生物质谱分析蛋白质磷酸化位点

应用生物质谱分析蛋白质磷酸化位点 摘 要 蛋白质的可逆磷酸化具有重要的生物学意义,对蛋白质磷酸化位点进行分析有助于阐明蛋白质磷酸化的机制与功能。生物质谱是目前进行蛋白质磷酸化分析最有力的方法之一。我们用天然磷酸化蛋白建立了中性丢失扫描和固相金属亲和色谱(IMAC)两种基于质谱的磷酸化蛋白分析方法。应用这两种方法均可将从蛋白质酶切混合物中找出磷酸化肽段,进而通过序列分析定位磷酸化位点。两种方法具有不同的特点及局限性,具体研究中还要视具体情况优化实验条件。 点击这里进入下载页面:进入下载页面......阅读全文

方案8-用-ESIMS-确定组氨酸磷酸化位点实验

实验材料目标磷酸化蛋白混合物试剂、试剂盒nano-RP-HPLC 缓冲液NH4HCO3三氟乙酸仪器、耗材μC18预柱HPLC 系统质谱仪nano-HPLC 柱子预柱分流器SEQUEST 软件UV 检测器实验步骤一、多肽的消化和浓缩二、用 SEQUEST 法则进行数据自动化分析展开

核糖体结合位点的蛋白质构成

  核糖体是细胞内一种核糖核蛋白颗粒(ribonucleoproteinparticle),主要由rRNA和蛋白质构成,其唯一功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链,所以核糖体是细胞内蛋白质合成的分子机器。  构成核糖体的蛋白质。大肠杆菌核糖体蛋白的初级结构均被确定。大肠杆菌核糖体的30S

核糖体结合位点的蛋白质构成

核糖体是细胞内一种核糖核蛋白颗粒(ribonucleoproteinparticle),主要由rRNA和蛋白质构成,其唯一功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链,所以核糖体是细胞内蛋白质合成的分子机器。构成核糖体的蛋白质。大肠杆菌核糖体蛋白的初级结构均被确定。大肠杆菌核糖体的30S亚基含S

识别位点

中文名称识别位点英文名称recognition site定  义限制性内切酶特异结合的核苷酸序列。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

剪接位点

中文名称剪接位点英文名称splicing site;splice site定  义剪接体可识别的RNA前体中内含子和外显子连接边界的序列和接头位点。根据位置不同可以分为供体和接纳体剪接位点。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

蛋白质磷酸化

Tyrosine Kinase Assay Using Synthetic Peptides (T. Miller)Small synthetic peptide substrates are especially well suited for applications such as assay

磷酸化位点分析实验——高分辨凝胶电泳分离磷酸肽

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤在聚丙烯酰胺凝胶上用 2-DE 纯化磷酸肽是最近发表的制备技术,其结果与 2D-PP 结果相似。非变性凝胶等电聚焦结合碱性 40%PAGE 胶用于磷酸肽分离及比较分析。 32p 标记样品用放射自显影或磷储屏检测。用 Edman 测序方法鉴定蛋白质并确定磷酸化位

进入位点

中文名称进入位点英文名称entry site定  义特指氨酰tRNA进入核糖体的部位。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科) 

加帽位点

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双深度PCA:找到人类蛋白质关键变构位点

  根据6日发表在《自然》网站上的一项新研究,人类蛋白质表面的潜在治疗靶点的数量比之前认为的要多得多。西班牙巴塞罗那基因组调控中心(CRG)的研究人员开发出一项突破性新技术,揭示了许多控制蛋白质功能的“秘密大门”,从理论上讲,这些“门”可以显著改变痴呆症、癌症和传染病等各种疾病的进程。现在,他们已经

核糖体结合位点的蛋白质合成的介绍

  真核细胞中,核糖体进行蛋白质合成时,既可以游离在细胞质中,称为游离核糖体(freeribosome)。也可以附着在内质网的表面,称为膜旁核糖体或附着核糖体。参与构成RER,称为固着核糖体或膜旁核糖体,是以大亚基圆锥形部与膜接着游离核糖体(freeribosome)。分布在线粒体中的核糖体,比一般

核糖体结合位点的蛋白质构成的介绍

  核糖体是细胞内一种核糖核蛋白颗粒(ribonucleoproteinparticle),主要由rRNA和蛋白质构成,其唯一功能是按照mRNA的指令将氨基酸合成蛋白质多肽链,所以核糖体是细胞内蛋白质合成的分子机器。  构成核糖体的蛋白质。大肠杆菌核糖体蛋白的初级结构均被确定。大肠杆菌核糖体的30S

方案7-用-ESIMS-确定丝氨酸、苏氨酸的磷酸化位点实验

实验材料丙烯酰胺凝胶条中放射性标记的目标磷酸化蛋白试剂、试剂盒乙腈烷化剂甲酸β-巯基乙醇nano-RP-HPLC 缓冲液蛋白酶溶液还原剂三氟乙酸仪器、耗材超声仪HPLC 泵HPLC 系统质谱仪、带有纳喷离子源的ESI-MSnano-HPLC 柱预柱预柱分流器SEQUEST 软件试管实验步骤一、磷酸化

磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——IMAC-分离/富集磷酸肽

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤磷酸肽分析的常见困难是由磷酸化的低化学计量值导致的,样品中相同序列肽段的磷酸肽的含量要比非磷酸化肽段含量少得多,这种情况下即使 32p标记的 2D-PP 上的点,经全蛋白质水解及 HPLC 组分收集,已经确定磷酸肽存在,用质谱技术也难以鉴定磷酸肽。数据依赖的

昆明动物所在预测蛋白质功能位点方面取得重要进展

   随着蛋白质结构信息的不断积累,以及结构基因组学不断的发展,越来越多的功能未知但结构已知的蛋白质提交到了国际大分子数据库中(PDB数据库),这些蛋白质的功能及其功能位点需要注释。而随着实验生物学的不断发展,以前一些已知功能的蛋白质的功能及其功能位点可能需要重新注释。因此,发展一种

磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——RPHPLC-分离磷酸肽

实验材料蛋白样品仪器、耗材质谱仪实验步骤反相 HPLC 分段收集磷酸肽重现性好,简单,且不需要特殊装备。在 RP-HPLC 中,磷酸肽根据其疏水性被分离。分离后收集的组分经 Cerenkov计数检测。对 Cerenkov计数和时间作图,显示具放射性活性的组分的计数。纯化的磷酸肽用 MS 分析;可用不

nut-位点的定义

中文名称nut 位点英文名称nut site定  义噬菌体基因组中抗终止因子N蛋白的识别位点。N蛋白对nut位点的识别和随之发生的相互作用,使RNA聚合酶能忽略终止信号而持续通过终止子。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

什么是活性位点

者一般用在大分子化学中,活性位点指的是可以发生化学反应的集团。活性位点少,发生有效碰撞的机率就少,也就是说反应比较单一,容易被控制

方案7-位点特异性蛋白质DNA-光交联法实验

实验材料DNA 聚合酶 I Klenow 片段限制性内切酶A 和 B单链 DNA 结合蛋白单链 DNA 模板T4 DNA 连接酶T4 DNA 聚合酶T4 多聚核苷酸激酶T7 DNA 聚合酶上游引物试剂、试剂盒10 X 退火缓冲液ATP对叠氮化苯甲酰甲溴生物素-11-dATP生物素-11-dCTP生物

新方法为蛋白质疏水作用位点功能研究提供手段

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/3/518295.shtm

磷酸化位点分析实验磷酸肽的分离——2DPP-分离磷酸肽

实验方法原理即使纳喷 MS/MS 技术已经成功用于直接分析蛋白酶解产生的磷酸肽但是出于以下一些原因,通常建议在质谱分析前作一些分离:(1) 磷酸肽在蛋白酶切产物中通常只占少数因此容易淹没在低率度离子产生的总背景中,肽分离技术可浓缩分析物,因此会提高信噪比。(2) 如果磷酸肽被放射性标记并具有相同比活

Cell子刊揭秘代谢转移反套路——三个磷酸化位点一台戏

  【科研反套路】  一、研究背景  1.  AMPK:全称为Adenosine 5’monophosphate-activated protein kinase,意为AMP依赖蛋白激酶,参与糖脂、蛋白质代谢,调控能量稳态。应激、饥饿、毒性作用等可以激活AMPK,促进分解代谢,减少合成代谢,从而增加

分子生物学蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨

分子生物学蛋白质磷酸化分析技术

在所 有 的 翻译后修饰中,可逆的磷酸化,几乎调节着生命活动的整个过程,包括细胞的增殖、发育和分化,神经活动,肌肉收缩,新陈代谢,肿瘤发生等。据统计,哺乳动物细胞内有三分之一以上的蛋白质可以被磷酸化川,蛋白质的可逆磷酸化使得蛋白质组学研究更为复杂。 真核 生 物 细胞蛋白质中主要的磷酸化氨基酸为丝氨

阴离子位点显示实验

实验方法原理 实验材料 组织样品试剂、试剂盒 磷酸缓冲液阳离子化铁蛋白液体戊二醛锇酸实验步骤 1. 0.1 mol/L磷酸缓冲液配制阳离子化铁蛋白,浓度为0.2~0.5 mg/ml。2. 组织样品悬浮于阳离子化铁蛋白液体中,室温下反应30 min。3. 0.1 mol/L磷酸缓冲液充分漂洗。4. 3

无碱基位点的定义

中文名称无碱基位点英文名称abasic site定  义核酸中失去碱基的部位。该部位碱基失去后,产生一个醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

序列标签位点的定义

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

加帽位点的概念

中文名称加帽位点英文名称cap site定  义mRNA中加帽结构的部位,该位点在前体mRNA的5'端。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

什么是序列标签位点?

序列标签位点(sequence-tagged site),是已知核苷酸序列的DNA片段,是基因组中任何单拷贝的短DNA序列,长度在100~500bp之间。

无嘧啶位点的概念

中文名称无嘧啶位点英文名称apyrimidinic site定  义核酸中脱去嘧啶碱的部位。产生的醛基,易发生β消除反应而使核酸链在该处断裂。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)