果蝇细胞中发现五种主要染色质类型

该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型 转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型,但它应该进行升级,以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基因组分析表明,染色质有五种主要类型;这些可以构成描述表观基因组的新框架。 阿姆斯特丹市荷兰癌症研究所的Guillaume J. Filion和同事从染色质蛋白质组中选择了一组宽泛的蛋白质,并利用DamID方法在一个胚胎果蝇细胞株中绘制了它们的基因组位置。在这项技术中,每种感兴趣的蛋白质都被混合了DNA腺嘌呤甲基转移酶(Dam),它利用一个甲基腺嘌呤足迹标记了蛋白质—DNA的相互作用位点。研究人员随后利用一种数据驱动的计算分类策略在整个基因组中鉴别出了周期性的、完全不同的蛋白质组合。基因组区域——长度从1kb变化到100多kb——通过......阅读全文

曹雪涛发Nature综述:抗感染固有免疫反应的表观遗传调控

  曹雪涛院士全面阐述了近年来关于表观遗传调控因子在感染诱导的天然免疫和炎症反应中的调控作用的代表性研究成果。  表观遗传学立足于染色质层面,涉及DNA、非编码RNA和组蛋白等染色质相关分子的调控,为近年来世界生命科学前沿的热点领域。其研究生命体分化发育过程中,在基因组不变的情况下,产生表型和功能各

中南大学医学表观基因组学实验室获批湖南省重点实验室

中南大学医学表观基因组学实验室正式获批湖南省重点实验室  根据湖南省科技厅《关于同意组建2010年度省级重点实验室的通知》(湘科计字【2010】116号)精神,中南大学医学表观基因组学实验室正式获得立项批准组建省级重点实验室,建设期为2年,此次湖南省有6个实验室获得批准。  医学

新的基因编辑领域突破口——表观遗传调控(一)

几十年来,DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质,但是近些年不断的研究表明,生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的,比如科学家们发现,可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰,这种改变不仅影响个体的发育,而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起,且与DNA和组蛋白修饰

八年!“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划

  DNA上核苷酸序列承载了生命的遗传信息,遗传物质能够遵循孟德尔遗传法则代代相传。遗传信息从DNA传递给RNA,再从RNA传递给蛋白质,完成遗传信息的转录和翻译过程。  随着时间推移,科学家们逐渐认识到,即使从上一代那里复制获得的DNA序列不发生变化,基因表达也会发生能够继承的变化。上世纪80年代

Science树立新观念:能遗传的不仅仅是基因

  我们不仅仅是基因的总和。由饮食、疾病或生活方式等环境因素调节的表观遗传机制可以通过调节基因的开关来调节DNA。长久以来人们一直争论不休的是:如果表观遗传修饰在整个生命中积累,它是否可以跨越世代的边界,遗传给下一代。  现在,德国Max Planck研究所的免疫生物学和表观遗传学研究人员获得有力的

饮食改变衰老过程的表观遗传学修饰

  表观遗传学修饰可以不改变基因编码,而影响基因的开启或关闭。研究人员对185位志愿者(84位男性和101位女性)的直肠组织切片进行了研究,发现人体内基因的表观遗传学修饰主要受衰老的驱动,不过日常饮食也会对表观遗传学修饰产生重要影响。该研究发表在十二月六日的Aging Cell杂志上。   研

Cell:朊蛋白,表观遗传学的新层面

  朊蛋白prion总是与疯牛病和克-雅氏病等联系在一起,不过人们正逐渐意识到,朊蛋白在生物中也能够发挥正常的有益功能。   日前科学家们发现,朊蛋白能够使酵母从常规单细胞形态转变为多细胞协作形式,并由此在不利环境条件下增大酵母的生存几率。这种可遗传的改变不会影响酵母基因组,是一种表观遗传学现象。

神经精神疾病的表观遗传学关联

  根据加州大学欧文分校的科学家报道,多巴胺信号的功能障碍,可深刻地改变大脑前额叶皮层中大约2000个基因的活性水平,可能是某些复杂神经精神疾病(如精神分裂症)的一个根本原因。  接收这种神经递质的脑细胞中基因活性的这种表观遗传学改变,首次表明多巴胺不足会影响前额叶皮层中调控的各种行为和生理功能。 

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

Science新闻:表观遗传学印记让基因“窒息”

  吸烟留下的可不仅仅是衣服和手指上的烟味,现在一项新研究提出了强有力的证据指出,吸烟能够通过表观遗传学修饰影响增加癌症发病风险的基因活性。这一发现,为研究者们提供了一个评估吸烟人群癌症风险的新工具。   我们DNA上的化学修饰可以影响基因的功能,决定基因的开启和关闭,这些化学修饰被称为表观遗传学

何川教授eLife最新表观遗传学成果

  7月2日,国际著名学术期刊《eLife》在线刊登了芝加哥大学何川教授(Chuan He)和俄亥俄州立大学Li Wu带领的一项研究成果,题为“N6-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protei

表观遗传学变异或可解释慢性肾病

  由宾夕法尼亚大学佩雷尔曼医学院肾电解质和高血压部门的医学副教授、临床科学家Katalin Susztak博士带领的一项研究,试图阐明慢性肾病的分子根源和遗传素质,其研究成果发表在最近的Genome Biology杂志上。   在这项研究中,Susztak和她的共同通讯作者、来自阿尔伯特爱因

Science:表观遗传学实现行为重编程

  在佛罗里达木蚁中,大工蚁(majors)和小工蚁(minors)属于两个完全不同的阶级,它们的社会性行为存在很大差异。宾夕法尼亚大学领导的研究团队发现, 这些阶级特异性的社会行为并非一成不变,可以人为地进行表观遗传学重编程。这一重要成果发表在本期的Science杂志上。  表观遗传学修饰可以在不

厦门大学PNAS表观遗传学新文章

  来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。  厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教

美国女院士表观遗传学新成果

  TET(ten-eleven translocation)蛋白是生物体内存在的一种α-酮戊二酸(α-KG)和Fe2+依赖的双加氧酶,是DNA去甲基化过程中的一种重要的酶,对于维持干细胞的多能性有重要作用。多年来,科学家了解到,TET蛋白家族有肿瘤抑制因子的作用,但是,它们是如何抑制失控的癌细胞增

朱冰:表观遗传学过去,现在,未来

  由北京生命科学研究所朱冰研究组领衔完成的Science研究论文,揭示出染色质的紧密程度能调节组蛋白H3K27甲基化酶复合体PRC2的催化活性,从而影响基因转录,这有助于解析基因转录调控以及基因沉默的重要机制。为了更深入追踪这项研究的具体内容,生物通特联系了朱冰研究员,就几个方面请教了他。   

表观遗传学药物有望解决癌症治疗难题

  表观遗传学是一种调控基因表达的可逆途径,通过DNA和组蛋白的化学修饰,决定特定基因是否能得以表达。在癌症中,表观遗传学修饰的添加或删除,与肿瘤抑制基因的沉默或者癌基因的过表达有关。有研究显示,在标准的化疗流程之前先用表观遗传学药物处理癌细胞,可以增强这些细胞对抗癌药物的敏感性。这样的措施将大大有

世界最大表观遗传学研究项目正式启动

  表观遗传学:主要探索细胞内随时发生的化学变化如何影响基因的活动。这些化学变化有些可能是随机的,有些可能与生活方式或者饮食有关,而这种影响可能持续多代。  记者从华大基因研究院获悉,作为人类基因组学研究中最具潜力的项目之一,全球最大的表观遗传学研究项目将于9月6日正式启动。  该项目将对

表观遗传学研究揭示拉美人长寿之谜

  加州大学洛杉矶分校UCLA的研究人员首次证实,拉美人(Latinos)的衰老速度的确比其他民族的慢。这项研究发表在本期的Genome Biology杂志上,有望帮助科学家们找到适合所有人的抗衰老途径。  “尽管拉美人患糖尿病和其他疾病的比例较高,但他们的寿命比高加索人长。这被科学家们视为一种难以

吉林大学Cell子刊发表表观遗传学研究成果

  高等生物的基因组DNA围绕着由四种组蛋白组成的八聚体,形成碟状的核小体结构。基因组DNA以这样的形式包装成为染色质,使DNA受到良好的保护。染色质的结构和动态受到组蛋白表观遗传学修饰的调控,比如最近发现的组蛋白赖氨酸巴豆酰化。这种组蛋白修饰在基因表达、DNA损伤应答等重要的细胞过程中起到了关键性

人体如何发育?首次揭示人类早期胚胎染色体结构动态

   人体是如何发育的?个体差异是怎么产生的?疾病又是如何来的?科学家正一步步揭开其神秘面纱。  12月5日,《自然》杂志刊发了中国科学院北京基因组所研究员刘江团队与中国科学院院士、山东大学附属生殖医院教授陈子江团队合作研究成果,该研究首次揭示了人类早期胚胎中的染色体三维结构的动态变化,并发现CTC

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

  *本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供   染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神

杰出女科学家再发Cell解析调控机制

  来自美国麻省大学医学院,英国牛津大学等处的研究人员发现DEAD-box家族蛋白中两个成员:UAP56和Vasa在piRNA生成和功能行使过程中扮演了重要角色,并指出了一种新型核周转录沉默机制。相关成果公布在Cell杂志上。   文章的通讯作者分别是麻省大学医学院生物信息学和整合生物学部的翁志萍

患者基因组的3D结构促进膀胱癌和儿童脑部肿瘤发生

  儿童高级别胶质瘤(pHGGs,Pediatric high-grade gliomas)包括多形性胶质细胞瘤(GBM)和扩散型内因性脑桥神经胶质瘤(DIPG,diffuse intrinsic pontine glioma),其均是病态的脑部肿瘤;即使患者经过治疗,其生存率仍然很低,这就使得pH

达尔文加拉马克,可能才是完整的进化论

  随着科学的进一步发展,达尔文理论也显示出了一些不足之处。  所谓物竞天择,适者生存,现代生物学的许多主流研究方向都以查尔斯·达尔文(Charles Darwin)“自然选择”的进化论为基础:只有最能适应环境的生命体才能在物种演化的洪流中获得生存和繁衍的权利。这个自然选择的过程也被称为适应,而最容

Nature-|-刷新认知!科学家首次证明,没有基因突变也会发生癌症

  尽管癌症的发生和发展通常与体细胞突变的积累有关,但大量的表观基因组改变是肿瘤发生和癌症易感性的许多方面的基础,这表明遗传机制可能不是恶性转化的唯一驱动因素。然而,是否纯粹的非遗传机制足以启动肿瘤发生,而不管突变是未知的。  2024年4月24日,法国蒙彼利埃大学 A.-M. Martinez1、

山东大学Cellstemcell干细胞研究新成果

  来自山东大学医学院和密歇根大学的研究人员发表了题为“The Histone Acetyltransferase MOF Is a Key Regulator of the Embryonic Stem Cell Core Transcriptional Network”的研究论文,证实组

不容忽视的表观基因组

  肥胖有可能不仅写在基因之中,也写在基因之上。迄今为止最大型的一项探讨人类表观基因组(epigenome)的研究发现,某些表观遗传标记与身体质量指数(body mass index,BMI)相关。   科学家们报告称在2500多人的血液和脂肪细胞发现与新陈代谢相关的一个基因发生了化学改变。这

首次绘制小麦表观基因组图谱

  最近,英国利物浦大学的科学家们,对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化,进行了首次全基因组范围的调查,这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读:权威期刊发布首个小麦单体型图谱。  表观遗传标记是一种化学标签,将自己附着在DNA上

Nature子刊:CRISPR发现表观遗传对染色体的影响

染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化,对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展,科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作,他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神疾病的患病风险息息相关,但这一研究领域仍存在许多未解之谜。来自西