干细胞牛人PNAS发布染色质蛋白组学分析法

当下生物医学研究的一个重要特点是技术手段的革新非常快,人类基因组计划完成后,组学水平的研究使得从整体水平认识生命过程成为可能。美国怀海德生物医学研究所(Whitehead Institute for Biomedical Research)的Richard A Young博士在这方面——尤其是利用组学工具研究干细胞,做出了重要贡献。早在2005年,他的实验室在《Cell》杂志上首次报道人胚胎干细胞中三个维持多能性的重要基因——Oct4,Sox2和Nanog在全基因组上的结合情况,揭示这三个基因协同作用维持胚胎干细胞多能性的分子机制,并提出核心转录因子调控网络的概念,突破了研究单个基因在干细胞中作用的限制,开创了从整体水平了解干细胞复杂调控机制的新时代。 三月九日,Richard A Young博士带领的研究小组在《PNAS》杂志发表一项重要研究成果,题为“Chromatin proteomic profiling reve......阅读全文

细胞核基因组

  每条染色体含1个DNA分子,1个细胞的全部遗传信息(基因)都编码在线状的DNA分子上。由于每个体细胞中有2套染色体(2n),故所含的DNA是由两个基因组(genome)构成。每个单倍体基因组约含3.2×109bp.人类基因的平均长度为1~1.5kb,所以基因组以足以编码1.5×106蛋白质,但实

PNAS:特殊蛋白质可控制机体“基因组卫士”

  近日,发表在国际杂志PNAS上的一篇研究报告中,来自蒙特利尔临床研究学院的科学家通过研究鉴别出了免疫反应已知机制的一种新的作用亮点,研究人员发现了一种新型特殊蛋白,其可以控制“基因组卫士”—p53肿瘤抑制蛋白的活性。  文章中,研究者对T细胞和B细胞的发育也进行了深入研究,这两种细胞均是保护机体

细胞化学词汇线性基因组

中文名称:线性基因组英文名称:linear genome定  义:构成生物体全部遗传信息的核酸分子的一种结构形式,具有这种结构形式的长链核酸分子的5′端和3′端都是游离的。具有线性基因组的生物包括真核生物、某些噬菌体和病毒,其基因组的完整复制依赖于各种有别于具有环状基因组的生物。应用学科:生物化学与

细胞化学词汇基因组重构

中文名称:基因组重构英文名称:genome reorganization定  义:由于进化中的选择压力所造成的物种间在基因组结构特征上的改变。可以通过染色体重排(如缺失、扩增、置换等)形成。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇基因组组构

中文名称:基因组组构英文名称:genome organization定  义:生物的基因组在诸如各基因的排列顺序、基因的结构、同源基因的序列差异等基因组结构上的特征。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇镶嵌基因组

中文名称:镶嵌基因组英文名称:mosaic genome定  义:由不同生物基因组的DNA序列经过重新组合而形成的一套杂合的生物体基因。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇基因组DNA

中文名称:基因组DNA英文名称:genomic DNA定  义:组成生物基因组的所有DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

细胞化学词汇前基因组

中文名称:前基因组英文名称:pregenome定  义:某些病毒基因组DNA进入细胞核后,在宿主RNA聚合酶作用下产生的一条作为遗传信息载体的信使核糖核酸(mRNA)。可以通过逆转录形成双链的病毒基因组DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

真核细胞基因组的特点

(1)主要存在于细胞核内,少量存在于线粒体中。(2)为单顺反子,表现为一个结构基因经过转录后生成一个单顺反子mRNA分子,翻译成一条多肽。(3)基本上没有操纵子。(4)为断裂基因,内含子占绝大多数,不翻译成蛋白质;外显子占少数,可以翻译成蛋白质。(5)具有较高重复序列。(6)具有多基因家族基因和假基

细胞化学词汇线性基因组

在同一染色体上突变的等位基因的位置联系紧密。

蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图

  据《科学》杂志近日发表的一项最新研究,研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合,绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图,显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。通过创建基因组蛋白质组图,科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。   蛋白质故障会导

蛋白质、基因组与人类疾病有了关联图

  据《科学》杂志近日发表的一项最新研究,研究人员将人体血液中的数千种蛋白质数据与遗传数据相结合,绘出了蛋白质、基因组与人类疾病的网络关系图,显示了影响这些蛋白质的遗传差异如何将多种多样的相关疾病联系在一起。  通过创建基因组蛋白质组图,科学家们发现了不同人类疾病之间的数百种新联系。  蛋白质故障会

Nat-Rev-Cancer综述:肿瘤蛋白质基因组学

导 读       肿瘤蛋白质基因组学(Cancer proteogenomics)是将基于质谱(MS)的蛋白质丰度和翻译后修饰(PTM)信息与临床前肿瘤模型和肿瘤样本的基因组、表观基因组和转录组数据相结合的组学技术。基因组学和表观基因组学为解释可能发生的生物过程提供了基础知识,蛋白质组学是对已经发

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临

《基因组蛋白质组与生物信息学报》:蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成,但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现,蛋白质才是生命活动真正的执行者,所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究,试图找出人类疾病的致病机理,最终解决人类

细胞核基因组——重复顺序

  高度重复顺序其长度可能2、4、6、8等几个bp,较长的顺序可达200bp,但是重复拷贝数可达106次以上,例如染色体着丝粒、端粒和Y染色体长臂上的异染区就是由高度重复顺序的卫星DNA构成的,高度重复顺序不能转录,它们参与染色体结构的维持,形成结构基因间隔,可能与减数分裂时同源染色体的联会配对有关

真核细胞基因组DNA的提取

实验概要高等动物,高等植物的基因组相当庞大,如人类细胞基因组由30亿个碱基对组成,果蝇基因组有1.4×108个碱基对,水稻基因组有1.4×109个碱基对。真核细胞基因组中,约1万-1.5万个可表达的结构基因,其它大量存在的是调控序列和内含子序列。可以说某特定物种的基因组,包含了该物种生长,发育,繁殖

细胞质基因组的概念

细胞质基因组(plasmon)是细胞质中基因的总称,细胞质基因是细胞质中存在的支配遗传性状的基因。细胞质中存在的一个个基因。

解析古老的单细胞基因组

  单细胞的古细菌用肉眼根本看不到,甚至在使用显微镜时,也必须特别用心才能观察到它们。近日由丹麦奥尔胡斯大学地质微生物学中心领导的一个国际研究人员小组,却成功地从海底淤泥中获得了四个古细菌细胞,并绘制出了每个细胞的基因组图谱。这一突破性研究成果发表在著名的《自然》(Nature)杂志上。   “直

细胞器基因组的概念

中文名称细胞器基因组英文名称organelle genome定  义真核细胞线粒体、叶绿体等细胞器所包含的全部DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

细胞化学基础叶绿体基因组--cpDNA

叶绿体基因组在很多方面与线粒体基因组的结构是相似的。叶绿体DNA(cpDNA)是双链环状,缺乏组蛋白和超螺旋。cpDNA中的GC含量与核DNA及mtDNA有 很大的不同。因此可用CsCl密度梯度离心来分离cpDNA。每个叶绿体中cpDNA的拷贝数随着物种的不同而不同。但都是多拷贝的。这些拷贝位于类核

细胞周期蛋白质的细胞周期

我们可以把细胞周期人为地划分为几个时期。开始人们按照细胞所处的形态学变化将细胞划分为间期和分裂期两相,霍华德学说划分细胞周期各期则是以细胞核的遗传物质DNA的复制和分裂作为主要标界——即按时间顺序将细胞周期确定为四个期:DNA合成前期(G1期),DNA合成期(S期),DNA合成后期(G2期)和分裂期

单细胞蛋白质的优点

  从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快,原料要求低(包括农林副产物及废料,食品加工后的废物、副产品,石油衍生原料,厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等),营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分),是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物,包括含

蛋白质的细胞功能介绍

  蛋白质是细胞中的主要功能分子。除了特定类别的RNA,大多数的其他生物分子都需要蛋白质来调控。蛋白质也是细胞中含量最为丰富的分子之一;例如,蛋白质占大肠杆菌细胞干重的一半,而其他大分子如DNA和RNA则只分别占3%和20%。在一个特定细胞或细胞类型中表达的所有蛋白被称为对应细胞的蛋白质组。  蛋白

单细胞蛋白质的用途

  ①用作食品有些单细胞蛋白质,特别是用农产品培养生长的酵母菌菌体可用作食品(必要时要先经过处理)。  ②用作饲料用单细胞蛋白质作为饲料,可以节约粮食,促进畜牧业发展。  ③用作其他从单细胞蛋 白质中可提取许多有用之物,如辅酶A,细胞色素C和辅酶I等医药产品,如酵母浸出汁等生物试剂。

单细胞蛋白质的介绍

  从单细胞微生物中提取出的蛋白。由于微生物繁殖速度快,原料要求低(包括农林副产物及废料,食品加工后的废物、副产品,石油衍生原料,厌氧废物处理过程中产生的生物质副产品等),营养价值高(含有碳水化合物、脂肪、维生素和矿物质等多种营养成分),是人类和动物获得蛋白质的手段之一。可制取蛋白质的微生物,包括含

真核细胞蛋白质合成过程

真核细胞中,核糖体进行蛋白质合成时,既可以游离在细胞质中,称为游离核糖体(freeribosome)。也可以附着在内质网的表面,称为膜旁核糖体或附着核糖体。参与构成RER,称为固着核糖体或膜旁核糖体,是以大亚基圆锥形部与膜接着游离核糖体(freeribosome)。分布在线粒体中的核糖体,比一般核糖

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(二)

针对一些乳腺癌亚型和携带常见突变如PIK3CA和TP53突变的肿瘤,分析结果揭示出了一些新的蛋白质标记物和信号通路。另外将一些基因中的拷贝数改变与蛋白质水平联系一起,从而鉴别出了10个新的候选调控因子。其中两个候选基因SKP1和 CETN3可能与癌基因EGFR有关联。EGFR是一种特别具有侵

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(三)

人类尚未充分认识复杂的癌症基因组是如何转化为导致复发和死亡的驱动生物学的,将蛋白质组学与基因组学结合在一起能够让我们获得对癌症的新认识,同时提供一种有价值的资源以便科学界能够用来提出关于这些疾病的新假设,以及治疗它的手段。蛋白质基因组学终有一天会被证明是一种强大的临床工具,使得人类能够横跨癌症基因组

蛋白质组学之逆袭:深度注释基因组(一)

申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完成了对多种物