上海生科院开发构建因果关系的分子调控网络模型和方法

2014年12月24日,国际学术期刊Nuclear Acid Research 在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所陈洛南研究组的研究成果,开发基于小样本构建因果关系的分子调控网络模型和方法。 整合高通量生物学信息,构建分子生物网络,从而在系统的水准上揭示生物分子的相互作用机理及因果调控规律,是后基因组时代所面临的重要计算生物学问题之一。统计学上对于具有n个基因的调控网络的因果关系的精确推断,要求n-2阶条件相关性的评估(高斯噪声),即需要n个以上独立生物样本数据。对于大多哺乳动物,n远大于10000基因,因此在同一条件下采集这么多的生物样本构建分子调控网络或建立因果关系不现实。 根据基因调控网络的特性(如稀疏性等),利用信息熵的非线性测度的性质及条件相关性阶数的一致性特性,研究组建立了基于小样本推断基因调控网络的新模型和算法(CMI-PCA:通路一致性分析法)。该方法主要通过评估各基因之间的......阅读全文

研究在构建大规模异构生物分子关联网络取得进展

  中国科学院新疆理化技术研究所多语种信息技术研究室研究生郭镇豪、易海成在研究员尤著宏的指导下,开展的关于大规模异构生物分子关联网络的研究“Construction and Comprehensive Analysis of a Molecular Association Network via l

我国学者揭示棒曲霉素生物合成及转运路径分子网络

  由真菌产生的聚酮类次生代谢产物——棒曲霉素(Patulin)是造成果实及其加工产品污染的重要真菌毒素,对人和动物都具有毒性,给消费者的身体健康带来巨大威胁。因此,解析真菌中棒曲霉素生物合成的分子基础,并阐明其合成途径及调控机制,对创制果实采后棒曲霉素防控技术至关重要。  中国科学院植物研究所田世

生物物理所血脑屏障发育分子调控网络研究获新进展

  8月21日,中国科学院生物物理研究所阎锡蕴课题组与广东医科大学附属医院张晶晶课题组合作,在《美国国家科学院院刊》(PNAS)杂志以长文形式在线发表研究论文,揭示了CD146在血脑屏障(BBB)发育中协同周细胞与血管内皮细胞的作用机制。  BBB对维持中枢神经系统的稳态至关重要,其发育是一个由血管

人体分子图谱“化身”科研网络工具

  卡塔尔威尔康奈尔医学院科学家通过分析391名志愿者的血液、尿液和唾液样本中的数千种分子,绘制出人体及其复杂生理过程的分子图。这些数据被整合成一个强大的交互式可视化网络工具,名为“连接组学”。这一工具有助于研究人体复杂的分子构成,发现与各种疾病相关的潜在特征。相关研究发表在新一期《自然·通讯》杂志

人体分子图谱“化身”科研网络工具

“连接组学”工具可以研究人体分子水平上的运作方式。图片来源:卡塔尔威尔康奈尔医学院科技日报北京9月18日电(记者张佳欣)卡塔尔威尔康奈尔医学院科学家通过分析391名志愿者的血液、尿液和唾液样本中的数千种分子,绘制出人体及其复杂生理过程的分子图。这些数据被整合成一个强大的交互式可视化网络工具,名为“连

Cell子刊:干细胞的分子通讯网络

  来自新加坡A*STAR基因组研究所(GIS)和德国马克斯普朗克分子遗传学研究所(MPIMG)的科学家们,在人类胚胎干细胞(hESCs)中发现了一个负责整合细胞通讯信号,维持其干细胞状态的分子网络。这项研究报道在6月的《分子细胞》(Molecular Cell)杂志上。   人类胚胎细胞具有

生物大分子是什么?脂肪是不是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子是什么?脂肪是生物大分子吗?

  生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。  脂肪不是生物大分子。  脂类是油、脂肪、类脂的总称。脂肪由C、H、O三种元素组成。 脂肪是由甘油和脂肪酸组成的三酰甘

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物大分子概况

生物大分子是生物体的重要组成成份,不但有生物功能,而且分子量较大,其结构也比较复杂。在生物大分子中除主要的蛋白质与核酸外,另外还有糖、脂类和它们相互结合的产物。如糖蛋白、脂蛋白、核蛋白等。它们的分子量往往比一般的无机盐类大百倍或千倍以上。蛋白质的分子量在一万至数万左右,核酸的分子量有的竟达上百万。这

生物细胞分子的功能

  DNA 是负责遗传的主要分子,由 A、C、T、G 四种不同的单元依任意的顺序排列,例如一个有 10 个单元的 DNA 分子,会有 4 的 10 次方种不同的排列顺序,各种生物的遗传虽然均由 DNA 分子负责,由于排列顺序的差异,以致造成相互间极大的不同;RNA 是负责传递遗传讯息的分子,它将 D

生物分子的提取概述

       生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。        生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,

生物分子的提取概述

生物分子分生物小分子和生物大分子。生物小分子的结构由较强的共价键决定。生物大分子中除较强的共价键外,还含有较弱的共价键和次级键,需温和的条件才能保证生物大分子的活性不被破坏。这两类生物分子的提取液成分和操作条件差别很大。生物分子的提取在离心机分离纯化的前期。将样品研磨,把被破碎的细胞置于一定的提取液

生物高通量检测分析服务网络

  近日,由中国科学院科技服务网络计划(STS计划)项目支持,中科院青岛生物能源与过程研究所、北京生命科学研究院、天津工业生物技术研究所、微生物研究所共同承担的“生物高通量检测分析服务网络”项目结题验收。   经过5年的实施,该项目研制出了单细胞拉曼分选仪工程化样机(RACS-Mini),开发了单

建立完善各类生物安全实验室网络

  当前,随着全球化程度加深,跨国健康风险加剧,本市作为口岸城市,传染病输入风险明显增加,需要长期、积极应对。传染病防治关乎全市人民群众的身体健康和生命安全,关系经济社会发展和安全稳定。广大防治人员在传染病防治工作中发挥着主力军作用,直接面临职业暴露的感染风险。加强传染病防治人员的安全防护,是保障其

新研究揭示荔枝芽成花转变的分子调控网络

近日,华南农业大学园艺学院、岭南现代农业科学与技术广东省实验室教授王惠聪团队构建植物单细胞研究实验体系从单细胞水平上揭示荔枝芽成花转变的分子调控网络。相关研究分别发表于Journal of Experimental Botany和Cells。针对植物因为存在细胞壁和大量次生代谢产物,高质量原生质体难

研究揭示细胞后端皮层微丝网络建成的分子机制

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497833.shtm 2023年4月3日,中科院生物物理研究所蔡华清课题组在Journal of Cell Biology杂志发表题为"GxcM-Fbp17/RacC-WASP signaling r

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...

分子生物学概念的发展与检验诊断—分子生物学到生物...  经过了免疫学的热潮,20世纪中叶开始兴起了又一门新的学科“分子生物学”。人们怀着满腔热忱,期待这一学科能够对那些机理不清的疾病予以新的认识。众多科学家经过了半个世纪的努力,终于用分子生物学方法整理出一批单基因病等和基因相关的疾病。随着基因基础

中科院应用微生物研究网络启动

启动会现场  8月24日,中国科学院应用微生物研究网络启动会在北京举行。我国应用微生物研究领域的专家和中国科学院生命科学与生物技术局及有关研究所的领导就中国科学院应用微生物研究网络的战略规划、管理模式、运行机制、资源共享等问题进行了深入的探讨。  应用微生物研究网络(Research

什么是生物单分子技术

单分子技术是可孤立或用于实验或分析研究某一个分子。单分子研究,对比测量一个整体或大量分子,其中个体行为无法区分收集测量对比,只有一般特征才可以衡量。虽然大多数测量技术在观察单分子还不够灵敏,单分子荧光已成为一种探测尚不能充分理解的位于大量分子层面上,如肌球蛋白在肌肉组织或肌动蛋白丝运动,还有个体位于

生物大分子的特点

生物大分子的特点在于其表现出的各种生物活性和在生物新陈代谢中的作用。生物大分子是构成生命的基础物质。比如:某些多肽和某些脂类物质的分子量并未达到惊人的地步,但其在生命过程中同样表现出了重要的生理活性。与一般的生物大分子并无二致。

生物大分子的“相变”

编者按:生物大分子的“相变”或者说“相分离”应该说近几年来生命科学领域里面发展非常迅速的热门领域。然而很多同行却表示自己还没搞清楚“相分离”到底是怎么回事它就已经火了。为什么说火了?除了同行私底下交谈关于最新学术进展可以约莫了解一些之外,另一个风向标是观察以CNS为代表的杂志发表相关论文的情况。截止

生物分子自调节的特点

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)

生物大分子的概念

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

什么是生物大分子?

生物大分子是指生物体细胞内存在的蛋白质、核酸、多糖等大分子。每个生物大分子内有几千到几十万个原子,分子量从几万到几百万以上。生物大分子的结构很复杂,但其基本的结构单元并不复杂。蛋白质分子是由氨基酸分子以一定的顺序排列成的长链。氨基酸分子是大部分生命物质的组成材料,不同的氨基酸分子有好几十种。生物体内

生物大分子的形成

在原始地球条件下,有两条路径可以达到脱水缩合以形成高分子:其一是通过加热,将低相对分子量的构成物质加热使之脱水而聚合;其二是利用存在于原始地球上的脱水剂来缩合。前者常常是在近于无水的火山环境中进行,后者则可以在水的环境中进行。生物大分子都可以在生物体内由简单的结构合成,也都可以在生物体内经过分解作用

生物细胞分子的常见基团

  (一)羟基-OH  很多有机分子上含有羟基-OH,如醇、糖、核酸、蛋白质等。“羟”的字和音都由“氢氧”二字拼合而成。羟基与水有某些相似的性质,羟基是典型的极性基团,与水可形成氢键,因此,分子上羟基越多,亲水性就越大。羟基与电负性大的原子如-NH中的氮能形成氢键,氢键在维持蛋白质、核酸等大分子的空

生物分子的溶剂提取法

一、生物分子的溶剂提取法原理:利用溶剂的溶解作用把所需物质从细胞中转移出来。二、影响生物分子的溶剂提取效率的因素:  1、溶剂的性质:根据相似相溶原理。  2、离子强度:离子强度是影响物质溶解度的主要因素,但离子强度对不同物质溶解度的影响不同,如高离子强度下DNA-核蛋白溶解度增加,低离子强度下RN

脂肪等于生物大分子

  脂肪到底是不是生物大分子,这是一个让很多生物老师都很纠结的问题,高中生物人教版必修一并没有生物大分子的定义(必修一33页提到“多糖、蛋白质、核酸等都是生物大分子”),很多辅导书籍及练习题也经常添乱,搞得我们在备课时一头雾水。开卷有益,让我们翻开高校教材找找答案吧!  一、高分子化合物  根据《有

什么是生物分子自调节?

中文名称自调节英文名称autoregulation定  义生物分子调节其自身的活性或表达的现象。如某一个转录因子的基因受该基因产物的调节。通过这种作用,一个刺激在小范围内产生的信号的影响可以维持很久,并产生很大的生理作用。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),信号转导(二级学科)