新方法准确检测Lynch综合征相关突变

贝勒医学院等机构的研究人员近日开发出一种更准确的方法,检测PMS2基因中的突变。这个基因的突变与遗传性非息肉结肠直肠癌(Lynch综合征)和Turcot综合征相关。研究结果在线发表于《the Journal of Molecular Diagnostics》上。 为了提高PMS2基因突变检测的准确性,研究人员开展了多重连接依赖的探针扩增(MLPA)、靶向捕获新一代测序以及长距离PCR(LR-PCR)。他们在32个临床样本和14个对照样本(8个阳性对照和6个阴性对照)上使用了这种方法。 美国每年诊断出14万例结肠直肠癌,但只有3-5%是由Lynch综合征引起的。然而,研究人员认为,PMS2基因在Lynch综合征中的作用被低估。同时,基因组区域中的高度同源序列,以及活性基因和假基因之间频繁的序列交换阻碍了这个基因的准确分析。 之前,PMS2突变是利用Sanger测序以及编码外显子和侧翼内含子区域的分析而检测的,这不能提供拷......阅读全文

研究人员找出与近视有关的基因突变

  人们理所当然地认为框架眼镜和隐形眼镜会改善近视者的视力,但一直不清楚近视这种常见现象背后的基因因素。现在,美国杜克大学医学院的科研人员朝着弄清这一问题又迈进了一步。   根据今天刊登在《美国人类遗传学杂志》(American Journal of Human Genetics)上的一项研究

研究人员发现导致猪免疫缺陷的突变基因

   美国爱荷华州大学的研究人员发现了一组可导致猪只免疫缺陷的突变基因,这使具备该种缺陷的猪只成为潜在药物疗法的独特测试模型。   突变基因的发现为爱荷华州大学进一步培育一个具有重症综合性免疫缺陷(SCID)的猪品种,改善猪的养殖和管理制度打下基础。   动物科学教授Christopher Tugg

EGFR基因21外显子突变是什么意思

可以这么简单的说就是基因突变的话,人所患癌症的几率就非常非常大啦。但是癌症也不是耽搁基因突变就能造成的,而是多个基因突变的结果。EGFR是原癌基因c-erbB1的表达产物,是表皮生长因子受体(HER)家族成员之一。该家族包括HER1(erbB1,EGFR)、HER2(erbB2,NEU)、HER3(

外显子测序发现早期胚胎致死基因突变

  King Faisal Specialist医院和Fowzan Alkuraya研究中心的团队对辣子两个怀孕有苦难的家庭女性进行了同和性作图和外显子测序,这些女性即使进行体外受精,怀孕也十分困难。研究人员本周在《Genome Biology》上报道了他们的结果,他们发现,TLE6中的突变似乎在早

Nature-Gen:外显子测序发现肺癌新突变基因

  最近,来自美国几所主要大学和俄罗斯ITMO大学的研究人员,在肺癌细胞中发现了一些新的驱动突变(driver mutations),可能用于基因靶向治疗和免疫治疗。相关研究结果发表在最新一期的《Nature Genetics》杂志。  在超过1000名肺癌或鳞状细胞癌患者中,研究者对他们的肿瘤外显

Nature最新成果:外显子测序找到罕见基因突变

  来自Broad研究所、麻省总医院等知名生物医学研究机构的研究人员发现了一种称为APOA5的基因发生罕见突变,会增加个体早期心脏病发作的风险。这些突变能令APOA5 基因失去作用,同时增加血液中的甘油三酯含量。  这一新发现与近期其它遗传方面的成果,尤其是APOC3 保护性基因突变(降低甘油三酯水

奥地利研究人员发现与癫痫(epilepsy)有关的基因突变

  奥地利维也纳医科大学神经科医院4月15日宣布,他们确认了导致一种罕见癫痫(epilepsy)的基因变异,它可能在其他基因性癫痫(epilepsy)的发病过程中也起着重要作用。   维也纳医科大学当天发表的公报说,该大学的专家与埃及和德国同行合作,对一个埃及家庭进行了研究。这个家庭有5个孩子患有

NimbleGen大麦外显子组捕获快速定位多节矮秆突变基因

在农业生产中,性状相关的基因定位对于科学育种十分重要,传统的遗传重组定位具有指导意义和实用价值,但传统方法周期长、耗费大。随着二代测序的发展,DNA测序速度大大加快、成本大大降低,使得通过测序法进行的基因定位(mapping-by-sequencing)成为越来越多动植物研究的主要手段。对合适的样本

外显子的跳跃突变的介绍

  超过一半的基因编码区的单核苷酸突变引起的疾病都是影响了RNA的剪切。例如这些突变导致基因的外显子缺失,被称为外显子跳跃现象。如果能将外显子重新恢复到基因转录本中去将会给许多疾病的治疗带来曙光。AdrianKrainerandLucaCartegni开发了一种新的方法ESSENCE(exon-sp

NJEM:研究人员找出导致肥胖相关代谢综合征的基因突变

  近日,耶鲁大学领导的研究确定肥胖了相关“代谢综合征”的基因突变,这项研究发表在5月15日的New England Journal of Medicine杂志。  到现在为止,基因分析已经成功地识别出个体患肥胖症,高血压或血糖水平升高得危险因素突变。然而映射负责疾病包括肥胖症,高血压和血糖水平升高

上海交大研究人员系统阐述胆囊癌基因突变图谱

  7月7日,记者从中科院上海生科院营养科学研究所获悉,该所王慧研究组与上海交通大学附属新华医院教授刘颖斌、复旦大学生物医学研究院副教授刘赟等合作,运用全基因组外显子测序和靶基因深度测序技术,首次系统阐述胆囊癌基因突变图谱,发现驱动胆囊癌发生发展的关键基因和信号通路,揭示ErbB信号通路的突变与胆囊

外显子测序揭示复发突变的预后

  研究人员对肿瘤做了外显子测序,并且将其与超过450名骨髓瘤患者获得的正常样品进行了匹配,这450名患者都是通过国家癌症研究所的骨髓瘤XI实验招募的,这是一个使用依靠临床结果、分子细胞遗传学和数据等等进行的精密或者不精密骨髓瘤治疗项目的临床3期实验。  在所有骨髓瘤样本中出现的基因突变频率,他们发

Cell-Reports:研究人员找到和致命前列腺癌相关的基因突变

图片来源:Wikipedia  来自克利夫兰诊所·勒纳研究所癌症生物学部的Nima Sharifi博士领导了这项研究,该研究表明缺乏该基因某种亚型的男性更容易患上治疗抵抗性的致命恶性前列腺癌。  Sharifi博士及其同事早期的研究发现基因HSD3B1突变会导致前列腺癌更耐受治疗、更容易增殖。他们发

外显子的基因反应

剪接方式并不是唯一的(参看替代剪接),所以外显子只能在成体mRNA中被看出。即使是使用生物信息学方法,要精确预测外显子的位置也是非常困难的,外显子的识别及其拼接都是难题。 真核生物的基因,其线性表达被内含子阻断,这就是所谓的断裂基因(英语splitgene),该现象的发现者RichardJ.Robe

基因突变的研究历史

基因突变首先由T.H.摩尔根于1910年在果蝇中发现。H.J.马勒于1927年、L.J.斯塔德勒于1928年分别用X射线等在果蝇、玉米中最先诱发了突变。1947年C.奥尔巴克首次使用了化学诱变剂,用氮芥诱发了果蝇的突变。1943年S.E.卢里亚和M.德尔布吕克最早在大肠杆菌中证明对噬菌体抗性的出现是

日本研究人员发现生成肌腱基因

  日本国立成育医疗研究中心系统发生和再生医学研究部的研究小组日前发现对生成连接骨骼和肌肉的肌腱发挥重要作用的基因。   研究小组利用独自开发的基因数据库,发现“Mkx”基因对肌腱发育成熟具有重要作用。通过老鼠实验发现,剔除了该基因的老鼠,其肌腱会停止发育,而且非常脆弱。肌腱一旦损

研究人员说,‘基因驱动’-值得关注

  据本期《政策论坛》的作者披露,在“基因驱动”被考虑用于像给蚊子基因组进行重新编程以消除疟疾或用于逆转杀虫剂抗药性的发生之前,涵盖这项技术——它包括了基因编辑——的法规中的缺口必须得到填补。他们说,现在是一个对“具有广泛包容性及信息灵通”的有关基因驱动的未来进行公共讨论的时候了。基因驱动技术是在1

PNAS:外显子变异检测——全基因组测序比全外显子测序更强大

  目前,全外显子测序和全基因组测序技术在遗传分析和发现导致疾病发生的潜在基因突变方面应用越来越广泛,随着测序技术的不断迭代更新,越来越成熟,昂贵的价格会逐渐降低,那么在排除价格因素之后,全外显子测序和全基因组测序在检测外显子突变方面究竟谁更加强大呢?来自美国的科学家对这一问题进行了相关研究,其研究

Nature外显子测序发现癌症等相关突变

  来自西雅图儿童医院,芝加哥大学等处的研究人员发表了题为“De novo germline and postzygotic mutations in AKT3, PIK3R2 and PIK3CA cause a spectrum of related megalencephaly syn

全外显子组测序追踪找到了白血病复发的基因突变

  近日,来自圣犹大儿童研究医院的研究人员发表在国际著名杂志Journal of the American Medical Association上的一篇研究论文中表示,他们已经使用了全外显子组测序对急性淋巴性白血病(Acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者机体的基因组

研究人员开发一种利用CRISPRCas9修复特定类型的基因突变

  在一项新的研究中,来自美国马萨诸塞大学医学院的研究人员开发出一种利用CRISPR-Cas9和一种很少使用的DNA修复途径编辑和修复一种特定类型的与微重复(microduplication)相关的基因突变。这种可编程基因编辑方法克服了之前在基因校正中所遭遇的低效率。相关研究结果于2019年4月3日

美研究人员发现负责脂肪转化基因

    很多人为保持身材苗条而不得不在美味的高热量食物面前望而却步,不过一项最新研究有望给他们带来福音。美国研究人员在人体内发现一种负责将碳水化合物转化为脂肪的基因,这一发现有望帮助人们控制体重。    据路透社3月19日报道,美国加州大学伯克利分校的研究人员发现,一种名为DNA-PK的基因似乎可以

研究人员绘出苹果基因组草图

  一个国际科研小组8月29日在英国《自然—遗传学》(Nature Genetics)杂志上报告说,他们绘出了苹果的基因组草图,这将有助于从基因水平上分析苹果性状,培育更多苹果新品种。  意大利、美国、新西兰等国研究人员报告说,他们绘出的是广受人们喜爱的“金冠苹果”的基因组草图。结果

日研究人员确定“叶化病”基因

  日本研究人员日前宣布,他们发现了导致八仙花(又名紫阳花、绣球花)和牵牛花等植物患上叶化病的植物菌原体所拥有的致病基因,并弄清了这种基因的功能。   叶化病是指植物的花器官部分或全部被类似叶片的结构代替,形成“花变叶”的状态,花朵呈绿色的珍稀八仙花有时也会患上叶化病。植物菌原体是一类目前尚不能人

研究人员破译结皮绿藻基因密码

  在沙漠和旱地中,有一种神奇的生物土壤结皮被称为“沙漠皮肤”,其在维持土壤健康、减少侵蚀、促进养分循环等方面发挥重要作用。绿藻(特指片球藻属绿藻)就是土壤结皮中的重要成员之一,因其能适应各种极端环境如冰川、火山等处的土壤,并在压力下展现卓越的脂质积累能力而引发关注。尽管结皮绿藻具有重要的生态和生物

研究人员克隆出建兰开花整合基因

  记者日前从中科院华南植物园获悉,该园科研人员完成的“建兰开花整合基因—CeFT基因及其应用”获国家发明ZL授权。该发明为通过基因工程改良植物生长进程、调控植物花期提供了一种有效的技术手段,具有广泛的应用前景和极大的经济价值。   据介绍,建兰是兰科兰属中的小花型地生种,为我国传统名花之一,具有

研究人员“沉默”重要的致癌基因

  最近,来自北卡罗来纳大学(UNC)医学院和德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员,开发出一种新方法,阻断KRAS致癌基因——在人类癌症中最常见的一个突变基因。这项研究,由UNC医学副教授Chad Pecot带领,为攻击KRAS提供了另外一种途径,这个突变被证明是药物开发当中一个难懂而令人沮丧的

鱼鳞病,也许是由这个突变引起的

   皮肤病虽然不致命,可是发作起来也是要人命的。鱼鳞病(ichthyoses)就是一组严重的皮肤病,主要表现为皮肤干燥,伴有鱼鳞状脱屑。研究人员近日发现,KDSR基因中的突变似乎与这种疾病存在关联。  耶鲁大学医学院的Lynn Boyden领导的研究团队对鱼鳞病患者的外显子组进行测序,以揭示KDS

研究人员首次确定基因“剪刀”可加速特定基因遗传

  近日,研究人员首次使用被称为基因“剪刀”的基因组技术CRISPR加快哺乳动物特定基因的遗传。这种极具争议的基因驱动策略几年前在实验室饲养的昆虫中得到证明。因为它能在整个物种中迅速传播一种基因,从而激发了人们利用致命基因消灭疟蚊等害虫的梦想。现在,被消灭的对象或许还有具有破坏作物或能致病的哺乳动物

外显子组测序并不一定带来正确的诊断

  美国医学遗传学学会(ACMG)的临床遗传学年会于3月24-28日在美国盐湖城举行。埃默里遗传学实验室的研究人员在会议上表示,外显子组测序数据的初步分析并不一定能带来正确的诊断,需要再次检查。  埃默里大学医学院的教授、遗传实验室的主管Madhuri Hegde在她的报告中举了两个病例,说明研究人