使用TAQMAN分析法的高通量基因分型实验
实验材料 基因组DNA试剂、试剂盒 PCR 混合液仪器、耗材 96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤 1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加24基因组DNA作为阳性对照,两种纯合子各加4孔。2.每孔加23ul PCR混合液,盖上透明盖,在水平离心机上短暂离心,用ABI PRISM 7700测序仪得到一个PCR反应前荧光读数。使用「PlateRead」形式,确保选中Use Spectral Compensation forEndpoint 项(在Advanced Optionsinthe Instrument and Diagnostics菜单下)。3.用下面的条件在热循环仪上开始PCR。1个循环:2 min 50°C1个循环:10min 95°C(变性)40个循......阅读全文
使用-TAQMAN-分析法的高通量基因分型实验
实验材料 基因组DNA试剂、试剂盒 PCR 混合液仪器、耗材 96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤 1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加2
使用-TAQMAN-分析法的高通量基因分型实验
实验材料基因组DNA试剂、试剂盒PCR 混合液仪器、耗材96孔透明板和盖子水平离心机ABI PRISM 7700 测序系统热循环仪统计软件包实验步骤1.96孔透明板B到H行每孔加2ul (30ng)基因组DNA,保留A行作对照—其中4孔只加2ul缓冲液作为「无 DNA」对照,余下8孔每孔加24基因组
使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型实验1
单重 PCR 的引物延伸法实验材料目的基因组DNA试剂、试剂盒10 X PCR 缓冲液4dNTP 混合液Taq DNA 聚合酶SNP 引物仪器、耗材384孔黑色 PCR 板多管移液器或液体操作工作站384孔 PCR 板封口垫带加热盖的热循环仪FP 读板设备实验步骤展开
使用引物延伸荧光偏振探测法的高通量基因分型实验2
四重 PCR 的引物延伸法实验材料目的基因组DNA试剂、试剂盒10XPCR扩增缓冲液Taq DNA 聚合酶4dNTP 混合液PCR 引物混合液AcydoTerminator混合液仪器、耗材384孔透明 PCR 板和黑色 PCR 板多管移液器或液体操作工作站384孔 PCR 板封口垫带加热盖的热循环
高通量基因分型检测平台及其应用案例
Agripheno™高通量基因分型检测平台包括高通量Oktopure DNA提取仪、Nexar®模块化内联液体处理与分析系统、Soellex®高通量PCR水浴热循环系统和Araya®内联荧光检测系统。Oktopure DNA提取仪采用磁珠的方法提取DNA,通量达到800个样本/3小时。同时,适用于多
高通量测序基因分型系统规范-即将实施!
国家标准《信息技术 生物特征识别 高通量测序基因分型系统规范》将于2023年12月1日正式实施。 该标准由TC28(全国信息技术标准化技术委员会)归口,TC28SC37(全国信息技术标准化技术委员会生物特征识别分会)执行 ,主管部门为国家标准化管理委员会。 主要起草单位 深圳华大法医科技有限公
SLAFseq技术:大规模基因分型高通量策略
大规模基因分型在遗传相关性研究中起着重要作用,尤其是和高通量测序技术结合后,它为基因挖掘带来了新的机遇。大规模基因分型的有效解决方法:SLAF-seq(specific-locus amplified fragment sequencing),该技术前期利用生物信息学方法,对目标物种的参考基因组(
MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路
MD应用文章下载:SNP基因分型高通量检测方法新思路SNP基因分型高通量检测方法新思路单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种,占所有已知多态性的90%以
自动荧光的分型实验
实验材料DNA 样本试剂、试剂盒4dNTP 混合液MgCl2荧光染料标记的每个微卫星标记的正向引物每个微卫星标记的正向引物Taq DNA 聚合酶仪器、耗材96孔板烤干炉多道排管吸液器和消毒的试剂盘96孔塑料封膜5ml 和 50ml 的管子热循环仪实验步骤支持方案1 混合用于基因分型的荧光标记的 PC
高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享
KASP技术经验分享 KASP技术经验分享 KASP技术经验分享 重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答. 1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些? 我们要求所提交的
高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享
重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答. 1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些? 我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点
高通量SNP分子分型技术(KASP技术)经验分享
重要的事情说三遍,终于可以开始实验了,但在实验前或实验中乃在实验后,根据小编多年的经验,您可能会遇到以下问题,不用担心,待小编为您一一解答.1.引物设计提交序列时的注意事项有哪些?我们要求所提交的序列长度至少为目标位点上下游各50bp。请注意序列来源,尽量保证序列准确,多态性位点BLAST结果证明为
单精子分型实验——--精子分型数据分析
实验步骤一、须考虑的样本含量0.5 cM 的遗传学距离转变为 0.005 的重组率,表明要发生 5 起重组事件,平均需要观察 1000 例 scoreable 减数分裂。根据泊松分布(假定重组事件间相互独立、互不干扰),那么在上述事例中,有约 56% 的可能性观察到至少 5 起重组事件,有约 88%
HPV分型基因检测的简介
HPV分型基因检测指的是检测多种基因型HPV的同时可以对HPV阳性结果进行基因分型的检测技术。其利用包括PCR-荧光探针法或其他分子生物学方法在内的核酸检测技术,以特定高危型HPV核酸(包括DNA和RNA)序列为检测目的,对人宫颈样本(如人宫颈脱落上皮细胞或分泌物等)进行体外定性检测的试剂,以确
丙型肝炎病毒的基因分型
HCV基因分型还无统一标准,因用于基因分型的部位和采用的技术方法不同,出现了各种基因分型结果,但各种基因型分类方法之间有一定的对应关系,兹举几种基因型分类法供参考。 HCV基因型各种分型之间的对应关系 现知欧美国家多数HCV-Ⅰ型感染,而亚洲国家以Ⅱ型为主,Ⅲ型次之。Okomoto报告日本慢
HPV分型基因检测的意义
近年来,人类乳头状瘤病毒(HPV)的发现及分型为宫颈癌筛查提供了一个全新途径。1976 年,Zur Hausen H 首次提出人类乳头状瘤病毒(HPV)与宫颈癌的发病密切相关。随后大量流行病学资料及研究已明确显示 HPV 持续感染是宫颈癌发病的首要条件。绝大多数宫颈癌样本都可检出HPV,HPV阴
用PCR进行基因分型
与许多一次做数百块Southern blots的研究人员一样,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)时觉得见效很快,不再需要等几天才能看到结果,不再需要DNA显微图像或者操作紫外线了。随着技术的不断进步,RCR使基因组学和转录组学发生了翻天覆地的变化,甚至随着免疫PCR的普及开始进军蛋白
TaqMan探针基因表达分析全面升级
TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了,然而你知道吗,对于部分降解的RNA,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品中的RNA,TaqMan引物探针的设计有更多的讲究,你知道这是为什么吗?FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化,RNA片段的大小在50-300 nt,大部分片段在100 n
高通量测序分的原理
对DNA分子进行序列测定。1.对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。2.根据发展历史、影响力、测序原理和技术不同等,主要有以下几种:大规模平行签名测序(Massively Parallel Signature Sequencing, MPSS)、聚合酶克隆(Polony S
荧光基因分型筛查微小亚端粒重排实验
实验材料样品 DNA试剂、试剂盒PCR 引物氯化镁溶液dATP、dGTP、dCTP 和 dTTP 混合液Taq 聚合酶96孔板PCR热循环仪琼脂糖EB 溶液上样缓冲液电泳缓冲液Long Ranger™ 凝胶溶液尿素仪器、耗材水平凝胶电泳装置紫外透射反射仪滤膜GS-400 HD ROXABI 377
荧光基因分型筛查微小亚端粒重排实验
实验方法原理 实验材料 样品 DNA试剂、试剂盒 PCR 引物 氯化镁溶液dATP、dGTP、dCTP 和 dTTP 混合液Taq 聚合酶96孔板PCR热循环仪琼脂糖EB 溶液上样缓冲液电泳缓冲液Long Ranger™ 凝胶溶液尿素仪器、耗材 水平凝胶电泳装置紫外透射反射仪滤膜 GS-400 HD
基因分型定量检测技术的定义
基因分型定量检测系统是国际上在传染病流行病学应用中最广泛的检测诊断系统。主要通过基因芯片对HPV、HSV等DNA病毒进行检测,分析基因表达的类型,了解基因功能,从而指导疾病的诊断、预后、病理分析、治疗等各种研究。基因芯片主要用于DNA 突变分析、基因谱差异分析、基因诊断分析和大规模基因类型分析。 基
HPV分型基因检测的应用前景
近年来 HPVDNA 检测逐步取代原有的宫颈癌筛查手段,其筛查CIN2+ 病变的敏感度明显高于细胞学检查。[7]HPV 检测检出宫颈高级别病变的敏感性较单独细胞学检测更好,几乎等同于联合筛查。高危型HPV检测作为宫颈癌初筛策略具有较好的成本效能,随着价值医学理念的深入,单独 HPV 检测作为初筛
乙肝病毒的基因分型
HBV根据抗原决定簇的差异可划分为4个不同的血清型和9个血清亚型, 通过对HBV全基因序列比较后发现,血清亚型的区分并不能反应HBV基因组的差异。根据HBV全基因核苷酸序列异源性≥ 8.0% 或者S基因区核苷酸序列异源性≥4.0% , 将不同病毒株分为A-H 8个基因型。 HBV基
基因分型定量检测技术的原理
基因分型定量检测系统的核心是基因芯片技术,基因芯片技术是一种大规模集成的固相杂交,其技术要点主要包括芯片的制备、样品的制备及标记、分子杂交与检测、生物信息学分析四个方面。基本原理是核酸分子杂交,即应用显微光蚀刻技术把大量的DNA片段以可寻址的方式,高密度地固定到一小块载玻片上,利用核酸碱基之间的配对
关于单基因病的分型介绍
1.常染色体疾病(显性和隐形) 致病基因为显性并且位于常染色体上。如软骨发育不全、多指(趾)症、基因位于X染色体上:抗维生素D佝偻症等。亲代有一患者,后带发病率一般为50%(如亲代为纯合体、则后带发病率为100%,但这种情况较少)。 2.常染色体隐形遗传病 致病基因为隐性并且位于常染色体上
HP分型检测的分型
幽门螺杆菌(Hp)可以分泌毒素损坏人体细胞,引起炎症、溃疡及肿瘤等。依据其分泌毒素的情况不同,可以将其分为产细胞毒素和非产细胞毒素两大类;能产生毒素的为I型,不能产生毒素的是II型。 不同类型的幽门螺杆菌毒力 Ⅰ型HP由于产生细胞毒素,因此有较强的毒性,与胃十二指肠溃疡、MALT淋巴瘤及胃癌
HLA基因分型方法:RFLP法
RFLP法1)常规制备DNA盐析法1.用淋巴细胞分离液从抗凝血中分离出白细胞。2.每3ml细胞悬液加10ml红细胞裂解液溶解红细胞两次,再加2ml白细胞裂解液溶解白细胞。3.加50μl 10% SDS和70μl蛋白酶K消化蛋白质,37℃过夜或55℃ 3h。4.加0.25体积饱和醋酸钠溶液,剧烈摇动1
乙肝HBV基因分型检测原理
1、全面型别分析 采用Sanger测序法对乙肝病毒进行分型基因检测。通过提取慢性乙型肝炎患者血液中的病毒DNA,利用特异性引物对HBVDNA中的基因进行PCR扩增。通过对扩增后的目的基因进行测序,将测序信息与NCBI中标准株的序列信息进行比对,可一次性检出慢性乙型肝炎病毒A、B、C、D
用PCR进行基因分型1
与许多一次做数百块Southern blots的研究人员一样,我第一次用PCR做基因分型(genotyping)时觉得见效很快,不再需要等几天才能看到结果,不再需要DNA显微图像或者操作紫外线了。随着技术的不断进步,RCR使基因组学和转录组学发生了翻天覆地的变化,甚至随着免疫PCR的普及开始进军蛋白