测序污染有多危险,如何防范与去除[实验手册]

一些研究表明,目前已经公布的基因组存在多种污染,随着这个问题越来越突出,我们需要找出方法来应对 生物通报道:Supratim Mukherjee在进行数据分析的时候,发现数以百计的微生物基因组中会重复出现同一种噬菌体序列,这令他感到很惊讶。这位来自劳伦斯伯克利国家实验室的生物信息学家最开始是为了比对这些微生物的代谢途径,但后来他发现了几乎无处不在的序列,“我以为我们发现了一些新的东西,”他回忆道,“在这些不同的微生物中,这整个噬菌体基因组是完整地保留下来的。” 但当Mukherjee一开始分析这个噬菌体序列时,他就知道这就是 PhiX 序列,一种Illumina公司测序试剂盒中用做标准品的噬菌体。PhiX 本来是作为一种质控检测指标,用于追踪每个测序过程中出现的错误率的,但在上百个案例中,Mukherjee发现研究人员都没有从其公布的基因组序列中剔除Phi X的序列。 并不是只有Mukherjee一人发现此种情况,最近......阅读全文

我国东北地区出现空气重污染过程

  环境保护部今日(9日)向媒体通报,11月6日起,受不利气象条件和污染排放的影响,我国东北地区持续出现空气重污染过程。  环境保护部环境监测司司长罗毅介绍说,11月6日,全国338个城市中,10个城市空气质量出现重度及以上污染,均位于东北地区。其中哈尔滨、长春、吉林和四平为严重污染,绥化、辽源、七

FID出现污染时,应采取的预防措施

FID是氢火焰离子化检测器的简称,属于质量型检测器,主要包括一个不锈钢制成的离子室、气体入口、火焰喷嘴、发射极和收集极、点火线圈、外罩等部件。    因为喷嘴所处位置极易被污染。一旦检测器被污染,轻则灵敏度明显降低或噪声增大,基线不稳,重则会熄火或点不着火,严重影响气相色谱的定性和定量分析,那么当出

进口转基因大豆将带来“基因污染”

  今年头两个月,黑龙江省大豆进口量激增,达到26.9万吨,同比增长6563.5%。而黑龙江省的大豆出口呈相反态势,今年头两个月仅出口1879吨,同比下降92.2%。   “一旦进口的转基因大豆占领黑龙江市场,危及的将不仅是当地世代以大豆种植为生的农户的利益和生存,黑龙江大豆的原产种源、环境也将遭

指示性生物分类水污染指示生物

不同生物类群对水环境有不同的指示特点。水生微生物对环境的指示快速、直接,藻类对环境的指示主要是反映中上层水体质量,低栖动物对环境的指示主要是反映下层水体和底质质量,鱼类的指示主要是体现因食物链的富集作用而表现的毒理特征,水生植物对水环境的指示则反映水体及与水体关系密切的生长基质。

朱永官等研究称基因工程有望用于砷污染生物修复

  日前,中科院城市环境所朱永官课题组在光合生物对砷的甲基化研究方面取得新进展。其研究成果表明,可以通过基因工程方法使植物具有挥发砷的能力,从而应用于砷污染土壤的生物修复。   砷在环境中广泛存在并对人体健康不利。我国也是受砷污染困扰的国家之一。砷在自然界中存在多种形态,砷形态对其毒性、移动性和最

生物污染的主要类型介绍

一是霉菌,它是造成过敏性疾病的最主要原因二是来自植物的花粉,如上面提到的悬铃木花粉三是由人体、动物、土壤和植物碎屑携带的细菌和病毒四是尘螨以及猫、狗和鸟类身上脱落的毛发、皮屑。

生物污染监测方法介绍

生物污染监测采用物理、化学方法,通过对生物体所含环境污染物的分析,对环境质量进行监测。它不同于以生物学、生态学方法对环境质量进行跟踪性检测的“生物监测”。前者的监测重点是生物体内环境污染物,而后者则是利用生物个体、种群或群落的状况和变化及其对环境污染或变化所产生的反应,阐明环境污染状况。

水体污染的生物监测手段

  主要有:①利用指示生物来监测,如根据颤蚓、蛭等大型底栖无脊椎动物和摇蚊幼虫,以及某些浮游生物在水体中的出现和消失、数量的多少等来监测水体的污染状况。利用污水生物系统监测水体污染也是一种常用的手段。②利用水生生物群落结构的变化来监测。水质状况发生变化,水生生物群落结构也会发生相应的改变。在有机物污

生物污染的主要监测方法

(1)光谱分析法(可见-紫外分光光度法,红外分光光度法 ,原子吸收分光光度,发射光谱法 ,“X”射线荧光光谱)(2)色谱分析法(薄层层析法,气相色谱法 ,高效液相色谱法) 可用于测定多种农药,含汞、砷、铜或酚类杀虫剂,芳香烃、共轭双键等不饱和烃,以及某些重金属和非金属(如氟、氰等)化合物等 。

“污染”的生物学概念

污染(pollution)是指自然环境中混入了对人类或其他生物有害的物质,其数量或程度达到或超出环境承载力,从而改变环境正常状态的现象。具体包括:水污染、大气污染、噪声污染、放射性污染、重金属污染等。

微生物污染的种类

微生物污染包括有害微生物污染、病原微生物污染和微生物毒素污染三种类型。有害微生物污染因环境条件变化打破了正常的生态平衡体系,抑制一些微生物生长而促进另一些微生物旺长,形成了不同于正常微生物群落结构的有害微生物群落,改变原来的生态功能,造成了环境质量的恶化,直接或间接地影响其他生物的生存。与另外两种类

基因不同可致体检出现偏差

日本东京大学和理研究所的研究小组对日本人遗传基因解析时,发现了46个可以左右健康体检等血液检查结果的遗传基因。这是研究小组用计算机从全日本20万人的DNA和血液中,对遗传基因个人差异、20项血液检查数据、遗传基因数据、实际身体健康状况等进行后得出的结论。由于个体不同、遗传基因类型不同,个体差别也不相

基因不同可致体检出现偏差

  《自然—遗传学》:基因不同可致体检出现偏差   发现46个可左右健康体检等血液检查结果的遗传基因   日本东京大学和理化学研究所的研究小组对日本人遗传基因解析时,发现了46个可以左右健康体检等血液检查结果的遗传基因。这是研究小组用计算机从全日本20万人的DNA和血液中,对遗传基因个人差异、2

我国化学品污染严重-多地区出现癌症村

  因化学污染个别地区出现“癌症村”  环保部近日公开发布《化学品环境风险防控“十二五”规划》(以下简称规划),规划显示,我国化学品污染防治形势十分严峻。  规划表示,我国有3 千余种已化学物质对人体健康和生态环境危害严重;个别地区甚至出现“癌症村”等严重的健康和社会问题。  规划称,“十

山西苯胺泄漏污染河水-事隔五日才出现报告

  山西、河北两省已采取联动应急措施   中广网北京1月6日消息 据中国之声《新闻纵横》报道,昨天(5日)下午5时左右,邯郸市市区突发大面积停水事故。事故原因是邯郸接山西省有关部门通报,漳河上游浊漳河山西境内发生了事故性污染物排放。目前,邯郸市的水质检测报告尚未出炉,政府提醒民众暂时不要饮用漳

中国乡村污染现状调查:浙江绍兴出现多个癌症村

  一些曾高频率出现的热词未必继续流行,但是眼下获得公众广泛呼应、政府也丝毫不回避的关键词,并非新词汇却必然成为持久的话题与关注点。比如“雾霾”之下对于美丽中国的憧憬。必须指出,“美丽”中国不该是梦想,因为我们世代传承的土地上从来就是风光无限;“雾霾”天气之所以频频蒙蔽北京的蓝天,是因为我

基因污染的大致现状介绍

  与此同时,转基因的生物及生物制品也在悄然走进中国。作为农业大国,中国富有丰富的基因资源,更是水稻,大豆等农作物的故乡,各种各样的野生,人工选育的品种,构成了天然的庞大基因库。这些天然的基因资源一旦受到转基因的污染其损失将无可限量。  对于突如其来的基因污染问题中国已积极面对,出台了一系列应对方案

关于基因污染的形成介绍

  20世纪70年代基因工程技术兴起时,基因重组实验必须在“负压”实验室进行。为了防止基因重组的生物当时主要是微生物不致进入人体或逃逸到外界,实验室设立了各种等级的物理屏障和生物屏障。虽然以后对非病原体基因工程实验的规定有所放宽,但有关生物安全的原则不变。各国政府对于基因重组实验颁布有相应的操作规程

指示性生物分类大气污染指示生物

许多植物对大气污染的反应非常敏感,即使在极低浓度的情况下,也能很快表现出受害症状。大气污染对植物的危害作用主要表现在:a.外部伤害,污染物通过气孔被吸收进入植物体,对叶面产生严重伤害;b.组织伤害,污染物进人植物体内,引起阔叶树叶内海绵细胞和叶下表皮的破坏,使叶绿体发生畸变,引起栅栏细胞伤害,最终导

细胞生物基本方法:微生物污染的排除

微生物污染的排除细胞受各种霉菌、细菌和支原体污染后,一般都较难排除或杀灭,其中以支原体更难排除,因此从预防着眼为上。 1)  抗生素除菌法:用BM-1(截耳素衍生物)和BM-2(四环素衍生物)抑制支原体1.抗生素制备:均可用PBS配成250×浓缩液-20℃备用,使用浓度参考《组织培养和分子细胞学技术

指示性生物分类土壤污染指示生物

土壤中含有大量的土壤微生物和原生动物等,土壤原生动物常常作为土壤环境的指示生物。土壤原生动物是生活在土表凋落物和土壤中的重要动物类群,它的种类繁多且生物量巨大,包括鞭毛虫、肉足虫和纤毛虫等。土壤原生动物作为指示生物具有以下优越性:a.原生动物是土壤生态系统的重要组成部分,具有巨大而稳定的生产力;b.

京津冀再次出现重污染天气-河北中南部将达严重污染

  据中国之声《新闻纵横》报道,刚刚走没多久的雾霾天又回来了。中央气象台昨晚发布了“霾”黄色预警,环保部和中国气象局,还联合发布了京津冀及周边地区重污染天气预报。预计未来三天,北京中南部、天津、河北中南部、山西中部、山东西北部空气污染气象扩散条件很差,将出现持续重污染天气,其中河北中南部的部分地区,

PCR基因扩增中污染来源及污染防治措施介绍

1、测定分析前的污染源测定分析前实验材料的污染主要来自非病人标本来源的核酸。2、测定分析阶段的污染源通常,测定分析阶段的每一步都可能发生对样本的污染。反应混合液的任何成分及核酸的制备和反应建立阶段所涉及到的实验设备的任何部位都是可能的污染源。如受污染的试剂(例如牛血清白蛋白,明胶或矿物油)、商品酶制

食品微生物污染控制(一)

  食品加工可以利用水分活度、pH、化学物质及包装来控制病原体生长。而对食品加工来讲,通过控制病原体所需的营养成分,则难以达到目的,因为除特别情形之外,大多数食品为病原体生长产提供了充足的营养。我们还是集中精力通过水分活度、pH、化学物质及包装控制病原体生长。   通过分别控制食品中水分活度和p

关于微生物污染的控制

  酶反应器不需要在完全无菌条件下进行,但仍需要控制微生物污染。因为微生物污染会降低酶反应器的生产效率和降低产品质量,不仅会堵塞反应柱,还能使固定化酶活性载体降解,它们产生的酶和代谢物会使产物降解和增加反应副产物,减少产物的产出,增大产物分离难度。因此,应采取适当的方法对底物进行灭菌,酶反应器每次使

微生物污染的排除实验

实验方法原理 细胞培养中用抗生素是杀灭微生物的主要手段;但迄今尚无对抗支原体特效抗生素。各种抗生素性的性质不同,联合应用比单用效果好;一般在已发生微生物污染后,再使用抗生素,常难以根除.预防性应用比污染后使用更好。有时抗生素仅对细菌有抑制作用,而无杀灭效应;反复使用抗生索还能使微生物产生抗药性,且对

食品微生物污染控制(二)

  某些微生物生长温度范围如下表:   1、冷藏库   冷藏温度对控制致病菌的生长确实起到了很好的作用,但是一些病菌比如:李斯特菌和耶尔森氏菌在接近冻结点时仍可以生长。冷藏在减慢食品变质、氧化酸败和导致其它质量缺陷的生物的、化学的变化过程方面具有显著作用。   2、时间/温度   食

Nat-Commun:铀污染的生物治理

  据本期Nature Communications上发表的一项研究,来自废弃矿山的铀污染可能会是一个比以前所认为的更大的问题。这一发现可能会导致人们对铀矿治理策略进行修正——这些策略是将铀从被污染的地下水和地表水中清除。   全世界20个国家都开采铀矿石,主要是将其用作生产核能的一种燃料。虽

什么是水污染指示生物?

水污染指示生物是在一定水质条件下生存,对水体环境质量的变化反应敏感而被用来监测和评价水体污染状况的水生生物。如浮游生物,水生微生物,大型底栖无脊椎动物、硅藻、小球藻等。利用指示生物可以对水体污染程度作出综合判断并进行定性分析,但应注意,生物种类和数量分布也和其他条件如地理、气候以及水体的底质、流速、

食品污染有关的生物毒素

  在本节中我们将讨论部分在海洋生物中常见的自然毒素和部分农产品中常见的自然毒素。  前面已讨论过食品中微生物的危害,但并不是所有的食品危害都由微生物直接引起,有些是由于微生物的副产品或食品原料本身所引起的化学危害。  一、海洋毒素  鱼类产品,自然地由于海洋毒素的影响会产生一些独特的食品毒素。我们