果蝇细胞中发现五种主要染色质类型
该发现构成了描述表观基因组的新框架荷兰科学家在果蝇细胞中发现五种主要染色质类型 转录活性常染色质与受阻遏异染色质的染色质传统分类曾是一个有用的模型，但它应该进行升级，以适应人们日益增加的有关染色质功能域的知识。一项在果蝇中对与蛋白质有关的53种染色质进行的大规模综合性全基因组分析表明，染色质有五种主要类型；这些可以构成描述表观基因组的新框架。 阿姆斯特丹市荷兰癌症研究所的Guillaume J. Filion和同事从染色质蛋白质组中选择了一组宽泛的蛋白质，并利用DamID方法在一个胚胎果蝇细胞株中绘制了它们的基因组位置。在这项技术中，每种感兴趣的蛋白质都被混合了DNA腺嘌呤甲基转移酶（Dam），它利用一个甲基腺嘌呤足迹标记了蛋白质—DNA的相互作用位点。研究人员随后利用一种数据驱动的计算分类策略在整个基因组中鉴别出了周期性的、完全不同的蛋白质组合。基因组区域——长度从1kb变化到100多kb——通过......阅读全文
不容忽视的表观基因组
肥胖有可能不仅写在基因之中，也写在基因之上。迄今为止最大型的一项探讨人类表观基因组(epigenome)的研究发现，某些表观遗传标记与身体质量指数(body mass index,BMI)相关。 科学家们报告称在2500多人的血液和脂肪细胞发现与新陈代谢相关的一个基因发生了化学改变。这
首次绘制小麦表观基因组图谱
最近，英国利物浦大学的科学家们，对小麦中调节基因活性的遗传性分子变化，进行了首次全基因组范围的调查，这可能成为提高作物育种技术的一种新工具。相关研究结果发表在最新一期的《Genome Biology》。延伸阅读：权威期刊发布首个小麦单体型图谱。 表观遗传标记是一种化学标签，将自己附着在DNA上
北大学者朱健发表两项表观遗传学成果
北京大学生命科学学院的朱健研究员带领的课题组，运用经典发育遗传学与细胞生物学和生物化学紧密结合的研究手段，揭示在表观遗传学、小RNA、RNA可变剪切、蛋白修饰及跨膜转运等多个层次上调控信号转导途径的关键因子及其作用机理。近期，该课题组先后在国际学术期刊《Developmental Cell》和《
创新性液体活检，检测儿童肿瘤
科学家分析了血液中循环的肿瘤DNA的短片段。这种液体活检分析利用了骨肿瘤独特的表观遗传学原理，并且不依赖于任何遗传改变，而这种改变在儿童期癌症中很少见。这种方法有望改善个性化诊断，并可能改善诸如尤因肉瘤等儿童肿瘤的未来治疗方法。 该研究已发表在Nature Communications杂志上。
最新果蝇基因组测序，展现奇妙的进化
对真核生物进行全基因组测序在二十世纪还是一项了不起的大工程，直到2000年末人们还只完成了四项这样的研究。不过自那以后，测序技术的飞速进步使全基因组测序对于许多研究团队来说触手可及，现在每隔不久就会涌现出一项新的测序成果。日前，维也纳兽医大学Christian Schlötterer研究组的
染色质DNA基因组的介绍
凡是具有细胞形态的生物其遗传物质都是DNA,只有少数病毒的遗传物质是RNA。在真核细胞中,每条未复制的染色体包含一条纵向贯穿的DNA分子。狭义而言,某一生物的细胞中储存于单倍染色体组中的总遗传信息,组成该生物的基因组。真核生物基因组DNA的含量比原核生物高得多。 突变分析结果表明,并非所有基因
果蝇－S190－染色质重组抽提物的制备实验
实验方法原理 实验材料 0～6 h 果蜗胚胎试剂、试剂盒 脱色洗液胚胎洗液盐洗液缓冲液 RMgCl2 液氮仪器、耗材 细尼龙网玻璃烧杯锥形管玻璃棒塑料注射器真空吸气机Wheaton 杜恩斯匀浆器 Sorvall Superspeed 离心机Beckman 超速离心机实验步骤 1. 试剂准备：脱色洗液
果蝇－S190－染色质重组抽提物的制备实验
实验材料0～6 h 果蜗胚胎试剂、试剂盒脱色洗液胚胎洗液盐洗液缓冲液 RMgCl2液氮仪器、耗材细尼龙网玻璃烧杯锥形管玻璃棒塑料注射器真空吸气机Wheaton 杜恩斯匀浆器Sorvall Superspeed 离心机Beckman 超速离心机实验步骤1. 试剂准备：脱色洗液：50％（V/V）家用漂白
只需100个细胞的表观基因组分析
近年来，表观遗传学已经成为了干细胞分化、炎症、癌症等多个领域的研究热点，但它在临床上的潜力还未得到充分挖掘。表观基因组分析可以帮助医生根据患者的自身状态调整治疗方案，最终实现个性化医疗。问题在于，表观基因组分析需要的细胞量很大。举例来说，检测全基因组的蛋白-DNA互作和染色质修饰大约需要一千万细
新的基因编辑领域突破口—表观遗传调控
几十年来，DNA一直被认为是决定生命遗传信息的核心物质，但是近些年不断的研究表明，生命遗传信息从来就不是基因所能完全决定的，比如科学家们发现，可以在不影响DNA序列的情况下改变基因组的修饰，这种改变不仅影响个体的发育，而且还可遗传给后代。如肿瘤等多种疾病并非仅由基因突变而引起，且与DNA和组蛋白
PNAS：衰老过程的罪魁祸首――转座子
多年来，科学家们一直在研究遗传因素对衰老的贡献，但是成果甚少。最近，一项新的研究阐明了转座子在加速衰老过程中的作用。在过去的十年中，科学家们已经开始认识到非编码序列在我们基因组中所起的重要生物作用。一种特别“狡猾”的非编码元件――高度重复的转座子，能将自己插入到我们基因组中任何可访问的部分，从而有可
在生命之初，胚胎中最早的转录因何触发
在一段生命旅程开始之初，精子细胞刺穿卵细胞，它们的遗传物质融合。然而，在之后的一段时间，所获得的DNA一直保持沉默：受精卵或早期胚胎中的基因不被转录。科学家也不清楚，是什么最终启动了这一过程。 最近发表在《Nature Genetics》上的三项研究深入探索了这一过程。研究人员报告了一个基因D
Nature医学：表观基因组决定你胖得健不健康
肥胖容易带来糖尿病，但并不是所有胖子都会生病。不少肥胖的人拥有正常的代谢能力，“健康”的胖子发展成糖尿病的机率并不高。瑞典卡罗林斯卡学院（Karolinska Institutet）和法国国家健康和医学研究院（INSERM）的研究人员在Nature Medicine杂志上发表文章指出，与肥胖有关
第二军医大学独家发表Nature－Cell－Biology文章
来自第二军医大学医学遗传学教研室的研究人员发表了题为“The MBNL3 splicing factor promotes hepatocellular carcinoma by increasing PXN expression through the alternative splicing
华人先锋《Nature－Methods》利用CRISPRi绘制遗传互作图谱
斯坦福大学亓磊（Lei Stanley Qi）教授早年毕业于清华大学，现任斯坦福大学生物工程学、化学和系统生物学系的助理教授，近年来他在CRISPR研究领域取得了一系列突破性进展，比如第一次采用CRISPR-Cas9系统的变种技术，改变了读取诱导多能干细胞(iPSCs)基因组的方式（由此入选了生
Autoimmunity：能研究细胞表观基因组学特性的新型工具
如今研究人员都知道，表观基因组在控制DNA表达上扮演着关键角色，而且表观基因组的一系列改变与多种健康问题直接相关，比如癌症、自身免疫性障碍等多种疾病，但目前科学家们关于表观基因组并不是知道地很多，甚至也并没有工具去研究表观基因组。图片来源：CC0 Public Domain 刊登在国际杂志Au
Nature：科学家成功解析人类表观遗传学修饰的特殊语言
表观遗传学改变在癌症、代谢性疾病和年龄相关疾病的发生过程中扮演着重要角色，但在机体适应力丧失的过程中其或许也发挥着重要作用，因为其会导致受影响细胞中的遗传物质被错误解释。 近日，一篇发表在国际杂志Nature上题为“Decoding chromatin states by proteomic
Aging：雷帕霉素可以延缓表观遗传学衰老
正如我们所知，年龄显然是一个不恰当的测量，因为它完全是基于时间的流逝，而不考虑我们身体的生物变化。2013年，加州大学洛杉矶分校(UCLA)的Steve Horvath描述了DNA上的化学修饰(称为甲基化)随着年龄的增长而发生变化的惊人数学精度。利用这些甲基化图谱，他推导出了一种高度精确的年龄预
不可忽视的表观遗传学：运动可改变DNA
瑞典德隆大学的科研人员发现运动可以从基因角度改变脂肪存储的方式。脂肪组织不仅可以被动地存储能量，还能够产生一些具有生物活性的化学物质作用于身体的其他部位。这项研究表明，运动可以使人体的脂肪细胞更高效地进行脂肪代谢，从而使脂肪存储在正确的部位。这项研究发表在Public Library of
复旦大学发表Nature表观遗传学新文章
来自复旦大学、中国科学院等机构的研究人员在新研究中揭示出了，从头甲基化转移酶DNMT3A自抑制以及组蛋白H3诱导DNMT3A激活的机制。研究结果发表在11月10日的《自然》（Nature）杂志上。 领导这一研究的是复旦大学上海医学院，生科院的徐彦辉(Yanhui Xu)教授，其早年毕业于清华大
Nature子刊：表观遗传学调控与小脑发育
渥太华大学的研究团队在Nature Communications杂志上发表文章指出，Snf2h基因能够通过控制染色质的组成形式，对小脑发育产生特殊的影响。小脑是大脑的重要控制中心，与平衡能力、精细运动和复杂的肢体运动有关。 运动员和艺术家们的非凡成就取决于他们的小脑，同样小脑对我们的日常生活也
“小时吃好，长大不胖”的表观遗传学基础
“再苦不能苦孩子”——数十年来，人们已经对儿童早期发育时期的营养良好供给的重要性达成共识。 确实，早期营养供给“烙印”对人的一生具有深刻且持久影响。例如妊娠期和/或哺乳期营养不良记录可作为表观遗传记忆储存在孩子的基因组上，持续到成年期，从而增加个体对肥胖等代谢疾病的易感性。 表观遗传学与成年
关节炎中的表观遗传学基因开关
一项新研究发现DNA甲基化是控制MMP13酶基因的开关，而MMP13酶具有重要的软骨破坏作用。文章发表在FASEB Journal杂志的网站上。 骨关节炎是一种退行性关节疾病，该疾病的典型症状是患者关节软骨持续不可逆的损失，这主要是由于基质金属蛋白酶MMP13破坏基质中的II型胶原引起
华人女院士发表表观遗传学重要成果
MECP2的突变会引起神经发育性疾病Rett综合征（RTT）。RTT是一种常发生在女童身上的神经系统疾病，属于严重的自闭症谱系障碍。患者会出现类似自闭症的行为、丧失运动控制能力、呼吸不规律以及骨骼问题。 RTT中的错义突变MECP2R306C可以阻止MeCP2与NCoR/HDAC3复合物互作。
何川教授Nature发布表观遗传学重要发现
几十年前研究人员就已经知道，对遗传信息流动至关重要的信使核糖核酸(mRNA)上存在着一种化学修饰。然而直到最近，芝加哥大学的研究人员才通过实验证实，这种修饰的一个主要功能是控制RNA的寿命和降解，这一过程对于健康细胞发育极为重要。相关研究成果发表在2014年1月2日纸质版的《自然》(Nature
朱健康院士Nature子刊表观遗传学成果
拟南芥5-甲基胞嘧啶（5mC）DNA糖基化酶的ROS1/DEMETER家族，是真核生物中第一个遗传表征的DNA去甲基化酶。然而，ROS1靶基因位点的特征还没有得到很好的理解。10月31日在《Nature Plants》发表的一项研究中，来自中科院上海植物逆境生物学中心和普渡大学的研究人员，对拟南芥C
北大教授最新文章解析癌症表观遗传学
来自北京市肿瘤防治研究所，北京大学肿瘤医院病因研究室的研究人员在之前研究的基础上，展开了胃癌发生发展相关DNA甲基化组扫描，进行了所获90余个基因的DHPLC大规模研究，在中日韩三国验证队列中证明了了GFRA1的去甲基化激活，SRF和ZNF382的甲基化失活可用作胃癌等恶性肿瘤的转移标志物。就此
黄国宁：表观遗传学“照亮”胚胎筛选“暗箱”
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/519073.shtm当辅助生殖技术照亮大量不孕不育患者“迷途之路”时，真实的研究数据依然提醒人们生殖医学的道路漫长。据2021年《柳叶刀》相关研究统计，当前全球辅助生殖（试管婴儿）的活产率不足30%。如何
35岁助理教授追逐表观遗传学的奥秘
当黄云（Yun “Nancy” Huang，音译）还是一名大学生时，她一直希望成为一名医生，但在浙江大学医学院获得学士学位后，她的想法改变了，“我意识到，要治愈疾病，我还需要了解更多疾病的基础生物学知识。” 2005年，黄云来到了美国，在乔治亚州立大学的Jenny Yang实验室开始攻读生物化
任兵教授利用CRISPR发现新型增强子
人类基因组只有不到2%编码蛋白质，因此解析非编码DNA的功能是一个很大的挑战。科学家们已经通过分析DNA甲基化、染色质修饰、核酸酶敏感性、转录因子结合，在人类基因组中预测了数百万个调控序列，但只有少数序列在天然条件下得到证实。 加州大学的研究团队为此开发了基于CRISPR/Cas9的高通量筛选