“万种脊椎动物基因组计划”宣布启动
拟两年解码101种物种 建立遗传信息数据库 深圳华大基因研究院与“万种脊椎动物基因组计划”联盟(G10KCOS)的科学家联合宣布启动万种脊椎动物基因组一期计划。该计划将依托华大基因先进的新一代测序技术平台、前沿的信息分析和数据处理能力,在未来两年内完成对101种脊椎动物的全基因组测序,解析其遗传密码。 “万种脊椎动物基因组计划”拟绘制万种脊椎动物基因组图谱,建立哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类和鱼类等10000种脊椎动物的遗传信息数据库,研究生物多样性和动物进化的机制,为生命科学和全球动物保护提供前所未有的基础资源。该计划现有来自全球的43个研究机构和68位科学家参与其中。 据介绍,全球已公布的正在测序的脊椎动物物种已达120种。华大基因与G10KCOS的各物种的研究委员会(哺乳类、鸟类、爬行类、两栖类和鱼类)选择并启动了101种新物种的测序工作。筛选这些物种所依据的重要因素包括物种的特殊进化地位及其系统发育的......阅读全文
依托高通量测序技术-400多个水稻基因转基因克隆工作完成
我国的水稻研究已进入了一个全新的领域,目前华大基因农能平台已经完成400多个水稻基因的转基因克隆工作,依托华大基因强大的高通量测序技术,今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。这是记者在6月29日结束的“水稻基因组学与农业应用研讨会”上获悉的消息。 作为世界上最早种植水稻的国家,水稻
我国已完成400多个水稻基因转基因克隆工作
我国的水稻研究已进入了一个全新的领域,目前华大基因农能平台已经完成400多个水稻基因的转基因克隆工作,依托华大基因强大的高通量测序技术,今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。这是记者在6月29日结束的“水稻基因组学与农业应用研讨会”上获悉的消息。 作为世界上最早种植水稻的
华大基因全球发布新型桌面化测序系统BGISEQ500
2015年10月24日,中国深圳--在第十届国际基因组学大会(ICG-10)上,全球最大的基因组学研发机构华大基因发布了其自主研发的新型桌面化测序系统BGISEQ-500。该仪器是华大基因继今年6月推出“超级测序仪”DRevolocity™之后的第二款测序系统。华大基因2013年全资并
全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因
在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。
全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因
在寻找疾病相关基因的研究中,使用基因芯片对家系进行连锁分析,将基因定位于少数几个区域中,接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异,是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究,均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。
高通量测序技术核酸片段分选
近年来,高通量测序技术已经日渐成为基因组学研究项目的标准。从样品制备到文库制备及最终测序,大多步骤都要求精确高效化、易于自动化操作,并且许多高通量测序应用都要求核酸片段在特定范围内紧密分布,因此精准快速的进行片段选择步骤更具挑战性。在进行核酸片段分选的过程中,传统的琼脂糖凝胶回收法不适于安全、高通量
高通量测序技术总结与展望
第一代测序技术凭借其长的序列片段和高的准确率,适合对新物种进行基因组长距框架的搭建以及后期GAP填补,但是成本昂贵,而且难以胜任微量DNA样品的测序工作。第二代测序技术中,454序列片段最长,比较适合对未知基因组从头测序,搭建主体结构,但是在判断连续单碱基重复区时准确度不高。Solexa较454
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
llumina高通量测序平台的应用
Illumina公司的新一代测序仪Genome Analyzer最早由Solexa公司研发,利用其ZL核心技术“DNA簇”和“可逆性末端终结(reversible terminator)”,实现自动化样本制备及基因组数百万个碱基大规模平行测序。Illumina公司于2007年花费6亿美金的巨资收
关于高通量测序的基本介绍
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术(Next-generation sequencing technology),或大规模平行测序(Massively parallel sequencing,MPS)。区别于传统Sanger(双脱氧法)测
高通量测序数据分析
1. 是不是一定要用大型计算机? 除了序列拼接组装以外,其它分析不是一定要大型计算机,在普通的PC上也可以进行一些处理,当然,买一台或几台高性能的工作站电脑,能显著加快数据处理的速度。 2. 是不是一定要用Linux系统? 也不一定非用Linux不可,在Window下可以完成部分数据处理。
高通量测序的应用及前景
一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力,对照一个参比基因组(reference genome)高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence),2007年van Orsouw
高通量测序技术及原理介绍
高通量测序技术及原理介绍如下:1.什么是高通量测序高通量测序技术也被称作二代测序技术(Next Generation Sequencing, NGS),这是相对一代测序技术(Sanger Sequencing)而言的,同时由于高通量测序的出现使得我们能对一个物种的基因组和转录组进行全面、细致的分析成
高通量测序(NGS)的原理简介
高通量测序(High-Throughput Sequencing)又名下一代测序(Next Generation Sequencing,NGS),是相对于传统的桑格测序(Sanger Sequencing)而言的。目前高通量测序的主要平台代表有罗氏公司(Roche)的454测序仪(Roch
-资本躁动-百名机构调研基因测序虚实
“中国现在每年有1700万新生儿,放开二胎,每年加100万,大概会到2000万。假设其中有1000万在城市,华大能覆盖25%,那就是每年250万,每例算1000元,就是25个亿……” 只需15秒,35岁的华大医学执行总裁尹烨就能把产前无创基因检测的商业“故事”讲完。近几年来,面对各路投资者讲述
高通量测序技术-中的“高通量”-是什么意思
高通量是相对于第一代测序的,第一代测序只能一次测1个样品的1段序列,产生的数据量相对来说很小,而高通量测序一次能够产生的数据量在几十G上百G,可以一次测很多的样本。在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。不过到2005年以后,高通
猴外显子基因测序及分析平台开发成功
猴外显子测序及分析平台由全球最大的基因组学研究机构之一深圳华大基因开发成功。通过该平台,研究人员可以更加高效地了解各个猴基因组的细微差异,进行医药和疾病等方面的研究。 记者10月15日从华大基因获悉,猴外显子捕获芯片和新一代高通量测序技术为该平台的两大核心技术。这两大技术的结合,使研
中信湘雅与华大基因携手促基因组学等前沿研究
7月3日,中信湘雅生殖与遗传专科医院和深圳华大基因科技有限公司签署战略合作协议,双方将共建“中信湘雅-华大DCSlab”科研实验平台,推动基因组学、基因检测、辅助生殖技术及精准医疗等领域的科学研究。签约仪式现场。中信湘雅医院 供图双方将共建以高通量测序仪、串联质谱仪等平台为基础的精准医学检验平台,该
重磅!华大基因HALOS-PMseq一体机升级发布
随着健康中国战略的深入实施,我国医疗服务体系正朝着流程更高效、信息更准确、服务更便捷的方向发展。信息化工具则成为了当下各级医疗机构实现更高效优质服务的重要渠道之一。 为承载医院日益增长的信息分析需求,华大基因(300676)于2018年自主研发了可实现本地化独立运行的基因分析一体机“HALOS
高通量测序技术——第二代测序技术
高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de
广东首次将标准化导入生命科学领域
近日,广东省质监局组织省标准化研究院(以下简称省标院)等单位,帮助深圳华大基因研究院(以下简称华大基因)将“基因测序技术规范、混合肉类鉴定方法及基因合成质量要求”3项科研ZL技术转化为广东省地方标准,使基因测序产业实现有标可依,为规范检测市场奠定基础。 基因测序被誉为生命科学领域的高新技术服务
广东首次将标准化导入生命科学-助推基因测序与检测技术
近日,广东省质监局组织省标准化研究院(以下简称省标院)等单位,帮助深圳华大基因研究院(以下简称华大基因)将“基因测序技术规范、混合肉类鉴定方法及基因合成质量要求”3项科研ZL技术转化为广东省地方标准,使基因测序产业实现有标可依,为规范检测市场奠定基础。 基因测序被誉为生命科学领域的高新技术
华大基因启动-出生缺陷检测计划
随着基因科技的发展和临床应用,基因技术可以用于遗传疾病的检测,对预防出生缺陷有重要意义。7月8日,华大基因董事长汪建、华大医学执行总裁尹烨等在北京共同宣布启动“千万家庭远离遗传出生缺陷”计划。 发布会上,华大基因旗下的华大医学产前业务负责人赵立见就无创技术的开展现状及应用前景作了介绍。赵立见表
无创产前技术概述(一)
什么是无创产前基因检测无创产前基因检测技术全球统称为NIPT(Noninvasive prenatal test),主要是通过采集5毫升的孕妇外周血,从血浆中把游离的DNA提取出来,经过高通量的测序和生物信息学的分析,得出胎儿患染色体异常的疾病风险率的一项技术。这项检测技术可以检测胎儿全部的
基因测序市场发展前景分析-市场规模将保持快速增长
从1988年人类基因组计划启动开始,基因组学应用的壮阔前景开始展现在人类面前。1998年毛细管测序技术问世,测序提速10倍,原计划15年完成的人类基因组计划加快进度。2006年第二代测序仪诞生,成本下降百倍,形成“超摩尔定律”之势。随着测序成本的显著降低和生物信息分析能力的显著上升,美国等西方发达国
The-scientist:2013年度最热基因组
新的一年即将来临,The scientist杂志盘点了2013年度的高引基因组研究,让我们看看今年又有哪些新解码的基因组受到热捧。 斑马鱼基因组 种属:Zebrafish, Danio rerio 基因组大小:~1.41 billion base pairs 斑马鱼(Da
地球生物基因组计划:生命科学史上最大计划即将启动
新浪科技讯 北京时间3月1日消息,“人类基因组计划”与“曼哈顿原子弹计划”、“阿波罗登月计划”并称为自然科学史上的“三大计划”。继人类基因组计划之后,生命科学领域又将迎来一件大事——比人类基因组计划更宏大的地球生物基因组计划(Earth BioGenome Project, EBP)即将启动,目
Oxford-Nanopore便携式高通量测序仪,打开基因组学新市场
Oxford Nanopore Technologies(“Oxford Nanopore”)推出PromethION 2(“P2”)Solo测序仪,这是全球可及性最高的高通量测序设备,有可能大大提高针对人类遗传学和其他更大数据集的准确、快速和负担得起的测序的可及性。 P2 Solo是市场上唯
新一代超高通量基因组测序系统-GS-FLX开创科研无限新...
新一代超高通量基因组测序系统 GS FLX开创科研无限新可能GS FLX系统是由罗氏454生命科学公司推出的目前应用最广的超高通量基因组测序系统,研究人员利用高准确性、长读长的GS FLX系统快速的获得高质量的生物数据,取得科研突破性进展。自GS系统问世以来,于世界顶级杂志共发表250余篇高质量
全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因-2
图1.2. 全基因组连锁分析结果。最高LOD值为3.01。接下来,研究使用了Agilent SureSelect平台对其中一例患者进行了外显子测序,测序深度为100X,但并没有发现功能相关变异。于是作者又进行了全基因组重测序,测序平台为Illumina Hiseq XTen,测序深度为平均每