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全基因组分析发现多个疾病相关基因

来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全组关联,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。 第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN10A的基因受到损伤或突然变异会增加患心脏病的风险。研究人员希望,他们的发现能帮助他们了解人体的心跳如何受到控制,能最终帮助他们找到治疗心律不齐的新办法。 脏病是世界上主要的死亡原因,其死亡人数每年约占七百万,英国约有十万。因严重的心律不齐(比如心室纤维性颤动——能导致心跳停止的心脏短路)而突然造成死亡的人数占半数以上。人的心跳受电信号控制,开始于中心地区——心脏起搏器——并环绕心脏肌肉运行。 伦敦帝国理工学院的流行病、公共和初级护理部研究报告的John Chambers博士表示,“基因变异就像硬币的两面,一面与增加风险有关,另一面与降低风......阅读全文

全基因组分析发现多个疾病相关基因

来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全组关联,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。 第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN10A的基因受

全基因组分析发现多个疾病相关基因

  来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全基因组关联分析,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。   第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因

  在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因

  在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因 2

图1.2. 全基因组连锁分析结果。最高LOD值为3.01。接下来,研究使用了Agilent SureSelect平台对其中一例患者进行了外显子测序,测序深度为100X,但并没有发现功能相关变异。于是作者又进行了全基因组重测序,测序平台为Illumina Hiseq XTen,测序深度为平均每

全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因 1

在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。该研

研究发现全新全基因组组装方法

   十年前,Illumina基因组测序技术进入市场时,前所未有的庞大数据量淘汰了较早开发的测序分析工具。  历史总是重演。如今,第三代测序技术已经达到低成本群体测序规模的临界点。  英国时间12月9日,《自然—方法学》在线发表了第一个能够跟上基因组测序产生速度的组装算法。  这篇论文只有两位作者,

多国实施全基因组分析计划

  由于基因测序可以探查与特定疾病相关的基因,该疗法正在成为日益受欢迎的诊断方法。   英国计划到2017年对10万人进行基因组测序。   美国加州一对龙凤胎出生后,他们的父母非常忧虑:两个婴儿不仅发育缓慢,而且肌肉松软无力。大脑扫描结果显示,男婴或存在大脑性麻痹;然而医生对造成女婴震颤和癫痫

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴...

靶向捕获测序应用于多基因遗传病银屑病的致病基因鉴定银屑病,俗称干癣,是一种常见的具有特征性皮损的慢性易于复发的炎症性皮肤病,被认为是是遗传因素与环境因素等多种因素相互作用的多基因遗传病。 在以往对多基因遗传病的发病机理探索中,研究者们通过正常与疾病对照样本的基于SNP芯片的全基因组GWAS实验,寻找

全基因组及转录组测序案例分析

案例:应用全基因组测序和 RNA 测序来描绘常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)的基因图谱 背景:常见的变异型免疫缺陷综合症(CVIDs)是机体免疫应答反应中不能产生抗体的最主要原因。CVIDs 变异度很高,大概 5% 的病人是由基因改变引起的。 目的:利用 Illumina HiSeq25