NatureBiotechnology：可取代ChIPseq的新技术
生物体内的所有细胞都携带着相同的遗传物质——DNA。不同细胞读取和表达不同的部分，从而实现特异性的功能。比如说，神经细胞表达的基因帮助它们给其他神经细胞传递信息，而免疫细胞表达基因帮助它们合成抗体。 这样的基因表达受到转录因子的控制，但人们一直很难定位功能性转录因子在DNA上的结合位点。之前的全基因组分析让人感到更加困惑，似乎转录因子在DNA上到处结合，甚至结合在不开/关基因的地方。 日前，Stowers医学研究所的研究人员开发了一个能够在基因组中精确定位转录因子结合位点的新技术，该技术分辨率很高，大大优于之前的分析方法。这一成果发表在三月九日的Nature Biotechnology杂志上。 研究显示，功能性的转录因子结合位点存在清晰的印迹，也就是说转录因子结合在特定的序列上。而那些可疑的结合位点并没有特定的模式，非常散乱。 “我们鉴定了转录因子结合位点独有的序列模体（motif），还发现了其他与结合特异性有关的序......阅读全文
通用转录因子的相关介绍
在真核生物中有效的和启动子特异性的起始需要几个起始因子，这些起始因子称为通用转录因子。通用转录因子共同执行
转录激活因子的定义
定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)
转录起始因子的定义
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
Nat－Commun：揭秘转录因子“勘察”细胞基因组的分子机制
转录因子（TFs）是一种能调节基因表达的特殊蛋白，其能在完整的基因组中搜索并结合特殊区域来调节基因的表达；我们都知道，转录因子不仅能结合特殊的DNA序列，还能非特异性结合任何DNA链。这些非特异性的关联就能够明显增加转录因子寻找特殊靶点的能力，然而目前研究人员并不清楚在扫描大量基因组、定位以及结
上科院阐明Hippo通路关键转录因子TEAD4特异性结合DNA机制
4月5日，国际学术期刊Oncogene在线发表了中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所/分子细胞科学卓越创新中心周兆才研究组的最新研究成果DNA-binding mechanism of the Hippo pathway transcription factor TEAD4。该
玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类重要的粮食作物，天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道，玉米籽粒
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2－调控醇溶蛋白
玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类重要的粮食作物，天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有
我国学者发现转录因子Sox2可与RNA结合调控体细胞重编程
国际学术期刊Nucleic Acids Research（《核酸研究》）在线发表了中国科学院广州生物医药与健康研究院鲍习琛课题组、香港大学Ralf Jauch课题组和中山大学医学院（深圳）侯琳琳团队共同合作的成果“Concurrent binding to DNA and RNA facilit
多名学者推荐全基因组分析转录因子功能新技术
来自北卡罗来纳大学教堂山分校，NIH等处的研究人员利用一种新型方法，分析了酵母转录因子Rap1在整个基因组中的结合动态，从而可以更好研究这一转录因子的功能，这一方法将有助于科学家们实时分析转录情况，相关成果公布在Nature杂志上。 对于这一成果，来自法国国家科学研究中心的François
Cell－reports:转录激活因子抑制基因表达——一切皆有可能
近日，来自韩国的科学家在国际学术期刊cell reports在线发表了他们的最新研究进展，他们发现Hippo肿瘤抑制途径下游一直作为转录共激活因子的YAP和YAZ，也能够通过与具有TEA结构域的转录因子相互作用发挥转录共抑制因子活性，促进肿瘤进展。 YAP和TAZ是位于Hippo肿瘤抑制途径下
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描
Scanning the human genome with combinatorial transcription factor librariesPublished online: 18 February 2003, doi:10.1038/nbt794March 2003 Volume 21
高通量的转录因子活性检测
转录因子(transcription factor，TF)在真核生物的基因表达过程中发挥着重要作用，或调节基因表达的强度，或控制目的基因的时空特异性表达，或应答外界刺激和环境胁迫。近年来，随着干细胞研究的不断升温，人们对转录因子的兴趣也日益浓厚。同一个基因组，为何最终分化成不
日找到控制细胞分化转录因子
日本理化研究所4月20日发表新闻公报说，该所研究人员与文部科学省项目小组通过大规模数据分析，找到一群控制细胞分化状态的转录因子，并解开了其中的具体机制。 公报说，研究人员以白血病患者的人体免疫细胞株THP—1为研究对象，借助先进的基因测序技术，按细胞分化过程中不同时间段收集它们从原单核细胞
转录因子Nanog的双重作用
来自中科院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所的朱学良研究组发表了题为“Nanog suppresses cell migration by downregulating Thymosin β4 and Rnd3”的文章，发现干细胞转录因子Nanog可通过下调下游基因Thymosin
通用转录因子的主要种类介绍
TFⅡD该通用转录因子识别TATA元件(大约在转录起始位点上游30个碱基对处)。像很多通用转录因子一样,TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP(TATA binding protein)。此复合体中的其他亚基称为TAF,即TBP关联因子(TBP-associa
分子遗传学词汇转录因子
真核生物转录起始过程十分复杂，往往需要多种蛋白因子的协助，转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体，共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类；第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时，转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外，还发现TFⅡA，TFⅡB，TF
ArrayStar转录因子活性ELISA检测法
ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活性。试剂盒采用96微孔板，标记探针是生物素标记的双链寡核甘酸片段，含有转录因子的特异性DNA结合序列。当标记探针与细胞核抽提物一起孵育时，核抽提物中活性形式的转录因子与探针特异性结合，形成转录因
转录因子的基本信息介绍
RNA的转录合成从化学角度来讲类似于DNA的复制，多核苷酸链的合成都是以5’→3’的方向，在3’-OH末端与加入的核苷酸形成磷酸二酯键，但是，由于复制和转录的目的不同，转录又具有其特点： （1）对于一个基因组来说，转录只发生在一部分基因，而且每个基因的转录都受到相对独立的控制； （2）转录是
转化生长因子β信转录
磷酸化的RSMAD/coSMAD复合物进入细胞核，与转录启动子及转录辅助因子结合，引起DNA转录。成骨蛋白引起参与骨发生、神经形成及腹部中胚层分化的mRNA的转录。TGF-β引起参与细胞凋亡、细胞外基质再生及免疫抑制的mRNA的转录。它也与细胞周期中的G1期阻滞有关。激活素引起参与性腺生长、胚胎分化
关于通用转录因子的成员介绍
1、TFⅡD 该通用转录因子识别TATA元件（大约在转录起始位点上游30个碱基对处）。像很多通用转录因子一样，TFⅡD实际上是一个多亚基复合体。TFⅡD中与TATA序列结合的成分称为TBP（TATA binding protein）。此复合体中的其他亚基称为TAF，即TBP关联因子（TBP-a
转录起始因子的功能介绍
中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定 义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学（一级学科），分子遗传学（二级学科）
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调...
玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2互作可协同调控醇溶蛋白的表达玉米（Zea mays）原产于墨西哥和中美洲地区，是一种由古印第安人（Indians）在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍（Euchlaenamexicana）（现存在于墨西哥和尼加拉瓜）杂交而来的品种。但是，作为一类
测量任一细胞因子转录因子的其他技术
虽然其他技术可以测量任一细胞因子，转录因子，或另外的磷酸化蛋白质，细胞内流式细胞仪可以测量多个细胞内标记同时上面的singlecell电平。这种方法提供了数据信号反应，分化状态，和其他细胞活动。特定的细胞表面和细胞内标记物的荧光抗体的结合使用使高分辨率的样本之间的多种细胞类型内的表型和功能的差异比较
版纳植物园转录调控因子Alfinlike基因家族研究获进展
通过比较基因组学，在基因组层次上研究特定基因家族的进化，进而揭示其变化的原因和机制，已成为目前进化生物学关注的热点问题。中科院西双版纳热带植物园生态进化生物学研究组研究人员利用模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)及其近缘物种琴叶拟南芥(A. lyrata)和小盐芥(Th
利用人工组合转录因子对人类基因组扫描2
Figure 5: Regulation of CDH5 by TFZFs in several human cancer cell lines.Blue, cells infected with a pMX construct containing the DNA binding domain o
基因转录调控的途径
可分为三种主要途径：1）遗传调控（转录因子与靶标基因的直接相互作用）；2）调控转录因子与转录机制相互作用，3）表观遗传调控（影响转录的DNA结构的非序列变化）。
基因转录后调控方式
真核生物的RNA被翻译之前需要通过核孔输出，因此核输出对基因表达有着显著影响。所有进出细胞核的mRNA的运输都是通过核孔进行的，受到各种输入蛋白和输出蛋白的控制。携带遗传密码的mRNA需要存活足够长的时间才能被翻译，因为mRNA在翻译之前必须经过很长距离的运输。在典型的细胞中，RNA分子仅在特异性保
揭示CpG岛结合蛋白BEND3调控分化中二价基因转录的功能
2月10日，中国科学院生物物理研究所朱冰课题组与许瑞明课题组合作，在《科学》（Science）上，在线发表了题为Highly enriched BEND3 prevents bivalent genes from premature activation during differentiati
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子
RNA聚合酶Ⅱ的基本转录因子转录因子分子量(kD)功能TBP30与TATA盒结合TFⅡ-B33介导RNA聚合酶Ⅱ的结合TFⅡ-F30,74解旋酶TFⅡ-E34,37ATP酶TFⅡ-H62,89解旋酶TFⅡ-A12,19,35稳定TFⅡ-D的结合TFⅡ-I120促进TFⅡ-D的结合