关于外显子捕获的简介
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接,这就需要有剪接供体(splicing donor,SD)位点和剪接受体(splicing acceptor,SA)位点。因此,SA位点可作为基因的标志。pETV—SD载体的克隆位点上游有一个“外显子捕获序列”(exon trap cassette),可用来识别载体的插入片段中有无SA位点。......阅读全文
关于外显子捕获的简介
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接
关于外显子捕获的操作步骤介绍
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。 (2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
外显子捕获与扩增(二)
材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体(步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified
外显子捕获与扩增2
阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X
外显子捕获与扩增1
本方案以哺乳动物穿梭载体 pSPL3 为例,描述了外显子扩增的方法,内容分为以下五个阶段。阶段 1: 文库的构建; 阶段 2: 电穿孔法将文库转染 COS-7 细胞; 阶段 3:mRNA 的提取; 阶段 4: 反转录 PCR; 阶段 5: 克隆分析。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:
外显子捕获与扩增(三)
凝胶琼脂糖凝胶(1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸与寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分别提取自转染有对照载体和重组载体的 COS-7 细胞的 RNA(阶段 3)。培养基含 50ug/ml 氨苄青霉素的 LB 琼脂平板专用设备自动微量加样器所用的加样器尖头微
外显子捕获与扩增(一)
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3COS-7 细胞载体 pBluescriptⅡ大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱限制性内切核酸酶PvuⅡT4DNA 连接酶LB 琼脂平板黏粒载体TESOC 培养基琼脂糖凝胶LB 肉汤培养基PBS胰酶-EDTA 溶液D
外显子捕获的概念和方法
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接,这
分子遗传学词汇外显子捕获
中文名称:外显子捕获外文名称:exon trapping定义:外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体
安捷伦推出全新SureSelect人全外显子UTR捕获试剂
超乎寻常的效率;为次日测序准备好外显子样品 2012年11月8日,加利福尼亚州圣克拉拉市 ― 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)11月8日宣布推出新一代靶向序列捕获测序产品 SureSelect 人全外显子 V5 以及 V5 + UTR。做为此项技术的发起机构,新型的全外显子捕获解决方案
NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因
在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本
关于外显子混编的介绍
当两个转座子被同一转座酶识别而整合到染色体的临近位置时,则它们之间的DNA将变得易于被转座酶作用而转座。如果它们之间的DNA中含有外显子,则该外显子将被切离,并可能插入另一基因之中。这种效应称为外显子混编。 即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编
关于外显子的表达序列介绍
在反式剪接中,不同mRNA的外显子可以被接合在一起。外显子在剪接(Splicing)后仍会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序列。术语外显子也指编码相应RNA外
关于外显子的应用机理介绍
应用聚合酶链反应-单链构象多态性(polymerasechainreaction-singlestrandconformationpolymorphsim,PCR-SSCP)及DNA直接测序技术检测68例SAD患者和65名正常老年人的早老素-1基因第5外显子。
关于外显子的结果应用介绍
结果发现68例SAD患者中有4例患者的SSCP发生泳动异常,DNA序列分析发现:这4例SAD患者的130号密码子发了CTG→ATG错义突变(388位点发生C→A突变),使氨基酸由亮氨酸变为蛋氨酸(Leu130Met);157号密码子发生了GTG→CTG错义突变(469位点发生G→C突变),使氨基
安捷伦推出首款商业化测序外显子靶向序列捕获试剂盒
安捷伦科技针对模式生物,推出世界首款 商业化下一代测序外显子靶向序列捕获试剂盒 2011 年 1 月 19 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出 ,这是全球首款可用于模式生物外显子靶向序列捕获的商业化系统,用以简化下一代测序实验。 日本 RIKEN
电子捕获检测器简介
电子捕获检测器(electron capture detector),简称ECD。 电子捕获检测器也是一种离子化检测器,它是一个有选择性的高灵敏度的检测器,它只对具有电负性的物质,如含卤素、硫、磷、氮的物质有信号,物质的电负性越强,也就是电子吸收系数越大,检测器的灵敏度越高,而对电中性(无电负性
关于全外显子测序技术
在过去10年里,随着高通量测序技术的出现与发展,科研与临床医学领域的遗传学检测范围不断扩大,检测速度不断加快。时至今天,DNA测序技术不仅推进了遗传学研究,也被用于各种遗传疾病的检查。特别是利用全外显子组测序(whole exomesequencing,WES)与全基因组测序(wholegenome
关于电子捕获层析的应用介绍
电子捕获层析法具有选择性较好、灵敏度高、检测限低、易于操作和维修等特点,是分析痕量电负性有机化合物最有效的检测器,也是当今GC分析各种基质中PCBs广泛使用的一种检测器。美国EPA8080A方法将气相色谱电子捕获检测检测法作为检测多氯联苯的标准方法。然而,电子捕获层析法不能区分PCBs与象4-4
关于外显子的基本信息介绍
断裂基因中的编码序列。外显子(expressed region)是真核生物基因的一部分。它在剪接(Splicing)后会被保存下来,并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟RNA中的基因序列,又称表达序列。 既存在于最初的转录产物中,也存在于成熟的RNA分子中的核苷酸序
电子捕获检测器的相关原理简介
它是利用放射性同位素作为放射源轰击载气生成正离子和自由电子,在所施电场的影响下,电子向正极移动,形成了一定的离子流,称为基流。 当载气带着微量的电负性组分(含卤素、硫、磷、氰基等的化合物)进入时,这些亲电子的组分将捕获电子形成负离子而使基流下降,从而产生检测信号;生成的负离子与载气正离子复合成
关于外显子基因识别的基本介绍
许多基因中遗传上的“无义”片段——即内含子,会妨碍基因指导蛋白质的合成。现在,一篇发表于3月11日期的《自然遗传学》杂志上的文章提出了基因识别这些内含子的新机制。 细胞产生一种蛋白质时,首先需要将编码蛋白质的基因转化成RNA分子,接下来,通过细胞的剪接机制除去有潜在破坏作用的内含子,再把基因序
气相色谱电子捕获检测器的简介
早期电子捕获检测器由两个平行电极制成。现多用放射性同轴电极。在检测器池体内,装有一个不锈钢棒作为正极,一个圆筒状-放射源(3H、63Ni)作负极,两极间施加流电或脉冲电压。 工作原理:当纯载气(通常用高纯N2)进入检测室时,受射线照射,电离产生正离子(N2+)和电子e-,生成的正离子和电子在电
关于电子捕获层析的基本信息介绍
电子捕获检测器是分析痕量电负性较强的有机化合物最有效的检测器,也是放射性离子化检测器中应用最广的一种检测器。电子捕获层析的作用机理是:利用电负性化合物对放射性电子射线的不同电子俘获能力。外加一定场强时,放射源的初级电子在电场作用下向正极(收集极)移动,经与载气分子碰撞,产生更多的次级电子与正离子
关于电子捕获层析的电子轰击源的介绍
电子捕获层析的电子轰击源(EI)是应用最多的离子源。有机分子被一束电子流(能量一般为70eV)轰击,失去一个外层电子,形成带正电荷的分子离子(M+),M+进一步碎裂成各种碎片离子、中性离子或游离基,在电场作用下,正离子被加速、聚焦、进入质量分析器分析。EI源的特点是稳定,电离效率高,能量分散小,
关于电子捕获检测器的分类介绍
用于ECD的分类方法很多,熟悉这些分类方法,可以更加了解它们的操作特性,以便在不同分析需要时合理选用。 1.按使用离子源分类 用于ECD的电离源,有放射性同位素源和无放射性两大类。非放射性ECD虽然已有商品,并有无放射性的优点,但在操作中要用高纯度的He以及加添某些稀有气体作载气,ECD结构
外显子混编的功能
即新的基因是由原来的基因打断后的断片混编而成的,或者是由编码蛋白质结构域的基因片段混编而成。这种基因片段可能就是外显子,因此称为外显子混编。