董梦秋、贺思敏NatureMethods发表重要成果

蛋白交联是一种特殊的翻译后修饰,在所有生命中起到了基础性的作用,包括建立细胞外基质、调控蛋白在细胞内外的功能或半衰期等。内源蛋白质交联有很多种形式,从相当普遍的二硫键或异肽键,到胶原和弹力蛋白中的特殊连接。 二硫键是许多分泌蛋白必不可少的部分,比如激素、生长因子和细胞表面受体。但分析二硫键一直是个难题。为了精确鉴定通过二硫键相连的多肽,北京师范大学、北京生命科学研究所、中科院计算技术研究所等单位的研究人员开发了一个高通量的质谱方法pLink-SS。这一成果发表在二月九日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是董梦秋(Meng-Qiu Dong)研究员和贺思敏(Si-Min He)研究员。 研究人员以质谱(MS)为基础建立了一个在单个或复杂蛋白质样本中获得二硫键图谱的新方法,包括自动化数据分析和错误发现率(FDR)控制。 现在的医药产业亟需一种新工具来分析单克隆抗体中的天然二硫键。研究人员用自己的方法对一个......阅读全文

我科学家“看清”PTB蛋白如何致癌

  PTB蛋白(PTB是一个普遍表达的重要RNA结合蛋白,这些年来被发现在神经发育和肿瘤发生中有重要功能。)是一种致癌蛋白质,但其致癌机制至今不明。我国科学家通过新技术解析了PTB蛋白在癌细胞基因组里结合位置,发现了受该蛋白质调控的一大批新靶标基因,其中一些可解释该蛋白质的致癌机制。2009年12月

《科学》:研究阐明葡萄糖转运蛋白结构

美国和法国科学家近日研究阐明了钠依赖葡萄糖转运蛋白(SGLTs)的结构,该蛋白的作用在于将葡萄糖“泵”进细胞。这类蛋白在慢性腹泻的治疗中得到应用,每年挽救了数百万患病儿童的生命。弄清这类蛋白的结构将有助于加速一些新药的开发,用于治疗糖尿病和癌症。相关论文7月3日在线发表于《科学》(Science)杂

《科学》:古老蛋白塑造细菌紧凑基因组

该发现可能有助于开发其它标靶Rho的抗生素  与人类相比,细菌不携带过多的“垃圾DNA”,它们的基因组要“整洁”得多。比如大肠杆菌大约90%的基因组都包含编码蛋白质的DNA,而人类基因组的90%都是非编码的“垃圾DNA”。 美国科学家近日研究发现,细菌基因组的这种“整洁”可能要归功于一种名为R

我国科学家破解叶绿体蛋白转运之谜

从西湖大学获悉,该校生命科学学院特聘研究员闫浈实验室的相关研究揭开了叶绿体蛋白转运之谜,其研究结果在线发表于《细胞》期刊。  “光合作用被称为地球上最重要的化学反应。”闫浈介绍,叶绿体作为光合作用的重要场地,好比一个“光能工厂”,有2000至3000种蛋白需要经过TOC-TIC复合物被识别然后进入叶

科学家发现新肾癌驱动蛋白

  近日,一种针对具有相同遗传变异的肾癌的潜在治疗靶点被发现,科学家们已知这种遗传变化能够导致血管过多,这有助于为肿瘤提供营养。这项最新发现展示出一种潜在的新型癌症驱动通路,相关研究结果7月20日发表在《科学》期刊上。  据了解,这项新的研究由来自中国同济大学、复旦大学、美国北卡罗来纳大学、哈佛医学

科学家揭示叶绿体蛋白“马达”转运机制

日前,西湖大学、西湖实验室特聘研究员闫浈团队在《细胞》上连续发表了两篇关联论文,报道了在叶绿体蛋白转运的动力机制上取得的又一重大突破——揭示了叶绿体蛋白转运的动力机制及其进化多样性,为该领域的研究开辟了新视野。模式植物拟南芥。课题组供图研究团队揭示了一种被称为“马达”的蛋白复合体,该复合体能够驱动叶

科学家揭示叶绿体蛋白“马达”转运机制

  日前,西湖大学、西湖实验室特聘研究员闫浈团队在《细胞》上连续发表了两篇关联论文,报道了在叶绿体蛋白转运的动力机制上取得的又一重大突破——揭示了叶绿体蛋白转运的动力机制及其进化多样性,为该领域的研究开辟了新视野。  研究团队揭示了一种被称为“马达”的蛋白复合体,该复合体能够驱动叶绿体蛋白穿过叶绿体

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600nm 为 0.3~0.7 时,用 0.8 mmol/L I

细菌过表达产物(无二硫键者)新纯化实验

实验步骤 操作程序第 1 天今天的目的是试验 T7 RNA 聚合酶表达的诱导条件,确定其在上清/沉淀中的分布情况,并为第二天的分离纯化步骤作出初步评估。1) 取一份 50-ml 经低密度培养过夜的大肠杆菌细胞培养物,开始工作。2) 于 A600n

方案4-用Ellman-试剂测定自由巯基和二硫键实验

实验材料蛋白质样品试剂、试剂盒变性剂二硫苏糖醇Ellman 试剂碘乙酸氮气反应缓冲液4-乙烯基吡啶仪器、耗材透析系统尺寸排阻层析装置分光光度计和小试管实验步骤方法 1: 自由巯基1.加人 3 ml 反应缓冲液到样品管和对照小试管中。2.在 412nm 测定吸收值(吸收值应该调节至0,Abuffer)

巯基被氧化的原理

巯基是许多蛋白质和酶活性部位的必需基团,极易被氧化,形成分子内或分子间的二硫键,导致酶活性丧失。巯基又称氢硫基或硫醇基,是由一个硫原子和一个氢原子相连组成的负一价官能团,化学式为—SH。巯基端连接不同的基团,有机物所属的类别不同,如硫醇(R—SH)、硫酚(Ar—SH)。巯基与二硫键的相互转化体内含有

DTT对蛋白有哪些影响

DTT的作用是DTT可用于阻止蛋白质中的半胱氨酸之间所形成的蛋白质分子内或分子间二硫键。DTT对蛋白的影响是DTT也可以对蛋白质中二硫键进行还原。DTT是DL-Dithiothreitol的缩写,中文名为二硫苏糖醇。DTT往往无法还原包埋于蛋白质结构内部的二硫键,这类二硫键的还原常常需要先将蛋白质变

DTT的作用是什么,它对蛋白有哪些影响

DTT的作用是DTT可用于阻止蛋白质中的半胱氨酸之间所形成的蛋白质分子内或分子间二硫键。DTT对蛋白的影响是DTT也可以对蛋白质中二硫键进行还原。DTT是DL-Dithiothreitol的缩写,中文名为二硫苏糖醇。DTT往往无法还原包埋于蛋白质结构内部的二硫键,这类二硫键的还原常常需要先将蛋白质变

北大蛋白质科学中心:交叉视角下的蛋白质研究

在过去的半个世纪里,科学家对于作为生命活动直接执行者的蛋白质的认识已经取得了飞跃性的进展,蛋白质的“神秘面纱”被一点一点揭开。而这一切无不得益于针对蛋白质展开的跨学科研究。没人能够预料,跨学科研究所带来的思想碰撞还会产生怎样的结果。 作为国内蛋白质研究领域的重要力量之一,北京大学的科学家们正在突破传

对角线电泳的应用介绍

其主要作用是膜蛋白的分离鉴定,确定二硫键和蛋白质复合物的研究对角线电泳最经典的用途当属二硫键的确定:样品蛋白质经硫氧还蛋白处理后,利用荧光巯基探针标记巯基,目标蛋白会带上荧光探针。再进行对角线电泳时,如果发现目标蛋白存在分子内二硫键,则经处理后所得的点位于对角线的上方;如果目标蛋白存在分子间二硫键,

对角线电泳的应用介绍

其主要作用是膜蛋白的分离鉴定,确定二硫键和蛋白质复合物的研究对角线电泳最经典的用途当属二硫键的确定:样品蛋白质经硫氧还蛋白处理后,利用荧光巯基探针标记巯基,目标蛋白会带上荧光探针。再进行对角线电泳时,如果发现目标蛋白存在分子内二硫键,则经处理后所得的点位于对角线的上方;如果目标蛋白存在分子间二硫键,

科学家发现免疫球蛋白IgM受体

  复旦大学基础医学院免疫学系王继扬课题组在最新研究中发现了免疫球蛋白IgM的受体。免疫球蛋白IgM被誉为机体预防病毒和细菌感染的“第一道防线”,IgM与受体结合后,不仅可促进机体免疫功能增强,而且能抑制自身“有害”抗体的产生。该研究对治疗人的免疫缺陷病和自身免疫疾病有重大意义。相关成果日前在线发表

-科学家绘制世界最大蛋白质图谱

  科学家已经发现了上万种新的蛋白联结,约占蛋白联结总量的四分之一。为了揭示蛋白质是如何构建细胞与机体,来自多个国家的科学家组成的研究团队筛选了不同生物的细胞,这些细胞从变形虫到蠕虫到老鼠到人类,来源十分广泛。  这项蛋白质科学的壮举,是来自七个国家的三个研究小组合作的结果,由多伦多大学唐纳利中心的

科学家发现天然抗流感病毒蛋白

论文发表于《细胞》;有助于流感疫苗的研发   美国科学家通过在家禽和猪身上进行试验,发现了一类抗病毒蛋白——干扰素诱导跨膜蛋白家族,其中又以IFITM3蛋白尤其能够对抗甲型流感病毒、西尼罗河病毒、登革热病毒等多种病毒。科学家表示,这种蛋白或许可以帮助人类对抗流感病毒,也有助于流感疫苗的研发。相关研

科学家与融合蛋白质作斗争

   当得知儿子Max患有癌症后,Ariella Ritvo冲进医院病理室,要求亲自查看结果。“我不会走,我有一个16岁的患者躺在这,我希望证实这一切。”她告诉惊讶的病理学家。  面对显微镜下被染成蓝色的大量细胞,Ariella对未来9年她与Max将要面对的敌人进行了评估:一种名为尤因肉瘤的罕见儿童

科学家利用发光蛋白监控药物浓度

   科学家新研制出一种在治疗过程中监控药物浓度的方法,其利用光来识别有害的用药过量和无效的用药过少,这是在线发表于《自然-化学生物学》上的一项报告介绍的内容。该方法的简便或对诊断实验室之外的药物治疗的监控有着特别价值。  最佳用药剂量,或者说处方药的浓度,根据疾病种类和经过治疗的特定患者

《科学》:某蛋白激酶可以调控细胞死亡方式

  提起脑缺氧、心缺血、急性胰腺炎、动脉粥样硬化等疾病,从医学的笼统意义上说,它们都是由细胞坏死引起的疾病。近日,厦门大学生命科学学院韩家淮教授课题组的一项研究表明,存在于人体内的一种名为RIP3的蛋白激酶是将细胞凋亡转换成细胞坏死的分子“开关”,通过调控这个开关,就可以调控细胞死亡方式。这一发现,

科学家发现新型蛋白折叠驱动因子

  近期,美国宾夕法尼亚大学的研究团队发现新型的蛋白折叠驱动因子DAXX(Death Domain-associated Protein,DAXX),可以有效控制蛋白质的正确折叠。相关研究在《Nature》发表,题为:DAXX represents a new type of protein-fol

蛋白质科学界版ChatGPT来了

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/497505.shtm 凝视着手中的试管,又望向桌上那些依旧在各司其职的大大小小的实验仪器,赵惠民的一颗心像是被人用力攥着。他明白,已经到了不得不放弃的时候。 读博第三年,学校资格考试的巨大压力如海

科学家寻找谷物蛋白过敏背后的祸首

尽管消费者关注的是谷蛋白,但其他小麦成分可能是症状的根源。 图片来源:MATT RAINEY 患者没有疯——Knut Lundin很确信这一点。不过,他们的疾病始终是个谜。病人们相信,是谷蛋白让自己患病。然而,他们并未患上乳糜泻—— 一种对小麦、大麦和黑麦中通常被视为“恶棍”

科学家寻找谷物蛋白过敏背后的祸首

患者没有疯——Knut Lundin很确信这一点。不过,他们的疾病始终是个谜。病人们相信,是谷蛋白让自己患病。然而,他们并未患上乳糜泻—— 一种对小麦、大麦和黑麦中通常被视为“恶棍”的蛋白质“团伙”作出的自体免疫反应。同时,他们在小麦过敏测试中呈阴性。这些病人似乎占据了医学上的一个“真空地带”。约1

科学家揭示蛋白质折叠构象过程

  据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。  为更好了解蛋白质折叠是如何进行的,科学家必须首先确定

科学家揭示蛋白质折叠构象过程

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/5/523020.shtm据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从

科学家揭示蛋白质折叠构象过程

据发表在20日《美国国家科学院院刊》上的一项最新研究,美国科学家通过将数据转换为声音,揭示了氢键是如何在极短时间内促成蛋白质构象,并将氨基酸转化为功能性折叠蛋白质的过程,为研究蛋白质从未折叠状态到折叠状态时发生的氢键事件序列提供了独特视角。为更好了解蛋白质折叠是如何进行的,科学家必须首先确定一串氨基