合肥研究院等在冷等离子体作用蛋白酶研究中取得进展
近期，中国科学院合肥物质科学研究院等离子体物理研究所应用等离子体研究室程诚、沈洁等人与合肥研究院医学物理与技术中心以及中国科学技术大学教授夏维东课题组合作，在等离子体作用蛋白酶研究方面取得进展。 近年来，等离子体医学成为低温等离子体领域的研究热点。微生物失活和诱导细胞凋亡是等离子体医学的一个重要组成部分，而等离子体在生物分子层面上的作用机理尚不明晰。作为细胞的重要组成，蛋白在等离子体作用下的特性表现，对于掌握等离子体在生物医学过程中的作用机制，并从分子层面提供理论解释具有重要意义。 课题组采用乳酸脱氢酶（LDH）液为蛋白模型，通过研究发现等离子体可以使这种蛋白有效失活。结合圆二色谱和动态光散射仪等检测手段，研究不同处理方式给蛋白酶活力带来的变化，证实蛋白酶的失活与其二级结构的修饰有着重要的联系。通过对等离子体作用后液体中引发产生的长寿命活性基团进行检测，比较两种不同处理方式蛋白酶活力的差异，最终推测等离子体引发产生的长寿......阅读全文
几种主要的DNA二级结构对照表
几种主要的DNA二级结构对照表DNA模型螺旋方向直径(nm)碱基数/螺旋螺距(nm)旋转角度/碱基其它结构特征存在情况B-DNA右手2.37103.5436º平滑旋转梯形螺旋结构92%RH，钠盐，溶液和细胞中天然状态中的DNA多以此状态存在A-DNA右手2.55112.5332.7º碱基不与中心轴垂
关于蛋白质二级结构的β转角简介
多肽链中出现的180°回折的结构称为β转角（β-bend）或β回折（β-turn），即U型转折结构。它是由四个连续氨基酸残基构成，第2个氨基酸残基多为脯氨酸，甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺也常出现在β转角结构中，第一个氨基酸残基的羰基与第四个氨基酸残基的亚氨基之间形成氢键以维持其稳定。 常见的转角
简述转移核糖核酸的一级结构和二级结构
一级结构 自1965年R．W．霍利等首次测出酵母丙氨酸tRNA的一级结构即核苷酸排列顺序到1983年已有200多个tRNA（包括不同生物来源、不同器官、细胞器的同功受体tRNA以及校正tRNA）的一级结构被阐明。按照A－U、G－C以及G－U碱基配对原则,除个别例外, 二级结构 tRNA分子
关于蛋白质二级结构β－片层结构特点的内容介绍
①蛋白质二级结构β－片层结构特点—是肽链相当伸展的结构，肽链平面之间折叠成锯齿状，相邻肽键平面间呈110°角。氨基酸残基的R侧链伸出在锯齿的上方或下方。 ②蛋白质二级结构β－片层结构特点—依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的C=O与N-H形成氢键，使构象稳定。 ③蛋白质二级结构β－片层结构
木瓜蛋白酶的基本结构
番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中，木瓜蛋白酶属巯基蛋
枯草杆菌蛋白酶的结构
枯草杆菌蛋白酶的结构已通过X射线晶体学确定。成熟的形式是一种含有275个残基的球状蛋白质，带有几个α螺旋和一个大的β折叠片。N端包含一个I9前肽结构域（InterPro：IPR010259），它有助于枯草杆菌蛋白酶的折叠。域的蛋白水解去除激活酶。它在结构上与丝氨酸蛋白酶的糜蛋白酶族无关，但在活性位点
木瓜蛋白酶的组成结构
番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中，木瓜蛋白酶属巯基蛋
木瓜蛋白酶的组成结构
番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中，木瓜蛋白酶属巯基蛋
木瓜蛋白酶的结构功能
木瓜蛋白酶别名木瓜酶(Papain)纯木瓜蛋白酶是由212个氨基残基组成的单条肽链，相对分子量23406。木瓜蛋白酶制品可含有木瓜蛋白水解酶、木瓜凝乳酶和溶菌酶。是一种巯基蛋白酶，其专一性差！能分解比胰脏蛋白酶更多的蛋白质。木瓜凝乳酶相对分子量36000，约占可溶性蛋白酶的45%，溶菌酶相对分子量2
脱氧核糖核酸的分子结构二级结构的介绍
是指两条脱氧多核苷酸链反向平行盘绕所形成的双螺旋结构。DNA的二级结构分为两大类：一类是右手螺旋，如A-DNA、B-DNA、C-DNA、D-DNA等；另一类是左手双螺旋，如Z-DNA。詹姆斯·沃森与佛朗西斯·克里克所发现的双螺旋，是称为B型的水结合型DNA，在细胞中最为常见。也有的DNA为单链，
蛋白质二级结构预测－最邻近方法－NearestNeighboringmethods
早期，由于数据的缺乏，预测方法多基于单条序列。随着序列和结构数据的增加，人们的研究转向同源序列分析，充分利用隐藏在同源序列中的结构信息，使得结构预测的准确率得到了较大的提高。同源分析的基础是序列比较，通过序列比较发现相似的序列，根据相似序列具有相似结构的原理，将相似序列（或者序列片段）所对应的二级结
关于蛋白质二级结构肽键平面的介绍
Pauling等人对一些简单的肽及氨基酸的酰胺等进行了X线衍射分析，从一个肽键的周围来看，得知： （1）肽键平面—肽键中的C-N键长0.132nm，比相邻的N-C单键（0.147nm）短，而较一般C=N双键（0.128nm）长，可见，肽键中-C-N-键的性质介于单、双键之间，具有部分双键的性质
蛋白质二级结构预测(protein－secondary－structure－prediction)
蛋白质二级结构的预测开始于20世纪60年代中期。二级结构预测的方法大体分为三代，第一代是基于单个氨基酸残基统计分析，从有限的数据集中提取各种残基形成特定二级结构的倾向，以此作为二级结构预测的依据。第二代预测方法是基于氨基酸片段的统计分析，使用大量的数据作为统计基础，统计的对象不再是单个氨基酸残基，而
关于蛋白质的二级结构（β折叠）的简介
是蛋白质的二级结构，肽键平面折叠成锯齿状，相邻肽链主链的N-H和C=O之间形成有规则的氢键，在β-折叠中，所有的肽键都参与链间氢键的形成，氢键与β-折叠的长轴呈垂直关系。 60年代以来,球状蛋白质的晶体结构被陆续解出,发现许多蛋白质中都有β-折叠层,平行的和反平行的都有。有时候许多段肽链排列成
关于蛋白质二级结构的Ω环的介绍
Ω环（Ω loop）是近二三十年才发现的一类二级结构，它们虽然不像α螺旋和β折叠片那样规正，但仍有规则可循，属干部分规正的二级结构。从形式上Ω环可看成是β转角的延伸。此环有两个特征。一是环的长度不超过16个氨基酸残基，一般为6~8个残基，尤以8残基的Ω环为最多；二是它改变了蛋白质肽链的走向，使得
关于蛋白质二级结构的α螺旋的介绍
蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸a-碳原子的旋转，使多肽主链各原子沿中心轴向右盘曲形成稳定的α螺旋（a-helix）构象。 α螺旋具有下列特征： （1）多肽链以肽单元为基本单位，以Cα为旋转点形成右手螺旋，氨基酸残基的侧链基团伸向螺旋的外侧。 （2）每3.6个氨基酸旋转一周，螺距为0.54n
关于蛋白质二级结构的β折叠的介绍
β折叠是指多肽链以肽单元为单位，以Cα为旋转点形成伸展的锯齿状折叠构象，又称3片层（3-strand）结构，具有下列特征。 （1）肽链折叠成伸展的锯齿状，肽单元间的夹角为110°，氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。 （2）两条以上肽链（或同一条多肽链的不同部分）平行排列，相邻肽链之间的肽键
蛋白质二级结构(protein－secondary－structure)预测软件
蛋白质二级结构的预测通常被认为是蛋白结构预测的第一步，二级结构是指α螺旋和β折叠等规则的蛋白质局部结构元件。不同的氨基酸残基对于形成不同的二级结构元件具有不同的倾向性。按蛋白质中二级结构的成分可以把球形蛋白分为全α蛋白、全β蛋白、α＋β蛋白和α/β蛋白等四个折叠类型。预测蛋白质二级结构的算法大多以已
关于米曲霉蛋白酶的结构简介
酶的催化性质与酶分子的结构密切相关。特别是酶的三级结构，对酶对催化机制有重大影响，同一种酶,由于高级机构的不同，参与的反应可能就不同。郭继平等采用结构生物学和生物信息学手段对米曲霉碱性蛋白酶的三维结构进行了同源模建。通过序列相似性搜索蛋白序列数据库和布鲁克海文PDB蛋白结构数据库，找到了编号pd
蛋白酶体的结构和功能
蛋白酶体广泛分布于细胞质和细胞核中，26s蛋白酶体是一种分子量为2000的多亚基复合物，约有50种蛋白质亚基组成。具有多种蛋白水解酶活性，并且具有泛素依赖性。
寨卡病毒蛋白酶结构机理揭秘
伊蚊叮咬是寨卡病毒最主要的传播途径 德国吕贝克大学生物化学研究所所长罗尔夫·希尔根菲尔德教授领导的研究小组，日前揭秘了寨卡病毒蛋白酶结构机理，这项成果被刊登在最新一期的《科学》杂志上，为抗病毒剂的研发奠定了基础。 寨卡病毒是种蚊虫传播的病毒，可通过孕妇传染给胎儿，目前全球已有60个国家超
胃蛋白酶原的化学结构是什么？
胃蛋白酶原是一种由胃壁主细胞分泌的酶前体，它的化学结构主要由免疫原性不同的两个亚群组成，分别是I-5组成免疫原性相同的亚群，主要在胃底腺的主细胞和黏液颈细胞分泌。
蛋白酶体的结构和分布
蛋白酶体广泛分布于细胞质和细胞核中，26s蛋白酶体是一种分子量为2000的多亚基复合物，约有50种蛋白质亚基组成。具有多种蛋白水解酶活性，并且具有泛素依赖性。
中性蛋白酶的结构功能介绍
中性蛋白酶所起的作用就是把蛋白质大分子分解成能被动物机体吸收的小分子。蛋白质由氨基酸组成，是自然界中发现的最复杂的有机化合物之一。由盐酸和蛋白酶分解成易被高等动物的肠道和微生物有机体的细胞膜吸收的氨基酸。 包括人类在内的每种动物，必须要有足够的蛋白质来维持自身生长，来生成每个细胞所必需的氨基酸，一些
木瓜蛋白酶的组成结构介绍
番木瓜未成熟果实中含有木瓜蛋白酶(Papain)、木瓜凝乳蛋白酶A(Chymopapain A )、木瓜凝乳蛋白酶B(Chym opapain B )、木瓜肽酶B (PapayaPeptidase B ) 等多种蛋白水解酶。且已知四种半胱氨酸蛋白酶的一级结构具有高度的同源性。其中，木瓜蛋白酶属巯
胰蛋白酶的化学结构是什么？
胰蛋白酶是一种消化酶，由胰腺分泌。它的化学结构是一种由32个氨基酸组成的多肽链，分子量为25，700道尔顿。胰蛋白酶的氨基酸序列为：Asp-Ala-Val-Asp-Val-Thr-Glu-Lys-Asp-Leu-Ser-Glu-Ile-Glu-Glu-Glu-Ala-Val-Ala-Lys-Ar
远紫外CD－预测蛋白质二级结构的方法
利用圆二色光谱仪获得蛋白质CD 主要的工作包括:溶剂体系的选择,蛋白质溶液样品的制备[14 ] ,圆二色光谱仪实验参数的选择与调整等。对此,Kelly 等[15 ] 已经作了较为全面的综述。正确的蛋白质CD 图谱是预测蛋白质结构的基础与关键。在正确获得蛋白质CD 后,主要的工作是如何从CD 图谱
蛋白质二级结构预测－综合各种分析方法预测
综合各种分析方法预测在实际进行蛋白质二级结构预测时，往往会综合应用各种分析方法和相关数据。综合方法不仅包括各种预测方法的综合，而且也包括结构实验结果、序列对比结果、蛋白质结构分类预测结果等信息的综合。实际应用中最常见的综合方法是同时使用多个软件进行预测，通过分析各个软件的特点以及各个软件预测结果，最
蛋白质超二级结构的基本信息介绍
超二级结构（supersecondary structure）是指在多肽链内顺序上相互邻近的二级结构常常在空间折叠中靠近，彼此相互作用，形成规则的二级结构聚集体。发现的超二级结构有三种基本形式：α螺旋组合（αα）；β折叠组合（βββ）和α螺旋β折叠组合（βαβ），其中以βαβ组合最为常见。它们可
蛋白质二级结构预测－人工神经网络方法
人工神经网络是一种复杂的信息处理模型。随着神经网络研究的兴起，科学家们也将神经网络用于生物信息学，其中包括二级结构的预测、蛋白质结构的分类、折叠方式的预测以及基因序列的分析等等。将神经网络用于二级结构预测的最早是由Qian和Sejnowskit提出的，他们受到神经网络在文字语言处理方面应用的启发，将