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基因表达的系列分析

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定 义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)......阅读全文

基因表达的系列分析

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因表达的系列分析实验

            实验材料 玻璃及塑料器皿 试剂、试剂盒 溶液与缓冲液 引物

基因表达的系列分析实验

SAGE(Velculescuetal.1995) 是基于 PCR 技术的一种高灵敏度研究基因表达的方法,可得到 mRNA 文库的定性及定量信息。自 1995 年此技术产生以来,发表了大量的相关文章,表明 SAGE 可同时检测大量基因的表达水平的变化。实验材料玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒溶液与缓冲液引

基因表达的系列分析实验

实验材料 玻璃及塑料器皿试剂、试剂盒 溶液与缓冲液引物仪器、耗材 试剂盒MPC-EPCR仪Gene PulserII 型系统实验步骤 一、一般原则若用于 SAGE 的 RNA 有足够的量,最好用 2.5~5 ug polyA+RNA, 可按实验方案 A 进行。这里我们还提供了实验方案 B,它在多

基因表达系列分析简介

  1995年Velculescu等提出了基因表达系列分析(Serial Analysis of Gene Expression,SAGE)技术,能同时对上千个转录本进行研究。  SAGE是一种快速分析基因表达信息的技术,它通过快速和详细分析成千上万个表达序列标签(Expressed Sequenc

基因表达系列分析的原理简介

  第一、一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物(49),而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。  第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行

基因表达系列分析实验(SAGE)

实验材料感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · Cl仪器、耗材微量离心

基因表达系列分析实验(SAGE)(三)

58. 用 1:10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察,分出感兴趣的区带。 59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中(用 21-G 针头刺的)。 60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 m

基因表达系列分析实验(SAGE)(四)

83. 用作测序的 2 ul PCR 产物(所需的确切用量取决于测序的方案,并应当优化)用下述方法处理: 0.1 ul 外切核酸酶 I 0.1 ul 虾碱性磷酸酶 1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl,pH 8. 0 加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。

基因表达系列分析实验(SAGE)(二)

31. 乙醇沉淀:11.5 ml 样品10 ul SeeDNA100 ul 糖原5.1 ml 7.5 mol/L 乙酸铵38.3 ml 100% 乙醇干冰/甲醇浴 15 min。然后室温溶化 2 min。32. 轻轻涡旋混匀,台式离心机的吊桶转子室温约 3000 g (4000 r/min) 离心