蛋白质二级结构的定义

成氢键,这是稳定α-螺旋的主要键。 (4)肽链中氨基酸侧链R,分布在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响α-螺旋的形成。酸性或碱性氨基酸集中的区域,由于同电荷相斥,不利于α-螺旋形成;较大的R(如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸)集中的区域,也妨碍α-螺旋形成;脯氨酸因其α-碳原子位于五元环上,不易扭转,加之它是亚氨基酸,不易形成氢键,故不易形成上述α-螺旋;甘氨酸的R基为H,空间占位很小,也会影响该处螺旋的稳定。 2)β-片层结构Astbury等人曾对β-角蛋白进行X线衍射分析,发现具有0.7nm的重复单位。如将毛发α-角蛋白在湿热条件下拉伸,可拉长到原长二倍,这种α-螺旋的X线衍射图可改变为与β-角蛋白类似的衍射图。说明β-角蛋白中的结构和α-螺旋拉长伸展后结构相同。两段以上的这种折叠成锯齿状的肽链,通过氢键相连而平行成片层状的结构称为β-片层(β-pleated sheet)结构或称β-折迭(图1-5)。 β-片层结构特点是: ①是......阅读全文

蛋白质的二级结构与超二级结构结构的组装块

一、蛋白质的二级结构  蛋白质在细胞中必须通过详细的三维结构识别成千上万种的不同分子,这就需要蛋白质分子具有结构多样性。蛋白质结构研究得出的第一个重要的基本规律是水溶性球状蛋白质分子折叠的重要驱动力,它是将疏水侧链置于分子内部,产生一个"疏水内核"和一个亲水表面。为了把侧链放到分子内部去,相应的高度

二级结构预测的

中文名称二级结构预测英文名称secondary structure prediction定  义预测大分子(核酸、蛋白质)可能具有的二级结构。现在已有多种计算机软件可以进行这类预测,如nnPREDICT、ZPRED Server等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),方法与技术(二级学科)

tRNA二级结构特点

tRNA的二级结构为三叶草结构,其结构特征为:  (1)tRNA的二级结构由四臂、四环组成,已配对的片断称为臂,未配对的片断称为环。  (2)叶柄是氨基酸臂,其上含有CCA-OH3’,此结构是接受氨基酸的位置。  (3)氨基酸臂对面是反密码子环,在它的中部含有三个相邻碱基组成的反密码子,可与mRNA

DNA的二级结构介绍

DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。两条多核苷酸链以相同的旋转绕同一个公共轴形成右手双螺旋,螺旋的直径2.0nm;两条多核苷酸链是反向平行的,一条5’-3方向,另一条3’-5’方向;两条多核苷酸链的糖-磷酸骨架位于双螺旋外侧,碱基平面位于链的内侧;相邻碱基对之间的轴向距

DNA二级结构构型种类

①B型DNA(右手双螺旋DNA),是“经典”的Watson-Crick结构,二级结构相对稳定,水溶液和细胞内天然DNA大多为B型DNA;②A型DNA(右手双螺旋DNA),是一般B型DNA的重要变构形式,其分子形状与RNA的双链区和DNA/RNA杂交分子很相近;③Z型DNA(左手双螺旋DNA),也是B

DNA二级结构构型分类

①B型DNA(右手双螺旋DNA),是“经典”的Watson-Crick结构,二级结构相对稳定,水溶液和细胞内天然DNA大多为B型DNA;②A型DNA(右手双螺旋DNA),是一般B型DNA的重要变构形式,其分子形状与RNA的双链区和DNA/RNA杂交分子很相近;③Z型DNA(左手双螺旋DNA),也是B

什么是DNA的二级结构?

DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。通常情况下,DNA的二级结构分两大类:一类是右手螺旋,如A-DNA和B-DNA,DNA通常是以右手螺旋形式存在的;另一类是左手螺旋,即Z-DNA。

dna分子二级结构有哪些特点

结构特点:1、为右手双螺旋,两条链以反平行方式排列。2、两条由磷酸和脱氧核糖形成的主链骨架位于螺旋外侧,碱基位于内侧。3、两条链间存在碱基互补,通过氢键连系,且A=T、G ≡ C(碱基互补原则)。4、碱基平面与螺旋纵轴接近垂直,糖环平面接近平行。5、螺旋的螺距为3.4nm,直径为2nm,相邻两个碱基

蛋白质二级结构的定义

成氢键,这是稳定α-螺旋的主要键。 (4)肽链中氨基酸侧链R,分布在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响α-螺旋的形成。酸性或碱性氨基酸集中的区域,由于同电荷相斥,不利于α-螺旋形成;较大的R(如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸)集中的区域,也妨碍α-螺旋形成;脯氨酸因其α-碳原子位于五元环上,不易扭转,加之

什么是dna的二级结构,其结构要点是什么

DNA二级结构:生物大分子主链周期性折叠形成的规则构象成为二级结构,即DNA螺旋。  1.两条多核苷酸链以相同的旋转绕同一个公共轴形成右手双螺旋,螺旋的直径2.0nm  2.两条多核苷酸链是反向平行的,一条5’-3’,另一条3’-5’  3.两条多核苷酸链的糖-磷酸骨架位于双螺旋外侧,碱基平面位于链

关于蛋白质二级结构的定义

  蛋白质分子的二级结构(secondarystructure)通常是指蛋白质多肽链沿主链骨架方向的空间走向、规则性循环式排列,或某一段肽链的局部空间结构,即蛋白质的二级结构为肽链主链或一段肽链主链骨架原子的相对空间盘绕、折叠位置,它并不涉及氨基酸残基侧链的构象。

转移核糖核酸的二级结构介绍

tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级结构。它由3个环,即D环〔因该处二氢尿苷酸(D)含量高〕、反密码环(该环中部为反密码子)和TΨC环〔因绝大多数tRNA在该处含胸苷酸(T)、假尿苷酸(Ψ)、胞苷酸(C)顺序〕,四个茎,即D茎(与D环联接的茎)、反密码茎(与反密码环联接)、TΨC茎(与 TΨC环联

几种主要DNA二级结构对照表

几种主要的DNA二级结构对照表DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂

关于转运RNA的二级结构的介绍

  tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级结构。它由3个环,即D环〔因该处二氢尿苷酸(D)含量高〕、反密码环(该环中部为反密码子)和TΨC环〔因绝大多数tRNA在该处含胸苷酸(T)、假尿苷酸(Ψ)、胞苷酸(C)顺序〕,四个茎,即D茎(与D环联接的茎)、反密码茎(与反密码环联接)、TΨC茎(与 TΨC

蛋白质二级结构拟合算法

早期的蛋白质或多肽的二级结构拟合计算方法中,主要采用多聚氨基酸为参考多肽。Greenfield 等采用多聚L2赖氨酸作参考多肽,建立α2螺旋、β2折叠及无规卷曲等二级结构参考CD 光谱曲线,采用单一波长法(208nm) 计算出α2螺旋含量后,然后假设不同的β2折叠含量( Xβ) 值,并假设CD 值是

蛋白质二级结构的基本介绍

  蛋白质二级结构(secondary structure of protein)是指多肽主链骨架原子沿一定的轴盘旋或折叠而形成的特定的构象,即肽链主链骨架原子的空间位置排布,不涉及氨基酸残基侧链。蛋白质二级结构的主要形式包括α-螺旋、β-折叠、β-转角、Ω环和无规卷曲。 [1] 由于蛋白质的分子量

染色质DNA的二级结构介绍

  生物的遗传信息储存在DNA的核苷酸序列中,生物界物种的多样性也寓于DNA分子4种核苷酸千变万化的排列之中。DNA分子不仅一级结构具有多样性,而且二级结构也具有多态性。所谓二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。DNA二级结构构型分3种:  ①B型DNA(右手双螺旋DNA),是“

蛋白质的二级结构的特点

二级结构以往是由生物巨分子在原子量级结构下的氢键来定义的。在蛋白质,二级结构则是以主链中氨基之间的氢键模式来定义,亦即DSSP所定义的氢键,并不包括主链与旁链间或是旁链之间的氢键。而核酸的二级结构是以碱基之间的氢键来定义。在很多RNA分子,二级结构对RNA正常功能非常重要,有时甚至于较序列重要。这可

概述蛋白质二级结构的形式

  蛋白质二级结构的基本类型有α螺旋、β折叠、β转角、Ω环和无规卷曲。如血红蛋白和肌红蛋白中含有大量的α-螺旋,铁氧蛋白(ferredoxin)则不含任何的α螺旋。蛋白质中各种类型的二级结构并不是均匀地分布在蛋白质中,不同蛋白质中β折叠和β-转角的数量也有很大的变化。

蛋白质二级结构的红外检测

  蛋白质是与生命及各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质,机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质的参与。蛋白质是由不同氨基酸以肽键相连所组成的具有一定空间结构的生物大分子物质,其结构可分为以下4个结构层次:   图1 蛋白质的四个结构层次   我们所关注的蛋白质二级结构指的是蛋白质

关于丝裂原活化蛋白激酶的二级和超二级结构介绍

  与其他蛋白激酶相似,ERK2、p38和JNK1都具有一个较小的氨基酸结构域和一个较大的羧基端结构域,两者之间由一个交叉区连接在一起。氨基酸结构域主要由β折叠组成,而羧基端结构域则主要为α螺旋,两个结构与交界处形成一个裂隙,为ATP结合位点。

几种主要的DNA二级结构对照表

DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂直,呈20º倾角75%RH,钠

几种主要的DNA二级结构对照表

几种主要的DNA二级结构对照表DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂

几种主要的DNA二级结构对照表

几种主要的DNA二级结构对照表DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂

几种主要的DNA二级结构对照表

DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH,钠盐,溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂直,呈20º倾角75%RH,钠

远紫外CD-预测二级结构存在的问题

随着基因工程与蛋白质工程的发展,人们迫切需要了解蛋白质的结构。CD 已经成为研究溶液中蛋白质二级结构的强有力工具,得到了越来越广泛的应用,然而远紫外CD 光谱预测蛋白质二级结构仍然存在一些不足之处。膜蛋白是近年来分子生物学研究的热点。膜蛋白是一类具有晶体类似结构的镶嵌于细胞膜上的蛋白,到目前为止,仅

关于蛋白质二级结构的β转角简介

  多肽链中出现的180°回折的结构称为β转角(β-bend)或β回折(β-turn),即U型转折结构。它是由四个连续氨基酸残基构成,第2个氨基酸残基多为脯氨酸,甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺也常出现在β转角结构中,第一个氨基酸残基的羰基与第四个氨基酸残基的亚氨基之间形成氢键以维持其稳定。  常见的转角

简述蛋白质二级结构的无规卷曲

  多肽链中肽平面的一些无规则排列的无规律构象,称为无规卷曲(randomcoil)。无规卷曲通过主链间的氢键或主链与侧链间的氢键稳定其构象,是蛋白质结构中的基本构件。卷曲的柔性构象可使肽链改变走向,利于连接结构相对刚性的α螺旋和β折叠,在蛋白质肽链的卷曲、折叠过程中起重要作用。

远紫外CD分析蛋白质二级结构

一、 远紫外CD分析蛋白质二级结构  远紫外CD分析蛋白质二级结构的方法,主要是运用计算机采用一定的拟合算法对CD数据进行加工处理,进而解析蛋白质二级结构。远紫外区CD光谱主要反映肽键的圆二色性。在蛋白质或多肽的规则二级结构中,肽键是高度有规律排列的,其排列的方向性决定了肽键能级跃迁的分裂情况。单一

简述转移核糖核酸的一级结构和二级结构

  一级结构  自1965年R.W.霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA(包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA)的一级结构被阐明。按照A-U、G-C以及G-U碱基配对原则,除个别例外,  二级结构  tRNA分子