Nature惊人发现:可编码的“垃圾”RNA
在植物和动物中,microRNAs(miRNAs)调控了许多不同基因的表达。这样的调控在许多过程包括经历不同发育阶段的转变以及对环境压力的响应中都起着关键的作用。miRNAs是由酶切割前体转录物初级miRNAs (pri-miRs)而生成,直到现在人们都认为pri-miRs不编码任何的蛋白质。 现在,来自法国的研究人员提供了令人信服的反面证据。他们发现一些pri-miRs编码了促进它们的miRNAs生成的肽。这是第一份研究报道证实一个pri-miR编码了一种功能肽,由此从全新的视角认识了pri-miR区域除直接生成miRNAs之外的重要功能。相关论文发表在3月25日的《自然》(Nature)杂志上。 在上世纪70年代,人们开始清楚地认识到编码蛋白质的基因组区域(基因)遨游在非蛋白质编码序列的大海之中,遗传学家Susumu Ohno提出的“垃圾DNA”的概念成为了一个热门话题。尽管现在生物学家们已清楚地知道了内含子(基因内......阅读全文
非编码序列的定义
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
什么是CDS编码序列?
CDS是编码序列(Coding sequence)的缩写。DNA转录成mRNA,mRNA经剪接等加工后翻译出蛋白质,所谓CDS就是与蛋白质序列一 一对应的DNA序列,且该序列中间不含其它非该蛋白质对应的序列,不考虑mRNA加工等过程中的序列变化,总之,就是与蛋白质的密码子完全对应。CDS是编码一段蛋
非编码序列的概念
中文名称非编码序列英文名称non-coding sequence定 义基因中不具有编码功能的序列。如真核生物基因的内含子、启动子等。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)
Nature:CRISPRa截然不同的非编码调控序列分析技术
来自加州大学旧金山分校的一组研究人员修改了现有的基因编辑CRISPR技术,用以来寻找增强子,他们的方法并不是编辑增强子,令其发挥作用,而是利用一种称为CRISPRa(CRISPR activation)的工具,搜寻影响T细胞免疫细胞发育的一种基因的增强子。这项研究发现将有助于解析自身免疫疾病,如
非编码序列内含子子长度多度性((ILPs)
实验概要本实验中运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列,从而开发潜在的ILP标记,通过EPIC-PCR开发候选ILP标记,最后用实验验证及评价了ILP标记。实验步骤1. 水稻釉粳亚种基因组比较搜索ILP我们运用Perl脚本用于比较Nipponbare和93-11基因组序列
研究提出新型时间序列预测框架
近期,中国科学院软件研究所研究团队为提升大语言模型时间序列预测性能,提出了向量注入式上下文学习框架。该框架能够稳定提升时间序列预测性能,并可以降低计算开销。 大语言模型进行时间序列预测时面临一项主要挑战——预训练文本与时间序列数据在分布与结构上存在差异。传统方法采用全量微调来减少这种差异,但其
研究揭示南极长时间序列固定冰图
南极固定冰与冰山(李新情供图) 南极中山站固定冰Landsat-8卫星影像(影像获取时间为2015年10月7日,李新情供图) 中山大学测绘科学与技术学院极地遥感团队与国内外科研人员合作,基于高分辨率SAR影像首次获取了环南极时间序列固定冰数据集,揭示了南极固定冰的时空分布、变化特征及其与冰
用原位筛选法分离编码序列特异性DNA结合蛋白的cDNA
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1.按照(三)中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小,200bp左右的片段需要4~5%的凝胶,小于100bp的片段应灌制6~8%的凝胶。 l DN
基因组所开发出编码蛋白质DNA序列并行比对工具ParaAT
中国科学院北京基因组研究所基因组科学与信息重点实验室“百人计划”章张研究员,带领其团队成功开发出“编码蛋白质DNA序列并行比对工具—ParaAT(Parallel Alignment and back-Translation)”。该研究成果发表在Biochemical and Biop
前导序列
中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列,这部分序列能被转录,但不被翻译,在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点(通常 AUG)为止,在蛋白质合成过程中不被翻译。
关于增强子序列的相关研究分析介绍
观测位于HPV16 LCR序列YY1结合位点上游的组织特异性增强子序列对YY1蛋白的启动子P97抑制作用的影响。 方法构建带有不同长度的HPV16野生株、启动子远端YY1位点突变株、启动子近端YY1位点突变株的5′端LCR缺损序列的荧光素酶报导质粒,以及不同长度的近端YY1/SP1重叠结合位点基
太湖长序列极端洪水事件重建研究获进展
较之气候水文平均态的缓慢变化,特大洪水引发的灾害对人类社会影响更加显著,而关注极端洪水、认识小概率事件需要更长时间序列。太湖洪水历来受到关注,自早全新世到20世纪末,历史和近现代都不乏特大洪水发生。文物考古与历史文献结合,成为了定量研究历史极端洪水的重要证据。然而,刻录洪水的文物对重建洪水序列也
新研究利用DNA序列追溯植物演化关键事件
来自北美、欧洲和中国的科学家最新研究揭示了地球植物演化过程中的重要过渡细节,该研究成果于2014年10月27日发表在《美国科学院院刊》上。 从外来藻类植物、苔藓植物、蕨类植物、生长在潮湿热带雨林中的花草树木、人们食用的谷子、蔬菜到家中的观赏植物,地球上的现生植物共同经历了长达十亿多年的历史。
基于深度学习的时间序列预测研究获进展
时间序列预测是大规模数据无损压缩和极端天气预报等领域的核心技术。随着应用场景多样化和数据复杂性提升,现有模型在异构数据的统一表达、长序列结构依赖建模、极端天气波动捕捉等方面存在挑战。中国科学院计算机网络信息中心人工智能团队围绕上述挑战开展研究,提出一系列创新算法与模型,并在实际系统部署应用。
《自然》:研究揭示mRNA非编码功能
由1962年诺贝尔生理学或医学奖获得者英国科学家克里克和美国科学家沃森提出的分子生物学中心法则认为,遗传信息是从DNA(脱氧核糖核酸)传递给mRNA(信使核糖核酸),再从mRNA传递给功能蛋白质,由此来完成遗传信息的转录和翻译过程的。 根据这一中心法则,mRNA似乎只有唯一的功
最新研究揭示全球海洋遗传资源序列ZL分布情况
2018年6月6日出版的《科学进展》杂志(Science Advances)发表的最新研究报告显示,总部位于德国的世界最大化学品生产商巴斯夫公司注册了1988年至今的全球所有海洋遗传资源序列(Marine Genetic resources, MGRs)ZL的47%。该研究报告显示,通过对已记
地理资源所遥感参数时间序列重构研究获进展
太阳辐射是各种陆地表层应用模型的重要输入参数,由于云、气溶胶、太阳高度角和地物双向性反射等的影响,造成了遥感反演的太阳辐射数据在时间、空间上的缺失,会严重影响应用模型的精度。“时间序列重构”是利用多种统计和数值分析方法,模拟辐射的季节变化规律,从而插补缺失观测值,优化时间序列数据。 中国科
核酸序列分析
【实验目的】1、 掌握已知或未知序列接受号的核酸序列检索的基本步骤;2、 掌握使用BioEdit软件进行核酸序列的基本分析;3、 熟悉基于核酸序列比对分析的真核基因结构分析(内含子/外显子分析);4、 了解基因的电子表达谱分析。【实验原理】针对核酸序列的分析就是在核酸序列中寻找基因,找出基因的位置和
设计引物用cds序列和cdna序列的区别
cDNA和mRNA的序列是互补的,如果用两个引物,最后的两条DNA序列分别对应于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向从5‘至3’,所以两个引物对应于mRNA和cDNA中相应序列即可。
冲激序列信号与阶跃序列信号各有什么特性
单位脉冲序列只在n=0 处有一个单位值1,其余点上皆为0;单位阶跃序列只有在n>=0时,才取非零值1,当n
关于长非编码核糖核酸研究
10月6日,中国科学院分子细胞科学卓越创新中心(生物化学与细胞生物学研究所)研究员陈玲玲在《自然-方法》(Nature Methods)上,发表了题为Towards higher-resolution and in vivo understanding of lncRNA biogenesis
长链非编码-RNA(lncRNA)研究策略
长链非编码 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是转录本长度在 200-100000 nt 之间的 RNA 分子,它们不编码蛋白,位于细胞核或胞质内,具有保守的二级结构。研究显示,lncRNA 并非以前所认识的那样没有功能,它可与蛋白质、DNA 和 RNA 相互作
中国科大研究成功新型量子比特编码
中国科学技术大学教授、中国科学院院士郭光灿领导的中科院量子信息重点实验室在新型量子比特编码方面取得新进展。该实验室郭国平研究组及合作者首次在砷化镓半导体量子芯片中成功实现量子相干特性好、操控速度快、可控性强的电控新型编码量子比特,研究成果发表在2月25日出版的《物理评论快报》上。 与现代计算机
鲤科鱼类散在重复序列研究取得新进展
4月29日,BMC Evolutionary Biology发表了研究论文 “Multiple source genes of HAmo SINE actively expanded and ongoing retroposition in cyprinid genome
美研究称基因序列预测长寿准确率高达77%
美国研究人员宣布,他们发现基因序列可以预测人能否长寿,预测准确率高达77%。研究论文7月1日由《科学》(Science)杂志发表。长寿老人多有长寿基因 波士顿大学一个研究小组调查1000多名百岁老人,根据收集数据开发出一个基因分析系统。使用这个系统,可以预测人们是否有相当大机会“格外
研究揭示金属原子排布序列影响气体吸附的作用机制
在多相催化过程中,金属位点对原料和中间体的吸脱附是决定催化性能的关键因素。为探究金属原子排布序列影响金属位点吸附性能的微观机制,中国科学院山西煤炭化学研究所研究员何鹏团队与南开大学、中国科学院青海盐湖研究所合作,使用13C固体核磁共振解析了含有一维金属-氧链的混合金属MOF-74材料中Mg2+离
研究揭示金属原子排布序列影响气体吸附的作用机制
在多相催化过程中,金属位点对原料和中间体的吸脱附是决定催化性能的关键因素。为探究金属原子排布序列影响金属位点吸附性能的微观机制,中国科学院山西煤炭化学研究所研究员何鹏团队与南开大学、中国科学院青海盐湖研究所合作,使用13C固体核磁共振解析了含有一维金属-氧链的混合金属MOF-74材料中Mg2+离
信号序列的概念
信号序列是引导蛋白质定向转移的线性序列,通常有16-26个氨基酸残基,对所引导的蛋白质没有特异性要求。
RGD序列的用途
该序列肽能够竞争性抑制包括纤维蛋白在内的各种粘附蛋白与血小板的结合,可达抑制血小板与纤维蛋白结合的目的,有较好的临床研究价值。
DNA-序列分析技术
DNA序列分析技术可用于:(1)分析物种的遗传多样性;(2)鉴定新的物种;(3)用于比较基因组学。实验方法原理本节描述运用Perkin-Elmer 公司的373 和377 型全自动DNA 测序仪进行双链DNA 测序的方法。热循环测序反应使用 Applied Biosystems Inc.的DyeDe