关于蛋白质二级结构的α螺旋的介绍

蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸a-碳原子的旋转,使多肽主链各原子沿中心轴向右盘曲形成稳定的α螺旋(a-helix)构象。 α螺旋具有下列特征: (1)多肽链以肽单元为基本单位,以Cα为旋转点形成右手螺旋,氨基酸残基的侧链基团伸向螺旋的外侧。 (2)每3.6个氨基酸旋转一周,螺距为0.54nm,每个氨基酸残基的高度为0.15nm,肽键平面与中心轴平行。 (3)氢键是α螺旋稳定的主要次级键。相邻螺旋之间形成链内氢键,即每个肽单位N上的氢原子与第四个肽单位羰基上的氧原子生成氢键,氢键与中心轴平行。若氢键破坏,α螺旋构象即被破坏。 α螺旋的形成和稳定性受肽链中氨基酸残基侧链基团的形状、大小及电荷等影响。如多肽中连续存在酸性或碱性氨基酸,由于带同性电荷而相斥,阻止链内氢键形成趋势而不利于α螺旋的生成;R侧链较大的氨基酸残基(如异亮氨酸、苯丙氨酸、色氨酸等)集中的区域,因空间位阻的影响,也不利于α螺旋的稳定;脯氨酸或羟脯氨酸残......阅读全文

关于蛋白质二级结构的α螺旋的介绍

  蛋白质分子中多个肽平面通过氨基酸a-碳原子的旋转,使多肽主链各原子沿中心轴向右盘曲形成稳定的α螺旋(a-helix)构象。 α螺旋具有下列特征:  (1)多肽链以肽单元为基本单位,以Cα为旋转点形成右手螺旋,氨基酸残基的侧链基团伸向螺旋的外侧。  (2)每3.6个氨基酸旋转一周,螺距为0.54n

关于蛋白质二级结构的Ω环的介绍

  Ω环(Ω loop)是近二三十年才发现的一类二级结构,它们虽然不像α螺旋和β折叠片那样规正,但仍有规则可循,属干部分规正的二级结构。从形式上Ω环可看成是β转角的延伸。此环有两个特征。一是环的长度不超过16个氨基酸残基,一般为6~8个残基,尤以8残基的Ω环为最多;二是它改变了蛋白质肽链的走向,使得

关于蛋白质二级结构的β折叠的介绍

  β折叠是指多肽链以肽单元为单位,以Cα为旋转点形成伸展的锯齿状折叠构象,又称3片层(3-strand)结构,具有下列特征。  (1)肽链折叠成伸展的锯齿状,肽单元间的夹角为110°,氨基酸残基的R侧链分布在片层的上下。  (2)两条以上肽链(或同一条多肽链的不同部分)平行排列,相邻肽链之间的肽键

关于β螺旋的结构介绍

  第一个被发现的β螺旋结构是在酶的果胶酸裂解酶中,其中包含一七转螺旋,达到34Å(3.4 nm)长。P22噬菌体的tailspike蛋白,拥有一个13圈的螺旋,由其构成的同源三聚体达到了200Å(20 nm)的长度。它的内部密集,无中心孔,包含了疏水残基和通过盐桥中和的带电残基。  果胶裂解酶和P

关于蛋白质二级结构的定义

  蛋白质分子的二级结构(secondarystructure)通常是指蛋白质多肽链沿主链骨架方向的空间走向、规则性循环式排列,或某一段肽链的局部空间结构,即蛋白质的二级结构为肽链主链或一段肽链主链骨架原子的相对空间盘绕、折叠位置,它并不涉及氨基酸残基侧链的构象。

蛋白质二级结构的基本介绍

  蛋白质二级结构(secondary structure of protein)是指多肽主链骨架原子沿一定的轴盘旋或折叠而形成的特定的构象,即肽链主链骨架原子的空间位置排布,不涉及氨基酸残基侧链。蛋白质二级结构的主要形式包括α-螺旋、β-折叠、β-转角、Ω环和无规卷曲。 [1] 由于蛋白质的分子量

关于蛋白质二级结构的β转角简介

  多肽链中出现的180°回折的结构称为β转角(β-bend)或β回折(β-turn),即U型转折结构。它是由四个连续氨基酸残基构成,第2个氨基酸残基多为脯氨酸,甘氨酸、天冬氨酸、天冬酰胺也常出现在β转角结构中,第一个氨基酸残基的羰基与第四个氨基酸残基的亚氨基之间形成氢键以维持其稳定。  常见的转角

关于超螺旋DNA的结构介绍

  由于具有螺旋结构的双链各自闭合,结果使整个DNA分子进一步旋曲而形成三级结构。自然界中主要是负超螺旋.另外如果一条或二条链的不同部位上产生一个断口,就会成为无旋曲的开环DNA分子。从细胞中提取出来的质粒或病毒DNA都含有闭环和开环这二种分子。可根据两者与色素结合能力的不同,而将两者分离开来。

蛋白质的二级结构与超二级结构结构的组装块

一、蛋白质的二级结构  蛋白质在细胞中必须通过详细的三维结构识别成千上万种的不同分子,这就需要蛋白质分子具有结构多样性。蛋白质结构研究得出的第一个重要的基本规律是水溶性球状蛋白质分子折叠的重要驱动力,它是将疏水侧链置于分子内部,产生一个"疏水内核"和一个亲水表面。为了把侧链放到分子内部去,相应的高度

关于转运RNA的二级结构的介绍

  tRNA分子均可排布成三叶草模型的二级结构。它由3个环,即D环〔因该处二氢尿苷酸(D)含量高〕、反密码环(该环中部为反密码子)和TΨC环〔因绝大多数tRNA在该处含胸苷酸(T)、假尿苷酸(Ψ)、胞苷酸(C)顺序〕,四个茎,即D茎(与D环联接的茎)、反密码茎(与反密码环联接)、TΨC茎(与 TΨC

蛋白质二级结构的定义

成氢键,这是稳定α-螺旋的主要键。 (4)肽链中氨基酸侧链R,分布在螺旋外侧,其形状、大小及电荷影响α-螺旋的形成。酸性或碱性氨基酸集中的区域,由于同电荷相斥,不利于α-螺旋形成;较大的R(如苯丙氨酸、色氨酸、异亮氨酸)集中的区域,也妨碍α-螺旋形成;脯氨酸因其α-碳原子位于五元环上,不易扭转,加之

蛋白质的二级结构的特点

二级结构以往是由生物巨分子在原子量级结构下的氢键来定义的。在蛋白质,二级结构则是以主链中氨基之间的氢键模式来定义,亦即DSSP所定义的氢键,并不包括主链与旁链间或是旁链之间的氢键。而核酸的二级结构是以碱基之间的氢键来定义。在很多RNA分子,二级结构对RNA正常功能非常重要,有时甚至于较序列重要。这可

概述蛋白质二级结构的形式

  蛋白质二级结构的基本类型有α螺旋、β折叠、β转角、Ω环和无规卷曲。如血红蛋白和肌红蛋白中含有大量的α-螺旋,铁氧蛋白(ferredoxin)则不含任何的α螺旋。蛋白质中各种类型的二级结构并不是均匀地分布在蛋白质中,不同蛋白质中β折叠和β-转角的数量也有很大的变化。

蛋白质二级结构的红外检测

  蛋白质是与生命及各种形式的生命活动紧密联系在一起的物质,机体中的每一个细胞和所有重要组成部分都有蛋白质的参与。蛋白质是由不同氨基酸以肽键相连所组成的具有一定空间结构的生物大分子物质,其结构可分为以下4个结构层次:   图1 蛋白质的四个结构层次   我们所关注的蛋白质二级结构指的是蛋白质

DNA的二级结构介绍

DNA的二级结构是指两条多核苷酸链反向平行盘绕所生成的双螺旋结构。两条多核苷酸链以相同的旋转绕同一个公共轴形成右手双螺旋,螺旋的直径2.0nm;两条多核苷酸链是反向平行的,一条5’-3方向,另一条3’-5’方向;两条多核苷酸链的糖-磷酸骨架位于双螺旋外侧,碱基平面位于链的内侧;相邻碱基对之间的轴向距

简述蛋白质二级结构的无规卷曲

  多肽链中肽平面的一些无规则排列的无规律构象,称为无规卷曲(randomcoil)。无规卷曲通过主链间的氢键或主链与侧链间的氢键稳定其构象,是蛋白质结构中的基本构件。卷曲的柔性构象可使肽链改变走向,利于连接结构相对刚性的α螺旋和β折叠,在蛋白质肽链的卷曲、折叠过程中起重要作用。

关于κBGT蛋白质结构的介绍

  κ-BGT是1983年从台湾产银环蛇毒素中首次分离、分子量6500,等电点为9.1的一种神经毒素,由于k-BGT能选择性地阻断α3β2亚型,被认为是少数能作为神经元烟碱乙酰胆碱受体(nAChRs)分型的特异性工具之一。κ-BGT的蛋白质一级结构由A、B两条链构成,每条链由66个氨基酸残基组成,含

关于丝裂原活化蛋白激酶的二级和超二级结构介绍

  与其他蛋白激酶相似,ERK2、p38和JNK1都具有一个较小的氨基酸结构域和一个较大的羧基端结构域,两者之间由一个交叉区连接在一起。氨基酸结构域主要由β折叠组成,而羧基端结构域则主要为α螺旋,两个结构与交界处形成一个裂隙,为ATP结合位点。

关于蛋白质的结构的相关介绍

  结构决定功能。大多数的蛋白质都自然折叠为一个特定的三维结构,这一特定结构被称为天然状态。虽然多数蛋白可以通过本身氨基酸序列的性质进行自我折叠,但还是有许多蛋白质需要分子伴侣的帮助来进行正确的折叠。在高温或极端pH等条件下,蛋白质会失去其天然结构和活性,这一现象就称为变性。生物化学家常常用以下四个

蛋白质二级结构拟合算法

早期的蛋白质或多肽的二级结构拟合计算方法中,主要采用多聚氨基酸为参考多肽。Greenfield 等采用多聚L2赖氨酸作参考多肽,建立α2螺旋、β2折叠及无规卷曲等二级结构参考CD 光谱曲线,采用单一波长法(208nm) 计算出α2螺旋含量后,然后假设不同的β2折叠含量( Xβ) 值,并假设CD 值是

关于α螺旋的详细介绍

  α螺旋是一种最常见的二级结构,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要内容是:  ①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展;  ②螺旋形成是自发的,肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有

螺旋转角螺旋结构域的结构功能

中文名称螺旋-转角-螺旋结构域英文名称helix-turnhelix motif定  义由两个α螺旋间隔以一定角度的转角构成的结构域。其中一个α螺旋可插入DNA大沟中与专一DNA序列结合。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞化学(二级学科)

螺旋袢螺旋结构域的结构功能

中文名称螺旋-袢-螺旋结构域英文名称helix-loophelix motif定  义存在于转录因子的DNA结合结构域中的一种蛋白质结构域。由两个α螺旋和中间的一个袢组成,识别并结合特异的DNA序列。

关于γBGT蛋白质结构的基本介绍

  γ-BGT是从银环蛇毒腺中分离出的一种新的突触后神经毒素。Aird SD等(1999)利用质谱测量法和Edman降解法测定了其一级结构。γ-BGT的一级结构由68个氨基酸残基构成,分子量为7524.7。其氨基酸序列为:MQCKTCSFYT CPNSETCPDGKNICVKR-SWT AVRGDG

远紫外CD-预测蛋白质二级结构的方法

  利用圆二色光谱仪获得蛋白质CD 主要的工作包括:溶剂体系的选择,蛋白质溶液样品的制备[14 ] ,圆二色光谱仪实验参数的选择与调整等。对此,Kelly 等[15 ] 已经作了较为全面的综述。正确的蛋白质CD 图谱是预测蛋白质结构的基础与关键。在正确获得蛋白质CD 后,主要的工作是如何从CD 图谱

远紫外CD分析蛋白质二级结构

一、 远紫外CD分析蛋白质二级结构  远紫外CD分析蛋白质二级结构的方法,主要是运用计算机采用一定的拟合算法对CD数据进行加工处理,进而解析蛋白质二级结构。远紫外区CD光谱主要反映肽键的圆二色性。在蛋白质或多肽的规则二级结构中,肽键是高度有规律排列的,其排列的方向性决定了肽键能级跃迁的分裂情况。单一

螺旋结构的特点

在很多种聚合物的晶区中,由于相邻分子链的侧基之间的相互作用和最紧密的堆砌要求,其分子链采取反式和左右式不同交替方式的构象排列,形成螺旋结构。

α螺旋的结构特点

α-螺旋(α-helix)是蛋白质二级结构的主要形式之一。指多肽链主链围绕中心轴呈有规律的螺旋式上升,每3.6 个氨基酸残基螺旋上升一圈,向上平移0.54nm,故螺距为0.54nm,两个氨基酸残基之间的距离为0.15nm。螺旋的方向为右手螺旋。氨基酸侧链R基团伸向螺旋外侧,每个肽键的肽键的羰基氧和第

α螺旋的基本结构

α螺旋是一种最常见的二级结构,最先由Linus Pauling和Robert Corey于1951年提出,其主要内容是: ①肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸展;②螺旋形成是自发的,肽链骨架上由n位氨基酸残基上的-C=O与n+4位残基上的-NH之间形成的氢键起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有13个原子

CD测蛋白质二级结构的基本原理

1. CD测蛋白质二级结构的基本原理        蛋白质是由氨基酸通过肽链组成的具有特定结构的生物大分子。蛋白质中氨基酸残基的排列次序是蛋白质的一级结构,而肽链中局部肽段骨架形成的构象称为二级结构,二级结构是靠台联股价中的烫机上的氧原子和亚胺基上的氢之间的氢键来维系的,根据肽链的旋转方向与氢键之间