外显子捕获的概念和方法
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接,这就需要有剪接供体(splicing donor,SD)位点和剪接受体(splicing acceptor,SA)位点。因此,SA位点可作为基因的标志。pETV—SD载体的克隆位点上游有一个“外显子捕获序列”(exon trap cassette),可用来识别载体的插入片段中有无SA位点。......阅读全文
外显子捕获的概念和方法
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接,这
启动子捕获的概念和方法
中文名称启动子捕获英文名称promoter trapping定 义用于确定基因组DNA启动子区域的一项技术。用做检测的载体含有报道基因可作表达的标记,但缺乏启动子,将拟检测的DNA序列克隆入这种载体的适当位置,导入细胞或个体,从报道基因表达的程度可分析出启动子的存在与否及其强弱。应用学科生物化学与
外显子捕获与扩增
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3 COS-7 细胞 载体 pBluescriptⅡ 大肠杆菌 DH5α
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
关于外显子捕获的简介
外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体。因为凡是有内含子和外显子的基因在转录后都要经过RNA剪接
外显子捕获的操作步骤
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。(2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋白质)成
外显子捕获与扩增1
本方案以哺乳动物穿梭载体 pSPL3 为例,描述了外显子扩增的方法,内容分为以下五个阶段。阶段 1: 文库的构建; 阶段 2: 电穿孔法将文库转染 COS-7 细胞; 阶段 3:mRNA 的提取; 阶段 4: 反转录 PCR; 阶段 5: 克隆分析。本实验来源于分子克隆实验指南(第三版)上册,作者:
外显子捕获与扩增(三)
凝胶琼脂糖凝胶(1.5%m/V), 用 TBE 配制核酸与寡核苷酸寡核苷酸引物 [20 mmol/L,TE(pH8.0) 配制]分别提取自转染有对照载体和重组载体的 COS-7 细胞的 RNA(阶段 3)。培养基含 50ug/ml 氨苄青霉素的 LB 琼脂平板专用设备自动微量加样器所用的加样器尖头微
外显子捕获与扩增2
阶段 3:mRNA 的提取材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。DEPC 处理水乙醇NaCl(5mol/L)酚酚:氯仿无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)SDS(5%m/V)TMK 缓冲液10 mmol/LTris-HCl(pH7.5)10 mmol/LKCl1 mmol/LMgCl2Triton X
外显子捕获与扩增(一)
实验材料 大肠杆菌菌株 HB101 质粒 pSPL3COS-7 细胞载体 pBluescriptⅡ大肠杆菌 DH5α试剂、试剂盒 pSPL3 多克隆位点图谱限制性内切核酸酶PvuⅡT4DNA 连接酶LB 琼脂平板黏粒载体TESOC 培养基琼脂糖凝胶LB 肉汤培养基PBS胰酶-EDTA 溶液D
外显子捕获与扩增(二)
材料缓冲液与溶液按合适比例稀释贮存液。无二价阳离子的磷酸缓冲液(PBS)酶及缓冲液胰酶-EDTA 溶液核酸与寡核苷酸DNA用于转染的质粒 DNA 制备见本方案阶段 1, 步骤 10~12。用作对照的质粒载体(步骤 3)培养基含 10% 热灭活胎牛血清的 Dulbecco's modified
关于外显子捕获的操作步骤介绍
(1)基因组DNA经“霰弹法”切成小片段后,克隆在位于“外显子捕获序列”下游的克隆位点上。 (2)将这些重组载体汇总后感染反转录病毒的专宿包装细胞系(ecotropicretroviral packaging cell line)——ψ2细胞系。ψ2细胞提供蛋白质产物使载体(自身不能合成病毒蛋
外显子跳读的概念
中文名称外显子跳读英文名称exon skipping定 义跳过一个或多个外显子剪接为成熟的mRNA,是mRNA剪接多样性中的一种主要方式。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
分子遗传学词汇外显子捕获
中文名称:外显子捕获外文名称:exon trapping定义:外显子捕获(exon trapping) 是构建一种载体,从其插入片段中识别和回收外显子序列,从而克隆目的基因。捕获外显子的载体pETV—SD是一种反转录病毒穿梭载体,即可在不同种生物中如大肠杆菌和酵母,细菌和哺乳动物细胞等进行复制的载体
基因捕获技术的概念
基因捕获技术是最具应用前景的基因克隆方法之一。利用该技术建立的随机插入突变的突变体文库,可用于寻找、鉴定和研究大量未知功能和已知功能的活化基因,它是继自然突变、物理突变和化学突变之后发展起来的新的分子生物学方法。基因捕获载体是带有报告基因和/或选择标记基因的不完整的基因表达载体;这些载体所带的基因只
雄蛾捕获量的概念
中文名称雄蛾捕获量英文名称catches of male moths定 义诱捕器捕获雄蛾的数量。应用学科生态学(一级学科),化学生态学(二级学科)
安捷伦推出全新SureSelect人全外显子UTR捕获试剂
超乎寻常的效率;为次日测序准备好外显子样品 2012年11月8日,加利福尼亚州圣克拉拉市 ― 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)11月8日宣布推出新一代靶向序列捕获测序产品 SureSelect 人全外显子 V5 以及 V5 + UTR。做为此项技术的发起机构,新型的全外显子捕获解决方案
NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因
在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本
加帽的概念和方法
加帽是在催化剂N-甲基咪唑(NMI)的催化下,通过脱水乙酸酐对5’羟基的乙酰化完成。当合成完成时,寡核苷酸通过琥珀酸酯仍连于固相载体上,碱基的环外基团仍携有保护基团。
基因捕获的方法原理
基因捕获的方法酷似以报告基因为诱饵来捕获基因。其基本过程是将一含报告基因的DNA 载体随机插入基因组,从而产生内源基因失活突变,并通过报告基因的表达激活提示插入突变的存在,及突变内源基因表达特点。通过筛选得到的插入突变的ES 细胞克隆经囊胚注射转化为基因突变动物模型,进而分析表型来研究突变基因功能。
外植的概念和方法
中文名称外植英文名称explantation定 义把活组织从原生长处移植到体内其他部位或体外进行培养的方法。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞培养与细胞工程(二级学科)
脱核的概念和方法
又称脱核。是指人工将核从细胞中除去。(1)利用离心力使海胆卵的核或变形虫的核靠向一边,然后把细胞从中心部切成两段,再用微量吸管将核吸出;(2)用紫外线或射线照射核的部位,把核杀死;(3)对于伞藻(Acet-alularia)那种的大形细胞,因核位于细胞的一端,所以可把核所在的那一端的细胞部分切去。去
细胞治疗的概念和方法
细胞治疗是指给机体输入细胞制剂,以激活或增强机体的特异性免疫应答。(1)细胞疫苗 包括肿瘤细胞疫苗(如灭活瘤苗、异构瘤苗等)、基因修饰的瘤苗和树突状细胞疫苗等。(2)干细胞移植 干细胞具有自我更新能力和多种分化潜能,在适当条件下可被诱导分化为多种细胞组织,如脐带血、外周血、骨髓等。(3)过继免疫细胞
安捷伦推出首款商业化测序外显子靶向序列捕获试剂盒
安捷伦科技针对模式生物,推出世界首款 商业化下一代测序外显子靶向序列捕获试剂盒 2011 年 1 月 19 日,北京——安捷伦科技公司(纽约证交所:A)今日推出 ,这是全球首款可用于模式生物外显子靶向序列捕获的商业化系统,用以简化下一代测序实验。 日本 RIKEN
捕获包被法检测抗体和捕获包被法检测抗体
捕获包被法(亦称反向间接法)ELISA,首要用于血清中某种抗体亚型成分(如IgM)的测定。以目前常用的IgM测定为例,因血清中针对某种抗原的特异性IgM和IgG同时存在,则后者可搅扰IgM的测定。因此先将一切血清IgM(包括异性IgM和非特异性IgM)固定在固相上,在去除IgG后再测定特异性I
微萃取方法的概念和应用
微萃取是另一种形式的液 - 液萃取技术,采用0.001-0.01范围的相比率值(V)进行萃取过程。与传统的液 - 液萃取相比,它采用小体积有机溶剂。微萃取提供的回收率较差,但是在有机相中的欲测物质的浓缩大大地增高。此外,使用的溶剂量也大大地减少。在容量瓶中进行萃取,可以选择比水密度低的有机溶剂,结果
末端分析的概念和产业方法
中文名称末端分析英文名称terminal analysis定 义常指蛋白质肽链两端氨基酸的分析。对于N端分析有三种方法:桑格-库森法、丹璜酰法和埃德曼降解法,后者可连续测入,并可自动化操作;对于C端分析,主要用外肽酶,如一些羧肽酶,将肽链的羧基末端氨基酸切下分析。应用学科生物化学与分子生物学(一级
仪器分析方法的概念和种类
仪器分析方法:以物质的物理和物理化学性质为基础的分析方法称物理和物理化学分析法。这类方法都需要较特殊的仪器,通常称为仪器分析方法。最主要的仪器分析方法有以下几种:1、光学分析法根据物质的光学性质所建立的分析方法。主要包括:分子光谱法、分光分析法、分子荧光及磷光分析法;原子光谱法,如原子发射光谱法、原
分子标记的概念和方法特点
分子标记(Molecular Genetic Markers)是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是 DNA 水平遗传多态性的直接的反映。与其他几种遗传标记——形态标记、同工酶标记、细胞标记相比,DNA 分子标记具有的优越性有:大多数分子标记为共显性,对隐性的农艺性状的选择十分便利;
合成化学的概念和方法
合成化学是化学的一个重要分支,主要研究如何通过化学反应和方法,将简单的起始原料转化为具有特定结构和性能的复杂化合物。合成化学的重要性体现在多个方面:创造新物质:为人类提供了各种各样的新材料,如药物、高分子材料、催化剂等,推动了科技进步和社会发展。解决实际问题:例如合成新型药物来治疗疾病,研发高性能材