Cell:基因定位听命于谁?

生物通报道 来自美国国立卫生研究院下属国家癌症研究所(NCI)的科学家们,利用新型的大规模成像技术绘制出了个别基因在人类细胞核中的空间位置,并确定了50个细胞因子是基因正确三维(3D)定位的必要条件。这些空间定位对基因表达、DNA修复、基因组稳定性和其他的细胞活动起重要的作用。这项研究发布在8月13日的《细胞》(Cell)杂志上。 DNA在细胞核中非随机排列是高等生物基因组的一个基本特性。研究人员很久以前就已经知道,大多数基因都会占据细胞核中偏爱的3D位置,基因的定位对于它们的功能至关重要,但一直以来却很难确定决定基因定位的作用分子和机制(延伸阅读:Cell:基因定位的重大影响 )。尽管采用荧光原位杂交(FISH)技术可以显影基因,并确定它们的位置,这一成像技术一次只能分析几个样本,无法用于大规模基因组作图。 NCI的研究人员开发出了一种叫做HIPMap(High-throughput Imaging Position......阅读全文

体细胞重组定位法对基因结构进行分析的方法原理

原理相同于基因纯合化的定位方法。由于体细胞交换发生得较少,所以常用 X射线处理杂合体使之发生更多的体细胞交换。

测序与芯片定位葡萄膜黑色素瘤关键基因

  英法两国的研究人员通过测序和芯片分析,发现了与葡萄膜黑色素瘤中选择性剪接相关的SF3B1突变。这一突变与预后良好相关,有望指导疾病的临床管理。这项研究成果于近日发表在《Cancer Discovery》(2012年影响因子:10.143)上。   葡萄膜黑色素瘤(uveal melan

新型CUT&RUN技术实现单细胞全基因组定位

  在一项新的突破性研究中,来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN(cleavage under targets and release using nuclease)的方法进行改进,使得在使用少量细胞(包括单细胞和单个植入前胚胎)的情形下,它适合用来研究转录因子和

NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因

在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本

昆明动物所等采用新的比较基因组方法定位改良相关基因

  经历过长期人工选育的具有独特性状的作物优良品种很可能固定了一些在祖先基因库中以低频状态存在的优质等位基因 (elite allele)。这些优质等位基因贡献了该优良品种的优良农艺性状。在传统的遗传学研究中,科学家使用数量性状位点连锁作图(Quantitative trait loci l

关于皮质脑电图μ节律术中定位运动区皮质的研究

大脑功能区病变手术治疗要在保留功能前提下,最大程度切除病变,准确术中功能区定位是关键。直接电刺激(direct electrical stimulation,DES)是脑功能区定位的金标准,但存在耗时长,诱发癫痫及病人无法配合等问题。皮质脑电图(electrocorticography,ECoG)利

最新研究揭示天敌昆虫精准定位害虫的分子机制

   近日,中国农业科学院植物保护研究所抗虫功能基因研究与利用团队通过比较组学揭示了在植物-蚜虫-天敌昆虫互作关系中重要的化学线索反-β-法尼烯的来源、生态学功能及其介导的天敌昆虫嗅觉识别的分子机制。相关研究发表在《当代生物学》(Current Biology)上。  反-β-法尼烯被鉴定为绝大多数

莲单瓣重瓣等性状遗传定位研究中取得进展

  莲(荷花)作为我国传统名花之一,已有几千年栽培历史,其花器官中表现出广泛的多样性,如花色、花瓣数等方面的变化。然而,莲花各种形态特征的遗传变异规律仍不清楚。  针对这一问题,中国科学院武汉植物园研究员陈进明研究团队联合武汉市园林科学研究院,对栽培花莲12个花器官为主的性状进行全基因组关联研究(G

ABB阀门定位器实现阀门的准确定位

bb阀门定位器主要用于调控控制阀,采集控制器输出的电流控制信号,通过气压信号调控阀门。调控阀产生动作后,阀杆会产生一定的位移,并将相关的信号传递到阀门定位器。定位器对输入控制信号和阀位反馈信号进行对比分析,如果两种信号不同,则促使阀门的驱动部件进行工作,直至两种信号相同为止。如果两种信号相同,则驱动

共定位中用到免疫荧光,“共定位”是什么

共定位的定义:共定位是对样品内两种荧光标记的信号共同分布的位置进行分析。 共定位就如字面意思上所说的,只能够表明蛋白A和B都在此细胞有表达,并且在同样的细胞内位置/细胞器。相关短语:共定位通道 PDM Channel细胞共定位 Cellular co localization细胞内共定位信息 cel

梁慧珍等定位24个大豆幼苗期根系性状基因

  日前,在国家转基因重大专项和河南省科技创新杰出人才计划资助下,河南省农科院研究员梁慧珍等人定位了24个大豆根系相关性状的QTL(数量性状座位)位点。相关研究发表在《理论与应用遗传学》上。  以梁慧珍为首的研究团队,利用栽培大豆×半野生大豆所衍生的重组自交系群体,通过多年多点试验,定位了24个控制

重测序构建芝麻超高密度图谱以及花序基因的定位

连锁分析寻找QTL位点,是最经典的性状定位方法。而遗传图谱的密度是限制定位精度的其中一个方面。目前,构建图谱的方法已从基于传统的SSR、AFLP等基于片段长度多态性的分子标记,过渡到了基于SNP芯片或NGS测序的SNP分子标记。NGS测序最常用的是简化基因组测序和全基因组重测序,区别在于标记数量的多

科学家发现新基因:能帮助人体器官正确“定位”

    X光片显示,因不对称发育,该人体的心脏和其他器官出现了位置错误。图片来源:ZEPHYR/SCIENCE SOURCE  从外表上看,人类有着令人愉悦的对称性:手臂、腿和眼睛呈左右对称。但人体的器官分布却是另一回事:心脏在左边,肝脏在右边,肺和肾也是不对称的。  近日,新加坡基因组研究所等机构

锚定位的定义

分析从HLA分子抗原结合槽洗脱下来的各种天然Ag肽的一级结构,发现都带有两个或两个以上与MHC分子抗原结合槽的特定部位,称为锚定位。

血尿的定位诊断

血尿的定位诊断除紧密结合临床病史、体征和X线、B超等辅助诊断手段外,尿液的实验室检查是一项非常重要的方法。    尿常规分析是血尿定位诊断的基础。血尿标本中若有明显的尿蛋白,尤其是肾小球性蛋白尿则提示尿中红细胞的起源可能来自于肾小球。肾小球性蛋白尿常以白蛋白及一些大分子的蛋白为主,而肾小管性

共定位的计算

用于计算另一相关系数的较简单的技术,需要去掉原始像素强度值和平均像素强度值这个差减项。 正式定义为 Overlap 系数( R) ,这个值范围从 0 到 1,在图像分析中对强度变化不敏感。 Overlap 系数定义为:分子是两个通道强度的乘积和,只有当同一个像素的两个通道值与共定位相关时,分子才会给

定位体征的病因

  由于神经系统各部位的解剖结构和生理功能不同,当损伤时即出现不同的神经功能障碍,表现出不同的临床症状和体征,定位诊断是根据这些症状和体征,结合神经解剖、生理和病理知识,推断其病灶部位的一种诊断过程。  常见病因有:感染、外伤、血管性疾病、中毒、代谢障碍、肿瘤、变性疾病、先天性疾病和寄生虫病等。

缺失定位法介绍

原理和基因的缺失定位相同,不过需要具备种类更多而差别更为细微的缺失菌株。在大肠杆菌的 T4噬菌体中曾经获得一系列快速溶菌突变型rⅡ基因部分缺失突变型,利用这些突变型可以迅速测定任何一个 rⅡ点突变在rⅡ基因中的位置。图5中的每一编号标明的横线表示一个缺失突变型的缺失范围。定位分两步进行,首先测定大的

RNA定位的功能

中文名称RNA定位英文名称RNA localization定  义RNA特异定位在细胞不同区域的过程。尤其是信使核糖核酸(mRNA)的定位对生长和发育是重要的。细胞质中RNA定位起始于细胞核,在核中被特异RNA结合蛋白识别,生成核糖核蛋白复合体,然后输出到细胞质。应用学科生物化学与分子生物学(一级学

荧光团共定位

当研究荧光团共定位时,要考虑的最重要的一点是:确保样品标记的质量最好。抗体和合成荧光团都应进行特异性的分析和选择,背景要低、没有交叉活性。为了降低串色影响,发射光谱分得比较开的荧光探针组合最适合做共定位实验。要做合适的 control 实验,包括用每个探针单独标记样品及未标记的只有自发荧光的样品,都

ZigBee无线定位技术

  大多数无线传感器网络都要求具备一种确定网络节点位置的方法。因此在设备安装期间,需要弄清楚哪些节点相互之间直接进行数据交换,或者确定哪些节点直接与中央数据采集点进行数据交换。  当通过基于软件的计算方法来确定网络节点位置时,就需要考虑到市场化解决方案 (market solution)。这些具体的

伽利略定位系统简介

  伽利略定位系统(Galileo Positioning System),是欧盟一个正在建造中的卫星定位系统,有“欧洲版GPS”之称,也是继美国现有的“全球定位系统” (GPS) 、俄罗斯的GLONASS系统及中国的北斗卫星导航系统外,第四个可供民用的定位系统,预计会于2010年开始运作。

杏果实性状遗传和QTL定位方面研究取得新进展

  近日,辽宁果树所李杏团队在国际植物学前沿期刊《植物科学前沿》(Frontiers in Plant Science)上发表研究论文。该研究对杏果实大小、可溶性固形物和果肉硬度进行了QTL定位,对培育优质耐贮新品种提供了理论基础。  杏主要种植在我国西北、华北、东北地区的干旱丘陵山区地带,近年来其

昆明动物所哺乳动物回声定位分子机制研究获进展

  回声定位是一种基于听觉能力的特殊感觉机制。具有回声定位能力的动物利用回声定位进行导航、搜索食物和躲避障碍物等,从而对它们的生存和繁殖具有非常重要的作用。尽管人们已经在动物行为学和生理学等方面对回声定位进行了研究,但是对其产生的分子机制却知之甚少。   中国科学院昆明动物研究所遗传资源与进化国家重

光机所对光损伤三维精确定位研究中取得进展

  近期,中国科学院上海光学精密机械研究所高功率激光物理联合实验室在利用深度学习对光损伤三维精确定位研究方面取得新进展,提出适用于衍射环检测的神经网络Diffraction-Net,实现对重叠率大于61%的衍射环识别,这是目前文献报道的最好结果。相关成果于3月30日发表于《光学快讯》(Optics

“中国生态系统定位观测与研究数据集”丛书发布

日前,中国国家生态系统观测研究网络(CNERN)和中科院中国生态系统研究网络(CERN)在北京召开“中国生态系统定位观测与研究数据集”丛书发布会。  生态系统观测研究网络是一个数据密集型的野外科技平台,各野外台站在长期的科学研究中,积累了丰富的科学数据,这些数据是生态学研究的第一手原始科学

阿自倍尔阀门定位器如何保护电源定位?

阿自倍尔阀门定位器在使用的时候,电源是很重要的一个部件,因此在使用的过程中,我们需要尽量避免损坏其电源定位,这是一个在使用定位器时必须了解的事项。对于阿自倍尔阀门定位器一般来说,没有必要连接定位器到键合导体,这个导体可以连接在设备内部。用于操作限制触点定位器,切换符合EN60947-5-6的放大器必

共转导定位法对基因结构进行分析的方法原理和应用

原理和基因的共转导定位也没有不同。共转导的精确性较好,而且所需要的只是一个转导噬菌体菌株,所以应用较广,尤期适用于测定一系列属于同一基因的点突变的相对位置。

Nature子刊:定位人类基因组的非常规翻译

  蛋白质翻译一直是科学家们重点研究的生物学过程。目前人们对翻译过程的常规机制已经有所了解,不过实际上蛋白的合成方式并不只有一种。   Arizona州立大学的研究人员,首次在全基因组范围内研究了不依赖帽子结构的翻译机制,鉴定了在这一机制中作为翻译增强元件(TEE)的mRNA序列,这些序列位于编码

一种新的数量性状定位方法克隆水稻产量性状优势基因

  7月5日,中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所国家基因研究中心韩斌研究组与上海师范大学黄学辉研究组、中国水稻所和福建农科院合作在《自然-通讯》(Nature Communications)杂志上发表了题为Dissecting a heterotic gene through G