生物物理所抗生素耐药性研究获进展
8月4日,中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临的最主要的公共健康威胁之一。抗药性相关的机制研究及对策已成为世界卫生组织和各国政府共同关注的问题。细菌有多种形式的抗药机制,最普遍的一种机制是利用细胞膜上的多个药物外排泵,将抗生素外排出细胞。大肠杆菌MFS家族的多药物外排蛋白MdfA是抗药机制研究中的范例,对该蛋白结构的解析有助于深入认识细菌的药物外排机制。张凯课题组成功解析了MdfA-氯霉素以及MdfA与多个底物类似物复合物的高分辨率晶体结构(最高2.0 Å)。在MSF家族中,药物底物与转运蛋白复合物的晶体结构的报道仍属首次。 MdfA形成12次跨膜螺旋的拓扑结构,含有由3次跨膜......阅读全文
我国揭示蛋白酶体在泛素链诱导下的变构及底物识别机制
近日,国际学术期刊Molecular Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心(上海)丛尧研究组的最新研究成果“Structural snapshots of 26S proteasome reveal tetraubiquitin-induced confor
白介素受体复合物的晶体结构
白细胞介素(interleukin)是淋巴细胞、单核细胞以及其它非单核细胞等产生的细胞因子(cytokine),它们在细胞间相互作用、免疫调节、造血过程以及炎症反应中起到重要作用。而其中的白细胞介素4(IL-4)和白细胞介素13(IL-13)对于T细胞介导的体液免疫应答非常关键,与过敏和哮喘等疾病相
基于TbSADH晶体结构进行酶设计改造
筛选是酶定向进化的瓶颈。酶理性设计及计算机虚拟筛选技术可有效解决这一瓶颈,是定向进化领域的重要发展方向。近年来基于构象动力学指导的酶理性设计取得一系列成功,该策略的关键是精准定位残基位点,通过引入合适突变,增强催化口袋的构象变化,进而改造底物谱、对映体选择性及热稳定性等催化特性。 中科院天津工
简述晶体结构的固定熔点的介绍
实验表明:从气态、液态或非晶态过渡到晶体时都要放热,反之,从晶态转变为非晶态、液态或气态时都有要吸热。表明:在相同的热力学条件下,与同种化学成分的气体、液体或非晶体相比,晶体的内能最小。即在相同的热力学条件下,以具有相同化学成分的晶体与非晶体相比,晶体是稳定的,非晶体是不稳定的,后者有自发转变为
Cell:Ⅱ型大麻素受体的晶体结构
中国科研小组与俄罗斯和美国科学家一起获得了Ⅱ型大麻素受体的晶体结构。这些知识将有助于开发抗炎症、神经退行性疾病和其他疾病的药物。发表在《Cell》杂志上的文章作者对Ⅰ型和Ⅱ型大麻素受体进行了比较,并得出结论说,这两种受体是人体大麻素系统的“阴和阳”。 盲目治疗 大麻素受体是人体信号系统的关键
简述葡萄糖激酶的晶体结构
GK晶体分为大区域和小区域, 大小区域之间通过连接区域连接,两区域间存在一个能与底物结合的可变角。在人体内GK存在三种构象,当葡萄糖浓度较低时,GK处于非活性超开放构象;当体内葡萄糖浓度升高时,GK与葡萄糖结合,处于活性开放/闭合构象。 作为单体变构酶,葡萄糖激酶GK在糖代谢中存在三种构象和两
清华大学颜宁小组破译一种人源葡萄糖转运蛋白结构
5月23日,记者从中科院上海光源获悉,清华大学医学院教授颜宁研究组利用上海光源生物大分子晶体学线站(BL17U1),在世界上首次解析了人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的三维晶体结构,初步揭示其工作机制以及致病机理。相关研究论文在线发表于《自然》。 GLUT1几乎存在于人体每一个细胞中,是红细胞和血
清华大学PNAS发表蛋白转运新成果
ABC(ATP结合盒)转运蛋白是一个古老而庞大的蛋白家族,包括一百多种膜转运蛋白。这种转运蛋白广泛存在于细菌、植物和哺乳动物的各种细胞中,主要功能是利用水解ATP的能量来驱动物质跨膜运输。ABC转运蛋白参与了多种物质的转运,底物可以是离子、单糖、氨基酸、磷脂、肽、多糖和蛋白质。大部分ABC蛋白由
Nature子刊:SLFN蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构
多家研究机构合作报道了 Schlafen(SLFN)蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构,证实 SLFN 是一个新型的核酸内切酶家族,通过破坏蛋白翻译机器调控真核生物的翻译进程,能够有效控制 HIV 病毒的复制和包装。 中山大学附属肿瘤医院,南方科技大学、德国马科斯•德尔布吕克分子医学中心
上海光源用户在《自然》发表两项研究成果
一、葡萄糖转运蛋白GLUT1-4的结构与机理研究 10月18日,清华大学医学院教授颜宁研究组在Nature以Research Article的形式发表了题为Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporter
新型ECL底物为Western带来漂亮结果
Bio-Rad公司近日推出了新的化学发光检测试剂 C Clarity western ECL底物。这种新底物既适合胶片检测,也适合数码检测,能为高表达和低表达蛋白带来出色的结果,满足研究人员的各种需求。 选择western blotting检测底物看似很简单,其实也有不少学问。一般
发光底物吖啶酯和鲁米诺哪个更好
吖啶酯类的直接化学发光剂不需酶的催化作用,只需改变溶液的pH等条件就能发光。吖啶酯的化学发光量子产率比鲁米诺高,而且吖啶酯标记条件温和,标记率高,标记后不影响分离。吖啶酯和鲁米诺两者价格也相差很大。
底物种类对酶活的影响
实验结果表明,用Sigma植酸钠做底物,其酶活检测值相当于国产植酸钠的82.49%左右,经过反复多次的对比,两种底物的检测值都有相似的对应关系。国产植酸钠完全可以替代Sigma植酸钠用于中性植酸酶酶活的检测,同时,其价格只有Sigma植酸钠的0.5%,用国产植酸钠可以大大降低检测成本。
化学发光底物(化学发光剂)
在化学发光反应中参与能量转移并最终以发射光子的形式释放能量的化合物称为化学发光剂或发光底物。在发光免疫技术中常用的化学发光底物有以下几类。 1、氨基苯二酰肼类主要是鲁米诺及异鲁米诺衍生物,是最常用的一类化学发光剂。鲁米诺(luminol,5'-氨基-2,3-二氢-1,
底物存放时间对酶活的影响
大量实验表明,长时间存放的底物,会造成较高的本底值,影响测定精度。我们分析了植酸钠溶液存放在4 ℃条件下,底物存放时间对酶活的影响,结果见表3。
底物化学发光使用方法
1. 印迹膜制备 按常规方法完成SDS-PAGE和电转膜操作,适当的封闭非常重要。可以通过标记一抗或二抗的手段引入HRP,一般采用市售的HRP二抗交联物。仔细地淋洗对于降低背景非常重要,在与HRP交联物温育后,膜片更需仔细洗涤,所有步骤均在室温下完成。2. 化学发光试剂的配置 在使用前等量混合a液和
大肠杆菌的呼吸酶和底物
大肠杆菌的呼吸酶和底物呼吸酶氧化还原对中点电位(伏)甲酸脱氢酶碳酸氢盐/甲酸盐−0.43氢化酶质子/氢−0.42NADH脱氢酶NAD/NADH−0.32甘油-3-磷酸脱氢酶DHAP/Gly-3-P−0.19丙酮酸氧化酶醋酸盐+二氧化碳/丙酮酸盐?乳酸脱氢酶丙酮酸盐/乳酸盐−0.19D-氨基酸脱氢酶2
底物用量对转化率的影响
恒温恒压时:如反应mA(g)+nB(g)≒pC(g)+qD(g)(1)当不改变反应物用量,平衡受温度或压强改变的影响向正向移动时,各反应物的转化率增大;(2)若反应达平衡后,增加一种气态反应物的用量,则另一种反应物的转化率增大,而本身的转化率反而减小;(3)投料比等于气态反应物化学计量数之比,各反应
关于胰岛素受体底物的简介
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRS) 是指能够被激活的胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基,可被磷酸化,磷酸化的IRS能够结合并激活下游效应物。 IRS在被胰岛素受体磷酸化以后,如同一块“磁铁”与那些具有SH2结构域的蛋白结合,根
酶催化的特点和底物类型
特点一、酶促反应具有极高的效率二、酶促反应具有高度的特异性酶的特异性是指酶对底物的选择性,有以下三种类型:1.绝对特异性 酶只作用于特定结构的底物,生成一种特定结构的产物。如淀粉酶只作用淀粉。2.相对特异性 酶可作用于一类化合物或一种化学键。例如磷酸酶可作用于所有含磷酸酯键的化合物。3.立体异构特异
胰岛素受体底物种类介绍
第一种是胰岛素受体底物1(IRS1),是一种蛋白质,其上有多个(至少8个)可被受体激酶磷酸化的位点,磷酸化后可同多种效应物结合,包括:PI(3)K、Syp(一种磷酸酪氨酸磷酸酶)、Nck(一种连接蛋白)、GRB2(growthfactor receptor-bound protein2,一种通过SH
胰岛素受体底物的功能介绍
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate,IRSs)是一种能够被激活的胰岛受体酪氨酸激酶的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基可被磷酸化,磷 酸化的IRSs能够结合并激活下游效应物。
血凝分析仪底物显色法简述
底物显色法(生物化学法) 底物显色法是通过测定产色底物的吸光度变化来推测所测物质的含量和活性的,该方法又可称为生物化学法。其原理是通过人工合成与天然凝血因子有相似的一段氨基酸排列顺序、并含有特定作用位点的小肽,并将可水解产色的化学基因与作用位点的氨基酸相连。测定时由于凝血因子具有蛋白水解酶的活
胰岛素受体底物的主要种类
已知有三种胰岛素受体酪氨酸激酶作用的底物(IRS)。第一种是胰岛素受体底物1(IRS1)。这是一种蛋白质,其上有多个(至少8个)可被受体激酶磷酸化的位点,磷酸化后可同多种效应物结合,包括PI3K(磷脂酰肌醇-3-激酶)、Syp(一种磷酸酪氨酸磷酸酶)、Nck(一种连接蛋白)、GRB2(growthf
ELISA中的试剂(3)-酶的底物
3.3 酶的底物 3.3.1 HRP的底物 HRP催化过氧化物的氧化反应,最具代表性的过氧化物为H2O2,其反应式如下:DH2+ H2O2 D+ H2O上式中,DH2为供氧体,H2O2为受氢体。在ELISA中,DH2一般为无色化合物,经酶作用后成为有色的产物,以便作比色测定。常用的供氢体有邻苯二
底物用量对转化率的影响
恒温恒压时:如反应mA(g)+nB(g)≒pC(g)+qD(g)(1)当不改变反应物用量,平衡受温度或压强改变的影响向正向移动时,各反应物的转化率增大;(2)若反应达平衡后,增加一种气态反应物的用量,则另一种反应物的转化率增大,而本身的转化率反而减小;(3)投料比等于气态反应物化学计量数之比,各反应
我国揭示KDM5亚家族组蛋白去甲基化酶的底物识别机制
12月12日,中国科学院植物逆境生物学研究中心杜嘉木课题组,中科院院士、中科院遗传与发育生物学研究所曹晓风课题组合作完成的论文,以Structure of the Arabidopsis JMJ14-H3K4me3 Complex Provides Insight into the Substr
Nature新研究惹巨大争议
一、葡萄糖转运蛋白GLUT1-4的结构与机理研究 10月18日,清华大学医学院教授颜宁研究组在Nature以Research Article的形式发表了题为Crystal structure of a bacterial homologue of glucose transporter
4月中国学者Nature文章井喷
四月份,国内学者在Nature及其子刊上发表文章井喷,发表了关于ICOS分子免疫新功能,能量耦合因子转运蛋白复合物四聚体的晶体结构,衰老相关酶SIRT6从所未知的新功能等多项成果。 首先清华大学的研究人员接连发表两篇文章,清华大学医学院祁海教授课题组首次揭示了ICOS共刺激分子直接控制T淋
β氨基酸脱氢酶催化机理及改造应用研究中获进展
手性β-氨基酸不仅是天然化合物中的重要组成部分,而且也是合成一些药物分子的重要砌块。从原子经济性和对环境影响的角度进行考量,氨基酸脱氢酶(AADHs)作为生物催化剂在手性氨基酸的不对称合成中具有较大潜力。然而,与被广泛研究的α-AADHs相比,目前β-AADH家族中已知成员只有l-赤式-3,5-