厦门大学PNAS表观遗传学新文章
来自厦门大学、加州大学圣地亚哥分校的研究人员证实,热休克蛋白HSP70精氨酸甲基化调控了维甲酸介导的RARβ2基因激活。这项研究发布在6月16日的《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 厦门大学药学院的刘文(Wen Liu)教授和加州大学圣地亚哥分校的Michael G. Rosenfeld教授是这篇论文的共同通讯作者。刘文教授主要从事表观遗传调控子(组蛋白修饰酶、去修饰酶、识别修饰的识别子、非编码RNA)在基因转录调控中的作用分子机制研究,及其在癌症等重大疾病发生发展中的应用研究;同时也致力于探寻靶向表观遗传调控子的活性小分子。论文发表在Nature,Cell, Cancer Cell,Molecular Cell, PNAS等科学期刊。 热休克蛋白(HSPs)又称应激蛋白(SP),是机体细胞在一些应激原如环境高温、缺氧、重金属中毒、氧化应激、感染、饥饿、创伤、代谢毒物等条件诱导下,激活HSP基因,高效表达的一组进化上......阅读全文
什么是甲基化?
甲基化,是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程,可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。
RNA甲基化研究
近期华人科学家辛辛那提大学陈建军教授研究了METTL14和m6A RNA甲基化修饰在正常和恶性造血过程中的重要作用,表明SPI1-METTL14-MYB/MYC信号轴在髓系分化以及白血病发生过程中的作用。该研究于2018年1月发表在干细胞顶级期刊《Cell Steam Cell》(影响因子:
RNA甲基化测序
1、NSUN2影响m5C在HEK293细胞中整体分布情况NSUN2被报道是RNA甲基转移酶,能使tRNAs和mRNA发生m5C甲基化修饰。为了探究NSUN2对HEK293细胞mRNA m5C甲基化修饰的影响。作者利用CRISP/Cas9技术敲减NSUN2(NSUN2-/-HEK293细胞)后进行
DNA甲基化预测
实验概要本实验分别对DNA片段、基因、启动子和外显子进行了甲基化的计算预测,并且随机选择了1000甲基化的和1000未甲基化的个体进行预测。用于甲基化预测的特征有:GC相关特征、四联体频率、转录因子结合位点(TFBSs)。所有预测方法均采用Weka提供的软件进行。实验步骤1. DNA甲基化数据本研究
DNA甲基化分析
The influence of methylation on the promoter activity and gene expression and the involvement of DNA methylation in carcinogenesis caused an extensive
什么是甲基化
甲基化是指从活性甲基化合物(如S-腺苷基甲硫氨酸)上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸(RNA)加工
DNA甲基化:在衰老细胞中的作用
近日,科学家们在45万个基因组位点中发现了8%的与衰老有关的DNA甲基化的改变。这项研究成果题为“Age-related variations in the methylome associated with gene expression in human monocytes and T c
组蛋白修饰与DNA甲基化之间的关系
在引起基因沉默的过程中,沉默信号(DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重新装配)是如何进行的?谁先谁后?这是一个“鸡和蛋”的问题,目前仍处于研究阶段,还没有定论。研究发现DNA甲基化和组蛋白乙酰化是一个相互促进、加强的过程,如许多HDAC可以和DNMTl、3a、3b相互作用;而甲基化CpG结合蛋白—
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析
技术优势:● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接● 可视化数据展示,提供paper级结果图表● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍: 人类基因组中仅有约2%的DNA序列最
甲基化特异性-PCR-确定-DNA-甲基化的模式
用 PCR 来分析 DNA 甲基化的方法可以运用于:(1)对基因组中任何位置的 CpG 甲基化的分析;(2)检测肿瘤患者的基因改变以及介人被印的基因的固定遗传障碍的研究。实验方法原理DNA甲基化(DNA methylation)是最早发现的修饰途径之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、D
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式,通常发生在CpG位点中的胞嘧啶,由DNA甲基转移酶所催化,将胞嘧啶(C)转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎发育
CHAPIR通过m6A甲基化调控心脏肥大的分子机制
慢性心肌肥大及其相关的心肌重塑是发展心脏功能障碍的主要因素,从而导致严重的心力衰竭和死亡。RNA m6A甲基化/去甲基化机制与心脏的生理和病理过程密切相关,然而m6A修饰参与心脏肥大的分子机制尚不清楚。非编码RNA(ncRNA),尤其是ncRNA的心脏特异性表达,在生理和病理性心脏肥大中均具
DNA甲基化参与调控大豆等表观遗传研究新进展
大豆胞囊线虫(Soybean cyst nematode, SCN; Heteroderaglycines)病是引起大豆减产的病害之一,研究大豆-线虫互作机制对提出新的病害防控策略、培育抗胞囊线虫病的大豆新品种具有重要意义。DNA甲基化(DNA methlation)是一种表观遗传标记,在植物生
上海生科院发现植物去甲基化调控的新机制
2月12日,国际权威学术期刊《分子细胞》(Molecular Cell)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院上海植物逆境生物学研究中心朱健康课题组的研究论文The Methyl-CpG-Binding Protein MBD7 Facilitates Active DNA Demethylat
裴端卿组综述DNA去甲基化的级联调控模型
中国科学院广州生物医药与健康研究院裴端卿课题组综合近期体细胞重编程过程中TET相关DNA去甲基化的研究进展【1】和之前的相关研究,对细胞命运变化过程中的DNA甲基化模式重排过程和级联调控模型进行了调研,提出偶联TET进行DNA去甲基化可能是转录因子打开染色质的一种基本模式,该综述以The Bat
揭示DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用
近日,《EMBO报告》在线发表了中国科学院昆明动物研究所李家立课题组的研究论文,该文揭示了DNA去甲基化与DNA损伤修复之间的调控作用。 准确而有效的DNA损伤与修复应答对机体各种类型的细胞维持基因组完整性是十分重要的,DNA损伤修复功能的障碍会引起严重疾病,包括多种癌症、免疫缺陷、代谢紊乱、
DNA甲基化调控竹笋快速生长研究方面取得新进展
竹类植物作为一种特殊的禾草,其笋期的快速生长这一特殊性状备受关注,但以往的研究主要集中在细胞微观结构、转录组、代谢组、蛋白质组、小RNA以及新基因等方面。DNA甲基化作为一种重要的表观遗传修饰,主要参与转座子沉默和基因的表达调控,在植物生长发育中发挥着重要的调控作用。然而,目前尚不清楚DNA甲基化是
动物所发现DNA甲基化调控胚胎左右不对称发育
DNA甲基化是常见的表观遗传修饰形式,通常发生在CpG位点中的胞嘧啶,由DNA甲基转移酶所催化,将胞嘧啶(C)转变为5-甲基胞嘧啶(5mC)。DNA甲基化在基因转录调控、染色体结构稳定性、基因印记、X染色体失活等方面发挥作用。脊椎动物早期胚胎全基因组DNA甲基化图谱研究提示DNA甲基化可能在胚胎
研究发现DNA甲基化修饰精准调控植物生物钟周期
生物钟通过协调细胞内代谢和生理活动的节律性以适应由地球自转而产生的昼夜光温周期性变化,为植物生长发育提供适应性优势。在多种真核生物中均已发现组蛋白修饰可参与调控生物钟周期,但DNA甲基化作为表观修饰的另一重要类型,是否参与以及如何调控真核生物的生物钟尚不清楚。 中国科学院植物研究所研究员王雷研
DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制获新进展
近日,华南农业大学园艺学院研究员李建国团队在岭南现代农业科学与技术广东省实验室和国家现代荔枝龙眼产业技术体系项目资助下,研究揭示了DNA甲基化调控荔枝种子发育的机制。相关成果发表于《实验植物学杂志》(Journal of Experimental Botany)。种子大小是决定荔枝商品价值的核心因素
肠道微生物通过甲基化调控肌肉纤维类型转化
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所(岭南现代农业科学与技术广东省实验室深圳分中心)和佛山鲲鹏现代农业研究院研究员唐中林团队在国际期刊《肠道微生物》(Gut Microbes)上发表论文。该研究揭示了肠道微生物通过调控关键代谢物甜菜碱(Betaine)的水平,影响骨骼肌中N6—甲基腺苷(m6
病毒通过泛素化调控寄主de-novo甲基化研究取得进展
双生病毒(Geminivirus)是一组具有双生颗粒形态的单链环状植物DNA病毒。由于双生病毒主要依赖于植物宿主系统来完成生活史,能够通过自身编码的少数几个蛋白来调控植物的若干重要生命过程,因此,对双生病毒展开深入研究,有助于揭示植物自身若干重要生命过程的分子机制。另外,双生病毒侵染广泛的农作物
lncRNA启动子DNA甲基化/羟甲基化测序分析综述
技术优势: ● 专注非编码RNA领域,完善的lncRNA启动子分析流程 ● 可与lncRNA表达谱芯片联合应用,实现平台间无缝对接 ● 可视化数据展示,提供paper级结果图表 ● 优化的IP实验方法,可信赖的检测平台及数据结果 介绍: 人类基因组中仅有
两篇PNAS:蛋白纳米孔检测DNA甲基化
两个独立的研究团队利用通道蛋白实现纳米孔测序,成功鉴别了5-甲基胞嘧啶和5-羟甲基胞嘧啶。这两篇文章发表在同一期的美国国家科学院院刊PNAS杂志上。 基因组所蕴含的编码信息,包括DNA序列和核苷酸修饰两个部分。其中,动态的DNA甲基化模式,是基因表达的重要调控者,与细胞分化、胚胎发育和癌症
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关
METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用
今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。 棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关
甲基化的检测方法
(1) 甲基化特异性的PCR(Methylation-specific PCR,MSP)用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后设计针对甲基化和非甲基化序列的引物进行PCR。通过电泳检测MSP扩增产物,如果用针对处理后甲基化DNA链的引物能得到
甲基化研究新套路
组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。 为更深入探索表观调控与临床现象间的具体机制,上海华盈生物合作伙伴——华中科技大学同济医院马丁院士课
甲基化干扰实验用途
应用这种技术可以检测靶DNA中G残基的优先甲基化,对尔后的蛋白质结合作用究竟会有什么效应,从而更加详细的揭示出DNA与蛋白质相互作用的模式。
关于甲基化的释义
甲基化是指从活性甲基化合物上将甲基催化转移到其他化合物的过程。可形成各种甲基化合物,或是对某些蛋白质或核酸等进行化学修饰形成甲基化产物。在生物系统内,甲基化是经酶催化的,这种甲基化涉及重金属修饰、基因表达的调控、蛋白质功能的调节以及核糖核酸加工。