果蝇细胞中发现五种主要染色质类型
该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型 转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型，但它应该进行升级，以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基因组分析表明，染色质有五种主要类型；这些可以构成描述表观基因组的新框架。 阿姆斯特丹市荷兰癌症研究所的Guillaume J. Filion和同事从染色质蛋白质组中选择了一组宽泛的蛋白质，并利用DamID方法在一个胚胎果蝇细胞株中绘制了它们的基因组位置。在这项技术中，每种感兴趣的蛋白质都被混合了DNA腺嘌呤甲基转移酶（Dam），它利用一个甲基腺嘌呤足迹标记了蛋白质—DNA的相互作用位点。研究人员随后利用一种数据驱动的计算分类策略在整个基因组中鉴别出了周期性的、完全不同的蛋白质组合。基因组区域——长度从1kb变化到100多kb——通过......阅读全文
Nature子刊解析干细胞的多能性机制
来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项新研究中解析了胚胎干细胞的多能性，即它们可以无限自我更新，并分化为人体内所有成熟细胞类型的能力。解析这一问题是现代生物学的一个重大挑战，有可能加速实现胚胎干细胞在细胞治疗和再生医学中的应用。如果科学家们能够复制实现多能性的机制，他们就可能在实验室构建出能够植
BioTechniques：生命科学2015十大最新引人的成果
2015年，我们研究细胞功能的方式，发生了一些惊人的变化，从蛋白质翻译起始的新模型和“RNA如何存在于细胞中”的再定义，到赋予旧测序仪器新的生命力，以及一个令人惊讶的衰老驱动机制。随着夏天的到来，BioTechniques为我们展示了今年到目前为止最流行的十大深度专题文章。 1. 父
Science：人出生时自带“出厂说明书”
人体中至少存在250种不同类型的细胞。它们虽然携带顺序完全相同的DNA碱基序列，但肝脏细胞和神经细胞咋就看起来不太一样呢？ 造成这种差异的原因是表观遗传学程序。表观遗传学修饰能标记DNA的特定区域，吸引或驱赶能激活基因的蛋白质。每一类细胞都有一套专属的基因表达激活模式。与固定的DNA遗传代码不同
使用重组的果蝇因子进行染色质装配实验1
实验材料重组的 NAP－1纯化的果蝇核心组蛋白重组的 ACF质粒 DNA试剂、试剂盒HEG 缓冲液KClPvOH PEG 溶液BSA 溶液MgCl2CaCl2重组的拓扑异构酶 Ⅰ 工作溶液缓冲液 R微球菌核酸酶储液EDTARNase A糖原终止缓冲液酚 氯仿 异戊醇乙醇仪器、耗材27℃ 和 30℃
使用重组的果蝇因子进行染色质装配实验2
重组染色质装配反应中的核心组蛋白与 DNA 比率的滴定实验材料见基本方案试剂、试剂盒见基本方案仪器、耗材见基本方案实验步骤1. 按照基本方案 6 步骤 1～6 操作。要得到真实浓度的近似值，DNA 的浓度由 A260 值计算得到，组蛋白的浓度通过 BCA 分析系统来确定。2. 按如下所述进行 5 个
－Nature：庄小威团队实现染色质组织的直接成像
后生动物基因组在空间的多个尺度上，通过DNA围绕着核小体将整条染色体分为不同的区域隔离包装。染色质在细胞核中是怎样折叠的对从基因表达的调控到DNA复制的很多生物过程都有重要意义。从千碱基到兆碱基的规模，其中包括基因的大小，基因簇和调控域，三维DNA的组织方式在多基因调控机制被涉及到，但了解这个组
Nature子刊发布大脑表观遗传学重要图谱
表观遗传修饰的重要性越来越被人们所认识，但在人类大脑中的作用并不是很清楚，实际上在胚胎和成人大脑中，神经干细胞增殖并通过一些受到高度调控的过程生成神经元和神经胶质，包括DNA和组蛋白修饰以及非编码RNAs调控在内的表观遗传学机制在神经发生的不同阶段发挥至关重要的作用。另一方面异常的表观遗传调控也
表观遗传学研究获重大突破
同济大学高绍荣团队首次从全基因组水平上揭示了小鼠植入前胚胎发育过程中的组蛋白H3K4me3和HK27me3修饰建立过程，并发现宽的H3K4me3修饰在植入前胚胎发育过程中对基因表达发挥重要调控作用。相关成果9月15日在线发表于《自然》。 高绍荣研究组利用极少量的细胞检测了小鼠植入前胚胎发育各个
Nature报道表观遗传学新发现
日前，芝加哥大学的科学家们在Nature上发表最新的研究成果。这项研究揭示了N6-甲基腺苷（N6-methyladenosine，m6A）调控RNA-蛋白质相互作用的一个未知机制。 RNA结合蛋白通过与单链RNA结合基序（RNA binding motif，RBMs）1、2、3的结合来控制细胞
Nature：遏制哮喘的表观遗传学酶
研究人员发现重编程小鼠体内促哮喘的免疫细胞可以减少气道损伤和炎症，并有可能促成哮喘患者的新治疗。 研究人员能够重编程的促哮喘细胞是一种称为Th2细胞的免疫细胞，他们确定了一种可以修饰这些细胞DNA的酶。该酶可作为开发过量Th2细胞导致的慢性炎症疾病，尤其是过敏性哮喘的新疗法的一个靶点。相关
JCB：“流放”DNA的表观遗传学修饰
皮肤细胞在发挥作用时启动的基因与肝细胞完全不同，而其他基因需要保持关闭。将基因“流放”到细胞核边缘，是能够一举关闭大量基因的重要途径。Johns Hopkins大学的一项新研究揭示了DNA被发配到细胞核边疆的具体机制，这一过程对于控制基因表达和决定细胞命运至关重要。相关论文发表在近期的Journ
Nature：癌症与表观遗传学重编程
延胡索酸（fumarate）是细胞三羧酸循环的一种中间产物。它天然存在于蔬菜水果中，也被用作调味的食物添加剂。Nature杂志发表的一项最新研究表明，代谢物延胡索酸过多会造成表观遗传学重编程，进而推动癌症发展。 遗传性平滑肌瘤病和肾细胞癌（HLRC）是一种罕见的人类癌症，会引起皮肤肿瘤和肾癌。
PerkinElmer发布表观遗传学和NGS新品
在上周举行的实验室自动化和筛查学会(SLAS)第二届年会上，PerkinElmer公司展示了一系列新产品，包括表观遗传学生化工具箱、JANUS® NGS Express™液体处理工作站和Sciclone® NGSx Workstation™平台。 表观遗传学新品 表观遗传学生化工
PNAS首次评估表观遗传学突变率
Groningen大学的科学家们在重要模式生物拟南芥中，精确评估了表观遗传学标志出现或消失的频率，有助于深入理解表观遗传学改变在植物进化中的重要性。这项研究发表在五月十一日的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 表观遗传学修饰可以在不改变DNA序列的情况下影响基因的活性。大多数动物（包括人类）的
Nature综述：表观遗传学预测癌症弱点
由Bellvitge生物医学研究协会癌症表观遗传与生物学研究组Manel Esteller领导的研究组，发表题为“DNA methylation profiling in the clinic: applications and challenges”的综述文章，概况了近期在应用表观遗传
表观遗传学有助解释妊娠高血压
弗吉尼亚联邦大学（VCU）医学院的研究者发现，一种关键酶的基因表达变化可能会导致有先兆子痫的孕妇出现高血压，并使她们形成血栓的易感性增加。这些结果可为孕妇高血压和血栓形成的最佳治疗方法提供线索，高血压和血栓形成可能会阻断孕妇内脏器官的血流，并且导致器官衰竭。 研究者一直致力于从分子层面
表观遗传学热点酶的作用机制
加州大学圣芭芭拉分校的研究人员发现大肠杆菌的Dam酶在DNA上移动进行修饰时会发生“跳跃”，并对其物理特性和行为进行了分析，这一研究成果能为生物医学研究和其他科学应用提供帮助。该文章发表在Journal of Biological Chemistry杂志上。 大肠杆菌的适应机制使其能依
表观遗传学关于DNA甲基化
表观遗传学是研究表观遗传变异的遗传学分支学科从目前的研究来看,X 染色体剂量补偿、DNA 甲基化、组蛋白密码、基因组印记、表观基因组学和人类表观基因组计划等问题都是表观遗传学研究的内容。其中甲基化是基因组DNA 的一种主要表观遗传修饰形式,是调节基因组功能的重要手段。在脊椎动物中,CpG二核
著名学者庄小威《Nature》发布重要表观遗传发现
来自哈佛大学及麻省理工学院的研究人员称，她们采用超分辨率成像揭示出了不同表观遗传状态的独特染色质折叠。这一重要的成果发布在1月13日的《自然》（Nature）杂志上。 论文的通讯作者是著名的华人女科学家庄小威（Xiaowei Zhuang）。庄小威早年毕业于中国科技大学少年班，34岁时成为了哈
表观遗传学开关控制基因节律性转录
当夜晚降临，我们就会慢慢入睡，这是受昼夜节律circadian cycle影响的结果，我们的每个器官甚至基因中都存在这样的节律。 Salk研究所的科学家发现，表观遗传学修饰是使肝脏活性与昼夜节律同步的遗传学开关。这一发现能够帮助人们进一步了解高血糖、高胆固醇等健康威胁背后的机制，文章于近期
解读“生命之书”－－新发现填补人类基因组图谱空白
美国加州大学圣地亚哥分校（UCSD）的研究人员制作了一份人类基因组的单细胞染色质图谱，确定了240种多基因特征和与疾病特征相关的细胞类型，并注释了非编码DNA变异的风险，有利于更好地理解遗传学与疾病之间的联系。这一发现发表在12日的《细胞》杂志在线版上。 此前，科学家在公布最新的被称为“生命之
百花齐放的单细胞分析技术
世界上没有完全相同的两片树叶，世界上也没有两个相同的细胞，单个细胞都是dute的，它们在大小、蛋白质水平和所表达的RNA转录子方面都可能相差甚远。单细胞分析（Single Cell Analysis ，SCA）即是对单个细胞进行研究，研究单个细胞不仅可以很好的认识到细胞异质性，而且可以更好的对疾病进
Nature子刊：殊途同归的疾病通路
面肩肱型肌营养不良症FSHD是一种严重的遗传疾病，患者会经历进程性的肌无力，约五分之一的患者在40岁时需要使用轮椅。FSHD通常是可遗传的，不过有时也会由于新突变而发病。科学家们发现了FSHD的新发病机制，阐述了表观遗传学修饰在该疾病发生中的作用，文章发表在十一月十一日的Nature Gen
ncRNA在精子发生过程中的关键作用研究
Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA（ncRNA），既不编码蛋白质，又缺乏生物学功能的遗传学证据，近几年得到了“平反”，越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage comp
研究揭示人类早期胚胎组蛋白修饰重编程
2019年7月4日，郑州大学孙莹璞课题组与清华大学颉伟课题组在Science上发表研究长文Resetting histone modifications during human parental-to-zygotic transition，揭示了人类早期发育过程中组蛋白修饰的重编程过程。表观遗
Nature－|－刷新认知！科学家首次证明，没有基因突变也会发生癌症
尽管癌症的发生和发展通常与体细胞突变的积累有关，但大量的表观基因组改变是肿瘤发生和癌症易感性的许多方面的基础，这表明遗传机制可能不是恶性转化的唯一驱动因素。然而，是否纯粹的非遗传机制足以启动肿瘤发生，而不管突变是未知的。 2024年4月24日，法国蒙彼利埃大学 A.-M. Martinez1、
清华大学Cell子刊发表表观遗传学新成果
组蛋白修饰和DNA甲基化是重要的表观遗传学修饰，决定着基因组的表观遗传学景观。组蛋白修饰和DNA甲基化能共同起作用调控基因的表达，但人们并不清楚它们在作用机制和功能上的具体关联。 清华大学和洛克菲勒大学的研究团队发现，改变DNA甲基转移酶的组蛋白识别区域会影响表观遗传学景观和小鼠的胚胎干细胞。
单细胞基因组，一个新时代的到来
单细胞基因组旨在通过组学方法研究单个细胞。近年来随着技术的发展，这一年轻的领域正在迅速成熟起来。单细胞基因组研究的前身可以追溯到用芯片检测单细胞的基因表达。不过，新一代DNA测序才是单细胞基因组学的大功臣，这些技术的出现让单细胞基因组研究最终一飞冲天。 2012年7月，Nature Biote
Nature子刊：CRISPR发现表观遗传对染色体的影响
*本研究所使用的靶向表观基因组编辑技术由赛业生物提供 染色质的3D结构会随着细胞的生活周期而变化，对我们人体的健康和疾病发生产生重要的影响。近年来随着新技术的发展，科学家们发现染色质折叠让一些DNA片段彼此靠近并发生互作，他们将这样的区域称为拓扑相关结构域TAD。大脑中TAD结构与神经精神
Science树立新观念：能遗传的不仅仅是基因
我们不仅仅是基因的总和。由饮食、疾病或生活方式等环境因素调节的表观遗传机制可以通过调节基因的开关来调节DNA。长久以来人们一直争论不休的是：如果表观遗传修饰在整个生命中积累，它是否可以跨越世代的边界，遗传给下一代。 现在，德国Max Planck研究所的免疫生物学和表观遗传学研究人员获得有力的