韩敬东课题组研究成果在《GenomeResearch》发表

近日,国际基因组研究权威期刊《Genome Research》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所、中科院遗传与发育生物学研究所和清华大学等处的最新研究论文“Single-cell-level spatial gene expression in the embryonic neural differentiation niche”。在这项研究中,研究人员开发了一种半自动化的原位杂交图像分析流程,并使用这种分析流程,在单细胞分辨率上得出了大脑皮质层中基因的空间表达模式,以深入了解大脑皮层发育过程中所发生的关键过程。 本文通讯作者的中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所韩敬东研究员,早年毕业于中国药科大学,1996年在美国Albert Einstein College of Medicine获博士学位,1997年至1998年在美国洛克菲勒大学霍华德休斯医学研究所从事博士后研究,后在美国多家公司担IT任......阅读全文

新研究:精准基因编辑技术

  中国科学院遗传与发育生物学研究所高彩霞研究组开创性地运用AI辅助结构预测,建立起基于三级结构的蛋白聚类方法,并扩展为全新的脱氨酶挖掘体系,开发了一系列具有中国自主知识产权的新型碱基编辑工具。该工作为蛋白功能分析、新功能元件挖掘提供了全新策略。新研发的碱基编辑系统具有我国自主知识产权的精准基因编辑

研究揭示番茄耐盐基因

  土壤是保障粮食安全的基石。然而近年来由于化肥农药的过度使用等,土壤生态条件大不如前,基础地力下降,耕地盐碱化问题变得尤为突出。  除了“治疗”盐碱地,科学家也在不遗余力地挖掘作物的耐盐潜力。近日,中国科学院上海植物逆境生物学研究中心(以下简称“逆境中心”)研究员朱健康团队与中国农业科学院(深圳)

研究发现抗衰老靶标基因

  2月27日,《自然》期刊在线发表了题为《两个保守的表观遗传调控因子妨碍健康衰老》的研究论文,该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心(神经科学研究所)、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室蔡时青研究组与中国科学院上海巴斯德研究所江陆斌研究组合作完成。  衰老是生物体随时间推移各

基因重复的研究进展

基因重复是基因通过不等交换、逆转录转座或全基因组重复等途径产生一个与原基因相似的基因或碱基序列。它与生物体基因组大小的进化、新基因的起源、物种的分化以及基因抗突变的能力大小等都密切相关。文章综述了重复基因的产生机制、保留机制、选择作用、分化途径以及重复基因进化速率等方面的相关研究,揭示了基因重复对生

多基因病分析(一)

   一些常见的先天畸形(congenital maiformation)和常见而病因复杂的疾病,其发病率一般都超过1/1000,疾病的发生都有一定的遗传基础,并常出现家族倾向,但不是单基因遗传,患者同胞的发病率不遵循1/2或1/4的规律,大约仅1%-10%,表明这些疾病有多基因遗传基础,故称为

基因测序市场行业分析

  基因测序市场究竟有多火,我已找不到任何一个词语去形容,据统计,仅中国,从事基因领域的相关企业就有超过600家了。前几天从一则消息上了解到就连从事软件开发的苹果、微软、IBM等国际巨头,居然也开始将业务触及到基因领域。那么,在经济迅猛发展的当代中国,基因测序行业到底谁主沉浮?以下深度好文将能告诉你

基因检测行业分析报告

  相关概念  基因是DNA分子上的一个功能片段,是遗传信息的基本单位,是决定一切生物物种最基本的因子;基因决定人的生老病死,是健康、靓丽、长寿之因,是生命的操纵者和调控者。因此,哪里有生命,哪里就有基因,一切生命的存在与衰亡的形式都是由基因决定的,包括您的长相、身高、体重、肤色、性格等均与基因密不

多基因病分析(二)

  多基因遗传引起的畸形,遗传和环境因素都有影响,诸如社会经济原因对母体及其子宫的影响均可导致畸形的产生。常见的这类先天畸形有脊椎裂、唇裂、腭裂、短指或缺指、先天性心脏病、先天性幽门狭窄、先天性髋脱臼、先天性肾缺乏、先天性巨结肠症等。举几例简述如下。  (1)先天性心脏缺陷(congenital h

多基因病分析(三)

  (3)糖尿病(diabetes mellitus):本病是胰岛缺乏引起的常见代谢性疾病。按对胰岛素的需要量分为胰岛素依赖型糖尿病(IDDM)和非胰岛素依赖性糖尿病(NIDDM)两个类型。其特征为血糖升高、糖尿、糖耐量降低和胰岛素释放反应异常。临床上患者多食、多饮、随病程进展可出现心血管、肾、

基因表达系列分析简介

  1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术,能同时对上千个转录本进行研究。  SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签(Expressed Sequenc

基因表达的系列分析

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因质谱分析系统

  基因质谱分析系统是一种用于预防医学与公共卫生学领域的分析仪器,于2012年6月19日启用  技术指标  可对4-30bp核酸片段进行分子量测定,每天分析完成>3000样本的1-36重RCR反应的检测和数据分析;一张芯片含384个孔,一次可任意选用1-384个孔,剩余孔可以分多次使用;数据读取完成

国家基因库参与人类胚胎基因编辑研究

   8月3日,由俄勒冈健康与科学大学、韩国基础科学研究院、美国Salk生物学研究所和深圳国家基因库合成与编辑平台合作完成的人类胚胎基因编辑最新重量级研究成果发表于《自然》杂志。在中国、美国、韩国的国际合作组的通力协作下,科学家第一次成功的利用CRISPR-Cas9系统在人类早期胚胎中对导致肥厚型心

水生所在原核生物的蛋白基因组分析研究中取得进展

  蛋白基因组学(Proteogenomics) 是基于高精度的串联质谱数据对基因组进行注释,不仅能在蛋白质水平上验证基因表达和模式,还能提供蛋白质组层面特有的信息,如翻译后修饰、信号肽等。目前,蛋白基因组学已成为功能基因组学研究不可或缺的重要工具。然而,对海量质谱数据实现全面和精准的解读仍是当前蛋

analytica-2014专注食品分析、塑料分析、基因和生物分析

  2014年4月1-4日,国际分析、生化技术、诊断和实验室技术博览会将再次成为科研和研究界的盛会。1100多家展商将在展会期间推出自己的最新产品和实验室技术方案。此外,展会还首次推出特别展,重点展示职业安全和健康方面的内容。   今年的analytica围绕三大主题展开——食品分析、塑

基因分析仪是不是就是基因测序仪

基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。[5]基因测序广为人知的还有针对唐氏综合征筛查的无创产前基因检测。只需要孕妇5毫升血,通过化验血液中甲型胎儿蛋白(AFP)、人类绒毛膜促性腺激素(β-hCG)的浓度,就可以算出胎儿出现唐氏综合征的危险性。[5]最近公众

关于新型基因检测技术—基因测序的问题分析

  基因测序是把双刃剑:  基因测序虽然是一种很好的治疗手段,但是中国科学院北京基因组研究所教授甄二真表示,从应用的角度来说,科学家只确定了部分的基因位点与疾病的确切关系,也就是说真正可以用于临床诊断和指导治疗的基因检测并不多。要想真正用基因来诊病,还需要时间。  基因测序就像一把双刃剑,如果运用得

Coimbra基因和华大基因联合发起胃癌基因组研究计划

  2013年9月30日,华大基因和来自葡萄牙的一家新兴生物公司Coimbra基因联合发起了一项胃癌基因组研究计划,以解密胃癌背后的遗传奥秘。该项目的启动经费达90万美元,将成为胃癌领域内首个大规模基因组研究项目。该项目的科研团队包括来自葡萄牙波尔图顶级癌症研究所 ――IPATIMUP的遗传学家

新研究证实癌症存在基因“开关”

  瑞典和芬兰研究人员最新研究发现,基因组区域中一种特定核苷酸变异与大肠癌和前列腺癌患病风险有着重要联系,是引发这两种癌症的“开关”。   瑞典卡罗林斯卡医学院和芬兰赫尔辛基大学研究人员在新一期美国《科学》杂志上报告说,他们在动物实验中移除了实验鼠体内存在核苷酸变异风险的基因区域 “Myc33

CRISPR大规模基因组研究

  来自杜克大学的研究人员设计出了一种能快速,方便有效靶向人类基因组任何基因的新方法,这种新工具建立在一种来自细菌的RNA引导酶的基础上,即CRISPR-Cas RNA引导性核酸酶(RNA-guided nucleases,RGNs)。   这一研究成果公布在7月25日Nature Met

韩国研究团队探明秃鹫基因信息

  据韩国未来创造科学部消息,由国立中央科学馆、韩国生命工学研究院国家生命研究资源信息中心等研究机构共同承担的“秃鹫基因信息分析”项目取得成功,研究解开了为什么秃鹫嗜食腐肉却不得病的原因。   目前,秃鹫被列为全球性濒危动物。此次,韩国研究团队是通过对两只活秃鹫的血液进行DNA和RNA序列生成,分

关于基因调控的研究方法介绍

  1、筛选突变型  这是在原核生物中广泛应用的方法,例如在乳糖操纵子的研究中筛选失去了基因调控能力的组成型,包括调节基因发生突变和操纵基因发生突变的突变型,以及筛选即使有乳糖或其他诱导物存在的情况下仍然不能合成β-半乳糖糖苷酶的超阻遏型等等。  2、激素诱导  在高等的真核生物中,除了离体培养的体

人大:规制人体基因及胚胎研究

  “有关人体基因、人体胚胎研究的规制问题的确非常重要,三审稿中将此内容纳入是很有针对性的。”在近日分组审议民法典人格权编草案三审稿时,全国人大常委会副委员长陈竺在发言中表示,三审稿在第789条之一加上“不得损害公共利益”是合适的,回应了学术界和公众的普遍关注。  本次会议的一项重要议程,是审议民法

创建荧光鱼研究基因功能

研究人员正在利用作为分子“灯塔”来研究动物的早期发育阶段。研究人员聚焦的Sp2基因可调节其他的表达,他们创建的荧光鱼也可为探究发展成因提供线索。此项研究成果刊登在近期出版的《期刊》(The Journal of Biological Chemistry)上。 Sp2是Sp转录因子家庭的成员之一,

植物激素调控基因研究获进展

  中科院上海药物研究所徐华强与中科院遗传与发育生物学研究所李家洋、美国温安洛研究所Karsten Melcher等合作,在植物中发现了一个与人体中特定信号机制非常相似的重要的分子机制,该机制与人类早期胚胎发育和癌症等疾病有着密切联系。相关研究日前在线发表于《科学进展》。  植物中复杂的分子网络调控

聚焦基因疗法研究新进展

  本文中,小编整理了多篇重要研究成果,共同聚焦科学家们在基因疗法研究领域取得的新进展,分享给大家!  图片来源:mainnews.net  【1】两种基因疗法或有望治愈罕见遗传病  doi:10.1172/jci.insight.130260 doi:10.1073/pnas.1906182116

研究发现狗狗与人共享“肥胖基因”

  不仅人类会遇到肥胖问题,狗狗也会。  据法新社报道,在美国《科学》杂志6日发布的一篇文章中,研究人员通过收集241只拉布拉多犬的口水样本并进行全基因组关联研究,发现一种名为DENND1B的基因与宠物狗肥胖密切相关,也与人类体重增加有关。  据英国广播公司介绍,该基因同样存在于人类中,会干扰大脑中

专家指南:如何研究基因调控(一)

随着基因组学研究的深入,人们已经不再满足于了解基因的功能,而是对基因调控表现出愈加浓厚的兴趣。现在,我们知道,DNA甲基化和组蛋白修饰可调控基因,microRNA和非编码RNA也可以。基因调控的研究工具也越来越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟该采用哪种方法来测定m

瑞典正式启动生命基因研究项目

        瑞典卡罗林斯卡医学院7日在斯德哥尔摩宣布,正式启动由其负责的瑞典生命基因研究项目。         卡罗林斯卡医学院当天发表新闻公报说,在美国芝加哥举行的2010芝加哥国际生物大会上,瑞典卡罗林斯卡医学院已确定项目正式启动。这一项目旨在充分利用瑞典医学资源优势,例如完善的人口注册

Nature发布基因组研究指南

  测序人类全基因组比以往任何时候变得更快速、更便宜,使得比较患者与无特定疾病人群基因组一类的研究激增。临床医生和从事某种疾病遗传贡献研究的研究人员往往会遇到一些似乎与疾病相关的变异,但却发现另外一些携带相同突变的人群并不罹患这种疾病或影响程度较轻。   医生要怎样找到真正引起疾病的遗传变化?发表