、G+C含量控制在40%~80%左右。  4、避免连续相同碱基的出现,特别是要避免GGGG或更多G出现。  5、在引物的5'端避免使用G。  6、选用比较多的碱基C。  7、退火温度Tm

实时荧光Taqman-探针设计的几个要点

实验室很多同学都要做Real time PCR实验,实验室的师兄师姐都会有很多宝贵意见,不过也有实验室前没有做过的,查找了下资料和大家分享下关于实时荧光 Taqman 探针设计、实时荧光PCR探针的选择、引物的设计及评价。荧光探针法是用序列特异的荧光标记探针来检测产物,探针法的出现使得定量PCR技术

SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)

snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼

荧光定量pcr-taqman为什么要用两步法

你这个结论并不对。两步法,三步法并没有本质区别,信号的读取都是在每一个延长结束后读取。定量PCR一开始的时候也是三步法的。两步法,是因为设计引物的时候把退火温度设为酶的工作温度,而且定量PCR的产物都很短,需要的时候都短,所以两步法更方便。三步法的话,花的时间长,不利于快速实验。

深蓝云qPCR知识小课堂TaqMan探针法的操作

  在之前发表的文章《实时荧光定量PCR检测方法,你选对了吗?》中提到,实时荧光定量PCR常用的方法包括了SYBR Green染料法、TaqMan探针法、分子信标、荧光共振能量传递(FRET)和LUX Primers等。那么应用最为广泛的则是SYBR Green染料法和TaqMan探针法,两者各有所

实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...2

下表列出了部分文献报道的TaqMan Probes技术所使用的酶和其它相关参数。   Target P1 P2 Probe Enzyme 退火温度 延伸温度 HCV 19

实时定量PCR技术综述(原理、荧光标记、TaqMan-Probes和...1

一.实时定量PCR基本原理1.PCR反应动力学右图为PCR反应曲线(横坐标为循环数,纵坐标表征产物量),不同的曲线代表初始模板量不同的 PCR反应。PCR反应的动力学公式为:Cn=C0(1+E)n其中C0和Cn分别为初始模板和n循环的拷贝数,n为循环数,E为扩增效率(0≤E≤1),理想状态下(即每个

肠道病毒EV71-TaqMan荧光定量RT-PCR法快速检测

  肠道病毒(EV)属于小RNA病毒科,根据血清学可以分为脊灰病毒、柯萨奇、埃可病毒和肠道病毒68~71型,共67个血清型。肠道病毒可引发众多疾病,并可暴发流行,导致死亡,严重危害人类健康。浙江省近几年由肠道病毒引起的无菌性脑炎〔1,2〕、手足口病〔3〕、急性出血性结膜炎和新生儿急性心肌炎等暴发疫情

实时荧光定量PCR检测方法SYBR-Green-I-法与TaqMan-探针法

来自美国Azure Biosystems公司的Azure Cielo™实时荧光定量PCR系统,融合了高品质Pilter温度模块和基于光纤传输的光学检测系统,为您的科学研究提供高精准、高灵敏的可靠结果。北京深蓝云生物科技有限公司已经为您准备好了仪器,期待您的试用哦~既然仪器已经备好了,那么该怎样选

Life-Tech试用最新产品―冻干TaqMan基因表达探针试剂盒

         试用最新产品——冻干TaqMan®基因表达探针试剂盒(含预混液) 尽享优质、便捷 新的冻干TaqMan®基因表达探针试剂盒(含预混液)是包含了实时荧光定量PCR反应所需的一切酶,dNTP试剂和探针/引物的混合物,大大简化了荧光定量PCR工作流程。由于移液步骤降至

TaqmanPCR技术检测淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体...

Taqman-PCR技术检测淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体的意义临床尿道炎患者中,淋病奈瑟菌、沙眼衣原体和解脲尿原体通常为共同感染状态,但常用的检测方法尚不能精确检测和鉴别,开发精确、灵敏、快速、无污染的临床诊断方法已经成为预防性传播疾病的重要措施。随着分子生物学的发展,基于Taqman-PCR

microRNA的实时定量茎环RTPCR技术

  microRNA的实时定量茎环RT-PCR技术   摘要:   已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分

microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(二)

图1。上图描述的是TaqMan miRNA的检测原理,基于TaqMan实时定量miRNA的包括两个步骤,茎环RT和实时PCR。茎环RT引物结合在miRNA分子的3'端和用反转录酶逆转录。然后,RT产品使用传统的TaqMan PCR定量,其中包括特定miRNA的正向引物,反向引物和

荧光标记基团的选择及其在荧光定量PCR中的应用

PCR实验室产品选择指南 荧光  基团是吸收一定波长的光子后发射特定波长的光波,可以作为抗体等分子的标记物,实时荧光定量PCR中的Taqman探针常用荧光基团FAM标记荧光基团和TAMRA标记。 荧光基团 吸收特定波长的光子后荧光染料(通常称为“荧光基团”或简称为“荧光素”)的化

microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(一)

摘要:已开发出一种新型的microRNA(miRNA)的定量方法,即利用茎环反转录,Taqman PCR分析。茎环RT引物在RT 效率和特异性方面比传统的更好。TaqMan miRNA的检测是很具体的,可以检测成熟miRNA和区分相关的甚至低至一个核苷酸的miRNAs。此外,他们不会受到基因组DNA

荧光定量PCR技术的荧光定量PCR的方法

接下来我们就来了解一下荧光定量的主要方法,我们如何选择合适的方法?荧光定量PCR所使用的荧光化学可分为两种:荧光探针和荧光染料。而荧光定量 PCR 的方法相应的可分为特异类和非特异类两类,特异性检测方法是在PCR反应中利用标记荧光染料的基因特异寡核苷酸探针来检测产物;而非特异性检测方法是在在PCR反

microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(四)

 图5。对热处理细胞,细胞裂解液和10 miRNA实时定量总RNA进行比较。用阈值循环(CT)来衡量miRNA的表达水平。每PCR扩增约400 HepG2细胞进行了分析。  图6。的TaqMan miRNAmiR-16的分析比较来解决以印迹杂交为基础的分析。总RNA来自小鼠肾,肝,肺,脾和睾丸组织。

microRNA的实时定量茎环RTPCR技术(三)

评估RNA分离的需要,我们直接在miRNA的检测中增加了细胞裂解物。相当于直接在7.5毫升逆转录反应中添加2.5-2500细胞。当检测到,在一些细胞中CT值相关R2>0.998)的RT反应至少有三个数量级(图4)。 图3。总RNA输入的阈值循环(CT)值检测8个miRNA的相关性。每RT反应中,小鼠

荧光定量PCR仪的技术指标

  独特设计的快速加热块可在极速运行的时候保证热均一性 TaqMan? Fast Universal PCR Master Mix和Fast SYBR? Green Master Mix可保证与标准实时PCR反应一样出色性能,并快速得到反应结果 快速光学反应板可确保在5-30?L反应体积下出色的检测

做-realtime-PCR之前,你应该如何着手设计引物

正在着手做 real-time PCR 的朋友们,我想最开始肯定要考虑引物设计的问题。看完下面的文字,我保证你得到想要的引物设计方法和引物序列。第一步:拿到你所要研究的基因的序列。不要告诉我你不会找序列。如果真的不会,请参考丁香园内其他版块,如NCBI使用,序列查找等。第二步:确定你想用哪种方法。T

siRNAs结合生物芯片的实验设计2

Figure 2. Silencer ™ siRNA Validation Data Generated Using Applied Biosystems TaqMan® Gene Expression Assays. The indicated Silencer Validated siRNAs

Life-Tech-qPCR在线中文视频

          Taqman Assay,实时荧光定量PCR的金标准 登入我们的网站,可直接观看qPCR 中文视频,了解AB在qPCR领域提供的多种产