生物物理所抗生素耐药性研究获进展
8月4日，中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临的最主要的公共健康威胁之一。抗药性相关的机制研究及对策已成为世界卫生组织和各国政府共同关注的问题。细菌有多种形式的抗药机制，最普遍的一种机制是利用细胞膜上的多个药物外排泵，将抗生素外排出细胞。大肠杆菌MFS家族的多药物外排蛋白MdfA是抗药机制研究中的范例，对该蛋白结构的解析有助于深入认识细菌的药物外排机制。张凯课题组成功解析了MdfA-氯霉素以及MdfA与多个底物类似物复合物的高分辨率晶体结构（最高2.0 Å）。在MSF家族中，药物底物与转运蛋白复合物的晶体结构的报道仍属首次。 MdfA形成12次跨膜螺旋的拓扑结构，含有由3次跨膜......阅读全文
原子晶体的晶体结构介绍
结构特征：空间立体网状结构（如金刚石、晶体硅、二氧化硅等）。 原子晶体的结构特点： ①由原子直接构成晶体，所有原子间只靠共价键连接成一个整体。 ②由基本结构单元向空间伸展形成空间网状结构。 ③破坏共价键需要较高的能量。 在原子晶体的晶格结点上排列着中性原子，原子间以坚强的共价键相结合，
请问晶体结构有哪些类型？
晶体可以由原子、离子或分子结合而成。例如非金属的碳原子通过共价键可以形成金刚石晶体。金属的钠原子与非金属的氯原子可以先分别形成Na和Cl离子，然后通过离子键结合成氯化钠晶体，每个离子周围是异号离子。离子结合而成的晶体称为离子晶体。在有些晶体中原子可以先结合成分子，然后通过分子间键或范德华(Van
人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构分析研究
2014年6月5日，清华大学宣布：清华大学医学院颜宁教授研究组在世界上首次解析了人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构，初步揭示了其工作机制及相关疾病的致病机理。该研究成果被国际学术界誉为“具有里程碑意义”的重大科学成就。 癌细胞要生存，需要依赖葡萄糖作为其“口粮”，而由于癌细胞消化葡萄
酶免疫技术酶与底物
酶结合物是酶与抗原或者抗体、半抗原在交联剂作用下联结的产物,是 ELISA 成败的关键试剂。它不仅具有抗原抗体的特异性反应,还具有酶促反应的特性,最终产生生物放大的特性。酶免疫反应中,最常用的酶是辣根过氧化物酶,HRP的催化反应需要底物过氧化氢(H2O2)和供氢体(DH2)。供氢体多为无色的还原型染
HRP底物归类以及操作流程
二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最比较敏感、常见的底物。它造成明显的深棕色物质，在水和醇中不融解。大部分状况下，强烈推荐在DAB中添加不一样的金属正离子。当添加金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶能够更为比较敏感。该类反映物质呈暗灰蓝色至灰黑色，且在水及醇中平稳。DAB／金
HRP底物分类及其操作步骤
底物范围较广，包括二氨基联苯胺(DAB)、氯萘酚和氨乙基咔唑等。二氨基联苯胺／金属盐 DAB是辣根过氧化物酶最敏感、常用的底物。它产生强烈的棕色产物，在水和醇中不溶解。多数情况下，推荐在DAB中加入不同的金属离子。当加入金属盐如钴、镍至底物液中，辣根过氧化物酶可以更加敏感。此类反应产物呈暗蓝灰色至黑
生物学术语假底物
可以特异地结合到酶的活性中心但不被催化、阻止真底物结合的物质。有些酶具有假底物结构域，其中的特定序列或残基作为假底物结合到酶的活性部位，抑制酶活性，当酶与配基结合后发生构象变化，释放假底物，恢复催化功能。这是体内调节酶活性的一种重要方式。
蛋白质免疫印迹（Western－Blot，WB－）——底物化学发光ECL法
蛋白质免疫印迹可应用于：（1）从蛋白质混合物中检出目标蛋白质；（2）定量或定性确定细胞或组织中蛋白质的表达情况；（3）用于蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA、蛋白质-RNA相互作用后续分析。实验方法原理Western免疫印迹，是将蛋白质转移到膜上，然后利用抗体进行检测的方法。对已知表达蛋白，可用相应抗体
用肽底物检测蛋白质激酶的活性和特异性实验1
利用肽底物分析酪蛋白激酶Ⅰ和Ⅱ试剂、试剂盒酪氨酸激酶分析缓冲液酪蛋白激酶肽底物溶液实验步骤1. 在离心管里配制 50 μl 反应混合物：5X 酪氨酸激酶分析缓冲液 10 μl10 mmol/L 酪蛋白激酶肽底物溶液 5
蛋白酶体在泛素链诱导下的变构及底物识别机制
泛素-蛋白酶体系统（ubiquitin-proteasome system）参与调控真核细胞内众多的生物进程，包括蛋白质质量控制、细胞周期维持、基因表达调控、应激反应等【1,2】。其功能的异常与癌症、神经退行性疾病、自身免疫病等人类重大疾病密切相关【3】。26S蛋白酶体是一种依赖于ATP的蛋白酶
我国学者解析9个参与植物胁迫应答的蛋白激酶底物网络
1月28日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组、王鹏程研究组、美国普渡大学教授W. Andy Tao研究组合作的题为Mapping proteome-wide targets of protein kinase
生物物理所抗生素耐药性研究获进展
8月4日，中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临
生物物理所揭示抗病毒蛋白ZAP活性区域的晶体结构与功能
3月11日，国际著名期刊Nature Structural & Molecular Biology发表了中国科学院生物物理研究所刘迎芳研究组和高光侠研究组合作完成的研究成果——抗病毒蛋白ZAP活性区域的晶体结构与功能研究（Structure of N
生物物理所973项目发表Cell－Research文章
8月4日，中国科学院生物物理研究所张凯组和赵永芳组合作在Cell Research 发表了题为Substrate-bound structure of the E. coli multidrug resistance transporter MdfA 的研究成果。 细菌的药物抗性是当今全球面临
植物所揭示己糖激酶1的双重功能的结构基础
糖类为植物的生长发育提供能量，也可以作为信号分子调控植物光合作用相关基因的表达。糖类的代谢和信号转导由一系列的酶催化，拟南芥己糖激酶（AtHXK1）在植物的糖酵解和糖信号转导中发挥着重要的作用。因此，AtHXK1的结构与功能研究对揭示植物体内糖的代谢与信号转导的双重功能具有重要意义。 近日，中
如何用衍射仪判断晶体结构
一种物质会有可能会有多种晶型，因此就有多个pdf卡片，如不同的αfe或γfe。有了pdf卡片，这种晶型的该物质的结构就已经确定了，卡上有该晶体的空间群晶格常数等信息。对于未知物质或其晶体类型，需要用透射电子衍射或者会聚束方法
关于晶体结构晶体的共性介绍
如果将大量的原子聚集到一起构成固体，那么显然原子会有无限多种不同的排列方式。而在相应于平衡状态下的最低能量状态，则要求原子在固体中有规则地排列。若把原子看作刚性小球，按物理学定律，原子小球应整齐地排列成平面，又由各平面重叠成规则的三维形状的固体。 人们很早就注意一些具有规则几何外形的固体，如岩
底物和抑制剂对多药转运蛋白Pglycoprotein的变构调节机制
在一项新的研究中，来自美国范德堡大学和弗吉尼亚大学的研究人员发现了一种蛋白泵如何区分它将细胞中排出的化学物和阻止它发挥作用的抑制剂。相关研究结果近期发表在Science期刊上，论文标题为“Mechanism of allosteric modulation of P-glycoprotein b
底物化学发光的用途
非放射性发光系统,用于检测固定在膜上的蛋白,其敏感性达1-5pg。用x光片可快速地获得永久的硬拷贝结果。所含独特的底物足以维持12小时以上的发光,便于反复曝光操作,免疫印迹膜经抗体脱卸处理后可供再次抗体探查使用。适用于痕量蛋白或核酸检测。
使用荧光底物的直接－ELISA－实验
实验概要使用荧光偶联一抗的直接 ELISA 测定的程序。实验步骤第 1 天：1. 在滤过的 PBS 中稀释包被抗体后，在每孔中加入 100 μl 进行包被。用封板膜覆盖酶标板，将酶标板在 4℃下孵育过夜。 第 2 天：2. 将 4 g Block ACE 粉末稀释于 100 ml 去离子水中，使用其
酶底物复合物的概念
中文名称酶-底物复合物英文名称enzyme-substrate complex定 义在酶催化的反应中，酶首先与底物结合形成的过渡态中间物。可转化成产物和酶。应用学科生物化学与分子生物学（一级学科），酶（二级学科）
什么是底物化学发光？
根过氧化酶使试剂中的发光物(luminol)氧化并发光,而试剂中含有增强剂这使得发光增强了1000倍。在免疫印迹中,将复杂的蛋白混合物经sds-page分离,并转移到固相膜上(如nc、pvdf)等,用于免疫学检测,经HRP标记的抗体与膜上的蛋白直接(标记一抗)或间接(标记二抗)反应。
胰岛素受体底物的定义
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate，IRS)，参与胰岛素及其他细胞因子信号转导的磷酸化蛋白。IRS在被胰岛素受体磷酸化以后，如同一块“磁铁”与那些具有SH2结构域的蛋白结合，根据所结合蛋白的具体结构产生不同的效应，如激活SH2蛋白的酶活性、改变蛋白质构型并同另外的蛋
底物化学发光操作注意
1. 试剂每个批号均独立优化,请不要混用或稀释试剂以免降低敏感性;2. 加入一抗后膜不能再干燥;3. 适当地封闭和洗涤膜片至关重要;4. 使用前配置化学发光试剂,配置足够覆盖膜片即可,弃去使用过的混合试剂;5. 使用干净取样头取用每种试剂;6. 第一张片子建议曝光1分钟,观察结果后判断最佳曝光时间可
胰岛素受体底物的概念
胰岛素受体底物(insulin receptor substrate，IRSs)是一种能够被激活的胰岛受体酪氨酸激酶的底物, 其上具有十几个酪氨酸残基可被磷酸化，磷酸化的IRSs能够结合并激活下游效应物。
试剂盒酶的底物分类
酶的底物 1.3.3.1 HRP的底物 HRP催化过氧化物的氧化反应，最具代表性的过氧化物为H2O2，其反应式如下：DH2+ H2O2 D+ H2O上式中，DH2为供氧体，H2O2为受氢体。2.在ELISA试剂盒中，DH2一般为无色化合物，经酶作用后成为有色的产品，以便作比色测定。常用的供氢体有邻苯
底物量对反应结果的影响
化学反应是化学学习的一个重要内容。物质间发生的化学反应往往错综复杂、变化万千。不少化学反应是需要在一定条件下发生的，缺少了反应条件，有的反应是不能发生的，或进行得很慢。反应物的量的不同对反应结果有影响。1、CO2气体通入NaOH溶液中。当n CO2/n NaOH≤1/2时，反应方程式为CO2+ 2N
底物量对反应结果的影响
化学反应是化学学习的一个重要内容。物质间发生的化学反应往往错综复杂、变化万千。不少化学反应是需要在一定条件下发生的，缺少了反应条件，有的反应是不能发生的，或进行得很慢。反应物的量的不同对反应结果有影响。1、CO2气体通入NaOH溶液中。当n CO2/n NaOH≤1/2时，反应方程式为CO2+ 2N
中国学者首次揭示人源葡萄糖转运蛋白GLUT1晶体结构
清华大学医学院颜宁教授研究组在世界上首次解析了人源葡萄糖转运蛋白GLUT1的晶体结构。在人类攻克癌症、糖尿病等疾病的探索道路上迈出重要一步。该成果以长文形式发表在6月5日正式出版的英国《自然》杂志上。 GLUT1几乎存在于人体每一个细胞中，是大脑、神经系统、肌肉等组织器官中最重要的葡萄糖转运蛋
我国揭示蛋白酶体在泛素链诱导下的变构及底物识别机制
近日，国际学术期刊Molecular Cell 在线发表了中国科学院生物化学与细胞生物学研究所国家蛋白质科学中心（上海）丛尧研究组的最新研究成果“Structural snapshots of 26S proteasome reveal tetraubiquitin-induced confor