用原位筛选法分离编码序列特异性DNA结合蛋白的cDNA
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1．按照（三）中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝胶，小于100bp的片段应灌制6～8％的凝胶。 l DNA的标记1．用两种限制性内切酶从10μg质粒上将待测DNA片段切下。注意务必使至少一种酶酶切后产生5’凸出末端。酶切体系终体积50μl，在适宜的酶反应缓冲液条件下反应1小时。2．向酶切反应混合液中加入[α－32P]dATP（约10μCi/μl）(若5’凸末端含T残基) ......阅读全文
用原位筛选法分离编码序列特异性DNA结合蛋白的cDNA
放射性标记DNA探针的制备l 聚丙烯酰胺凝胶的制备1．按照（三）中操作流程灌制非变性聚丙烯酰胺凝胶。将10×TBE稀释成0.5×的工作浓度。聚丙烯酰胺的工作浓度取决于待测DNA片段的大小，200bp左右的片段需要4～5％的凝胶，小于100bp的片段应灌制6～8％的凝胶。 l DN
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。实验方法原理将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。实验材料 TY试剂、试剂盒 储存液溶菌酶干粉细菌裂解缓冲液甘油水溶液实验步骤 一、材料与设备1. 2X TY：16 g 蛋白胨，10 g 酵母提
液相法筛选cDNA表达文库中RNA结合蛋白实验
实验方法原理 将 cDNA 文库表达的蛋白固定于硝酸纤维素膜或尼龙膜上，然后用标记的 RNA 对其进行筛选的方法是筛选 RNA 结合蛋白研究中最常用的技术。 实验材料
利用λ噬菌体文库筛选－DNA－结合蛋白实验
可利用合成双链寡核苷酸筛选构建于λ噬菌体的 cDNA 表达文库，以鉴定与特异 DNA 结合蛋白质相对应的克隆（Singhetal.1988,Vinsonetal.1988)。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）下册，作者：〔美〕J. 萨姆布鲁克 D.W. 拉塞尔。试剂、试剂盒ATP结合缓冲液变性溶
利用λ噬菌体文库筛选－DNA－结合蛋白实验
试剂、试剂盒 ATP结合缓冲液变性溶液二硫苏糖醇EDTA乙醇激酶 连接酶缓冲液酚氯仿筛选缓冲液SDS醋酸钠TET4 噬菌体 DNA 连接酶T4 噬菌体多核苷酸激酶合成的寡核苷酸[a-32P]ATP非变性聚丙烯酰胺凝胶仪器、耗材 烤盘结晶皿平头镊子装有防水黑墨水注射器硝酸纤维素滤膜Sephadex G
利用λ噬菌体文库筛选－DNA－结合蛋白实验
试剂、试剂盒 ATP 结合缓冲液 变性溶液 二硫苏糖醇 EDTA 乙醇激酶 连接酶缓冲液 酚 氯
用大片段基因组－DNA－克隆直接筛选－cDNA实验
试剂、试剂盒 扩增缓冲液 DNA 聚合酶 DNaseI 限制性内切核酸酶 ATP 链霉亲和素-磁珠结合缓冲液 T4DNA 连接酶
用大片段基因组－DNA－克隆直接筛选－cDNA实验
试剂、试剂盒 扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素-磁珠结合缓冲液T4DNA 连接酶热稳定 DNA 聚合酶琼脂糖凝胶BACDNA缺口平移缓冲液杂交液平末端 cDNACot1 基因组 DNA胞浆 poly(A)+RNAdNTP 溶液DNA 分子质量标志物寡
用大片段基因组－DNA－克隆直接筛选－cDNA实验
本方案使用克隆在 BAC 载体上的一段 500kb 的人基因组 DNA 连续序列，直接筛选与其互补的的 cDNA。但本方法也可适用于任意大小的基因组靶 DNA。本实验来源于分子克隆实验指南（第三版）上册，作者：黄培堂。试剂、试剂盒扩增缓冲液DNA 聚合酶 DNaseI限制性内切核酸酶ATP链霉亲和素
序列特异性DNA结合蛋白亲和层析纯化实验_DNA亲和层析法
实验材料制备性的DNA亲和层析树脂试剂、试剂盒缓冲液Z或其他柱缓冲液（如缓冲液Ze或TM)配制时含不同的KCl浓度（从缓冲液 Z 0.1 mol L KCl 至缓冲液 Z 1 mol L KCl对缓冲液Z 0. 1 mol L KCl透析的部分纯化的蛋白质组分非特异性的竞争DNA柱再生缓冲液柱储存缓
什么是非特异性的DNA结合蛋白
为DNA蛋白质之一种，是与单链DNA有强的亲和性，与DNA复制、遗传的重组等DNA代谢有关的蛋白质。也称螺旋不稳定蛋白质（helix destabili－zing protein），又称解DNA旋卷蛋白质（DNAuntwisting protein）。此蛋白质与单链DNA协同（cooperative
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
用盐酸胍进行干燥膜的变性/复性循环试剂、试剂盒HEPES结合缓冲液实验步骤1) 按基本方案步骤1〜15进行。2) 将平皿在4℃冷却10 min。用针扎孔标记各膜的位置。小心地揭起膜，室温下在空气中瞭干15 min。3) 将膜浸于HEPES结合缓冲液/6 mol/L盐酸狐中，4℃轻轻摇动温育10 mi
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
用位点识别DNA筛选λgtll表达文库 用盐酸胍进行干燥膜的变性/复性循环 从重组溶源菌中制备粗提物鉴定DNA结合蛋白的活性 实验方法原理
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
从重组溶源菌中制备粗提物鉴定DNA结合蛋白的活性实验材料大肠杆菌 Y1089试剂、试剂盒含有或不含10 mmol L MgCl2的LB培养液1010pfu mLλgtU重组噬菌体液1 mol L IPTG抽提缓冲液5 mg mL溶于抽提缓冲液中的溶菌酶（保存于-20℃)仪器、耗材4 mol L Na
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验
实验方法原理 实验材料 含有多个串联拷贝识别位点的、缺乏识别位点的（或含识别位点突变的）pUC重组质粒DNA试剂、试剂盒 限制性内切核酸酶EcoRI及HhdIII1 mol L Tris • Cl pH 7. 55 mmol L dCTPdGTPdTTPdATP5000 Ci mmol [α32P]
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。实验材料 mRNA寡核苷酸试剂、
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
实验方法原理 细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 m
天然RNA文库筛选与蛋白特异性结合的RNA序列实验
细胞中，蛋白质与 RNA 结合参与多种生理调控和发育过程。在 mRNA 的加帽，多聚腺苷酸化，剪切，核外运，翻译起始及降解等过程中都存在着蛋白质与 RNA 的直接相互作用。在发育的各个阶段，RNA 结合蛋白可以通过与 mRNA 的相互作用调控基因的表达。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞
编码DNA结合蛋白的cDNA克隆的检测、纯化和鉴定实验1
一个DNA位点识别探针被用来从表达文库中检测合适的重组克隆，并对 之进行纯化，证明其中编码了具有一定序列特异性的DNA结合域。这种策略排除了为 分离其基因而对序列特异性DNA结合蛋白进行纯化的过程；只需要一个合适的构建于 λgtll载体中的cDNA文库和一个DNA识别位点的探针。用位点识别DNA筛选
序列特异性DNA结合蛋白的亲和层析纯化实验
DNA亲和介质的制备 DNA偶联于溴化氰活化的琼脂糖上 用制备性凝胶电泳纯化寡核苷酸 DNA亲和层析法 实验方法原理
序列特异性DNA结合蛋白的亲和层析纯化实验
实验方法原理 实验材料 两种带有结合位点的合成寡核苷酸各440μg试剂、试剂盒 TE缓冲液 pH 7.810×T4噬菌体多核苷酸激酶缓冲液20 mmol L ATP (钠盐） pH 7.0150 m Ci mL [γ-32P] ATP (6000 Ci mmol)10 U μL T4噬菌体多
CDNA文库筛选
（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1．用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2．将过夜培养物以3000×g离心5min。3．分别用2ml λ-dil（10 mmol/L tris-Cl,
CDNA文库筛选
CDNA文库筛选（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1．用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2．将过夜培养物以3000×g离心5min。3．分别用2ml λ-dil（10 mmol/L
cDNA的筛选2
（三）免疫筛选制备Sepharose偶联细菌裂解液1.各用一个E.coli温度敏感溶源菌株（BTA 282（λgt11amp3）或BNN 97）单菌落接种于2×7.5ml培养基并于32℃生长过夜。2.过夜培养物用LB培养基稀释100倍，于32℃生长至OD600值为0.5。3.于45℃温育15min诱
cDNA的筛选1
（一）λgt11 cDNA文库铺平板宿主细菌制备1.用一个E.coli宿主菌株单菌落分别接种2×5ml LB培养基（Y1088用于噬菌斑杂交，Y1090用于免疫筛选），于37℃振荡培养过夜。2.将过夜培养物以3000×g离心5min。3.分别用2ml λ-dil（10 mmol/L tris-Cl,
cDNA的筛选3
免疫学染色1.为了洗去顶层琼脂上的残余物和细胞碎片，将硝酸纤维素滤膜一次最多5张转移放在摇床上的盘子（10×10cm）内，用25ml TBS室温洗涤10 min 2次。2.然后滤膜用25ml封闭缓冲液（每张90mm直径的滤膜至少15ml）于室温温育 30min，以封闭滤膜上的非特异性结合位点。不断晃
基因差异表达技术
真核生物中，从个体的生长、发育、衰老、死亡，到组织的得化、调亡以及细胞对各种生物、理化因子的应答，本质上都涉及基因的选择性表达。高等生物大约有30000个不同的基因，但在生物体内任意8细胞中只有10%的基因的以表达，而这些基因的表达按特定的时间和空间顺序有序地进行着，这种表达的方式即为基因的差异表达
常用的分子生物学基本技术1
DNA重组技术（或基因工程）是20世纪生物学的伟大成就，并已渗透到生命科学包括医学 各个领域，为肿瘤的实验研究和临床诊断及治疗提供了崭新的技术和有用的工具。本附录扼要介绍在分子肿瘤学领域中常用的分子生物学基本技术及其在肿瘤研究中的应用，着重介绍它们的原理和应用。至于具体的技术方法和操作步骤可参阅《分
DNA结合蛋白的形成
它是解链酶(unwinding enzyme)类中的一种类型，发现于原核生物的大肠杆菌细胞内，由相同亚基组成的四聚体，分子量8×104，与单链DNA亲和力极大，与双链DNA结合力较差。因此，当DNA发生暂时性熔化时，它与DNA单链区结合而促使反应偏向单链的形成，使DNA在大大低于Tm(解链温度)的温